带有分子轨道能量的3D-QSAR对N-氨基咪唑的研

N-氨基咪唑(NAIMs)能通过三种不同的作用方式抑制HIV-1的复制. 用比较分子场（CoMFA）方法对一系列有共同骨架的NAIM分子建立3D-QSAR模型. 与以往模型不同的是，在偏最小二乘（PLS）分析中尝试引入分子轨道能量的信息来研究生物活性与分子轨道能量的关系. 结果得到了几个模型，分子轨道能量对模型的贡献能为21.7%，轨道HOMO5对模型的贡献最大.     

消除KSM能量分解分析中的偶合项

在用KSM方法对分子相互作用能量的分解过程中由于轨道间的相互影响，使分 解的能量各分量之和不等于总的相互作用能，即产生偶合项。用能级位移算符逐步 改变某些特定轨道的能级，可以逐步解除对这些特定轨道的冻结，从而可以减少以 至完全消除轨道间的相互影响，即消除偶合项，使能量分解结果清晰、准确。     

密度矩阵旋转法 - 绕过波函数直接求密度矩阵

本文首次提出了一种直接求闭壳层体系密度矩阵的方法 - 密度矩阵旋转法(PMatrix Botanon method). PMR法的特点是不必象自洽场法(SCF)那样解HFR方程,也不必象分子轨道酉变换法(UTMO)那样考虑分子轨道系数,而是绕过波函数直接求体系的密度矩阵,进而从密度矩阵求出体系的所有性质,PMR法能够保证求解过程收敛,克服了传统的HFR-SCF法不能保证收敛的根本缺点.此外,PMR法的计算比SCF法和UTMO法更简便.在CNDO/2近似下,比较了PMR,UTMO和SCF三种方法的计算结果,表明PMR法较优越。     

CO2稳定性与π键结构关系的探讨

根据休克尔分子轨道理论,对CO2分子π分子轨道进行组建,并获得相应的轨道能级.通过对CO2分子中组态2π43、(π53和π33)及2π22的能量上的稳定性、对应键级、分子磁性及化学性质等方面进行比较,得出CO2分子形成两个π43键使体系的能量降低最多,是最稳定的成键方式.     

共轭分子稳定性的判据——苯环的特殊稳定性和4n+2规则

判断共轭分子稳定性最初的标准就是共轭能DE,如丁二烯的DE=0.472|β|,说明它的能量要比只形成二个孤立的乙烯双键时的能量低,因此相对地比较稳定(指热稳定性,以下同)。 HMO给出共轭直链多烯烃第j个π分子轨道的能量E_j为     

分子间电子耦合的简便计算方法—孤立轨道法

在两态模型近似下,运用不同的计算方法评估了面心放置苯二聚体分子间电子转移耦合矩阵元.其中,基于孤立轨道依据二聚体自洽计算得到的单电子Hamiltonian(Fock矩阵)直接求解的电子转移积分的计算方法能方便地考虑孤立轨道的非正交性所带来的影响得到准确的有效电子转移积分的数值解.在该孤立轨道方法下,基函数和分子间距对电子耦合积分的影响也被系统研究.结果表明,相对基于过渡态理论寻找"两态能量差最小"计算的精确电子耦合值,基函数D95V计算结果表现出最好距离相关性.     

Diels-Aider反应区域选择性的CNDO/2研究

用6-甲基-2,4-庚二烯与乙酸乙烯酯环加成然后氢化水解而合成薄荷醇的方案中存在一个区域选择性的问题.采用 CNDO/2法计算轨道能量和系数而用前线分子轨道法预言薄荷醇不是主要产物,而6-甲基-2,4-庚二烯二聚的主要产物应具有文中Ⅷ的结构.另用16个反应的区域选择性实验结果来检查方法的可靠性.结果14个预言符合实验;另两例的失败可归因于前线轨道法的粗糙性.     

有机链状分子的定域分子轨道的研究

利用Foster-Boys定域化程序和STO-3G ab initio方法,对含有C、H、O、N原子的100多个有机链状分子进行了研究,得到定域分子轨道能量及其相互作用参数。应用这些参数和定域分子轨道模型,对于众多的含有C、H、O、N原子的有机链状分子,可得到相应的正则分子轨道能量及其与定域分子轨道的关系。以此预测它们的电离能,结果与实验值符合较好。     

氧分子的三种自旋异构体

按照分子轨道理论(MO法),根据能量最低原理和Hund规则,O_2分子的分子轨道表示式为: KK(σ2s)~2(σ*2s)(σ2p_x)~2(π_y2p)~2(π_z2p)~2(π_y~*2p)~1(π_z~*2p)~1在上述基态O_2分子中,净的成键作用为一个σ鍵和二个叁电子π键,其总键能为494kJ·mol~(-1)。而且由于O_2分子的二重简并π~*反键分子轨道上,具有两个自旋平行的单电子,基态O_2分子应该是顺磁性物质,这与实验事实是相一致的。按照MO法,当基态O_2分子处于受激状态时,其最高被占分子轨道(π_y~*2p,π_z~*2p)上的两个单电子,有可能改变排布方式,使其从排布方式,变成○或排布方式。显然,对于后两种方式而言,O_2分子内已不存在自旋平行的单电子了,故应表现为反磁性物质。可见,按照MO法预言,应该存在三种电     

抗疟新药青蒿素及其衍生物的分子轨道研究

青蒿素是我国医药工作者新近寻找的抗疟药物,其分子式为 C_(15)O_5H_(22)。本文闸分子轨道 EHMO 法对青蒿素及其六个衍生物进行了量子化学计算,探求青蒿素的化学反应、晶体结构特征和抗疟药理作用的量子化学理论解释,初步建立青蒿素及其醚型衍生物系列化合物分子轨道能量与抗疟活性数据之间的线性关系式。     

苯环氯化反应机理的研究

本文应用CNDO/2方法研究了苯环氯化反应,通过计算得到反应过程中所涉及的八个分子稳定构型和轨道相关图。应用EHMO法得到了反应过程中构型转变,相应能量变化曲线,反应制约步骤和活化能。计算表明各步反应都是在一定“点群”控制下进行的,在整个反应中尽量保持分子轨道不可约表示对称性。     

S-P混杂与双原子分子的结构

在常见的同核双原子分子中,F_2,O_2分子轨道能级高低的顺序和N_2,C_2,B_2者不同,这是由于s-p混杂引起的。在结构化学教学中,怎样说明s-p混杂的含义?怎样从分子轨道图形上进行理解?s-p混杂与sp杂化有何差别?s-p混杂对轨道性质有何影响?N_2和O_2的MO能级高低次序不同,NO的能级次序和哪个相似?本文拟简单地说明这些问题。 s-p混杂是指2s和2px原子轨道能量相近时,由它们组成的对称性相同的分子轨道能     

非交替烃HOMO、LUMO、LOMO能量计算

本文将前文~[1,2]建议的直接计算交替烃HOMO(最高占据分子轨道)、LUMO(最低未占分子轨道)能量的方法推广到非交替烃。在HMO近似内, 对非交替烃分子的邻接矩阵联合应用逆迭代和Rayleigh商, 只需迭代一次就能得到该分子HOMO(或LUMO)能量的足够精确的结果。文中提出了计算的格式, 说明了选择初始变分函数的原则。用这种方法, 计算了30个分子的前线轨道~[3]能量, 平均误差为0.002β。本文提出了计算LOMO(最低占据分子轨道)能量的拓扑公式, 它同时适用于交替烃和非交替烃, 其计算精度要优于文献中曾经报道过的结果。用例子说明了方法的应用。     

外电场对N@C60, P@C60, As@C60分子结构和性质的影响

用量子力学方法研究了N@C60, P@C60, As@C60分子的几何和电子特征. 计算结果表明, 形成富勒烯包合物后, 碳笼只有微小的变形, 3种内包原子在笼中处于不同的位置, 碳笼与内包原子之间有明显的电荷转移和自旋轨道相互作用, 生成能分别为6.32, 70.88, -53.05 kJ/mol. 内包原子的3个单占据分子轨道(SOMO)能量变化很大, 并由于和碳笼作用而发生劈裂. 在外电场作用下, 分子的电子密度沿电场方向发生转移.分子的能量随外加电场的增强而降低. 分子轨道能级、能隙及SOMO轨道的能量和能级劈裂也发生了变化.     

双陪集在分子轨道理论计算中的应用

本文简单描述了双陪集的三个基本性质,并依据这些性质,提出分子轨道的构造及其矩阵元计算的方法。在W—H近似下,推导出分子轨道能量与群重叠积分的线性关系。     

定域分子轨道模型——含H、C、N、O有机小分子的研究

应用STO_(-3)G从头算方法和Fostre-Boys定域化分子轨道程序, 我们研究了20多个有机小分子(含H、C、N,O)的定域化分子轨道, 获得了它们的能量和相互作用参数。采用定域分子轨道模型和统一的参数, 对正醇类分子进行了计算, 与光电子能谱数据比较, 得到的电离能的计算结果是相当令人满意的。     

改进的Huckel分子轨道方法 Ⅸ.直链交替烯烃MHMO能级通式

我们曾就直链交替烯烃探讨了Huckel分子轨道方法的改进方案,通过对逐个分子直接解行列式方程得到了令人满意的结果.本文给出一个计算能级的通式. 直链交替烯烃能级通式唐敖庆、徐光宪曾用差分方程法与图形理论得到以下两个公式:     

LFMO和NBO的定域性和作用能解析

为分析苯并分子C12H6的垂直共振能(VRE), 建立了定域片断分子轨道(LFMO)和自然键轨道(NBO)两种基组, 并在两种基组之上进行NBO能量分析和Morokuma能量分解. 在NBO能量分析中, 两种基组的VRE都是稳定的; 而在Morokuma能量分解中, VRE的稳定性取决于基组. 在NBO能量分析中, Fock矩阵的一次性对角化忽视了σ体系和π体系之间的电子耦合作用. 故NBO基组和NBO能量分析方法在计算VRE时似乎都不合理.     

XYG3型双杂化密度泛函方法新进展：从能量到能量的解析梯度

本文回顾了现代密度泛函理论的基础,着重评述了XYG3型双杂化（XYG3typeofdoublyhybrid,xDH）泛函的最新进展,解析能量梯度的实现．XYG3是首个依照绝热途径理论建立的双杂化泛函,在具体实现上具有独特的构架．该类型泛函利用常用泛函（如B3LYP或PBE0等）作母泛函来进行自洽计算,以期获得更好的密度和轨道,然后将所得到的轨道和密度信息带入到xDH泛函中以得到最终能量．由于自洽泛函和最终能量泛函不同,因而在计算解析能量梯度时需要求解耦合微扰Kohn—Sham方程．在此基础上,还评述了xDH泛函在能量,尤其是构型优化方面的具体表现．测试的构型集包括以共价键键合的分子和非键相互作用体系的平衡结构,以及反应过渡态结构．结果表明,xDH双杂化泛函总体上给出了比母泛函更好的能量和几何构型．     

角重叠模型浅释

本文在分子轨道理论的定性概念基础上扼要介绍角重叠模型的两个基本概念:角重叠参数和角重叠因子。应用该模型计算了各d轨道的能量和配合物的分子轨道稳定化能,讨论了不同d~n电子组态对分子空间构型和八面体配合物取代反应速度的影响,并与晶体场理论所得结果加以对比。