胭脂红酸褪色光度法检测H2O2-Fe2+产生的羟自由基

提出了Fe2 H2O2 胭脂红酸分析新体系,并用于羟自由基的测定。该法用Fenton反应产生羟自由基,并加入胭脂红酸显色剂,使胭脂红酸褪色,采用分光光度计测定其ΔA值的变化,可间接测定羟自由基的产生量。通过测定条件的研究,得出最佳实验条件,并对抗坏血酸等7种抗氧化剂的抗羟自由基氧化性能进行了比较。     

Tobramycin与16S rRNA A位点复合物的分子动力学模拟

采用分子动力学方法(Molecular dynamics, MD)对托普霉素(Tobramycin)与16S rRNA的A位点复合物的特异性识别机制进行了理论模拟研究, 模拟时间为3.6 ns. 结果表明, A位点中波动最大的部位是两个环外碱基A1492和A1493; tobramycin的环Ⅰ和环Ⅱ是其最保守的结构单元, 可能参与了Tobramycin与16S rRNA的A位点之间的特异性识别. 另外, 发现一个残存时间为3.6 ns的“结构化”水分子, 它桥接了Tobramycin环Ⅱ的N3与环Ⅰ的N6'之间的氢键, 稳定了Tobramycin的结构; Tobramycin周围水合密度较高的位点出现在环Ⅰ和环Ⅱ附近, 这也正是晶体结构中形成较多水媒介氢键及动力学模拟中结构化水分子出现的位置. 动力学模拟证实Tobramycin与16S rRNA间的结合是大量氢键及水分子相互作用的结果, 这有助于设计和开发以Tobramycin为基础, 具有高亲和力及特异性的16S rRNA抑制剂.