MATHEMATICAL ANALYSIS OF WEST NILE VIRUS MODEL WITH DISCRETE DELAYS

The paper presents the basic model for the transmission dynamics of West Nile virus (WNV). The model, which consists of seven mutually-exclusive compartments representing the birds and vector dynamics,...     

胞嘧啶脱氨基化酶APOBEC3家族及其与核酸复合物结构研究进展

载脂蛋白B mRNA催化编辑蛋白APOBEC3（简称为A3）是细胞内逆转录转座子防御系统中一类家族蛋白,它通过对底物单链DNA和RNA中胞嘧啶的脱氨基化在人类的健康和疾病中发挥多种多样的作用.部分人源A3家族蛋白通过对病毒基因组中的胞嘧啶脱氨基化产生尿嘧啶,使逆转录病毒人类免疫缺陷病毒（HIV-1）基因组发生G→A碱基突变,致使HIV-1基因组不能执行正常的功能而抑制HIV-1病毒复制.作为反保护措施,HIV-1病毒利用自身的Vif蛋白（viral infectivity factor）结合人源A3蛋白,通过泛素化标记使A3蛋白降解,从而保证病毒感染.为更好理解A3蛋白催化胞嘧啶脱氨基化机制及抗病毒机制,综述了A3家族蛋白结构、它们对DNA或者RNA进行脱氨基化反应特点和它们与核酸复合物结构的研究进展,对A3家族蛋白参与脱氨基化反应的关键残基如何与核酸碱基相互作用等作了简单概括,相互作用的共同特征进行简要总结,对后期如何利用冷冻电镜技术开展全长A3蛋白相关工作做了展望.本文也部分讨论了A3蛋白如何与Vif相互作用,因此本综述对针对这些相互作用合理设计抗病毒药物有一定帮助.     

针对囊性纤维化症患者严重肺部感染的新型疗法

加拿大卡尔加里大学（University of Calgary）的研究者找到一种针对囊性纤维化症（cystic fibrosis,CF）严重肺部感染的新型疗法,并将其发表于今年9月第四个星期的《美国国家科学院汇刊》（Proceedings of the National Academy of Science）。     

新城疫病毒流式微球免疫检测新方法

本研究基于新城疫病毒多克隆抗体的制备及优化,以聚苯乙烯微球作为蛋白质载体建立免疫检测体系,建立了快速检测新城疫病毒的流式细胞术新方法。以藻红蛋白荧光染料对新城疫多克隆抗体荧光标记,取1μL荧光微球与100μL新配制的单克隆抗体溶液反应,依次加入一定量待测抗原和藻红蛋白标记的多克隆抗体,漩涡振荡10s,室温振荡反应充分,形成双抗体夹心复合物,用流式细胞仪进行检测。采用ELISA法对免疫试剂进行了匹配性筛选实验,优选了试剂用量,并与传统ELISA方法进行了对比分析。实验结果表明,单克隆抗体350mg/L、多克隆抗体300mg/L时可获得最佳分析效果,与传统的ELISA方法呈现出良好的相关性,不与鸡传染性支气管炎病毒、鸡痘病毒、鸡马立克氏病病毒等发生交叉反应。     

CRISPR/Cas9基因编辑非病毒递送系统

规律间隔成簇短回文重复序列及相关蛋白9(CRISPR/Cas9)系统的基因编辑技术为哺乳细胞基因组的精准修饰与编辑研究提供了高效、快捷的工具,但其化学生物学应用依然面临着CRISPR基因编辑工具Cas9蛋白和g RNA的细胞及活体递送等问题.近年来,研究人员通过开发多种非病毒递送载体,实现了编码CRISPR/Cas9基因编辑工具的DNA和信使RNA(mRNA)以及Cas9/gRNA核糖核蛋白(RNP)复合物的递送,并应用于靶基因的化学修饰与编辑调控.本文主要概述了近期CRISPR/Cas9基因编辑递送的研究进展,并对其化学生物学应用前景进行了展望.     

肝素亲和层析介质制备方法及应用研究进展

肝素亲和层析是利用生物大分子与层析介质表面的肝素特异性结合而进行选择性分离的一种技术,使用条件温和,纯化过程中能较好保持目标蛋白的生物活性。本文在阐述肝素与层析介质化学反应机理的基础上,系统论述了溴化氰活化及偶联法、环氧活化及偶联法、席夫碱法和碳二亚胺缩合法四种肝素亲和层析介质制备方法,深入分析了各制备方法的优缺点,总结了肝素亲和层析在血液制品、病毒纯化方面的应用。最后,进一步分析了肝素亲和层析在蛋白分离纯化领域应用存在的问题,并展望了其未来发展趋势,以期为肝素亲和层析介质的制备方法提供新思路。     

Fe_3O_4纳米粒子与慢病毒载体共同感染内皮祖细胞的促血管新生和MRI示踪的应用

采用化学共沉淀法制备了柠檬酸钠修饰Fe_3O_4纳米粒子(NPs),使用胎牛血清(FBS)改善Fe_3O_4NPs的分散性.实验表明Fe_3O_4NPs尺寸均匀,且具有良好的稳定性,FBS浓度小于5%(体积分数)时,Fe_3O_4NPs无聚集沉淀;在300 K下,饱和磁化强度达到74.86×10~(-3)A·m~2/g(74.86 emu/g);核磁共振T2序列成像时,75μg/m L Fe_3O_4NPs与慢病毒载体(LV)共同标记内皮祖细胞(EPCs)成像效果良好;而且EPCs具有稳定过表达目的基因血管内皮生长因子(VEGF)的能力.利用Fe_3O_4NPs与LV共同感染EPCs,可有效促进大鼠血管生成.说明修饰后的EPCs兼具核磁共振成像(MRI)示踪和促血管生成双重功能.     

一种识别病毒和蠕虫的算法

对现有的恶意软件检测算法进行研究之后发现,某些检测算法只能检测一种恶意软件,并且部分传统的检测算法在检测恶意程序时漏检率偏高。针对目前现有的检测算法缺乏综合性检测能力的短板,在此文中提出了一种新的检测算法,该检测算法具有一定的综合检测能力。新算法的思路如下：第一步区分某种软件是恶意软件还是非恶意软件,如果是恶意软件则提取其特征码,然后使用决策树根据恶意软件的特征码对恶意软件进行识别和分类,如果存在特征码不能识别的恶意软件,那么再根据病毒和蠕虫的特征使用相似性计算算法对未知的恶意软件进行相似性计算,最后使用决策系统对相似性算法计算的结果进行决策,该恶意软件是病毒还是蠕虫。将相似性计算算法,决策树和决策系统在检测恶意软件算法中进行应用是本文的创新之处。     

用微束激光穿刺技术将商陆抗病毒蛋白(PAP)cDNA导入马铃薯的研究

以马铃薯(Solanum tuberosum L.)品种“津引8号”微薯切片作为外植体,采用微束激光穿刺技术获得了商陆抗病毒蛋白(PAP)cDNA的导入、整合与表达.实验首次利用庆大霉素筛选马铃薯再生苗,庆大霉素筛选浓度为80mg/L,共得到65株庆大霉素抗性苗,全部移栽成活.PCR扩增和PCR-Southern杂交分析表明,PAP cDNA已经稳定整合到马铃薯基因组.攻毒实验发现,多数转基因植株生长健康,对供试病毒PVX具有高度抗性.     

一阶导数法在裂解色谱法中的应用

运用一阶导数数学方法对色谱馏出曲线的基本速率方程求导,应用导数光谱装置实现模拟微分,得到一阶导数色谱图。不但为裂解色谱特征的定性鉴别提供了又一个有力的手段,而且给色谱图数学方法的处理理论及信息转换以新的启迪。