丝组二肽对DNA的切割作用的研究

近20年来,人工核酸切割试剂的研究一直是生物化学中最为活跃的前沿领域之一,研究人工核酸切割试剂的主要目的是合成定点切割试剂,后者是一种重要的分子生物学工具,在疾病的基团治疗、反义PCR技术等领域中有着重要的应用价值。此外,人工核酸切割试剂还可以在足迹技术和核酸高级结构的研究中用作高分辨率的化学探针。     

大环配合物在核酸切割中的应用

核酸切割试剂的研究是化学和分子生物学中最为活跃的前沿领域之一.研究核酸切割试剂,不仅是因为对核酸酶催化机理进行深入了解之需,同时还因为人工核酸酶在基因治疗中有着诱人的前景.大环配合物的合成、结构及其对核酸的切割作用已有广泛的文献报道.本文综述了作为重要的核酸切割试剂的大环多胺配合物和氮杂冠醚配合物对核酸的切割作用及其规律性,并展望了今后的发展与应用方向.     

两亲性大环多胺La(III)配合物的合成、表征及催化质粒DNA水解的研究

近年来,人工核酸切割试剂的研究一直是化学生物学、生物化学和分子生物学中最为活跃的前沿领域之一。最近的研究结果表明大环多胺金属配合物在磷酸二酯水解方面表现出独特的催化性能,能作为化学核酸酶有效的催化DNA和RNA的磷酸二酯键的水解[1-2]。尤其是电荷较高的金属阳离子形     

两亲性大环多胺La(Ⅲ)配合物的合成、表征及催化质粒DNA水解的研究

近年来,人工核酸切割试剂的研究一直是化学生物学、生物化学和分子生物学中最为活跃的前沿领域之一.     

ODN-铈配合物定位水解切断DNA的研究

合成了能定位水解切断DNA的ODN-铈配合物人工核酸定位水解切断试剂. 使用HPLC对5′-EDTA-P-10 mers ODN进行了表征; 运用荧光光谱研究了5′-P-10 mers ODN和单链DNA之间的杂交反应, 证实合成的人工核酸定位水解切断试剂能够识别底物DNA, 并与之结合; 电泳实验结果表明该人工定位切断试剂具有良好的定位水解切断单链DNA的效果, 并对人工定位切断试剂切断DNA的位点进行了探讨. 该人工定位切断试剂可作为核酸工具酶在分子生物学和遗传工程中广泛应用.     

含对溴苯基的新型DNA切割剂的合成及活性研究

人工合成的光引发活性 DNA切割剂在化学、生物学和医药等领域中具有重要的学术意义和潜在的应用价值 [1,2 ] .DNA切割分子可以在光的引发下切割 DNA,它的优点在于对体系从时间和空间上进行控制 .目前已经成功地合成出芳香族卤化物、醌类、金属络合物、 C60 衍生物等多种光引发活性 DNA切割剂 .将 DNA识别分子与光切割分子相连 ,则可以合成具有识别功能的光引发活性 DNA切割分子 .卤代苯基是一类重要的光活性基团 ,在紫外光引发下 ,生成苯基自由基切割 DNA[3 ] .偏端霉素是含有 3个吡咯环的寡聚酰胺 ,它是一种天然的抗肿瘤抗生素 ,…     

萘二酰亚胺类探针闪光光解的研究

大量研究已经证实核酸光化学损害主要部位是核酸主链和碱基侧链[1],而核酸碱基的变异是导致基因突变的一个重要原因,因此对核酸碱基的光动态损害机理的深入研究具有重要的理论和实际意义.近年来,外源型荧光探针技术在生物化学,特别是核酸化学研究中应用极为广泛.其中萘二酰亚胺类化合物具有较好的抗癌性能[2],是典型外源型核酸荧光探针之一,在生物化学和医学的领域内广泛应用[3,4].因此,研究这类探针的瞬态与稳态光化学特性成为具有重要的学术意义,并为它们在核酸化学研究中的应用提供重要的信息.     

铜离子多核配合物切割DNA的研究

核酸的断裂与基因的重组技术是分子生物学与基因工程的核心技术,因而研究人工合成的定点切割核酸的切割剂,即核酸的"分子剪刀"在理论与应用上都具有十分重要的意义.目前在人工核酸切割剂的研究中,金属配合物占了很大的比重,由于自然界中许多与核酸有关的天然酶的活性部位,含有两个或多个相互协同作用的金属离子.     

高效毛细管电泳-安培检测研究核苷酸水解反应

核酸是重要的生命物质,近些年来,对核酸水解作用的研究已成为人们关注的焦点,寻找一种在温和的生理条件下能够迅速催化水解核酸的人工酶,对于进一步探索核酸的结构及其在生命活动中的作用,阐明细胞间信息传递的机理,以及对于抗癌药物的研制等具有重要意义.有关稀土金属离子及其配合物对核酸的催化作用已有报道[1～3],这种选择性的水解作用断裂点单一,无碎片产生,克服了以往通过氧化作用断裂核酸带来的弊端[4～5],但其作用的机理、水解体系的优化尚需进一步的探讨.以往对核酸水解作用的研究,主要是通过高效液相色谱(HPLC)[1,6]、化学滴定和…     

核酸定点切割试剂研究进展

近十年来,核酸定点切割试剂的研究引起了化学、生物化学和分子生物学等领域的广泛关注,并已成为研究的热点。本文综述了定点切割试剂及其两个组成部分——切割系统和识别系统的研究现状,讨论了影响其切割活性和位置专一性的因素,并提出了今后研究的方向。     

丝组二肽对牛血清白蛋白的切割作用研究

肽与蛋白质的切割作为生物化学中的热点之一 ,具有非常广泛的应用 .长期以来 ,天然存在的多种蛋白酶如胰蛋白酶 (Trypsin)、糜蛋白酶 (Chymotrypsin)由于其高活性及区域选择性 ,一直是蛋白切割的主要工具 .但是这些酶只能在某些特定的条件 (如 p H值和温度等 )下使用 ,而且由于蛋白酶对底物的特异性要求高 ,因而切割蛋白的断裂位点相对较少 ,有一定的局限性 .而现代生物化学及分子生物学的发展在蛋白切割方面提出了越来越多的要求 [1,2 ] ,如蛋白部分合成 ,大蛋白的序列测定 ,蛋白区域结构与功能的分析 ,蛋白与其它蛋白、核酸、膜形成复合…     

具有DNA切割功能的新型多聚酰胺/丝组缀合物

为得到具有核酸切割功能的人工核酸酶, 设计合成了一种新型多聚酰胺/丝组缀合物, 并研究了其DNA切割活性. 合成的目标化合物在pH=6.0的BR缓冲溶液中对pBR322 DNA切割活性的初步实验结果表明, 于37 ℃保温6 h后, pBR322 DNA基本上被完全从Form Ⅰ切割为Form Ⅱ, 保温36 h后, pBR322 DNA几乎被切割完全.     

Application of DEPBT on the Synthesis of the Protected Dipeptides Containing Histidine with Unprotected Imidazole Group by Solution Method

3- (Diethoxyphosphoryloxy)- 1,2,3-benzotriazln-4 (3H)-one (DE-PBT) was an organophosphorus coupling reagent developed by our group. It was an effective coupling reagent for the synthesis of protected peptides containing Tyr, Ser and Thr with unprotected hydroxy group on their side chain. The further study of the synthesis of a series of protected dipeptides containing hisfidine with unprotected imidazole group using DEPBT is reported. During the synthetic procedure, the imidazole group of histidine did not need to be protected. When the carboxyl components were N-protected aromatic amino acids or basic amino acids, the yields were relatively high (63%--81%). However,when the carboxyl components were N-protected acidic amino acids, the yields were relatively low (47%--48%). The results expanded the application of DEPBT on the synthesis of bioactive peptides containing histidine.     

Expansion of repertoire of modified DNAs prepared by PCR using KOD Dash DNA polymerase

Thymidine analogues bearing a variety of functional groups at the C5-position via an amino-linker arm were prepared and the substrate activity for PCR using thermophilic KOD Dash DNA polymerase was examined. The enzyme accepted the thymidine analogues bearing pyridine, imidazole, biotin, a cationic-charged guanidinium, a cationic-charged amino, mercaptopyridyl and phenanthrolne groups at the C5-position, forming the corresponding PCR product. However, a thymidine analogue bearing a carboxyl group at the C5-position was a poor substrate and the corresponding PCR products could not be obtained. The thymidine analogue bearing a mercapto group was also a poor substrate for the enzyme, because it dimerized by disulfide linkage under PCR conditions. The enzyme hardly accepts the thymidine analogues with a negatively-charged carboxyl group or a bulky group as a substrate. KOD Dash DNA polymerase, having a broader substrate specificity than any other DNA polymerase, will expand the variety of modified DNAs that can be prepared by PCR.     

Adsorption and photocatalytic decomposition of amino acids in TiO2 photocatalytic systems

The adsorption and photodecomposition of seven kinds of amino acids on a TiO2 surface were investigated by zeta potential measurements and 1H NMR spectroscopy in TiO2 aqueous suspension systems. The decomposition rates increased in the order of Phe < Ala < Asp < Trp < Asn < His < Ser. For Phe, Trp, Asn, His, and Ser, the isoelectric point (IEP) of TiO2 shifted to a lower pH with increasing decomposition rates upon adsorption on TiO2, suggesting that the effective adsorption and photocatalytic sites for these amino acids should be the basic terminal OH on the solid surface. Since the amino acids that decomposed faster than the others contain -OH (Ser), -NH (Trp, His), or -NH2 (Asn) in their side chain, they are considered to interact with the basic terminal OH groups more preferably by the side chain and are vulnerable to photocatalytic oxidation. On the other hand, Ala interacts with the acidic bridged OH on TiO2 to cause an IEP shift to a higher pH. The correlation of the surface hydroxyl groups with the photocatalysis of amino acids was verified by the use of calcined TiO2 without surface hydroxyl groups.     

SiO2固载咪唑基手性硫醚钯(ll)催化剂的合成及其在Suzuki反应中的应用

以L-缬氨酸、L-亮氨酸和L-苯丙氨酸为原料合成了未见报道的4种咪唑基手性硫醚化合物,并将咪唑基硫醚固载到SiO2上制备了二氧化硅固载咪唑基手性硫醚配体,用元素分析、热重等手段进行了表征;进而与PdCl2反应得到二氧化硅固载咪唑基手性硫醚-钯(Ⅱ)催化剂,用XPS等方法对其进行了表征.考察了该催化剂在Suzuki反应中的催化性能.结果表明,在以溴苯与苯硼酸为底物的Suzuki反应中,该催化剂用量为底物的0.75％、反应时间为5h、温度为80℃时,溴苯的转化率可达95％.     

Mass spectrometry assisted assignments of binding and cleavage sites of copper(II) and platinum(II) complexes towards oxidized insulin B chain

Interaction of cis-[Pt(en)(H2O)2]2+ and [CuL(H2O)]2+, where L is 2-[bis(2-aminoethyl)amino]ethanol, with oxidized insulin B chain in molar ratio of 1 : 1, 1 : 2 and 1 : 3 at pH 2.5 and 40 degrees C has been investigated by electrospray ionization mass spectrometry (ESI-MS) and tandem mass spectrometry (MS/MS). The results show that the binding sites of the two complexes with oxidized insulin B chain are terminal NH2, imidazole groups of His5 and His10. The hydrolytic cleavage studies show that the [CuL(H2O)]2+, upon a pendant hydroxyl group of the ligand, selectively cleaves the peptide bonds at Gly8-Ser9, Asn3-Gln4 and Phe1-Val2, and the cis-[Pt(en)(H2O)2]2+ only cleaves the peptide bond at His10-Leu11. This is the first report of cis-[Pt(en)(H2O)2]2+-promoted cleavage of His-X peptide bond.     

一对具有DNA切割功能的新型酰胺对映体

设计合成一对新型的丝氨酸-组胺酰胺对映体化合物L-Ser-Hism和D-Ser-Hism,发现它们具有明显的DNA切割活性,切割反应的最佳pH范围为6.0～6.5.L-Ser-Hism的切割活性比D-Ser-Hism的强.与丝组二肽相比,这对酰胺对映体未显示出明显的切割蛋白活性,表明其对DNA的优先切割功能.     

A New Method of Bile Acid Silylation for Their GLC–MS Analysis

The trimethylsilyl (TMS) derivatives of a mixture of nine bile acids (six free and three conjugated), namely lithocholic, deoxycholic, chenocholic, cholic, hyodeoxycholic, ursodeoxycholic, glycodeoxycholic, glycocholic and glycochenodeoxycholic acids, have been prepared by a new, simple, efficient derivatization procedure, based on the use of a mixture of N -methyl- N -trimethylsilyl-1,1,1- trifluoroacetamide and 1-(trimethylsilyl)imidazole, as the silylating agent. The above-mentioned bile acids were completely trimethylsilylated on all hydroxyl and carboxyl groups whereas carbonyl and amino groups remained untouched.     

瓜环准轮烷分子晶体结构及切割DNA研究

报道了瓜环准轮烷分子晶体结构及DNA的切割.