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求解对流扩散方程的两层半显式差分格式 总被引:1,自引:0,他引:1
本文给出了对流扩散方程的两种两层差分格式,讨论了它们的相容性、稳定性,极值性和单调性,给出了一种提高精度的方法。这两种格式为半显格式,对初边值问题可显式计算。它们都具有恒稳或亚恒稳定的性质。 相似文献
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纳米通道单分子检测P53蛋白与DNA的弱相互作用 总被引:1,自引:0,他引:1
利用基于α-溶血素(α-HL)的纳米通道单分子检测技术在单分子水平上探测位于肿瘤抑制蛋白P53 DNA结合域的多肽分子(P53-P)与含有p21waf1/cip1基因结合域的双链DNA (B40)之间弱相互作用. 在电场力的作用下, 单个P53-P/B40复合物被α-HL纳米通道捕获并限制在其前庭中. 通过空间限域作用, P53-P与B40之间的弱相互作用被放大为具有显著电压依赖性的复合物-α-HL间强烈的相互作用, 从而产生极易分辨的离子流特征阻断信号. 统计分析特征阻断信号显示P53-P与B40之间的弱相互作用使得B40产生微小的构型变化. 分子对接模拟进一步证明, P53-P能够插入B40的小沟并使得小沟间距变窄. 因此, 基于α-HL的纳米通道单分子检测技术可以作为研究单个生物大分子间弱相互作用的超灵敏分析方法. 相似文献
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一种量子化学有限元并行计算方法 总被引:2,自引:0,他引:2
利用有限元法计算了量子化学中双原子分子的Hartree-Fock-Slater方程,用八节点等参元来离散所要求解的方程,在计算离散后的广义特征值问题时,采用迁移式子空间迭代法来求解.本方法能以较高的精度和效率求得所需的前q维特征值和特征向量,具有编程容易、子空间维数低和占用内存少的优点.所提方法也适用于并行计算,并行程序是在微机机群系统上发展的,用SPMD(singleprogrammultipledate)模式在MPI(messagepassinginterfaces)并行编程平台上实现,MPI系统用于处理机群节点间的通信.给出计算两个双原子分子——BH分子和LiH分子基态总能量的数值算例,获得了较精确的计算结果,显示了本方法的优越性. 相似文献
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在CPU串行运算模式下实现大规模矩阵求逆是一个非常耗时的过程。为了解决这一问题,基于NVIDIA公司专为GPU(图形处理器)提供的CUDA(计算统一设备架构),从新的编程角度出发,利用GPU多线程并行处理技术,将矩阵求逆过程中大量的数据实现并行运算,从而获得了较大的加速比。同时,根据程序的执行结果,分析了GPU的单精度与双精度的浮点运算能力及其优、劣势。最后,通过分析数据传输时间对GPU性能的影响,总结出适合GPU的算法特征。 相似文献
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分子对接是计算机辅助药物分子优化设计的重要组成部分.引入了一种通过计算原子对间距离来评价结合自由能的知识打分函数,其构造方法与平均力势能函数相似.同时采用基于信息熵的多种群自适应遗传算法,形成一种新型的分子对接程序KGAsDock.给出与著名的分子对接程序DOCK6.1的对接结果比较,数值实验表明,该算法在不降低计算效率的前提下,提高了对接的精度. 相似文献
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分子表面的描述在蛋白-蛋白、蛋白-配体相互作用分析中起着关键的作用。为此,本研究设计了基于等值面原理的分子溶剂可及表面生成程序并进行了性能测试。该程序采用一维递归快速高斯滤波计算方法,在三维离散空间中快速构造等值面,利用等值面提取技术(Marching Cubes)获取以三角面片表示的分子溶剂可及表面,并使用中心差分法计算三角面片的法向量,从而获得更好的显示效果。实际测试结果表明,该算法计算速度较快,准确性良好,可为基于结构的靶标识别方法提供有效药物靶标的分子表面表征。目前该程序已经被整合入国产大型药物设计图形软件包D~3 Pharma中。 相似文献
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翠宏山铁多金属矿采用大直径深孔高阶段采矿法回采矿房、矿柱,阶段高度120m。本文对矿区岩体特性、采矿方法进行了阐述,重点就采场结构参数、充填体稳定性等关键技术问题及相关回采技术措施进行分析。 相似文献
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"无机化学"网上多媒体教学辅助系统集文本、图片、动画、音频、视频、实验等各类素材于一体,有助于学生自主学习并参与到教学活动过程中,体现教学过程中以学生为主体、教师为主导的教育思想,为创新人才的培养提供了非常有效的辅助教学手段. 相似文献