代谢组学研究中样本间区分度的简易评判方法

在代谢组学现有数据分析方法的基础上,引入了多元统计分析方法中的多元t检验、类间距计算、组内离差平方和计算等统计方法。结合4个代谢组学研究实例,演示了新引入的统计方法的应用。结果表明:多元t检验可以解答应激组和对照组的代谢组水平之间是否存在"系统差别",类间距可以提供差别大小,组内离差平方和可以提供离散程度等信息。这些新信息的获取能对模式识别分析所得出的得分图(Scores plot)作进一步的解释,并为后续实验设计提供参考。     

细胞色素c甲硫氨酸氧化机制的NMR研究

细胞在呼吸作用中产生活性氧，活性氧含量处于低水平时有利于信号传导，累积过量时会引发蛋白质氧化修饰．细胞色素c是位于线粒体内的多功能金属蛋白，其发生氧化修饰特别是甲硫氨酸Met80的亚砜化修饰可能影响蛋白构象变化，但其机制仍不清楚．本研究通过13C选择性标记细胞色素c上甲硫氨酸的末端甲基，利用液体核磁共振技术，追踪了细胞色素c在氧化环境中的氧化修饰变化．发现在氧化环境中，该蛋白质先由还原态转化为氧化态，当活性氧达到一定量时，再发生甲硫氨酸Met80的亚砜化修饰，但在活性氧作用初期未导致明显的蛋白结构变化．这表明细胞色素c具有一定抵御活性氧的作用．