考虑极性基团相互作用影响的疏水常数计算方法

通过对点价的修正,将分子连接性指数转变成为一种量子拓扑指数。由于改进后的量子拓扑指数能够很好地表达分子的体积和电性等结构信息,因此该指数与疏水常数计算中的极性基团相互作用有很好的相关性。实际计算表明,对于含有极性基团的分子,用该指数计算的结果更加精确。     

Mulliken布居对键强度判断的经验修正

Ｍｕｌｌｉｋｅｎ布居是Ｍｕｌｌｉｋｅｎ[1]提出的表示电荷在各组成原子之间分布情况的方法 .Ｍｕｌｌｉｋｅｎ指出 ,成键原子Ａ和Ｂ间的总重叠电荷ｎ(Ａ ,Ｂ)反映Ａ和Ｂ原子间形成共价键的程度 ,若ｎ(Ａ ,Ｂ)很大 ,则Ａ和Ｂ原子间有共价键存在 ,若ｎ(Ａ ,Ｂ)很小 ,则表示Ａ和Ｂ原子间不存在化学键或离子键 .但是 ,Ｍｕｌｌｉｋｅｎ的方法也有一些严重的缺陷 ,使得Ｍｕｌｌｉｋｅｎ布居分析在某些情况下得到的数值不合理 ,影响了其应用 .为克服Ｍｕｌｌｉｋｅｎ布居的这些缺陷 ,有人提出将重叠区电荷在两原子间加权分配[2 ],Ｐｏｌｌａｋ等…     

丝裂霉素C与牛血清蛋白结合作用的研究

结合光谱法与微量热法研究了水溶液中丝裂霉素C与牛血清白蛋白分子间的结合反应,测定了反应的结合常数K~A,结合位点数n及热力学函数△~rG~m,△~rH~m和△~rS~m,并确定了分子间作用力性质;依据Forster非辐射能量转移机制,确定了授体-受体间的结合距离和能量转移效率;采用同步荧光技术考察了丝裂霉素C对牛血清白蛋白构象的影响。     

2,6-二巯基吡啶互变异构平衡体系溶剂效应的理论研究

在气相及甲苯、氯仿、乙腈和水等溶剂中对2,6-二巯基吡啶及其硫酮式互变异构体进行了HF/6-31G^**水平上的优化,其中溶液中的计算采用Onsager自洽反应场(SCRF)模型.探讨了溶剂对体系几何结构和能量的影响.结果表明:溶剂的存在与极性的增加有利于平衡体系中硫酮式异构体的存在.     

苝四羧酸二酰亚胺系有机光导材料的光敏性与结构的关系研究

用AM1和CNDO方法优化得PTCAs可能存在的稳定结构.对比晶体结构发现化合物3-5晶体中以成键能较高的共面结构存在,该结构有利于形成分子的紧密堆积.最小二乘法拟合结果表明单取代化合物的光敏性与分子激发跃迁能(△E_L-H)存在定量构效关系(QSPR),r＞0.95;双取代化合物的光敏性与从CGL到CTL的空穴注入效率(△E_T-G)存在QSPR,r＞0.97.表明光电转换两个过程在不同类型PTCAs的光敏性产生过程中占据的作用不同:分子激发难易是影响单取代化合物光敏性的主要因素;而空穴注入效率是影响双取代化合物光敏性的主要因素.     

基于分子表面静电势参数研究多环芳烃化合物的定量结构-性质关系

对一系列多环芳烃分子进行了HF/6-31G^*水平上的结构优化,在优化结构上进行了分子静电势及其导出参数的计算.运用多元线性回归方法对多环芳烃的沸点、色谱保留指数、水溶性、正辛醇/水分配系数、正辛醇/空气分配系数、土壤吸附性、亨利系数以及生物富集因子等理化性质与分子的结构参数进行了关联.结果表明:分子空间和表面最负的静电势(V_min和V_s,min)、分子表面正的静电势和负的静电势的求和(∑V_s⁺和∑V_s^-)、表面静电势的平衡参数(ν)加上分子的体积可以很好地用于表达多环芳烃分子理化性质与其分子结构间的定量关系.     

组胺H4受体配体的3D-QSAR模型分析

组胺H4受体配体对于治疗哮喘、肿瘤、风湿性关节炎和瘙痒症等疾病具有一定作用.本文对一系列组胺H4受体配体进行了基于VolSurf参数的QSAR建模分析,得到了较好的结果(r2=0.86,q2=0.64),训练集模型对预测集具有良好的预测能力.参数分析表明分子体积与其活性成反比.具有适当的亲水性和较大的局部疏水体积的分子活性较高,分子内亲水区和疏水区具有合适的体积比也很关键,并且亲水区中心距离疏水区中心越远,分子的活性越高.氢键给体与受体的量对活性也有影响.分子平均极化率越高,配体的活性越低.     

微量热法研究 [Cu(phen)2]2+、[Cu(bpy)2]2+与DNA的作用

用微量热法对菲咯啉合铜([Cu(phen)     

CDK4与靛玉红及其衍生物复合物结构的模建

细胞周期蛋白依赖性激酶(Cyclin-dependent Kinases, CDKs)是细胞周期调控的重要因子, 也是治疗癌症的一类重要的药物靶标. 靛玉红是传统中药当归龙荟丸中治疗慢性疾病的有效成分, 靛玉红及其衍生物5-磺酸基-靛玉红对CDKs具有有效的抑制作用. 以获得晶体结构的CDK2与5-磺酸根-靛玉红的复合物为模板, 通过同源模建和分子对接的方法构建出的CDK4与靛玉红及其衍生物的结合模式. 结合CDK4与两种抑制剂的复合物结构, 解释了靛玉红和衍生物5-磺酸基-靛玉红之间抑制活性的差别, 同时也分析了5-磺酸基-靛玉红对CDK2和CDK4不同选择性的原因. 所建CDK4结构为进一步进行基于结构的抗癌药物设计提供了合理的模型.     

取代嘧啶化合物的合成和生物活性研究

合成了14个新型取代嘧啶类化合物,结构经质谱、红外光谱、氢核磁共振光谱和元素分析确证.杀虫、杀菌和除草活性测定结果表明,部分化合物具有良好的杀菌活性.在嘧啶环的2-位上导入二甲氨基时表现出杀菌活性,但在嘧啶环的5-位上有甲基取代基时,杀菌活性下降.在嘧啶的4-位导入苯氧基时,显示出良好的杀菌活性,如化合物3b,3c和3e,苯环上的最优取代基是2-硝基-4-三氟甲基.