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细胞色素BC1酶复合物是细胞呼吸和光合作用的重要组成部分,也是抑制病菌的重要靶标.细胞色素BC。酶复合物的抑制荆在近几年来的应用越来越广.为了得到活性更高的抑制剂,本文采用分子对接技术(DOCK4.0),对8个典型结构的此类抑制剂进行了对接,并通过分析结合能与活性的相关性,得到了较好的构效关系模型,相关系数R^2=O.75.在此基础上,设计了4个新的抑制剂,均具有较高的预测活性.所建立的模型将为研究新的细胞色素BC。酶复合物抑制剂提供一定的理论指导. 相似文献
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药物溶解性能与溶剂分子三维静电势参数的定量关系 总被引:1,自引:0,他引:1
对一系列溶剂分子的三维静电势及其统计上的导出参数进行了计算,运用多元线性回归分析建立了扑热息痛、利多卡因、氟派啶醇和磺胺嘧啶等四种常见药物在不同溶剂中溶解度与溶剂分子三维静电势参数之间的关系。从溶剂接受质子和给质子的能力以及极性大小方面对各药物的溶解性能进行了阐述。 相似文献
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用比较分子场分析法(CoMFA)研究了5-芳基乙内酰脲类化合物定量结构-保留关 系。本研究林构象搜索所得的低能结构出发构建化合物分子的构象,并进行了全空 间搜索。得到了较好的模型CoMFA的交叉验证回归系数q~2为0.764,模型的线性回 归系数r~2为0.962)。这些方程不仅有助于推测被识别剂和识别剂之间的结合方式 ,还可以定量地预测结构相近的类似物的拆分可能性,为设计合成新的识别剂和被 识别剂都提供了一定的理论依据。 相似文献
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为了揭示辅酶PQQ结构与反应性的关系,在B3LYP/D95(d, p)水平上对一系列PQQ模型化合物及其类似物与氨的亲核加成进行了理论计算.结果表明:对单羰基体系,羰基碳的亲电性对反应能垒有重要的影响;对双羰基体系,过渡态中邻位羰基氧与亲核试剂氨上的H形成的氢键对反应的活化能起着关键的作用;稠合芳香环本身对反应的能垒影响不大,但当稠合杂环的1-位为可提供氢键受体的N原子时,由于N1与氨上H原子间可形成氢键而进一步降低反应的活化能.发现过渡态中被进攻羰基与氨上N原子之间形成的夹角(OCN)与活化能有良好的线性关系. 相似文献
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G-蛋白偶联受体GPR120分子模建研究 总被引:1,自引:0,他引:1
新的长链脂肪酸受体G-蛋白偶联受体120 (G-protein-coupled receptor120, GPR120)是2型糖尿病的潜在治疗靶标. 由于其晶体结构迄今尚未获得, 成为基于结构的新药设计的瓶颈. 首先, 以人体β2肾上腺能素受体(human β2 adrenergic receptor, β2AR)晶体结构为模板, 通过同源模建方法构建GPR120三维结构, 对整个体系进行包膜的分子动力学模拟. 然后采用分子对接技术模建了GPR120的小分子激动剂GW9508与GPR120的相互作用模型, 发现了受体分子识别的关键性残基, 为开展定点突变实验提供了指导意义. 所建模型为研究受体与配体作用提供了合理的初始结构, 此方法也适用于其他G蛋白偶联受体的分子模建. 相似文献
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GSK-3抑制剂研究进展 总被引:2,自引:0,他引:2
糖原合成酶激酶-3 (Glycogen synthase kinase-3, GSK-3)是一个多功能的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,不仅参与肝糖代谢过程,而且还参与Wnt和Hedgehog信号通路,通过磷酸化多种底物蛋白来调节细胞的生理过程。GSK-3抑制剂作为目前倍受关注的小分子抑制剂,对治疗神经退化性疾病,癌症,II型糖尿病具有潜在的疗效。本文针对已开发出的GSK-3抑制剂,对其结构,与蛋白的作用模式以及构效关系进行阐述,为进一步设计合理的药物先导化合物和特异性小分子化学探针提供有益的启示。 相似文献