Molecular Dynamics Investigation of Differences in Melting Behaviors of Cu57 and Cu58 Clusters

应用基于嵌入原子方法的分子动力学计算研究了Cu57和Cu58团簇在升温过程中变为熔体的结构演化过程．两个团簇在熔化时表现出不同的结构变化行为,进而影响到它们能量变化的差异．在升温时,团簇不同区域的原子局域结构变化由原子密度分布函数确定．模拟表明,即使对于这两个仅相差一个原子的小尺寸团簇,结构变化也敏感于团簇的尺寸．     

Molecular Dynamics Simulation of Temperature-dependent Flexibility of Thermophilic Xylose Isomerase

构建了嗜热栖热菌木糖异构酶与底物木糖的复合物模型,并运用NAMD2.5软件对其在300 和360 K下进行了10 ns的分子动力学模拟. 对该酶的回旋半径、亚基间相互作用及残基柔性进行了计算与统计分析,确定了该酶在360 K时柔性残基及区域. 研究发现与300 K相比,360 K时木糖异构酶中B-因子增幅较大的残基主要可分为两组：一组位于催化结构域,是由残基55～80组成的helex-loop-helix区域,另一组位于其亚基界面上. 研究表明高温下该酶催化结构域回旋半径增加,可能加速了活性中心的运动从而有利于D-木糖的异构化反应.在360 K时亚基界面上减少了8个氢键和5个离子对,这可能也是高温下其整体结构刚性下降并且活性升高的主要原因,该结果也对文献报道的该酶E372G突变体冷适应的实验现象进行了解释. 研究结果揭示了嗜热栖热菌木糖异构酶温度和结构柔性之间的关系.     

Cavity Ring Down Laser Absorption Spectroscopy of NiI

用激光蒸发/反应、超声射流和光腔衰荡吸收光谱方法研究NiI在445～510 nm的吸收光谱. 发现两个新的跃迁体系[21.3]²?_5/2～X²?_5/2和[21.9]²Π_3/2～X²?_5/2,并且观察到了同位素分子⁵⁸NiI和⁶⁰NiI光谱. 同时计算得到了电子态[21.3]^{2相似文献}   

Nonlinear blood oxygen level-dependent responses for transient activations and deactivations in V1 - insights into the hemodynamic response function with the balloon model

We report studies of the nonlinear nature of blood oxygen level-dependent (BOLD) responses to short transient deactivations in human visual cortex. Both functional magnetic resonance imaging (fMRI) and near-infrared spectroscopy (NIRS) have been used to compare and contrast the hemodynamic response functions (HRFs) associated with transient activation and deactivation in primary visual cortex. We show that signal decreases for short duration deactivations are smaller than corresponding signal increases in activation studies. Moreover, the standard balloon model of BOLD effects may be modified to account for the observed nonlinear nature of deactivations by appropriate changes to simple hemodynamic parameters without recourse to new assumptions about the nature of the coupling between activity and oxygen use.     

基于FPGA的PLC并行执行定时器/计数器的设计

针对ARM+FPGA构建的PLC系统,分析PLC对定时器/计数器的功能需求,设计了可以并行执行的定时器/计数器,构建的定时器/计数器共用一个端口读写控制器与FPGA中央控制器进行数据通信,定时器/计数器内部工作是相互独立的,能够并行的工作,并通过使用地址映射存储器使得定时器/计数器的指令执行更加高效。对中央控制器与定时器/计数器的通信时序和通信格式进行了设计,方便了中央控制器对定时器/计数器的控制与测试。通过仿真测试,该定时器/计数器能够满足PLC定时器/计数器的基本功能,并且达到了稳定的定时/计数的设计要求。     

拉曼除谱原位测量水溶液中蛋白质的酰胺A谱带

蛋白质的酰胺A谱带对蛋白质的酰胺氢键结构很敏感. 然而由于该谱带和水的OH伸缩振动谱带严重重叠,导致在蛋白质水溶液中原位测量酰胺A谱带依旧很困难. 我们提出了一种新的分析方法用于原位测量水溶液中的酰胺A谱带. 这个方法称为拉曼除谱法. 将蛋白质水溶液光谱除以纯水光谱即可获得拉曼除谱. 利用数值模拟从数学上肯定了使用拉曼除谱可以直接获得酰胺A谱带. 我们还通过测量溶菌酶和α-糜蛋白酶的固体和水溶液的拉曼光谱,这些光谱也证实了可以通过拉曼除谱法直接获取酰胺A谱带. 利用拉曼除谱还分析了溶菌酶的热变性过程. 这些研究表明拉曼除谱可以原位地表征水溶液中的蛋白质酰胺A谱带.     

颗粒堆的体积分数与制备流量关系的实验研究

通过实验研究发现,颗粒堆的体积分数随制备颗粒堆的颗粒流流量指数衰减,减小或增加流量到一定程度时,体积分数都达到饱和;出料口直径与颗粒粒径的比值小到一临界值时,随着流量的减小体积分数增加急剧变缓;颗粒粒径小到一临界值时,随着流量的增加,体积分数的减小急剧变缓.结合颗粒物质的强耗散性、空气作用、瓶颈效应和碰撞理论解释了实验现象,从连续性原理出发推出的颗粒堆体积分数随制备流量变化的函数与实验数据的拟合公式相同.     

Friction phenomena in a two-dimensional Frenkel-Kontorova model

By using the molecular dynamic simulation method with a fourth-order Runge--Kutta algorithm, a two-dimensional dc- and ac-driven Frenkel--Kontorova (FK) model with a square symmetry substrate potential for a square lattice layer has been investigated in this paper. For this system, the effects of many different parameters on the average velocity and the static friction force have been studied. It is found that not only the amplitude and frequency of ac-driven force, but also the direction of the external driving force and the misfit angle between two layers have some strong influences on the static friction force. It can be concluded that the superlubricity phenomenon appears easily with a larger ac amplitude and lower ac frequency for some special direction of the external force and misfit angle.     

基于高斯混合尺度模型的压缩传感图像重构

在图像处理领域中,压缩传感重构是稀疏表示下的最重要的病态反问题之一。压缩传感图像重构利用图像可稀疏表示的先验知识,从比奈奎斯特采样率低得多的随机投影观测值中重构原始图像。为了克服传统的压缩传感算法中收敛速度慢和未利用变换系数的邻域统计特性的缺点,提出了基于高斯混合尺度模型的压缩传感图像重构算法,证明了独立的高斯混合尺度分布作为压缩传感重构的稀疏先验知识的可行性,结合全变差调整进一步提高算法的性能。实验结果表明,该算法有效地提高了重构图像的主观视觉效果和峰值信噪比,加快了压缩传感图像重构算法的收敛速度。     

Detection system for singlet oxygen luminescence in photodynamic therapy

Singlet oxygen （^1O2） is widely considered to play a major role in photodynamic therapy （PDT）, and thus an increasing attention has been focused on the direct detection of ^1O2 near-infrared luminescence around 1270 nm for PDT dosimetry. A new sensitive detection system is developed to directly measure the temporal and spectral resolved ^1O2 luminescence spectra. The triplet state and ^1O2 lifetimes of Rose Bengal as a model photosensitizer in different solvents are determined, and the obtained results agree well with the published data. Our detection system has the potential application in ^1O2 luminescence-based PDT dosimetry.