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In protein molecules each residue has a different ability to form contacts.In this paper,we calculated the number of contacts per residue and investigated the distribution of residue-residue contacts from 495 globular protein molecules using Contacts of Structural Units(CSU)software.It was found that the probability P(n)of amino acid residues having n pairs of contacts in all contacts fits Gaussian distribution very well.The distribution function of residue-residue contacts can be expressed as:P(n)=P_0+aexp[-b(n-n_c)~2].In our calculation,P_0=-0.06,α=11.4,b=-0.04 and n_c=9.0.According to distribution function,we found that those hydrophobic(H)residues including Leu,Val,Ile,Met,Phe,Tyr,Cys,and Trp residues have large values of the most probable number of contact n_c,and hydrophilic(P)residues including Ala,Gly,Thr, His,Glu,Gln,Asp,Asn,Lys,Ser,Arg,and Pro residues have the small ones.We also compare with Fauchere-Pliska hydrophobicity scale(FPH)and the most probable number of contact n_c for 20 amino acid residues,and find that there exists a linear relationship between Fauchere-Pliska hydrophobicity scale(FPH)and the most probable number of contact n_c, and it is expressed as:n_c=a+b×FPH,here α=8.87,and b=1.15.It is important to further explain protein folding and its stability from residue-residue contacts. 相似文献
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报道了在蓝宝石衬底上制备CeO2缓冲层的原位双温工艺法及其对Tl2Ba2CaCu2O8(Tl-2212)薄膜超导特性的影响.XPS和AFM测试结果表明,采用原位双温工艺法制备缓冲层,具有工艺简单,薄膜表面光滑,衬底材料原子扩散量少等特点.在先驱膜的高温后退火过程中,40 nm厚的CeO2薄膜就能有效地阻挡衬底材料对超导薄膜底层的扩散.随后制备厚度为530 nm的Tl-2212
关键词:
Tl-2212超导薄膜
蓝宝石
氧化铈缓冲层
原位双温工艺法 相似文献
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通过粗粒化分子动力学模拟,在高分子链与纳米棒间的不同相互作用强度、不同高分子链刚性,且在同时考虑单分散和双分散共混高分子链条件下,研究了高分子链在纳米棒界面区域的吸附行为。对于柔性环形高分子链,增强高分子链与纳米棒间的相互作用有利于提高纳米棒对高分子链的吸附。当高分子链与纳米棒间的相互作用强度较弱时,增强高分子链刚性会诱导高分子链套在纳米棒上形成规则的自组装结构。对环/线高分子链共混情况,当高分子链与纳米棒间的相互作用较弱时,随着链刚性的增强,环形高分子链优先占据纳米棒界面区域;当高分子链与纳米棒间的相互作用较强时,随着链刚性的增强,纳米棒界面区域由优先吸附环形高分子链转为优先吸附线形高分子链。研究结果有助于进一步了解高分子链与纳米棒的复合材料,为改善纳米复合材料的性能提供理论支持。 相似文献
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采用旋转异构态模型,计算受约于无限长圆柱体的聚亚甲基链的配分函数.发现受约聚亚甲基链的配分函数可以写成ln Z=a N+b,其中,N是键的数目,a和b与温度T、无限长圆柱体的直径D有关.同时计算了构象能量Econf和熵Sconf这种方法为研究多链体系的热力学提供一种近似方法. 相似文献
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研究了在铝酸镧(LAO)基片上TBCCO凝胶膜的热分解条件对Tl2Ba2 CaCu2O8(Tl-2212)薄膜的结晶质量、表面形貌、组分比例的影响.SEM和XRD研究表明,凝胶膜经过适当条件热分解后,可以制作出具有致密的晶体结构、高度c轴取向的外延Tl-2212超导薄膜,其薄膜具有较好的电学性能.其临界温度Tc可达106 K,临界电流密度Jc可达0.83 MA/cm2 (77 K,0T). 相似文献
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表面场诱导线性三嵌段共聚物薄膜的微结构及其转变规律 总被引:1,自引:0,他引:1
采用实空间自洽场理论研究了ABC对称线性三嵌段共聚物薄膜的自组装结构及其转变规律.选取具有特定聚合物参数的对称线性三嵌段共聚物,对无修饰条纹和有修饰条纹的两类薄膜受限表面情况,通过调节其薄膜表面场强度和薄膜厚度,获得了一系列新颖的聚合物薄膜微结构.研究结果表明,在无修饰条纹的单一薄膜受限情况下,共聚物趋向于形成规整有序的层状或穿孔层状结构;而在有条纹修饰情况下,共聚物在相应的条纹修饰区域下发生微相分离并趋于形成水平柱状结构. 相似文献
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采用实空间自洽场理论研究了线性三嵌段共聚物在格点薄膜受限下的自组装.根据受限空间内共聚物的自组装情况,描绘了不同嵌段比下共聚物的三角相图,分析各相结构的形成机理,并详细观察三色层状与核壳柱状之间的相变过程.在受限的基础上,通过在薄膜表面施加格点型吸附势,获得了一系列聚合物微结构,发现层状结构是最稳定的相结构;当吸附强度增大时,各嵌段的自组装结构发生变化,三色层逐渐打破稳定的平行状态,转变为编织层状.当嵌段比处于某特殊范围时,聚合物还形成了新颖的球-柱结构.研究结果可为制备稳定的新型材料提供理论方案. 相似文献