Molecular Dynamics Simulation of Temperature-dependent Flexibility of Thermophilic Xylose Isomerase

构建了嗜热栖热菌木糖异构酶与底物木糖的复合物模型,并运用NAMD2.5软件对其在300 和360 K下进行了10 ns的分子动力学模拟. 对该酶的回旋半径、亚基间相互作用及残基柔性进行了计算与统计分析,确定了该酶在360 K时柔性残基及区域. 研究发现与300 K相比,360 K时木糖异构酶中B-因子增幅较大的残基主要可分为两组：一组位于催化结构域,是由残基55～80组成的helex-loop-helix区域,另一组位于其亚基界面上. 研究表明高温下该酶催化结构域回旋半径增加,可能加速了活性中心的运动从而有利于D-木糖的异构化反应.在360 K时亚基界面上减少了8个氢键和5个离子对,这可能也是高温下其整体结构刚性下降并且活性升高的主要原因,该结果也对文献报道的该酶E372G突变体冷适应的实验现象进行了解释. 研究结果揭示了嗜热栖热菌木糖异构酶温度和结构柔性之间的关系.     

Thermus thermophilus木糖异构酶与木糖醇的分子对接及模型分析

在1BXB结构基础上, 通过分子对接方法构建木糖异构酶与抑制剂木糖醇的复合物模型, 为合理设计解除木糖醇对木糖异构酶的抑制及进一步揭示木糖醇对该酶抑制机理提供参考.     

5－O－苯甲酰基－2，3－二脱氧－3－硝基－D－呋喃戊糖甲苷的合成研究

５－Ｏ－苯甲酰基－２，３－二脱氧－３－硝基－Ｄ－呋喃戊糖甲苷的合成研究史达清，周龙虎，高原，戴桂元（徐州师范学院化学系，徐州，２２１００９）关键词呋喃戊糖苷，Ｄ－木糖，异构化，合成５－Ｏ－苯甲酰基－２，３－二脱氧－３－硝基－Ｄ呋喃戊糖甲苷１是合成河豚...     

柱前衍生化-高效液相色谱法分析木糖结晶母液的单糖组成

采用1-苯基-甲基-吡唑啉酮(PMP)柱前衍生化-反相高效液相色谱(HPLC)法建立了8种常见单糖的分离模式,并用于木糖结晶母液单糖组成的定量分析.结果表明:木糖结晶母液至少由甘露糖、鼠李糖、纤维二糖、葡萄糖、半乳糖、木糖、阿拉伯糖及岩藻糖8种单糖组成,其中以葡萄糖、半乳糖、木糖和阿拉伯糖为主.以峰高定量,8种单糖的浓...     

木糖-软模板水热法制备硼掺杂分级多孔炭球及其电化学性能

以D-木糖为炭源,月桂酸钠为模板剂,硼酸为掺杂剂,通过水热炭化方法制得硼掺杂分级多孔炭球（BPC_S）。通过扫描电子显微镜（SEM）、透射电子显微镜（TEM）、N₂吸附-脱附测试、X射线光电子能谱（XPS）、顺磁共振波谱（EPR）、傅里叶红外光谱（FT-IR）、拉曼光谱（Raman）、X射线粉末衍射（XRD）、热重（TG）分析对样品进行表征。结果表明：月桂酸钠作为介孔造孔剂的同时,通过与D-木糖间的氢键作用使有机-有机自组装过程自发进行并形成窄尺寸分布（2~5 μm）规整炭球;硼酸在水热中催化炭源脱水降解,并以BC₃、BCO₂和BC₂O的形式掺杂在炭球上,掺硼后炭球与水表面接触角降低,润湿性提高。经CO₂活化、月桂酸钠高温分解以及胶质炭球的堆积分别产生微孔（0.5~1.2 nm）、介孔（3.14~35.00 nm）和大孔（60~146 nm）并形成分级结构。当硼酸加入量为0.927 5 g时多孔炭球（BPC_S-1）的电化学性能最佳,在6 mol·L^-1 KOH三电极体系中电流密度为0.5 A·g^-1时,比电容达287.12 F·g^-1;两电极体系中电流密度为0.5 A·g^-1时比电容达151.34 F·g^-1,能量密度达5.3 Wh·kg^-1;电流密度为5 A·g^-1时进行1 000次充放电循环,电容保持率仍达96.43%。     

2，3，4－三苯甲酰化－1－β－氰基－D－吡喃木糖构象研究

２，３，４－三苯甲酰化－１－β－氰基－Ｄ－吡喃木糖构象研究张亮仁，张礼和（北京医科大学天然药物及仿生药物国家重点实验室，北京，１０００８３）关键词吡喃木糖，分子模拟，构象，分子动力学计算碳核苷类化合物是人们广泛关注的一类抗肿瘤抗病毒化合物［１～４］。...     

A New Method for Synthesis of Methyl 3—Azido—3—deoxy—2—O—mesyl—5—O—benzoylxylofuranoside

A new method for synthesis of 3-azido-3-deoxyxylofuranoside was described. D-ribose was methylated, then treated with methanesulfonyl chloride to give Ⅱ.Ⅱ was selectively replaced by benzoate at the 5-position to give Ⅲ. All these processes gave good yields. Ⅲ was treated with sodium azide to afford Ⅳ, whose structure was determined by ^1H NMR and ^13C NMR.     

离子电极法测定木糖

离子电极法测定木糖刘鹤，何亚明，胡伟凡（北京轻工业学院化工系北京１０００３７）关键词离子电极法，二硝基酚电极，木糖木糖常采用费林试剂法［１］，在沸腾条件下测定。当含量低于０．３％时，很难判断终点．本文用自制的２，４－二硝基酚电极，建立了测定木糖的离子...