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蛋白质的动态特性和结构活性对于蛋白质功能的调控具有根本意义。传统的结构确定方法(包括X射线和电子显微镜单颗粒分析技术等)往往需要成千上万不同蛋白质分子的平均信号,因此难以确定蛋白质分子的动态结构。而电子显微断层成像技术是一种对独个生物个体结构从不同的观测角度照相、并计算来恢复该个体的三维结构密度图的方法。传统的冷冻电子断层成像重构方法采用整个大尺寸电镜图像进行重构计算,通常用来研究细菌、细胞切片等大尺寸生物个体在较低分辨率下的结构;由于分辨率的限制,不足以获得小尺寸的蛋白质分子的结构细节。最近,任罡研究小组提出一种独个生物颗粒的电子显微断层成像方法(individual-particle electron tomography,IPET)。该方法通过减小图像尺寸(直至所选区域只包含单个蛋白质分子)的策略,运用提出的FETR(focused electron tomography reconstruction)算法来提高独个大分子重构的分辨率。此方法不需要初始模型和大量分子的平均信号,同时能够容忍一定的测角误差。本文综述了IPET/FETR方法在确定独个分子结构过程中的具体步骤以及如何应用该方法来研究蛋白动态特性和结构变化特征。期望通过该综述和国内同行交流,分享最新的前沿研究,为赶超世界科技前沿的建设添砖加瓦。 相似文献
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水分子通道蛋白的结构与功能 总被引:10,自引:0,他引:10
水分子穿越双磷脂生物膜的输运机理是生理学和细胞生物学中一个长期未能解决的重要问题.AQP1水通道蛋白的发现和鉴定使得人们确认出一个新的蛋白质家族--水通道蛋白家族.正是这一蛋白家族的存在,使得水分子可以进行快速的跨膜传输.由晶体学方法解出的哺乳动物AQP1水通道蛋白的原子结构,最终揭示了水通道蛋白只允许水分子快速传输而阻挡其他的小分子和离子(包括质子H+)的筛选输运机理.本文概述了水通道蛋白的发现和其对水分子的筛选传输机理. 相似文献
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人体胆固醇酯转移蛋白(CETP)会造成胆固醇酯从高密度脂蛋白(HDL)向低密度脂蛋白(LDL)或极低密度脂蛋白(VLDL)的转移,从而增加人体患心血管疾病的危险性。了解CETP在胆固醇酯转移过程中的作用和机理,是研发新的CETP抑制剂药物以预防和治疗心血管疾病的重要基础和关键步骤。本文综述了CETP结构与功能领域研究的最新进展,详细介绍了CETP与各类脂蛋白绑定结构的高分辨透射电子显微镜研究;并结合对CETP晶体结构的分析,以及生理溶液中CETP结构与动态特征、CETP与脂滴间相互作用的分子动力学模拟研究结果,阐述并讨论了CETP脂转移机理的“通道”模型;最后对尚待解决的关键问题与未来的研究方向进行了展望,以期促进CETP功能机理的研究和抑制药物的研制。 相似文献
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