分子三维投影法在苯酚类化合物构效关系研究中的应用

对苯酚类化合物进行三维投影得到了5个形状参数,将其与3个Am指数及8个量子化学参数相结合.由最佳变量子集回归法对变量进行了压缩与选择,运用多元回归分析和人工神经网络法分别构造了预测数学模型,得到了满意的结果.     

本征型聚酰亚胺介电常数的定量构效关系模型构建与研究

综合运用量子化学方法及基团贡献法,采集了78种不同化学结构聚酰亚胺的结构参数.采用通径分析法从16种参数中筛选出了对介电常数具有显著影响的8种结构参数,在此基础上,构建了2种针对聚酰亚胺介电常数的定量构效关系模型,平均相对误差均在10％以内.研究认为影响聚酰亚胺薄膜介电常数的最重要因素为分子体积,从宏观角度来看即体系的...     

苯甲酸类化合物小鼠经口LD50定量构效关系的研究

采用化合物定量结构-毒性效应关系(QSTR)方法研究了39个苯甲酸类化合物的各种量化参数对小鼠经口急性毒性(LD50)的影响,并建立了毒性预测模型.为了得到更准确的毒性预测模型,各个参数的交叉项同时考虑在内,利用线性回归方法得到了苯甲酸类化合物小鼠经口急性毒性预测模型(相关系数为0.958 2).该模型具有很好的预测能力.     

手性羟酸和氨基酸类化合物的构效关系研究

构造了用于手性参数衍生的距离矩阵和扩展的距离矩阵, 并且观察了与羟酸类和氨基酸类化合物手性薄层色谱保留指数的相关性, 得到了具有启示性的结果. 引进了扩展的eAm指数和连乘指数, 以及综合运用了三种算法. 所得参数进行了多元回归分析, 得到了单一变量和变量组合的分析结果. 与多元回归分析相比较, 运用人工神经网络法, 使结果得到了较大的改善. 所引进的方法对于化合物构效关系研究具有普遍可用性.     

苯胺类化合物结构-毒性定量构效关系研究

为定量预测环境中有害有机苯胺类化合物的毒性, 计算了量子参数和拓扑指数等, 进行了回归分析和人工神经网计算, 得到了较好的结果. 用CoMFA实施了三维构效关系研究,发现在常规CoMFA立体和静电参数的基础上, 引进分子生成热, 可使结果得到很大程度的改善, 不仅可得到较好的定量数学模型, 同时为探讨该类化合物毒性作用机理提供了依据.     

α—取代乙酰胺类化合物结构与除草活性的构效关系研究

分别研究了Ｎ，Ｎ－二取代－α－氯代乙酰胺类化合物及Ｎ，Ｎ－二取代－α－二硫代磷酰基之酰胺类化合物结构与除草活性的定量关系，结果表明，氮原子上取代基的大小对两类化合物的除草活性具有相同的影响，只是最适宜的疏水性不同，两类化合物可能具有相同的作用机制。     

HCV复制抑制剂的定量构效关系的研究

选用60个结构多样的HCV复制抑制剂分子作为数据集,随机选择其中46个分子作为训练集,剩余14个分子作为验证集.采用多元线性回归(MLR)和主成分分析(PCA)方法对每个分子的646个理化和结构参数进行了线性回归分析,并分别建立各自的最优模型.结果表明MLR中的逐步和向前法所建模型最佳,模型结果为:训练集R2=0.827,验证集R2=0.850,模型能够直观地反映影响化合物活性的主要因素.该模型将有助于筛选和开发新的HCV复制抑制.     

分子电性距离矢量用于三嗪类化合物的构效关系研究

采用分子电性距离矢量(Molecular Electronegativity Distance Vector,MEDV)表征了三嗪类化合物的分子结构,并运用多元线性回归(Multiple Linear Regression,MLR)建立了该类化合物结构与其发光菌和大型蚤毒性的定量结构-毒性相关(Quanti-tative Structure-Toxicity Relationship,QSTR)模型,同时采用留一法交互检验对所建模型进行了分析和验证,建模计算值的相关系数R分别为0.970和0.952,留一法交互检验预测值的相关系数RLOO分别为0.917和0.921,并进一步阐述了结构与毒性之间的关系。结果表明,三嗪环上π电子离域程度减小有利于毒性增加,侧链N上取代基数目增加,化合物毒性减小。为进一步预测该类化合物的毒性,进行药物筛选提供了有效的理论依据。     

α－取代乙酰胺类化合物结构与除草活性的构效关系研究

分别研究了Ｎ，Ｎ－二取代－α－氯代乙酰胺类化合物及Ｎ，Ｎ－二取代－α－二硫代磷酰基乙酰胺类化合物结构与除草活性的定量关系。结果表明：氮原子上取代基的大小对两类化合物的除草活性具有相同的影响，只是最适宜的疏水性不同，两类化合物可能具有相同的作用机制。     

广义二面角在定量结构/活性相关分析中的应用

化合物的结构与其活性具有相关性 .建立相关性需要由结构提取特征 ,并运用这些特征作为自变量去构造数学模型 ,以便预测未知的化合物及其活性 .目前 ,在诸多 3D- QSAR方法中 ,应用最为广泛的是 Co MFA( Comparasive Molecular Field Analysis)方法 [1～ 3] ,但新近的研究发现 ,Co MFA方法对于某类化合物 (如苯胺类化合物 )适应性较差 ,但分子在三维空间投影面积及量化参数的引入可大大改善所得结果[4 ] .本文从另一角度 (即广义二面角 )研究了分子在三维空间的形状 ,得到了满意的结果 .1　实验部分本文选用 34个 1 - [( 2 - Hydroxy…     

辨识药物定量构效关系的模糊神经网络方法研究

提出一种基于遗传算法的新型模糊神经网络方法,用于计算Benzodiazepines(BZs)类药物的定量构效关系.这类模糊神经网络综合了神经网络、遗传算法与模糊逻辑的各自优势,具有优良的定量构效关系辨识能力,其学习速度较快,不易陷入局部最小区域;网络知识以模糊语言变量的形式加以表达,不仅易于理解,而且能有效地利用已有的专家经验.一旦通过学习获得规律后,不仅能很好地预测化合物的活性,还能对后续的药物分子设计提供有益的理论指导.     

苯甲酰胺类化合物的结构/活性的定量构效关系研究

用分子连接性指数及比较分子力场分析分别研究了苯甲酰胺类化合物的结构与抗炎活性的关系，结果表明，三维空间上立体效应是描述该类化合物的抗炎活性和进行结构与性能关系研究的最重要的结构参数。     

喹诺酮类N1位定量构效关系研究

氟隆诺酮类化合物是抗菌药中的重要一类，由于它的许多突出特点，已引起越来越多的研究者的关注山．这类化合物骨架见图1．我们对该类化合物进行过一些研究［’‘l自发现诺氟沙星＊以后，几位取代基在寻找高效、广谱峻诺酮类化合物方面起重要作用，但在发现环丙基（1983年）、特丁基（1989年）以后，一直未发现新的有意义的取代基·在NI位定性与定星构效关系的研究中有二种观点：（1）古贺弘等k’］提出的由立体效应决定的观点；（z）Domagala［71、Chu问等主张的立体与电子效应共同起作用的观点·3D－QSAR研究中的比较分子力场分析（Co…     

The study of the relationship between the new topological index A(m) and the gas chromatographic retention indices of hydrocarbons by artificial neural networks

The newly developed topological indices A_m1-A_m3 and the molecular connectivity indices ^mX were applied to multivariate analysis in structure-property correlation studies. The topological indices calculated from the chemical structures of some hydrocarbons were used to represent the molecular structures. The prediction of the retention indices of the hydrocarbons on three different kinds of stationary phase in gas chromatography can be achieved applying artificial neural networks and multiple linear regression models. The results from the artificial neural networks approach were compared with those of multiple linear regression models. It is shown that the predictive ability of artificial neural networks is superior to that of multiple linear regression method under the experimental conditions in this paper. Both the topological indices ²X and A_m1 can improve the predicted results of the retention indices of the hydrocarbons on the stationary phase studied.     

二肽肽酶IV抑制剂的三维定量构效关系研究

二肽肽酶IV是一类用于治疗II型糖尿病具有潜在价值的关键酶, 很多此类酶的抑制剂用于处理此病具有相当好的有效性. 一系列N-取代的甘氨酰氰基吡咯烷衍生物对于二肽肽酶具有高的活性和选择性. 我们使用比较分子力场分析方法建立DPP-IV抑制剂——N-取代的甘氨酰氰基吡咯衍生物的三维定量构效关系, 该模型为设计用于治疗II型糖尿病的高效DPP-IV抑制剂提供结构信息. CoMFA模型的交叉验证相关系数q²＝0.575, 非交叉验证相关系数r²＝0.981, 绝对误差S＝0.184, F_9.68＝388.5. 使用七个预测集检验了模型的预测能力. 所得的模型解释了已有的构效关系, 并对同类化合物有较好的预测能力, 该模型可用于指导新型的DPP-IV抑制剂的设计与优化.     

原子三角法在定量结构/活性相关分析中的应用

分子相似度;回归分析;人工神经网络;原子三角法在定量结构/活性相关分析中的应用