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各种体外实验技术被广泛地用来研究DNA-蛋白质之间的相互作用, 但体外和体内实验一个最明显的区别是实验使用的DNA片段远远短于基因组DNA, 因而多出了大量线性DNA分子末端. 末端问题曾倍受关注, 若干研究小组在不同系统中对其进行了研究, 但结果却并不一致, 甚至完全相反. 本文利用表面等离子共振技术(SPR)对一系列不同长度非特异DNA和Mnt阻遏蛋白结合和解离过程进行实时监测, 结果表明该蛋白在线性DNA分子末端有比内部位点更高的解离速率. 通过考察在不同位点含有特异序列的DNA与Mnt阻遏蛋白的结合过程, 发现线性DNA分子末端在一定距离内会直接影响DNA与该蛋白的特异性结合. 相似文献
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原子电荷在深入理解和模拟蛋白质的化学行为中发挥了重要的作用。通过校正电负性均衡方法(EEM)可快速计算大分子中原子电荷的分布情况。为进一步提高电负性均衡方法的准确性,本文根据Bader提出的分子区域片段中原子电荷高度转移理论,提出了一种校正电负性均衡理论的新方法,专门用于快速、准确计算生物大分子多肽或蛋白质中分子中原子电荷(AIM)。在EEM参数优化过程中,本方法不仅包括了不同原子间的连接性和价键的杂化属性,还考虑了分子片段或基团的区域化学环境因素对校正的影响。本研究对变量优化方法进行了深入讨论,微分进化算法被证明对目标函数有较好地表现。本方法计算的AIM电荷,与密度泛函理论的计算结果进行了比较。结果表明,与原来的EEM模型相比较,本方法计算的AIM电荷的精确度得到了大幅提高,为具有重复分子片段或基团的生物大分子体系(如多肽或蛋白质等)的原子电荷的快速计算提供了一种更为准确的方法,同时也为EEM的校正提供了一种新的思路。 相似文献
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本文分别用微波辅助提取、超声助提取、冷凝回流提取、室温冷浸提取4种方法提取杜仲叶中的绿原酸,并将4种提取方法进行比较,用反相高效液相色谱法检测其含量。实验采用日本岛津C18(15 mm×4.6 mm,5μm)色谱柱,V(甲醇)∶V(水)∶V(冰醋酸)=60∶40∶0.3为流动相,流速为0.8 mL/min,紫外检测波长为332 nm,进样体积为10μL。实验结果表明:绿原酸在4.07×10-4~2.22μg范围内线性关系良好,回收率为103.22%(RSD=1.28%)。本法具有良好的精密度、重现性,结果准确可靠,可作为杜仲药材及绿原酸类产品的质量控制方法。 相似文献
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建立了木质素氧化降解产物中单酚类产物的超高效液相色谱/高分辨质谱联用(UPLC/HRMS)检测方法。采用反相C18色谱柱,柱温30℃,0.1%(V/V)甲酸溶液-10%(V/V)甲醇乙腈溶液为流动相二元梯度洗脱,流速为0.2 mL/min,280 nm波长下紫外检测,可实现木质素氧化降解获得的9种单酚类化合物的有效分离,结合电喷雾离子源超高分辨飞行时间质谱(ESI-Q-TOF)正离子模式进行检测,对单酚类降解产物进行准确定性分析;通过高分辨质谱精确离子流抽提,面积外标法定量分析。本方法的线性范围为5.0~10000μg/L,线性相关系数大于0.9998,相对标准偏差(RSD)小于1.7%,检出限(LOD)和定量限(LOQ)分别为0.1~0.3μg/L和0.3~0.5μg/L,平均加标回收率为98.9%~105.1%。结果表明,酸性流动相体系下的正离子模式进行单酚类产物的质谱分析,具有较好的色谱分离效果和较高灵敏度。 相似文献
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Equilibrium dialysis of metal-serum albumin (Ⅱ)——Allosteric effect in Ni(Ⅱ)-serum albumin systems 总被引:1,自引:0,他引:1
Detailed studies were carried out on equilibrium dialysis of the binding of Ni2++ ion to human scrum albumin (HSA) and bovine serum albumin (BSA).The successive stability constants were obtained by the Icfisi squares fitting.The eight binding sites found for both Ni(Ⅱ)-HSA and Ni(Ⅱ)-BSA systems can be divided into two different sets; and for both systems,there exist two identical prior binding sites where the bound Ni2+ ions can he con sidered as allosteric effectors,which induce the allosteric effect in accordance with the model proposed by Moeod et al As indicated by allosteric parameters,the ability of R-state to bind Ni2+ ions is ca 100 times as much as that of T state,and the conformation of HSA is markedly tenser than that of BSA. 相似文献