固氮酶Fe-Mo辅因子空间构型模拟——分子力学在分子模型设计中的应用

在分子模型设计中交替使用分子图形学软件和分子力学优化计算,用计算机模拟固氮酶Fe-Mo辅因子空间构型,从而为进一步的理论研究提供了一个非实验方法的有效手段。     

P_7~ 原子团簇及其特殊配位

在激光产生的磷原子团簇正离子的质谱图中 ,P7 具有最强的谱峰 .使用分子图形软件设计出 2 4种 P7 的同分异构体 ,并进行分子力学、PM3半经验量子化学和 ADF密度泛函优化 .在磷原子团簇正离子模型中 ,磷原子采用二、三、四或六配位方式成键 .从各异构体成键能量的比较中可得知 ,最稳定的 P7 构型是在最稳定的 P6的双键位置增加 1个磷原子所生成的结构 .在磷原子六配位的结构中 ,d轨道参与成键 .具有平面或六配位原子的 P7 结构是不稳定的结构 .     

C_（60）共边五员环与分子空间立体能

使用分子图形方法设计出Ｉｈ、Ｃ２ｖ、Ｃｖ、Ｄ２ｈ、Ｄ２ｄ和Ｄ３点群的笼状结构Ｃ６０同分异构体．经由分子力学的计算，得出各异构体中的共边五员环与分子空间立体能量有线性关系．这样，通过Ｃ６０异构体的共边的五员环的数目可推算出分子的空间立体能量．     

固氮酶Fe—Mo辅因子空间构型模拟—分子力学在分子…

在分子模型设计中交替使用分子图形学软件和分子力学优化计算，用计算机模拟固氮酶Ｆｅ－Ｍｏ辅因子空间构型，从而为进一步的理论研究提供了一个非实验方法的有效手段。     

球烯分子的几何构型预测

以球烯分子含有12个五员环和若干个六员环为出发点,交替使用分子图形软件的编辑功能和分子力学能量优化计算两种方法,设计出一系列的球烯大分子,这些预测的构型为球烯大分子的合成和理论研究提供了必要的信息。     

快速傅里叶变换CAI软件

一、前言快速傅里叶变换(FFT)基本上克服了时间域与频率之间的相互转换的计算障碍,为数字谐波分析的广泛应用创造了条件。在化学上,FFT应用在红外光谱、核磁共振波谱和晶体结构分析方面最为成功。例如NMR时间域的谱图能极快速地收集,但解释却相当困难。运用FFT很容易地将时间域变换为频率域谱图     

CCOD——一种适合科学家使用的磁盘期刊

近年来,发表科技论文的科技期刊已不再局限于纸张。国际上越来越多的期刊使用非印刷媒体出版,如使用光盘和磁盘替代纸张的光盘期刊和磁盘期刊。美国科学信息研究所的Current Contents     

Web上的三维分子结构模拟

介绍几种基于web上的三维分子结构模拟技术：VRML及chime、chem3D、Hyperchem插件，并讨论它们的优缺点．这些模拟技术具有可操作的特点，可以进行旋转、缩放、平移等实时交互操作，并改变其形状和颜色的表现形式．三维分子结构模拟可以增强化学网络课程的表现能力，提高教学效果，是发展远程教育的重要技术。     

原子团簇Ge11同分异体的密度泛函研究

用分子图形软件设计出多种Ge_11原子团簇模型,使用B3LYP密度泛函方法进行几何构型优化和振动频率计算,比较了14种同分异构体的总能量,得到了新的基态构型。锗原子团簇的大部分原子以三、四、五和六配位成键。在Ge11原子团簇中,双角反四棱柱衍生出来的构型能量较低,它是设计大分子锗原子团簇初始模型的重要结构单元。由三棱柱演变的构型能量居中。带心结构和共边构型带有高配位原子,其总能量较高,是不稳定的结构。