硫堇与DNA分子相互作用的电化学方法研究

采用交流阻抗技术和循环伏安法 ,研究了在硫堇自组装膜修饰金电极上 ,以及在硫堇或DNA吸附修饰的玻碳电极上 ,硫堇与DNA分子的相互作用;硫堇自组装膜修饰金电极与DNA分子作用后 ,阻抗增大 ,表明它们之间发生了作用 ;吸附在玻碳电极上的硫堇 (DNA)与DNA(硫堇 )作用后 ,峰电位和峰电流均发生了变化 ,结合光谱测定结果 ,表明硫堇与DNA分子间存在着嵌插、静电等作用 ,二者作用的反应速度与分子在电极上固定的位置有关;在PBS缓冲液中硫堇 -DNA的表观结合常数为4.9×104L·mol -1 ;交流阻抗技术和循环伏安法是研究小分子与DNA分子间相互作用的经济、快速、简便的方法     

生物小分子与DNA相互作用的光谱及电化学研究进展

评述了生物小分子与DNA的作用方式及其相互作用的光谱及电化学研究方法.引用文献32篇.     

电化学方法研究β-环糊精-硫堇包合物与DNA的相互作用

用电化学方法研究了β-环糊精-硫堇包合物与DNA的相互作用。结果表明,在pH7.2的PBS缓冲液中,β-环糊精以1:1包合硫堇,其包合常数为458L mol-1。β-环糊精-硫堇包合物以嵌入方式与DNA形成一种非电活性超分子化合物,包合物与DNA的结合比是1:1,结合常数为6.25×104L mol-1。     

硫堇与DNA相互作用及DNA光散射/荧光比率测定方法

在pH4.56的BR缓冲溶液中,DNA能使硫堇的光散射增强,荧光发生猝灭。本实验基于硫堇的三维光谱讨论了其发光属性,并通过在普通荧光光度计上单次扫描同时获得的539nm处的光散射强度(I539)与630nm处的荧光强度(F630)之比,建立了测定痕量DNA的光散射/荧光比率法。当硫堇的浓度为1.0×10-4mol/L时,方法的线性范围为0.1~1.6mg/L,检测限为(3σ)为12.0μg/L。将所建立的方法用于DNA合成样品的测定,回收率为94.9%~107.0%,相对标准偏差小于3.0%。     

溶液pH对硫堇与DNA相互作用方式的影响

用电化学和光谱方法研究了溶液pH对硫堇(TH)与小牛胸腺脱氧核糖核酸(CT-DNA)相互作用方式的影响.电化学测量结果表明，在pH 7.2的磷酸盐缓冲溶液中, TH与CT-DNA之间的作用方式以嵌入结合为主，在pH 6.5的磷酸盐缓冲溶液中， TH与CT-DNA之间的作用方式既存在嵌入结合也存在静电作用.荧光光谱测量结果表明，TH与DNA结合后其荧光发生猝灭，通过Stern-Volmer方程计算得到pH 6.5时TH-DNA体系的猝灭常数高于pH 7.2时的值，表明在pH 6.5的溶液中两者相互作用更强.圆二色谱(CD)实验结果也证实了这一结论.     

有机药物分子与DNA相互作用的研究进展

综述了有机药物分子与DNA相互作用的模式、影响因素、并着重介绍了其相互作用的电化学等研究方法,概括了其近几年的研究进展,并在此基础上提出了在药物分子与DNA相互作用的研究工作中应解决的问题.     

尼古丁与DNA相互作用的电化学研究

用线性扫描伏安法、循环伏安法及光谱法研究了尼古丁与DNA在0.2 mol/LpH 6.0的H2C2O4缓冲溶液中的相互作用。研究结果显示,随着DNA的加入,尼古丁峰电流降低,峰电位正移,说明尼古丁是以嵌入形式与DNA结合,生成了一种结合比为2∶1的非电活性化合物,结合常数β为1.56×109。并用多种电化学方法求得了电极过程的动力学参数。     

药物小分子与生物大分子相互作用的研究方法进展

评述了药物小分子与血清白蛋白、DNA相互作用的模式和近几年来国内外相关研究方法进展。引用文献57篇。     

烟酰胺与DNA相互作用的电化学研究

利用示差脉冲伏安法研究了烟酰胺(NA)与小牛胸腺DNA在pH 8.0条件下相互作用的电化学行为.双链DNA(dsDNA)或单链DNA(ssDNA)的存在导致NA的峰电流明显降低且峰电位负移,表明NA与DNA发生相互作用,生成了复合物,且其作用模式主要是静电模式,但NA与dsDNA的相互作用强于与ssDNA的相互作用,可用于识别dsDNA和ssDNA.通过dsDNA加入前后峰电流的变化,计算得出NA与dsDNA结合常数β=4.946×10(11),结合位点数m=3.此外,NA的峰电流Ip与DNA质量浓度在1～14mg/L的范围内呈线性关系,线性回归方程为Ip(10-5A)=-0.03451cDNA(mg/L)+1.7408,相关系数R为0.9998.该法具有良好的回收率和选择性,可用于样品中DNA的测定.     

荧光小分子2-氨基-7-甲基-1,8-萘啶与存在碱基缺失损伤的dsDNA相互作用的研究

摘要采用光谱法研究了小分子2-氨基-7-甲基-1,8-萘啶与存在单碱基缺失损伤的dsDNA的相互作用。紫外-可见光谱显示小分子与dsDNA结合后．其位于330nm处的吸收峰降低并在350nm处产生了新的吸收峰,表明二者有强烈的相互作用。dsDNA的圆二色光谱表明相互作用导致dsDNA的构象发生了变化。     

Impedance‐Based DNA Biosensor Employing Molecular Beacon DNA as Probe and Thionine as Charge Neutralizer

In this paper, we present an impedance‐based DNA biosensor using thionine intercalation to amplify DNA hybridization signal. Beacon single‐stranded DNA (ssDNA) probe and mercaptoacetic acid were self‐assembled onto a Au electrode by forming Au? S bonds. These beacon ssDNAs were hybridized with the complementary sequences around the loop structure. Then thionine was intercalated into the double‐stranded DNA (dsDNA) immobilized on the Au electrode surface. Due to the neutralization of the negative charges of dsDNA by the intercalated thionine, the electronic transfer resistance (R_et) of the DNA modified Au electrode was significantly diminished. Herein, the decreased value of R_et resulted from the thionine intercalating into dsDNA was employed as the hybridization signal. SDS was used to reduce the unspecific adsorption between ssDNA and thionine. Several experimental conditions, including the surface coverage of ssDNA probe on Au electrode, the hybridization temperature and time were all optimized. Moreover, the hybridization reactions of the unstructured linear ssDNA probe and the structured beacon ssDNA probe with their complementary sequences were compared in this work. The sensitivity of the presented DNA biosensor highlighted that the intercalation of thionine into dsDNA was an efficient approach to amplify the hybridization signal using impedance detection technique. Additionally, in this DNA biosensing protocol, beacon ssDNA has a good ability to distinguish target DNA sequences. This results in a higher specificity than using traditional unstructured DNA probe.     

DNA Electrochemical Aptasensor for Detecting Fumonisins B1 Based on Graphene and Thionine Nanocomposite

In this paper, a novel aptasensor was designed by with the dual amplification of Au nanoparticles (AuNPs) and graphene/thionine nanocomposites (GS‐TH) for sensitive determination of fumonisins B₁ (FB₁). AuNPs is modified at the electrode surface to increase the electrical conductivity and fabricate specific recognition interface for FB₁ through the hybridization of capture DNA and its aptamer. Large number of TH molecules were loaded at the surface of graphene sheet to served as electrochemical probe and increase its electrochemical signal due to the excellent conductivity and large surface area of graphene sheet. This type of nanocomposites is then assembled to the single strand section of FB₁ aptamer at electrode surface by π–π stacking interactions between them, leading to an enhanced electrochemical signal. After the specific combination between FB₁ aptamer and its target (FB₁) in solution, GS–TH was released from electrode surface, resulting in a decreased electrochemical signal. The result demonstrated that the decreased currents were proportional to the FB₁ concentration in the range of 1–10⁶ pg/mL with a detection limit of 1 pg/mL. Besides, the developed aptasensor was also applied successfully for the determination of FB₁ in feed samples. The result shows this aptasensor has a higher sensitivity and selectivity.     

柔红霉素与DNA作用的序列特异性研究

采用紫外-可见光谱法和紫外-可见光谱电化学法研究了柔红霉素(DNR)与不同寡聚核苷酸之间的相互作用.结果表明,DNR优先作用于寡聚核苷酸的CpG位点,然后是ApG和ApC.因为DNR可与鸟嘌呤之间形成3个氢键.与双链寡聚核苷酸作用时,DNR最先插入的位点是(CpG)₂碱基对之间,其次是(TpG)(CpA)和(GpC)(ApC)碱基对之间.当DNR与存在未配对G碱基的DNA链作用时,因游离的DNR量增加使其电化学活性增加,导致DNA构象和构型的变化,使DNA生理功能受到损伤,DNA碱基增色效应显著上升.此法可用于G碱基未配对DNA链的检测.     

蒽环类抗肿瘤抗生素与DNA作用差异性的光谱电化学研究

利用在线紫外一可见光谱电化学技术、微分脉冲伏安法及琼脂糖凝胶电泳技术考察了柔红霉素、表阿霉素、阿克拉霉素、伊达比星与DNA的作用。实验表明,药物与DNA形成复合物的稳定性主要取决于药物的糖环与DNA之问的作用,糖苷配基上取代基与DNA形成氢键也有一定影响。另外,DNR在还原代谢过程中最易产生半醌自由基。     

柔红霉素与DNA相互作用的机理研究

本文以循环伏安、光谱电化学和原子力显微镜方法从DNA角度研究柔红霉素与天然鱼精DNA和热变性DNA之间相互作用的机理。并对柔红霉素与鱼精DNA和热变性DNA复合物的组成及复合物的形成常数作了测定。研究发现嵌入作用是柔红霉素和天然DNA之间的主要作用方式；并且柔红霉素和天然DNA之间的作用要强于和热变性单链DNA之间的作用。对这两种复合物的光谱电化学和原子力显微镜研究表明，在体内氧化还原代谢条件下，柔红霉素还原过程中产生的半醌自由基可引发自由基链反应，造成DNA链的解链、断裂等损伤。     

硫堇的电化学聚合及聚硫堇的性质

使用循环伏安法实现了硫堇在酸性溶液中的电化学聚合.聚硫堇是一种蓝色物质,它的颜色能随电位迅速变化.在0.50 mol•dm－3 HCl 至pH 6.0的溶液中,聚硫堇具有很好的电化学可逆性、稳定性和快速传递电子的能力.测定了聚硫堇的可见光谱和红外光谱,根据红外光谱,提出了硫堇的电化学聚合机理的假设.     

萘普生和酵母DNA相互作用的荧光光谱研究

使用紫外和荧光光谱法研究了萘普生和酵母DNA之间的相互作用。酵母DNA对萘普生的荧光存在强烈的猝灭作用，其作用方式随DNA浓度的变化而发生转变。用Stern-Volmer方程与Scatchard方程两种方法得到相同结果：在较低的DNA浓度下，萘普生与DNA间的作用较弱，而在较高DNA浓度时，萘普生与DNA的作用较强，键合位点数也随着酵母DNA浓度的升高而在临界酵母DNA浓度100 mmol/L附近出现转变。紫外光谱、离子强度的影响和I^-猝灭等研究表明，DNA浓度的变化并不改变两者间的作用方式，它们之间始终是一种沟槽作用模式。