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蛋白质与小分子结合的研究中,处理单位点结合模型的经典方法在计算解离平衡常数(Kd,Ki)时有缺点;文中推导的两个公式拟解决这个问题.公式直接使用受体总浓度([R]t)、配体总浓度([L]t)和探针分子总浓度([P]t),其适用性不受受体浓度、受体被探针饱和的程度,以及配体活性高低等因素的影响.基于这两个公式使用非线性拟合方法,可以从结合实验求得探针分子的Kd,从竞争实验求得配体的Ki.以CPA为荧光探针,运用推导的公式,则测定了PPARγ和一些配体结合的Ki,并首次报道了PPARγ-LY171883的Ki. 相似文献
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溶剂效应量子化学研究进展 总被引:9,自引:0,他引:9
本文就近年来溶剂效应的量子化学研究状况了综述。介绍了溶剂效应量子化学计算的两种方法-自洽反应场(SCRF)理论计算法和量子力学、分子力学结合模型(QM-MM模型)计算法以及它们的应用,并提出了溶剂效应理论研究今后可能发展的方向。 相似文献
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化学库及分子差异性设计研究进展 总被引:2,自引:0,他引:2
组合化学是近年来发展起来的一种快速合成和平行筛选群体化合物的新方法。它可以用来设计先导化合物,也可以对药物分子进行结构改造。本文主要综述了化学库的合成以及计算机辅助组合化学的研究进展。 相似文献
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运用abinitioHartree-Fock从头算,微扰MP2和密度泛函B3LYP方法在不同的基组水平上对碱金属阳离子-苯复合物体系的可能构型进行了自由优化,得到了复合物的能量最低构型为碱金属阳离子位于苯环平面的正上方,频率计算结果表明该结构为稳定结构.复合物的键长、原子净电荷、分子轨道、前沿轨道能量、Mullicken键级等都表明,碱金属阳离子和苯环碳原子之间的作用包含p-π作用方式,碱金属阳离子与苯结合时电子从苯环向碱金属阳离子转移,形成电荷转移复合物.它们之间的结合方式和氢键的结合方式相似,但计算得到的热力学参数表明复合物中碱金属阳离子与苯之间的结合强度远远大于典型的氢键,尤其是锂离子-苯复合物的生成焓已和普通的化学键相当.复合物的红外特征振动频率位于200^-^1附近,对应于碱金属阳离子垂直于苯环平面的来回振动,同时形成复合物后,原来位于3200cm^-^1的苯的C--H振动红外活性消失。 相似文献
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荧光光谱在蛋白质分子构象研究中的应用 《化学进展》2001,13(3):182
荧光光谱在蛋白质分子构象研究中的应用(杨家祥 张元慧 陈真龙 刘清亮) 基质金属蛋白酶抑制剂设计的研究进展(成峰 柳红 罗小民 蒋华良 沈竞康 陈凯先) 渗透汽化分离芳烃/烷烃混合体系的研究进展(杨立明 徐利文 郭勇) 光敏异构化智能生物开关的研究(原义光 庄云龙) 液相组合化学研究进展(肖远胜 万伯顺 梁鑫淼) 可逆热色性化合物的研究进展(朱传方 徐汉红) 强化气流两相传质的研究进展(成弘 周明 余国琮) 超临界CO2流体萃取重金属的研究进展(文震 党志 余德顺) 噪声在非线性体系中的作用研究现状(张季谦 朱振明 辛厚文) 反铁电性液晶化合物研究现状(范星河 周其凤) 置换色谱及其在生物分子分离纯化中的研究进展(祁彦 黄骏雄) 相似文献
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