毛细管电泳与MFOLD软件研究单链脱氧核糖核酸分离二级结构

从Gene Bank数据库中下载质粒基因序列,用DNAssist软件分析并最终建立了单点碱基突变模型,并以此为研究对象对单链DNA分离机理进行研究探讨。采用高效毛细管电泳-激光诱导荧光检测(CE-LIF)方法,以线性聚丙烯酸胺为筛分介质对模型进行分离分析,并与MFOLD软件所预测的单链二级结构进行对照分析。分离条件为:线性聚丙烯酸胺浓度为6%,负极进样,13kV分离,温度为19℃,λem=488nm、λex=520nm。结果发现毛细管电泳实际分析结果有4个单链峰,而MFOLD软件预测的只有3种二级结构,预测的准确度为75%,MFOLD软件虽然有局限性,但预测DNA二级结构仍有一定的参考价值。     

快速凝固Cu-1.5%Be合金的制备

采用单辊旋淬法制备了快速凝固Cu-1.5%Be合金(Be质量分数1.5%)薄带。根据热传输平衡方程对快速凝固冷却速率进行了估算,并借助X射线衍射仪、扫描电子显微镜对该合金的微观结构及相选择进行了分析。结果表明:当辊面线速度在29.93~39.19 m/s范围内时,合金冷却速率可达到9.80105~1.63106 K/s;随着辊轮转速的提高和喷注气压的减小,合金条带厚度和晶粒度逐渐变小;随着冷却速率的增加,溶质截留效果显著,合金相结构由复相向单相转变,当辊面线速度达到34.54 m/s时,Cu-1.5%Be合金可形成过饱和的-Cu固溶体组织,且组织细小均匀,可获得纳米晶;条带横断面显微组织由接近辊面一侧的细小等轴晶区、中间的柱状晶区和靠近自由表面的等轴晶区组成。     

用于团簇负离子的共线光电子速度成像仪

描述了包含共线的光电子速度成像仪,以及与双阀激光溅射团簇源联用的时间飞行质谱装置．为了避免预混气体,两个脉冲阀和一个反应通道被用来产生反应负离子．共线的光电子成像仪采用了改进的速度成像透镜系统,它的能量分辨率优于3%．此外还报道了Si₄^-团簇在532和355 nm,以及Si₃C^- 团簇在532 nm的光电子速度成像．从实验图像中可以获得光电子能谱和各向异性参数．从Si₄^-团簇能谱上获得了中性的Si₄团簇的基态和第一激发态的振动频率分别为330和312 cm^-1．初步的实验结果证明这套光电子成像装置对研究团簇负离子的电子结构以及光脱附动力学非常有效.     

纳米晶Cu薄带的单辊法制备及结构分析

 采用单辊法制备出纳米晶Cu薄带，利用X射线衍射对纳米晶Cu薄带的结构进行分析，并研究了工艺参数对结构的影响。实验发现：纳米晶Cu薄带的平均晶粒度为65.17～121.8 nm，辊轮转速越快，喷铸压力越小，保护气压越大，保护气体越冷，薄带的晶粒尺寸越小；纳米晶内部均存在晶格畸变和晶胞参数的涨落，说明采用单辊法制备纯金属薄带会在材料内部产生不同程度的晶格扭曲，Cu带处于非稳定状态；所有样品均发生(200) 晶面择优取向，原因可能与单辊法的快淬工艺有关。     

A study of cavitation nucleation in pure water using molecular dynamics simulation

To discover the microscopic mechanism responsible for cavitation nucleation in pure water, nucleation processes in pure water are simulated using the molecular dynamics method. Cavitation nucleation is generated by uniformly stretching the system under isothermal conditions, and the formation and development of cavitation nuclei are simulated and discussed at the molecular level. The processes of energy, pressure, and density are analyzed, and the tensile strength of the pure water and the critical volume of the bubble nuclei are investigated. The results show that critical states exist in the process of cavitation nucleation. In the critical state, the energy, density, and pressure of the system change abruptly, and a stable cavitation nucleus is produced if the energy barrier is broken and the critical volume is exceeded. System pressure and water density are the key factors in the generation of cavitation nuclei. When the critical state is surpassed, the liquid is completely ruptured, and the volume of the cavitation nucleus rapidly increases to larger than 100 nm³; at this point, the surface tension of the bubble dominates the cavitation nucleus, instead of intermolecular forces. The negative critical pressure for bubble nucleation is -198.6 MPa, the corresponding critical volume is 13.84 nm³, and the nucleation rate is 2.42×10³² m^-3·^-1 in pure water at 300 K. Temperature has a significant effect on nucleation: as the temperature rises, nucleation thresholds decrease, and cavitation nucleation occurs earlier.     

毛细管电泳-激光诱导荧光检测法分析胃癌组织及癌旁正常组织蛋白质的差异性

胃癌是临床常见的恶性肿瘤之一。近年来寻找肿瘤相关特异蛋白质是蛋白质组学研究的热点。本文通过考察毛细管动态涂层方法、筛分介质聚环氧乙烷(PEO)的浓度、缓冲液的pH值、分离电压、温度及荧光染料对分离效果的影响,建立了毛细管电泳-激光诱导荧光法分离胃癌组织及癌旁正常组织蛋白质的方法;通过分离检测,获得两者的蛋白质指纹图谱。经分析,两者的指纹图谱相似度达到0.8以上,差异蛋白质分子质量集中在50000~100000 Da之间,提示某些小分子蛋白质可能是和肿瘤发生相关的特异蛋白质,从而缩小了特异性分子标记物的筛选范围。病理组织学分型及蛋白质电泳峰数目的统计结果验证了该方法的可靠性。该方法具有临床应用的潜力。     

毛细管电泳法检测肺癌p53基因第七外显子的突变

p53基因点突变在肺癌的发生过程中起重要作用,检测基因点突变的方法学研究将有助于临床准确诊断肺癌.本实验用PCR扩增包含249位密码子的肺癌及癌旁正常组织p53基因第七外显子,扩增样品分别经96 ℃变性和HaeⅢ酶切处理,以CE-SSCP、CE-RFLP、PAGE-SSCP和PAGE-RFLP对其突变情况进行检测,并从上样量、时间、检出限和检出率4个方面进行比较.PAGE凝胶浓度为15%;CE筛分介质PEO浓度3.0%,pH 8.2,电压15 kV,温度15 ℃,λex=488 nm,λem=520 nm荧光检测.检出率由高到低分别为:CE-SSCP>PAGE-SSCP>CE-RFLP>PAGE-RFLP.CE-SSCP可作为大规模肺癌早期诊断的简便可靠的方法.     

毛细管电泳检测肺癌基因突变的方法学研究

建立了一种毛细管电泳快速高效检测聚合酶链反应(PCR)扩增产物以及限制性内切酶酶切产物的方法,使其更好地用于基因诊断.以聚环氧乙烷(poly(ethylene oxide),PEO)为筛分介质,用涂层的毛细管柱(37 cm×75 μm,有效长度27 cm)分离pUC19 DNA/MspⅠ(HpaⅡ) Marker标准DNA片段.考察了筛分介质的质量浓度、pH值、毛细管柱的温度和运行电压.在1×TBE (pH 8.2)电泳液、电压15 kV、温度15 ℃,于10 min内成功分离了Marker标准DNA片段.该方法快速、灵敏、准确,用于临床76例肺癌患者正常组织和肿瘤组织p53基因和ras基因点突变情况的检测,结果满意.     

甲胺水合离子团簇的结构模型及红外光谱研究

本文利用量子化学计算方法,研究了甲胺和水复合离子团簇[(CH₃NH₂)(H₂O)_n]⁺的几何结构、能量和红外光谱,揭示了结构生长模型、氢键作用机制和质子转移机理. 研究结果表明,在[(CH₃NH₂)(H₂O)_n]⁺团簇中,甲胺甲基上的一个氢原子转移到氨基上,形成分子内质子转移的CH₂NH₃⁺离子核心结构模型,水分子作为氢键受体,与质子化氨基NH₃⁺形成氢键. CH₃NH₂⁺离子核心结构模型没有CH₂NH₃⁺离子核心结构模型稳定. 在团簇的红外光谱中,CH振动、自由NH振动、氢键结合的NH振动和OH振动模式在CH₃NH₂⁺和CH₂NH₃⁺两种离子核心结构模型的理论计算红外光谱中明显不同,因此可用于鉴别甲胺水合离子团簇的结构模型,有助于理解甲胺和水复合团簇的氢键网络结构.     

毛细管电泳-限制性片段长度多态性快速检测胃癌组织中P53基因点突变的方法

为建立毛细管电泳快速高效检测小于70bp双链DNA的方法。对毛细管电泳过程中的各参数进行了考察,最终得到最佳分离体系(筛分介质浓度8%,添加剂甘露醇浓度8%,pH6.5,温度15℃,电场强度275V/cm),并将该体系用于临床59例胃癌患者肿瘤组织基因248位、249位密码子点突变情况的检测,30min之内同时检测了两个密码子位点的突变情况,实现了35bp和40bpDNA片段的基线分离,且分离度较高(1.642),初步建立了快速、高分辨诊断胃癌的方法。