拟南芥TIR1与生长素IAA相互作用的分子对接及分子动力学研究

基于最新得到的拟南芥运输抑制剂响应蛋白质1(TIR1)与吲哚乙酸(IAA)复合物的晶体结构, 使用分子对接方法和分子动力学方法对TIR1与生长素IAA相互作用的方式进行了研究. 分子对接结果表明, 通过逐级考察辅酶InsP₆和中心水分子的影响, 发现辅酶InsP₆和中心水分子对生长素IAA正确结合到活性位点有重要作用. 分子动力学结果表明, 复合物体系在整个模拟过程中较为稳定, 2个水分子相继作为中心水分子与生长素IAA形成了稳定的氢键作用, IAA与活性位点处残基的相互作用与晶体结构相比略有差异.     

3-芳胺甲烯基-5,6-二氢-二氢吡喃-2,4-二酮类化合物催化氢化反应选择性的理论研究

用分子力学方法、AM1半经验方法以及从头算密度泛函B3LYP/6-311G^**方法研究了3-芳胺甲烯基-5,6-二氢-二氢吡喃-2,4-二酮类化合物在催化氢化反应中影响反应选择性的因素,结果表明,R基团对自由基中间物稳定性的影响决定了反应选择性.     

VRML在分子对称性教学中的应用

以椅式环己烷为例,介绍了如何应用分子模拟软件制作含有分子对称元素的VRML模型的过程。利用VRML的交互性可以帮助学生直观地掌握分子的三维结构以及对称元素的分布,切实提高了分子对称性的教学效果。     

ⅡB族金属离子-α-氨基酸-二酮肟配体三元体系稳定性研究

在（３５．０±０．１）℃，Ｉ＝０．１ｍｏｌ／ＬＫＮＯ３条件下，用ｐＨ法测定了３，３，９，９－四甲基－４，８－二氮杂十一烷－２，１０－二酮肟配体（ＰｎＡＯ）和α－氨基酸（ＡＡ）的质子化常数，Ｚｎ（Ⅱ）、Ｃｄ（Ⅱ）和Ｈｇ（Ⅱ）分别与ＰｎＡＯ和α－氨基酸二元体系的稳定常数以及Ｚｎ（Ⅱ）－、Ｃｄ（Ⅱ）－和Ｈｇ（Ⅱ）－ＰｎＡＯ－α－氨基酸三元体系的稳定常数．实验结果表明：在上述三元体系中均存在良好的直线自由能关系，并从三元配合物构型上讨论了存在线性关系的原因．发现标题体系的稳定性趋势为Ｚｎ（Ⅱ）＞Ｃｄ（Ⅱ）＜Ｈｇ（Ⅱ），并从金属离子的角度讨论了这种趋势的内在原因．     

几点提升结构化学模型实习课效果的举措

为提升结构化学模型实习课的效果,相继采取了建立虚拟模型实习网站,录制模型实习讲解视频以及改造模型实习课为讨论课等几项举措,切实克服了原来实习课所存在的问题,提升了学生在模型实习课中学习分子和晶体结构的效果。     

有机金属化合物中二级化学键的理论研究(V)——二级化学键生成的分子力学研究

用分子力学方法对一些金属汞化合物进行了探讨和研究.通过与参考体系对比以及内旋转势垒计算的方式，说明了在诸如cis-ClHgCHCHCl(Ⅰ)，0-C     

二元有机液体混合物热容与过剩热容的测定

溶液的热容及过剩热容是热力学的重要函数，对其测定与研究具有理论与实际意义．首先，热容是化工传热计算中的基础数据，过剩热容则可检验溶液中分子间的相互作用，并可利用其计算混合物的热容．本文报告了用法国Setaram公司生产的MS-80型Calvet微量热仪对环己酮-芳烃（苯、甲     

杯[4]二吡咯与卤素阴离子相互作用的密度泛函理论研究

采用密度泛函B3LYP方法, 在6\|31G*/LANL2DZ水平上对杯[4]二吡咯主体分子及其与卤素阴离子形成的复合物进行研究.  结果表明, 杯[4]二吡咯可与卤素阴离子相互作用形成具有较高对称性的复合物, 其8个吡咯NH基团上的H原子均可以和卤素阴离子形成氢键; 杯[4]二吡咯与卤素阴离子结合能力大小的顺序为F- >Cl- >Br- > I-.  振动光谱、 电荷分布以及前线轨道计算结果表明, 杯[4]二吡咯与卤素阴离子相互作用的本质为氢键, 经BSSE校正的结合能与电荷转移程度、 N-H键键长和N-H伸缩振动频率变化呈线性关系.      

ⅡB族金属离子-5-取代邻菲罗啉-二酮肟配体三元体系的 稳定性研究

在(35±0.1)℃,I=0.1mol·dm^-^3KNO~3条件下,用pH法测定了二酮肟配体PnAO,5-取代邻菲罗啉(5-Rphen,R=CH~3,H,Cl,NO~2)的质子化常数,Zn(Ⅱ),Cd(Ⅱ),Hg(Ⅱ)分别与PnAO和5-Rphen二元体系的稳定常数,以及Zn(Ⅱ),Cd(Ⅱ),Hg(Ⅱ)-PnAO-5-Rphen三元体系的稳定常数。实验结果表明,在上述二元、三元体系中均存在良好的直线自由能关系,并从三元配合物构型上讨论了存在线性关系的内在原因。同时,讨论了金属离子、取代基对配合物稳定性的影响。