N—亚硝基化合物的结构／致癌活性的三维构效关系研究

用比较力场分析研究了Ｎ－亚硝基化合物的结构与致癌活性的关系，考察了网络结构和探针原子对结果的影响。结果表明，立体效应和静电作用场是描述其致癌活性和进行结构性能关系研究的最重要的结构参数。     

芳胺结构致癌活性关系的双区理论定量阐释

本文将双区理论定量地推广到63种芳胺的定量结构致癌活性关系上,借氨基亚氮阳离子与环上环氧化物的双官能烷化作用的观点,建立了芳胺结构与致癌性能间的定量关系式,计算与实验的一致达98％。从而将芳胺类难以捉摸的致癌性能变化,表达为可以理解的结构化学活性关系。     

N-亚硝基化合物结构-致癌活性的相关性研究

Ｎ－亚硝基化合物结构－致癌活性的相关性研究许禄,姚瑜元（中国科学院长春应用化学研究所应用谱学开放实验室,长春,１３００２２）关键词Ｎ－亚硝基化合物,半经验量化方法,构效关系目前已发现的Ｎ－亚硝基化合物约３００种中多数具有致癌活性。化学家和生物学家对该...     

N－亚硝基化合物的结构／致癌活性的三维构效关系研究

用比较力场分析研究了Ｎ－亚硝基化合物的结构与致癌活性的关系，考察了网络结构和探针原子对结果的影响．结果表明，立体效应和静电作用场是描述其致癌活性和进行结构性能关系研究的最重要的结构参数。     

3,5-二甲基-亚硝基哌嗪代谢物对DNA烷化作用的理论研究

用从头计算法在MP2/6-311＋G(d,p)水平上对3,5-二甲基-亚硝基哌嗪(DMNP)及其类似物经代谢生成DNA烷化剂的机理进行了研究. 探讨了N’原子上取代基的变化对DMNP代谢物生成α-位和γ-位两个烷化中心的影响, 解释了两个烷化中心的生成活性与化合物的致癌性之间的关系. 结果表明, α-位和γ-位代谢物越容易生成活泼亲电中间体, 其母体化合物的致癌活性越高. 但如果有一个烷化中心丧失活性, 就会明显减弱化合物的致癌活性. 因此, DMNP类化合物的致癌性取决于其α-位和γ-位的协同烷化作用, 在评价DMNP的致癌强度时需同时考虑两个烷化中心的烷化能力以及二者之间的关系.     

β-甲基亚硝基哌嗪致癌剂第二亲电中心邻基参与作用的理论研究

用从头计算Hartree-Fork方法和密度泛函B3LYP方法在6-311G(d)水平上对β-甲基亚硝基哌嗪类化合物代谢活化后的邻基参与作用机理进行了研究. 计算结果表明, 哌嗪环上N'原子和N'-取代基上氧原子的邻基参与作用明显提高了β-甲基亚硝基哌嗪代谢物的亲电反应活性, 促进了对DNA的烷化作用. 解释了甲基取代的N-亚硝基哌嗪较其母体化合物的致癌性具有显著增强的现象, 为N-亚硝基哌嗪在其γ-位形成第二亲电活性中心的致癌代谢途径提供了理论依据.     

醇类化合物热值改进剂的定量结构-性质关系研究

醇类化合物燃料作为一种新型的可再生清洁能源,目前是代替燃油及煤的优良环保型燃料.本文计算表征了醇类化合物热值改进剂的4个分子连接性指数和5个量子化学参数,用多元线性回归方法对参数进行了优化筛选,获得了醇类化合物热值改进剂的定量结构与热值性质的关系模型,其相关系数R为0.961.计算结果表明:与醇类化合物热值改进剂的热值显著相关的变量是最低空轨道能量ELUMO、最低空轨道能量与最高占有轨道能量差△E、总能量ET,预测值与相应的实验值较好吻合,所建模型具有良好稳定性和预测能力,与分子连接性指数等的相关程度较好.     

肉桂中醛、酸类化合物结构与抗菌活性的关系

本文对肉桂醛、酸及其衍生物的抑菌效果进行了测定，对其量子化学参数进行了计算，并对这类化合物抗菌活性和分子化学结构之间的关系进行了相关分析。结果表明，该类化合物抑菌率EFPO、ELUMO和EHOMO的相关系数分别为一0．7814（p＜0．05）、－0．7328（0．05＜ρ＜0．1）和0．6318（ρ＞0．1）。该类化合物的抗菌活性中心原子可能是羰基氧、α-碳、β-碳，由这些原子组成的不饱和羰基共轭体系可能是抗菌剂的活性功能域．     

黄酮类化合物抑制MMP-9的定量结构-活性关系和结构修饰的理论研究

运用密度泛函理论(DFT)和线性回归分析等方法研究了黄酮类化合物抑制MMP-9的定量结构-活性关系(QSAR)和结构修饰. 研究发现, 黄酮类化合物抑制MMP-9的实验生物活性数据－lg EC₅₀值与计算获得的黄酮类化合物的最低空分子轨道能量及分子水合能之间均存在着良好的线性关系|留一法交叉验证结果表明, 所建立的两个相应的QSAR模型都具有良好的稳定性和预测能力. 进一步研究发现, 在黄酮类化合物分子的A环、B环和C环上的合适部位选用供电子能力较强、能降低分子水合能的取代基团对其进行结构修饰, 有利于提高修饰后的分子抑制MMP-9的生物活性. 根据对木犀草素(Luteolin)分子进行结构修饰的结果(共33种化合物), 我们提出了黄酮类化合物抑制MMP-9可能的作用机理, 并设计出8种经结构修饰后生物活性有显著提高的MMP-9抑制剂, 希望将来得到实验的证实.     

蛋白质的电子结构与活性关系——理论与计算方法

随着生物工程的发展,要求对蛋白质的电子结构与活性关系进行研究。而不加分割地对蛋白质作完整分子的量子化学计算,至今尚未见报导。其原因在于,未能找到合适的数值计算方法。本文报导了这方面的研究成果。假设一个蛋白质由N个氨基酸残基构成,其中有L对硫-硫键,每一个氨基酸残基有m_n个单元轨道,则整个蛋白质分子的分子轨道可以写成这些单元轨道的线性组合:     

多环芳香硫化合物的定量结构-气相色谱保留指数关系

应用分子电性距离矢量(MEDV)对114个多环芳香硫化合物(PASHs)进行结构表征,通过多元线性回归建立了PASHs的气相色谱保留指数与MEDV参数之间的定量结构-保留值关系模型;同时采用逐步回归分析进行变量筛选,继而以留一法交互检验对所得优化模型进行预测能力评价,所建立的模型的相关系数为0.9947,交互检验相关系数为0.9940,表明该优化模型具有良好的稳定性和预测能力。此外,通过将样本集按2:1分成校准集和测试集预测,统计分析结果显示所建的模型具有良好的相关性和稳定性。本文所建的定量结构-保留值关系(QSRR)模型为预测PASHs的气相色谱保留指数提供了一个便捷有效的新方法。     

应用量化参数和拓扑指数研究吡喃酮类化合物结构与活性的相关性

QSAR;量子化学参数;应用量化参数和拓扑指数研究吡喃酮类化合物结构与活性的相关性     

基于启发式变量筛选方法研究与雌激素β受体结合的化合物结构与活性之间的关系

雌激素类化合物由于其对人和野生动物健康的负面影响而受到广泛关注.雌激素受体存在两种亚型(ERα和ERβ),化合物与两种受体亚型在结合活性和化合物结构特征方面存在差异.以31种与雌激素β受体亚型(ERβ)结合的化合物为研究对象,采用启发式变量筛选方法,从1524个变量中筛选出5个与化合物活性(lgRBA)最相关的变量,然后采用多元线性回归(MLR)建立最佳预测模型.模型相关性显著,而且具有良好的稳健性和预测能力(r2=0.829,q2LOO=0.742,r2pred=0.772,q2ext=0.724,RMSEE=0.395).同时揭示了影响化合物与ERβ受体结合的配体化合物分子的结构特征,并对模型的应用域进行了研究.     

4, 4', 6, 6'-四叔丁基-2, 2'-[乙二氧双(氮次甲基)]二酚铜(Ⅱ)化合物的合成、结构及抑菌活性

在室温、无水乙醇溶剂中, H₂L(H₂L=4, 4', 6, 6'-四叔丁基-2, 2'-[乙二氧双(氮次甲基)]二酚)与一水合醋酸铜反应得到了一种新的铜(Ⅱ)化合物C₃₂H₄₆CuN₂O₄([CuL]), 并通过红外光谱、元素分析及X射线单晶衍射等技术手段对[CuL]进行了表征。 [CuL]的结构解析表明, 属单斜晶系, 空间群C2/c, 晶胞参数为a=2.7231(3) nm, b=1.1196(3) nm, c=1.0704(2) nm, α=90.00°, β=101.293(2)°, γ=90.00°, V=3.2002(11) nm³, Z=4, M_r=586.25, D_c=1.217 g/cm³, μ=0.718 mm^-1, F(000)=1252, R₁=0.0957, wR₂=0.2297。 [CuL]的对称单元中含有1个Cu(Ⅱ)原子和1个配位L分子组成, 中心Cu(Ⅱ)的配位数为4, 分别与来自L单元上的N1、N1#、O2、O2# 4个原子进行配位, 以金属离子为中心形成了稍微扭曲四面体结构的配位几何构型。 对金黄色葡萄球菌、大肠杆菌和枯草杆菌的抑菌活性实验表明, [CuL]对3种菌均有显著的抑制作用, 其抑菌活性较配体L更强。     

1,4,2-二氮磷杂环戊-5-(硫)酮类化合物除草活性的构效关系研究

利用与自由能有关的取代基的物理化学参数,考察了1,4,2－二氮磷杂环戊－5－(硫)酮类化合物对除草活性的相关性.根据Hansch方程及多元回归分析,进行了结构与活性定量关系的研究,建立了较好的结构与活性相关式,预测出化合物的活性并得到实验证实.     

含天然苯乙烯结构的4-甲基-1,2,4-三唑-硫醚化合物的合成、除草活性及三维定量构效关系(3D-QSAR)研究

为了寻找以天然可再生资源为基础的除草剂,设计并合成了 26个新型含天然苯乙烯结构的4-甲基-1,2,4-三唑-硫醚类化合物,并通过FTIR,1H NMR,13C NMR,ESI-MS和元素分析等方法对其结构进行了确认.初步的除草活性测试表明,在质量浓度为100μg/mL时,大多数目标化合物对油菜胚根生长表现出良好的抑制...     

3-取代硫基-5-(2-羟基苯基)-4H-1,2,4-三唑类化合物抑菌活性的定量构效关系和结构修饰的理论研究

用DFT-B3LYP 方法, 在基组6-31G 水平, 对24 种3-取代硫基-5-(2-羟基苯基)-4H-1,2,4-三唑类化合物分子进行几何优化, 并计算了E_HOMO, E_LUMO, E_NHOMO, E_NLUMO, Q_C1～Q_C8, Q_N1～Q_N3, Q_O, Q_S和ΔE₁, ΔE₂, ΣQ 等量子化学描述符(q_c). 通过最佳变量子集回归建立13 种上述化合物对大肠杆菌、白色念珠菌、金黄色葡萄球菌等抑菌活性(A_J: A_e, A_m 和A_s) 的QSAR 模型. 对于大肠杆菌的A_e 模型的相关系数(R²)和逐一剔除法交叉验证系数R_cv² 依次为0.930 和0.871, 相应白色念珠菌A_m 模型为0.926 和0.869, A_s 模型为0.781 和0.572. 通过R_adj², F, R_cv², VIF, AIC, FIT 等检验, 上述模型具有令人满意的稳健性和预测能力. 结果显示ΔE₁ 和ΣQ 直接影响这些化合物的生物活性: ΣQ 增大, 其抑菌活性增强; ΔE₁ 越高, A_J 下降. 据此提出三唑类化合物分子可能的抑菌机理. 由此发现, 在三唑类化合物分子的R 中合适部位选用吸电子能力较强的取代基团进行结构修饰, 有利于提高被修饰后分子的抑菌活性. 根据对R 进行结构修饰(共提出11 种化合物), 得出4 种抑菌活性均超出100%的三唑类化合物(质量分数为0.01%), 希望将来得到生物实验的证实.