Molecular Dynamics Simulation of Temperature-dependent Flexibility of Thermophilic Xylose Isomerase

构建了嗜热栖热菌木糖异构酶与底物木糖的复合物模型,并运用NAMD2.5软件对其在300 和360 K下进行了10 ns的分子动力学模拟. 对该酶的回旋半径、亚基间相互作用及残基柔性进行了计算与统计分析,确定了该酶在360 K时柔性残基及区域. 研究发现与300 K相比,360 K时木糖异构酶中B-因子增幅较大的残基主要可分为两组：一组位于催化结构域,是由残基55～80组成的helex-loop-helix区域,另一组位于其亚基界面上. 研究表明高温下该酶催化结构域回旋半径增加,可能加速了活性中心的运动从而有利于D-木糖的异构化反应.在360 K时亚基界面上减少了8个氢键和5个离子对,这可能也是高温下其整体结构刚性下降并且活性升高的主要原因,该结果也对文献报道的该酶E372G突变体冷适应的实验现象进行了解释. 研究结果揭示了嗜热栖热菌木糖异构酶温度和结构柔性之间的关系.     

吡喃木糖热裂解机理的密度泛函理论研究

采用密度泛函理论理论方法M062X/6-311++G(d,p),对吡喃木糖的热解反应机理进行了理论计算分析。针对吡喃木糖热解可能发生的化学反应共设计了九条可能的热解路径,并对各路径中的反应物、中间体和过渡态的几何结构进行了能量梯度全优化,并在梯度全优化的基础上计算了各热解反应路径的热力学和动力学参数。文中以两大类方式来设计反应路径：1）木糖首先经过过渡态TS1发生开环反应生成链状中间体2,该步的反应能垒为188.7 kJ/mol,对于中间体2共设计了五种可能的热解反应路径;2）考虑双键同时断裂的情况,木糖先发生脱水反应,接着按C-C和C-O键同时断裂的情况发生开环反应,针于这种情况共设计了四条可能的热解路径。计算结果表明,吡喃木糖热解的主要反应产物有乙醇、乙醛、糠醛、丙酮、酸类、CO2和CO等小分子化合物。     

5－O－苯甲酰基－2，3－二脱氧－3－硝基－D－呋喃戊糖甲苷的合成研究

５－Ｏ－苯甲酰基－２，３－二脱氧－３－硝基－Ｄ－呋喃戊糖甲苷的合成研究史达清，周龙虎，高原，戴桂元（徐州师范学院化学系，徐州，２２１００９）关键词呋喃戊糖苷，Ｄ－木糖，异构化，合成５－Ｏ－苯甲酰基－２，３－二脱氧－３－硝基－Ｄ呋喃戊糖甲苷１是合成河豚...     

大豆木糖葡聚糖的结构研究

利用4mol·dm^-^3NaOH提取结合层析柱提纯, 从大豆细胞壁物质(膳食纤维)中分离出PRF6聚合物组分(即木糖葡聚糖)。通过酸水解、酸部分水解、纤维素酶降解和甲基化等分析方法, 借助气相色谱和色质联用等现代仪器, 对该组分的结构特征作了详尽的剖析。结果表明其主链结构是由β(1→4)糖苷键连接的葡聚糖, 主链在6-C位置带有吡喃木糖残基作为侧键, 部分木糖残基在2-C位置还连有阿拉伯呋喃糖或半乳吡喃糖残基。     

Thermus thermophilus木糖异构酶与木糖醇的分子对接及模型分析

在1BXB结构基础上, 通过分子对接方法构建木糖异构酶与抑制剂木糖醇的复合物模型, 为合理设计解除木糖醇对木糖异构酶的抑制及进一步揭示木糖醇对该酶抑制机理提供参考.     

木糖-软模板水热法制备硼掺杂分级多孔炭球及其电化学性能

以D-木糖为炭源,月桂酸钠为模板剂,硼酸为掺杂剂,通过水热炭化方法制得硼掺杂分级多孔炭球（BPC_S）。通过扫描电子显微镜（SEM）、透射电子显微镜（TEM）、N₂吸附-脱附测试、X射线光电子能谱（XPS）、顺磁共振波谱（EPR）、傅里叶红外光谱（FT-IR）、拉曼光谱（Raman）、X射线粉末衍射（XRD）、热重（TG）分析对样品进行表征。结果表明：月桂酸钠作为介孔造孔剂的同时,通过与D-木糖间的氢键作用使有机-有机自组装过程自发进行并形成窄尺寸分布（2~5 μm）规整炭球;硼酸在水热中催化炭源脱水降解,并以BC₃、BCO₂和BC₂O的形式掺杂在炭球上,掺硼后炭球与水表面接触角降低,润湿性提高。经CO₂活化、月桂酸钠高温分解以及胶质炭球的堆积分别产生微孔（0.5~1.2 nm）、介孔（3.14~35.00 nm）和大孔（60~146 nm）并形成分级结构。当硼酸加入量为0.927 5 g时多孔炭球（BPC_S-1）的电化学性能最佳,在6 mol·L^-1 KOH三电极体系中电流密度为0.5 A·g^-1时,比电容达287.12 F·g^-1;两电极体系中电流密度为0.5 A·g^-1时比电容达151.34 F·g^-1,能量密度达5.3 Wh·kg^-1;电流密度为5 A·g^-1时进行1 000次充放电循环,电容保持率仍达96.43%。     

碳苷合成研究——3-β-D-吡喃木糖基-1,2,4-氧杂二唑类化合物的合成

本文研究了1-(2,3,4-三-O-苯甲酰-β-D-吡喃木糖基)-偕氨基肟与酸酐及酰氯的缩合反应,探讨了不同缩合剂、不同取代基对环合反应的影响,与酸酐反应可以一步完成,且收率较好;与酰氯反应分两步进行,第一步酰化,第二步脱水环合,芳环上取代基的电性效应,决定环合反应的难易,并证明了该环系的碳苷对酸、碱、热具有化学稳定性,本文合成了12个氧杂二唑类木糖碳苷及2个木糖基化的开环产物,通过光谱及元素分析,确定了它们的结构。     

综合利用稻壳制备木糖、电容炭与硅酸钙晶须

利用酸水解稻壳中的半纤维素制备木糖, 并将糖渣经过炭化后分离出碳和硅, 碳采用稀碱溶液活化改性制备电容炭, 硅采用水热法合成了硅酸钙晶须, 从而使稻壳所有组分得到充分利用. 采用循环伏安(CV)和恒流充放电(GCD)研究了电容炭的电化学性能. 通过X射线衍射(XRD)和扫描电子显微镜(SEM)对所得硅酸钙晶须的结构和形貌进行了表征. 实验结果表明, 稻壳酸水解的最优条件为硫酸浓度7%(质量分数)、 固液比(g/mL)为1:8、 反应时间为2.0 h, 在该条件下, 一次水解、 二次水解和三次水解的木糖收率(Y₁/Y₂/Y₃)和浓度(质量分数, C₁/C₂/C₃)都能达到最大值, Y₁=98.5%, C₁=3.6%; Y₂=85.4%, C₂=6.3%; Y₃=76.6%, C₃=9.0%. 采用15 mL 8%(质量分数) NaOH稀碱溶液活化改性制得的电容炭(AC/15)比电容值为77.32 F/g, 而且具有较好的倍率性和循环稳定性; 硅酸钙晶须为扫帚状针钠钙石晶须.     

N,N-二(邻硝基苯氨基乙基)甘氨酸糖酯的合成

在筛选抗植物病毒剂的研究中发现N,N-二(邻硝基苯氨基乙基)甘氨酸具有较好的抑制烟草花叶病毒(TMV)的活性,为提高其抗病毒活性,根据一些糖酯具有生理活性,而且它们的活性和药理性质都比同系物非糖酯要好,因此决定合成标题酸的酯基葡萄糖、乳糖、半乳糖和木糖酯,这些酯均为新化合物。     

H点标准加入光度法同时测定葡萄糖和木糖

１引言葡萄糖和木糖是自然界中最常见的两种单糖，其结构和化学性质极为相似，用普通方法很难将其分离和分别测定。本文利用硫酸－苯酚与糖的显色反应，采用Ｈ点标准加入法对葡萄糖和木糖不经分离进行同时测定。本法简便、快速、结果准确，已应用于食用纤维的分析。２方法原理在二元混合物（组分为ｘ和ｙ，浓度为ＣｘＣｙ）体系中，将不同量已知浓度的ｘ分别准确加入到一系列混合体系中，然后分别在λ１和λ２处测量其分析信号Ａ１和Ａ２。其表达式为：Ａ１＝ｋｘ１Ｃｘ＋Ｋｙ１Ｃｙ＋Ｋｘ１Ｃｉｘ（１）Ａ２＝ｋｘ２Ｃｘ＋Ｋｙ２Ｃｙ＋ｋｘ…