基序B参与调控模板依赖的聚合酶抑制作用

RNA依赖的RNA聚合酶是参与新冠病毒进行RNA复制与转录的主要分子机器. 之前的实验研究表明瑞德西韦在模板链上时存在两次抑制作用,即不仅可以抑制与之互补的尿嘧啶核苷三磷酸的加成,还可以抑制下一位核苷三磷酸的加成. 然而,第二次抑制作用的分子机制尚未阐明. 本文运用了分子动力学模拟,发现瑞德西韦在模板链上的第二次抑制不是直接作用于核苷酸在活性位点的加成,而是源于瑞德西韦从+1位点到-1位点的迁移过程受到阻碍,这将导致活性位点无法空出,核苷三磷酸无法进入活性位点从而产物链的延长被终止. 首先,发现了基序B中G683会和瑞德西韦的1''-氰基相互作用,导致移位后态的RNA双链配对稳定性低于移位前态,从而使得瑞德西韦的移位在热力学上不易发生. 其次,由于瑞德西韦的1''-氰基在迁移过程中会与基序B的S682产生位阻,进一步从动力学上阻碍了瑞德西韦动态移位的发生. 本研究不仅揭示了基序B上两个相邻且高度保守的氨基酸可以调控瑞德西韦沿模板链的移位过程,同时,本文的发现也进一步完善了对瑞德西韦抑制新冠病毒RNA复制和转录的分子机制的理解.     

国内埃博拉病毒检测试剂问世

从华大基因科技有限公司（以下简称华大基因）获悉,该公司联合军事医学科学院微生物流行病研究所,成功研制出埃博拉病毒核酸检测试剂,现已向国家食品药品监督管理总局申请应急审批,供防治埃博拉疫情使用。     

以gp41为靶标的小分子-多肽缀合物作为HIV-1融合抑制剂的设计、合成及活性初筛

芳基吡咯类小分子化合物NB-2衍生物(Noc或Npc)与衍生于C34中的靶标特异性多肽P26所形成的缀合物具有低纳摩尔水平的融合抑制活性.本文通过不同长度或不同柔性的连接臂将Noc或Npc与衍生于C34的靶标特异性多肽P27缀合,探讨了C34中a位残基I635和连接臂对缀合物活性的影响.人体免疫缺陷病毒1型(HIV-1)Env介导的细胞-细胞融合实验结果表明,多肽与小分子之间产生了强的协同作用.     

利用EGEE网格系统寻找对抗禽流感的药物

 亚洲和欧洲的实验室通力协作,利用科学电子化整合计划(EnableGridforE-science,EGEE)网格系统分析了30万种可能对抗禽流感病毒H5N1的药物成分,目的是寻找有效抑制禽流感病毒表面酶(即神经氨酸酶N1亚型)活性的成分。用网格系统确定最适于进行生物试验的成分,将加快药物的研制速度。这次计算机模拟开发新药的一个挑战,是确定能够与病毒活性位点对接以抑制其活动的分子。在4月的4个星期里,科学家利用2000台计算机(相当于1台计算机100年的运算量)研究了30万种对抗A型流感病毒神经氨酸酶8种结构的成分的分子对接,关系数据库中产生并存储了数据总量为600GB的6万多个文件。     

用微束激光穿刺技术将商陆抗病毒蛋白(PAP)cDNA导入马铃薯的研究

以马铃薯(Solanum tuberosum L.)品种“津引8号”微薯切片作为外植体,采用微束激光穿刺技术获得了商陆抗病毒蛋白(PAP)cDNA的导入、整合与表达.实验首次利用庆大霉素筛选马铃薯再生苗,庆大霉素筛选浓度为80mg/L,共得到65株庆大霉素抗性苗,全部移栽成活.PCR扩增和PCR-Southern杂交分析表明,PAP cDNA已经稳定整合到马铃薯基因组.攻毒实验发现,多数转基因植株生长健康,对供试病毒PVX具有高度抗性.     

可用于现场快速检测的小型化多通道光谱测量系统

现有商用光谱仪虽然能够以极高的光谱分辨率对目标物进行测量与分析,但是存在系统复杂、体积庞大和价格昂贵等缺点,难以满足现场检测等应用需求.为了解决该问题,提出了可用于现场快速检测的小型化多通道光谱测量系统.相较于传统光谱仪,提出的小型化多通道光谱测量系统不仅结构紧凑而且光谱分辨率高;另外,多通道设计可以用于同时检测多个样...     

老年痴呆治愈有望

<正>许多神经退行性疾病,包括老年痴呆,都是蛋白质产生错误折叠或出现其他差错(称为朊病毒)所致。作为对抗朊病毒的防御机制的一部分,大脑会发现病毒蛋白并停止蛋白质的生产,以防止病毒扩散。这一机制对其他错误蛋白也会启动,但停止生产蛋白质会导致脑细胞的死亡。     

具有感染年龄结构的CD4+ T-细胞感染HIV病毒模型分析

本文建立和研究一类具有感染年龄结构的CD4+ T-细胞感染HIV病毒的动力学模型.得到决定该模型的未感染平衡点和感染平衡点的存在性和局部渐近稳定性条件,即当一个感染细胞在其整个感染期间产生病毒的总数不超过某-个阈值时,系统总存在局部渐近稳定的未感染平衡点;当-个感染细胞在其整个感染期间产生病毒的总数超过这一阈值时,未感染平衡点不稳定,此时存在局部渐近稳定的感染平衡点.     

一种识别病毒和蠕虫的算法

对现有的恶意软件检测算法进行研究之后发现,某些检测算法只能检测一种恶意软件,并且部分传统的检测算法在检测恶意程序时漏检率偏高。针对目前现有的检测算法缺乏综合性检测能力的短板,在此文中提出了一种新的检测算法,该检测算法具有一定的综合检测能力。新算法的思路如下：第一步区分某种软件是恶意软件还是非恶意软件,如果是恶意软件则提取其特征码,然后使用决策树根据恶意软件的特征码对恶意软件进行识别和分类,如果存在特征码不能识别的恶意软件,那么再根据病毒和蠕虫的特征使用相似性计算算法对未知的恶意软件进行相似性计算,最后使用决策系统对相似性算法计算的结果进行决策,该恶意软件是病毒还是蠕虫。将相似性计算算法,决策树和决策系统在检测恶意软件算法中进行应用是本文的创新之处。