云南南部5种魔芋属植物居群遗传结构的ISSR分析

采用9个ISSR(inter-simple sequence repeat)分子标记对云南南部魔芋属植物5个物种(花魔芋,疣柄魔芋,攸乐魔芋,勐海魔芋和屏边魔芋)105份材料进行了居群遗传多样性分析.通过PCR扩增,9个ISSR引物从5个物种105份样品中共获得95条条带,其中多态性条带占条带总数的100%.每个位点平均等位基因数2.00,有效等位基因数1.40,平均Nei’s基因多样性指数0.255 2,Shannon’s信息多样性指数为0.401 2.在这5个魔芋属植物物种中,花魔芋居群内遗传多样性水平相对较低.居群水平上的UPGMA聚类表明这5个物种可被分为明显的两大组,花魔芋为一组,其余4种构成一组,其中屏边魔芋与疣柄魔芋遗传距离最近.个体水平上的聚类则显示,花魔芋和疣柄魔芋的个体各自聚在一起,其余3种的个体较为分散.本研究结果还认为人工栽培利用的方式对魔芋属植物遗传多样性可能存在一定影响.     

大花无柱兰遗传多样性的SRAP标记分析

大花无柱兰是一种珍稀兰科植物,具有一定的观赏和药用价值,但数量十分稀少,该物种亟待保护。本研究采用SRAP分子标记技术,对10个居群的115份DNA样品进行PCR扩增,并开展遗传多样性分析。从81对引物中筛选出9个条带清晰、多态性好、重复性高的引物组合,共扩增得到305条谱带。在物种水平上,多态性比率（PPB）为100%,Nei’s基因多样性指数（H）为0.209 8,Shannon’s指数（I）为0.340 2;在居群水平上,PPB为24.59%～52.13%,H为0.079 6～0.165 5,I为0.120 9～0.252 3。居群水平上,基因分化度（Gst）为0.520 9,基因流（Nm）为0.459 9,遗传距离为0.091 9～0.198 4。UPGMA聚类结果表明,10个居群可分为3大类,地理距离相近的居群优先聚集。大花无柱兰的遗传多样性较为丰富,居群间存在一定的遗传分化和基因交流,可采用就地保护和人工栽培等方式加以保护。     

大花无柱兰遗传多样性的SRAP标记分析

大花无柱兰是一种珍稀兰科植物,具有一定的观赏和药用价值,但数量十分稀少,该物种亟待保护。本研究采用SRAP分子标记技术,对10个居群的115份DNA样品进行PCR扩增,并开展遗传多样性分析。从81对引物中筛选出9个条带清晰、多态性好、重复性高的引物组合,共扩增得到305条谱带。在物种水平上,多态性比率（PPB）为100%,Nei’s基因多样性指数（H）为0.209 8,Shannon’s指数（I）为0.340 2;在居群水平上,PPB为24.59%～52.13%,H为0.079 6～0.165 5,I为0.120 9～0.252 3。居群水平上,基因分化度（Gst）为0.520 9,基因流（Nm）为0.459 9,遗传距离为0.091 9～0.198 4。UPGMA聚类结果表明,10个居群可分为3大类,地理距离相近的居群优先聚集。大花无柱兰的遗传多样性较为丰富,居群间存在一定的遗传分化和基因交流,可采用就地保护和人工栽培等方式加以保护。     

湖北大麦品种资源的RAPD分析

在对105份湖北栽培大麦酯酶同工酶研究的基础上,采用RAPD技术对分属于8种酶谱类型的10份湖北栽培大麦品种进行了研究.63个随机引物中有12个引物产生稳定多态性的带,共扩增出73条带,其中46条表现出多态性.将每一条带视为一个独立的性状,按其有无列出二元数据矩阵,计算Nei氏相似性系数(S)和遗传距离(D),列出遗传距离矩阵,采用PHYLIP3.5c软件包进行聚类.讨论了RAPD的稳定性以及RAPD标记与同工酶标记的异同.     

利用SRAP和ISSR标记分析五节芒(Miscanthus floridulus)的遗传多样性

对41个来自于梁子岛上4个居群的五节芒(Miscanthus floridulus)进行相关序列扩增多态性(se-quence-related amplified polymorphism,SRAP)和简单重复序列区间标记(inter simple sequence repeat,ISSR)分析.利用POPGENE32version1.32软件计算多样性指数,采用NTSYS.2.10e计算软件,得到相似性系数,并用UPG-MA法进行聚类分析.结果显示6条ISSR多态性引物,共扩增出103条DNA条带,其中98条为多态性条带,占95.15%,样品之间的相似系数为0.67～0.95.6对SRAP引物,共扩增出173条DNA条带,其中147条为多态性条带,占84.97%,样品之间的相似系数为0.75～1.00.两种标记均表明五节芒具有较高的遗传多样性.分别以个体为单位及以群体为单位进行聚类分析,2种标记分别得到了相似但并不完全相同的个体聚类图及群体聚类图.研究结果表明五节芒的遗传多样性水平较高.SRAP与ISSR标记均适用于五节芒的遗传多样性分析.     

长江中国胭脂鱼群体的遗传分化

研究采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性（PCR—RFLP）技术，分析了长江上、中游的宜宾、万州、宜昌和武汉金口4个江段的中国胭脂鱼群体的遗传结构．用13个限制性内切酶分析了4个群体线粒体DNAND-5／6片段的限制性片段长度多态性，发现Nci Ⅰ的酶切类型多态性是表现中国胭脂鱼遗传多样性的特异性标志．根据其酶切图谱显示的群体之间存在的多态性，计算出遗传距离和核酸序列差异程度．分析表明，长江宜宾江段的中国胭脂鱼群体与其他3群体产生了明显的歧化现象，长江中、下游群体间的基因交流好于上游群体，中国胭脂鱼群体内遗传结构比较单一，其群体的遗传多样性程度有进一步减退的可能性．     

珍稀植物日本荚蒾遗传多样性的ISSR分析

日本荚蒾是浙江省重点保护野生植物,种群数量极为稀少,仅零星分布于部分海岛。在野外调查的基础上,对8个居群共125份日本荚蒾样品进行了ISSR遗传多样性分析。从100条ISSR通用引物中筛选出7条引物用于ISSR-PCR,共扩增得到240个谱带,其中多态性谱带232个。在物种水平上,日本荚蒾的多态性位点百分比（PPB）达96.67%,Nei’s基因多样性指数（H）为0.227 3,Shannon’s信息指数（I）为0.358 1,具有较高的遗传多样性;在居群水平上,日本荚蒾的PPB为32.61%,H为0.073 1~0.136 3,均值为0.108 8;I为0.109 2~0.205 1,均值为0.164 2;居群间基因分化系数（Gst）为0.527 1,基因流（Nm）为0.448 7,遗传距离为0.098 2~0.254 0;聚类分析结果表明,同一地理来源的日本荚蒾大多聚为一类,呈一定的地域分布规律。日本荚蒾遗传多样性水平高,但主要存在于居群间,岛屿之间的地理隔离可能是遗传分化的主要原因。     

柯尔克孜族和维吾尔族ACE基因多态性与2型糖尿病的关联研究

探讨新疆柯尔克孜族和维吾尔族人群血管紧张素转化酶（ACE）基因rs1799752位点插入或缺失（I/D）多态性及其与2型糖尿病（TypeⅡdiabetes mellitus,T2DM）的关系．方法采用病例-对照的研究设计．采集无血缘关系、年龄性别匹配的新疆柯尔克孜族样本117例、维吾尔族样本127例,分为2型糖尿病组（T2DM）、糖耐量异常组（impaired glucose tolerance, IGT）和糖耐量正常组（normal glucose tolerance, NGT）,以Hardy-Weinberg平衡检验确认研究样本的群体代表性,采用PCR技术检测ACE基因I/D多态性．结果（1）病例组与对照组ACE基因多态性的分布符合Hardy-Weinberg平衡定律,所选人群具有代表性;（2）柯尔克孜族DD型42.74%,ID型31.58%,II型26.50%,D和I 等位基因频率分别为58.115%和41.876%;维吾尔族DD型35.43%,ID型28.35%,II型36.22%,D和I 等位基因频率分别为49.626%和50.387%．（3）ACE基因频率差异在柯尔克孜族（χ2=70.11,P 〈0.01）,维吾尔族（χ^2=35.11,P〈0.01）的糖调节异常组与糖耐量正常组间,分别具有统计学意义．在维吾尔族T2DM组中携带DD、ID、ID＋DD基因型的个体较携带II基因型的个体发生糖代谢异常（T2DM＋IGT）的危险性增加（OR=7.812,95%CI=3.135-19.607;OR=4.854,95%CI=1.835-12.821;OR=6.410,95%CI=2.865-14.286,携带D等位基因的个体较携带I等位基因的个体发生糖代谢异常（T2DM＋IGT）的危险性增加（OR=4.444,95%CI=2.617-7.576）,而柯尔克孜族DD、ID＋DD基因型和D等位基因性对糖代谢异常（T2DM＋IGT）的发病风险降低．结论ACE基因I/D多态性与新疆两个少数民族T2DM相关,ACE基因I/D多态性可能是维吾尔族T2DM的危险因素,柯尔克孜族的保护因素．     

5种不同体色黄鳝RAPD的初步分析

应用RAPD技术对鄱阳湖区5种不同体色黄鳝进行了遗传多样性研究,结果发现,该物种种群总基因多样性(Ht)为0.272 4,各群体内的基因多样性(Hs)为0.1948,占总群体基因变异的71.51%,提示鄱阳湖黄鳝具有较高的遗传多样性,且遗传变异主要存在于群体内.结果还发现,5种不同体色黄鳝群体间的遗传距离在0.040 0-0.180 l之间,其中细花斑群体与黄黑斑群体之间的遗传距离最小,大花斑与隐花斑之间的遗传距离最大;群体间的遗传分化系数(Gst)为0.2849,这表明,5种不同体色群体间存在明显的遗传分化.     

鄱阳湖区泥鳅的微卫星DNA多态性分析

应用SSR标记技术对鄱阳湖地区的3种不同斑纹泥鳅的遗传差异进行分析.利用6对特异性引物,在3种斑纹泥鳅中共获得67个微卫星位点,其中在大花斑泥鳅中多态性位点为45个,多态性比例为67.16%,小花斑泥鳅的多态性位点为39个,多态性比例为58.21%,无花斑泥鳅多态性位点为15,多态性比例为22.39%.大、小、无3种斑纹泥鳅的平均期望杂合度分别为0.155 4、0.179 9、0.085 7;平均多态信息含量分别0.273 7、0.362 6、0.198 9.分析显示3种花斑泥鳅间的遗传多样性很低,其中无花斑泥鳅尤甚.从Nei的遗传距离得到的系统聚类树状图显示小花斑泥鳅和无小花斑泥鳅先聚在一起,然后再和大花斑泥鳅聚在一起,结果显示小花斑泥鳅和无花斑泥鳅的亲缘关系更近.分析结果对我们正在开展的泥鳅良种选育具有重要的参考价值.     

水蕨的生境及其遗传多样性分析

对分布在中国的24个现存水蕨种群和历史记载曾经分布但现已绝迹的22个水蕨种群原产地进行了广泛调查，发现绝迹种群所在地的原生境已遭到严重破坏，其水体pH值和电导率的平均值都高于现存种群所在地（P〈0．05）．结果表明水蕨的濒危与水生生境破坏和丧失密切相关．用inter-简单重复序列（ISSR）标记分析了13个水蕨种群遗传多样性．总的多态位点百分率（PPB）为65．19％．分子变异分析（AMOVA）表明种群间的遗传变异为33．91％．结果显示水蕨在物种水平具有一个中间水平的遗传多样性和种群间低的遗传变异．孢子扩散引起的高的基因流可能是导致水蕨种群间低的遗传变异的主要原因．     

濒危植物长叶榧群体不同年龄级遗传多样性的RAPD和ISSR分析

按胸径将浙江省桐庐县白云源森林公园长叶榧群体划分为成体、小树、幼苗3个年龄级,利用RAPD和ISSR分子标记对不同年龄级的遗传多样性及遗传分化进行分析.12个RAPD引物和12个ISSR引物分别扩增出199和180个条带,总多态位点百分率分别为44.72%和56.11%.RAPD和ISSR分析均显示3个年龄级的多态位点百分率、Shannon信息指数、Nei指数以成体最高,小树次之,幼苗最低,表明长叶榧群体遗传变异呈衰退趋势.分子方差分析(AMOVA)表明长叶榧群体不同年龄级内、年龄级间均存在遗传变异,但遗传变异主要存在于年龄级内.RAPD和ISSR分析显示,长叶榧群体不同年龄级间的遗传分化系数(Gst)分别为0.2869、0.3077,基因流(Nm)分别为1.2412、1.1231.长叶榧群体不同年龄级间的遗传相似度以幼苗与小树最高,遗传距离以幼苗与小树间最小.在长叶榧群体不同年龄级中,ISSR能检测到比RAPD更多的遗传变异,经Mantel检验,两种分子标记的分析结果相关性极显著.     

泽苔草居群内遗传多样性

采用RAPD分子标记对泽片学湖甲膈群10个家系共60个子代样品进行了家系间及家系内的遗传多样性分析，12个有效引物共广：生91条带，其中83条带表现出多态性，占91．21％．各个家系的基因多样性在0.1l～0.23之间（家系水平为0．27），Shannon指数在0．17～0.34之间（家系水半为0．41）．分子变异分析（AMOVA）结果显示家系间的基因分化系数（Gst）为0．277，说明家系问的遗传变异占27．7％，家系内的遗传变异占72．31％，家系间和家系内的变异均极显著（P〈0.001）．基于家系间的遗传分化系数（Gst）估测家系间的基因流（Nm）为0.65．采用UPGMA法埘所有子代聚类结果表明：同一家系的子代个体并不能完全聚在一起．     

浙江天台山不同海拔高度七子花种群遗传多样性及其与环境因子的相关性分析

采用RAPD技术对浙江天台山3个海拔高度的七子花(Hepatacodium miconioides)天然种群的遗传多样性、遗传分化以及与环境因子的相关性进行了研究.12种随机引物在60株个体中共检测到122个可重复的位点.3个种群多态位点百分率为18.85%～23.77%,平均为21.86%,表明各种群的遗传多样性水平比较低.3个种群Shannon和Nei指数平均为0.132 9、0.092 5,其值较低.虽然3个种群所分布的地理范围小,但种群间存在明显的遗传分化,Shannon指数所显示的总遗传多样性中,种群内占33.58%,种群间占66.42%.Nei指数显示的种群间遗传分化系数为0.654 6.种群间的基因流很小,仅为0.265 6.3个七子花种群间的遗传相似度平均为0.712 6,遗传距离平均为0.341 2.海拔990 m种群与海拔780 m种群的遗传相似度较高,海拔500 m种群与其它两种群的相似度较低.七子花种群内的遗传多样性与土壤总氮呈极显著的正相关.     

新疆五种蝗虫的生化遗传学研究

应用同工酶技术,对隶属于两科五属的五种蝗虫的乳酸脱氢酶(LDH)同工酶、酯酶(EST)同工酶和苹果酸脱氢酶(MDH)同工酶进行了生化遗传学研究,共分析了7个基因位点,采用Nei(1972)的公式,计算各位点上等位基因的频率,求出标准遗传距离(D)和物种分化时间(t),并进行了聚类分析,得出以三点结论:1.五种蝗虫种间LDH,EST和MDH在基因位点的表达,各位点上等位基因的分布以及同一位点上各等位基因的频率三方面均具有明显差异。2.这五种蝗虫及所分析的7个基因位点,都表现出较高程度的基因分化和遗传多态现象。3.初步确定了这五种蝗虫种间的亲疏关系及物种分化时间。     

象山港黄墩支港菲律宾蛤仔种群COI和ITS1基因序列特征及遗传多样性分析

为了解象山港黄墩支港菲律宾蛤仔种质资源的遗传多样性现状, 采用COI和ITS1分子标记对该种群进行了基因序列特征和遗传多样性分析. 结果表明 在该种群30个个体中扩增得到的COI基因序列长度均为709bp, ITS1序列长度范围在693~729bp(共有746个位点). COI基因序列的位点中有670个保守位点(占94.50%)、39个变异位点(占5.50%); ITS1序列的位点中有保守位点671个(占89.95%)、变异位点62个(占8.31%)和缺失/插入位点13个(占1.74%). COI基因序列的保守性高于ITS1序列. 在COI基因序列中碱基(A+T)的占比(65.84%)高于(C+G), 而ITS1序列中则是碱基(A+T)占比(37.59%)低于(C+G). COI和ITS1序列的遗传距离分析均显示群体内遗传分化不明显. 基于COI基因序列和ITS1序列构建的遗传进化树显示 各科贝类分别相聚, 象山港菲律宾蛤仔位于帘蛤科的分支中, 其COI序列与杂色蛤进化关系最近. 遗传进化树中各种贝类的聚类关系与传统分类学结果相一致, 可作为分类的参考. COI和ITS1序列的平均核苷酸差异数分别为5.497和6.549, 核苷酸多样性指数分别为0.00775和0.00973, 单倍型数目分别为21和28, 单倍型多样性分别为0.963和0.993, 根据COI和ITS1两个序列计算得到的菲律宾蛤仔象山港群体单倍型多样性均大于0.5, 核苷酸多样性指数均大于0.005, 表明该种群遗传多样性丰富, 并处于稳定状态. 本研究结果补充了菲律宾蛤仔遗传多样性方面的研究资料, 并可为象山港菲律宾蛤仔种质资源保护和遗传育种提供理论基础.     

23种鸢尾属植物种质资源的AFLP分析

采用AFLP(扩增性片段长度多态性)分子标记技术对23种37份栽培鸢尾属植物种质资源进行遗传多样性分析,将筛选出的4对AFLP分子标记引物对材料进行扩增,共得到205个位点,其中177个为多态位点,多态位点百分率为86.3%;37份材料之间的遗传相似系数在0.23～0.97之间,平均为0.81.通过遗传相似系数计算,样品总体上亲缘关系非常接近,而白花紫苞鸢尾与其他物种有明显差异.本文还利用UPGMA(非加权算术平均法)进行样品聚类,分析了包括23个种的37份样品之间的遗传关系.