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利用超高效液相色谱-飞行时间质谱联用开展糖尿病尿液代谢组学研究。尿液样品经稀释过滤后进样分析,对采集的谱图进行峰提取、峰匹配和过滤后,采用主成分分析的偏最小二乘-判别分析进行数据分析。结果发现,糖尿病人较正常人尿液的代谢表型发生了显著变异,主成分分析得分散点图中健康对照组与患病组分类良好;根据谱库共筛选了18个表征标记物,对其中14个进行了结构鉴定。糖尿病患者尿液中的糖、脂、氨基酸等代谢通路均发生了紊乱,在糖类代谢物中,钠葡萄糖醛酸含量明显高于正常对照组;在脂肪酸类物质中,20-羧基花生四烯酸、棕榈酸及磷脂酰肌醇在糖尿病患者尿液中含量高于正常对照组;氨基酸类代谢物中,酪氨酸、N-β-丙氨酰-L组氨酸、色氨酸含量较正常人低,戊二酸、烟酰甘氨酸、天冬氨酸、苯丙氨酸等含量升高。 相似文献
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以邻苯二甲醛为衍生试剂,正缬氨酸为内标,采用柱前在线衍生高效液相色谱(HPLC)分离,荧光检测(FLD)的方法,建立了培养基中游离氨基酸(FAA)代谢消耗谱的定量分析方法。流动相A液为10 mmol/L Na2HPO4-Na2B4O7缓冲液(pH 7.95), B液为乙腈-甲醇-水(45:45:10, v/v/v);二元线性梯度洗脱,流动相B在35 min内由5%升至52%,33 min内17种FAA全部得到良好分离。应用该方法分别测定了HeLa细胞在紫杉醇和丝裂霉素干预24 h后的培养基氨基酸代谢消耗谱(以正常培养组为对照)。以相对峰面积作为原始数据,通过Matlab7.1软件平台,用偏最小二乘判别分析(PLS-DA)得分图进行关联研究,结果表明: 与对照组相比,培养基游离氨基酸代谢消耗谱能够区分两种不同机制的抗癌药物,为抗癌药物筛选过程中的药物作用机制预归类提供了一种新的技术方法。同时,这种以外观内的方法具有方便、经济的特点。 相似文献
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建立了基于超高效液相色谱-飞行时间质谱(UPLC/TOF MS)分析技术的血浆代谢指纹谱,应用多元统计分析方法评价糖尿病肾病患者血浆代谢物变化差异及糖肾方的干预效果。通过研究糖肾方干预糖尿病肾病血浆内源性代谢物的变化,探索与该疾病密切相关的代谢途径,评价糖肾方的治疗效果。结果发现: 经糖肾方治疗后,血浆内源性代谢物发生了明显变化,磷脂代谢、脂肪酸代谢、氨基酸代谢、嘌呤嘧啶代谢、固醇类代谢等多个代谢途径得到纠正。本研究基于UPLC/TOF MS的代谢组学方法,能够从整体水平反映疾病治疗过程中代谢网络的变化趋势,证实糖肾方具有治疗糖尿病肾病的临床疗效并有助于阐释药物作用机理。 相似文献
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运用代谢组学方法研究了三聚氰胺对儿童尿液代谢的影响.通过超高效液相色谱-飞行时间质谱(UPLC/TOF-MS)法分析儿童尿样的代谢指纹图谱,质谱数据采用MarkerLynx软件处理,然后使用主成分分析和偏最小二乘判别分析法分析病例组和正常对照组之间的代谢物谱差异,并通过变量重要性投影(VIP)选取潜在的生物标志物,结合质谱同位素分析和数据库检索对潜在的生物标志物进行鉴定.结果表明,三聚氰胺通过肾结石导致的物理性损伤干扰了柠檬酸代谢.代谢组学法能够应用于三聚氰胺导致的代谢异常的研究及三聚氰胺导致肾损伤的无创检测. 相似文献
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基于液相色谱-串联质谱的氨基酸代谢组学方法研究黄芪注射液治疗脑缺血 总被引:1,自引:0,他引:1
建立了基于液相色谱-串联质谱技术的氨基酸代谢组学分析方法。选用Diamonsil C18色谱柱,乙腈-0.1%甲酸为流动相,梯度洗脱,三重四级杆质谱检测器,MRM扫描方式,12 min内对血浆中12种氨基酸进行定量分析。应用本方法对脑缺血模型和黄芪注射液的治疗作用做出评价。通过偏最小二乘判别分析统计发现,脑缺血12 h,其血浆中的氨基酸代谢表达存在显著差异,结合载荷图及VIP值确定丝氨酸、天冬氨酸、甘胺酸等7种脑缺血生物标识物;采用黄芪注射液治疗后,从得分图上可以看到氨基酸代谢的轨迹发生了较大变化;与脑缺血模型组比较,丝氨酸、天冬氨酸、甘胺酸等生物标识物均向正常水平趋近。 相似文献
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药物引起的肝损伤是全世界关注的健康问题,药源性肝损伤的早期诊断仍然是临床治疗肝损伤的一大难题。本研究中,首先利用对乙酰氨基酚、四氯化碳、大黄素、雷公藤甲素和马兜铃酸构建不同类型的肝细胞损伤模型,利用超高效液相色谱-质谱联用技术(UPLC-MS)分别得到正常组和损伤组的细胞代谢轮廓谱。然后利用模式识别构建分类模型,筛选肝损伤相关的差异代谢物。结果显示,不同类型肝损伤在肝细胞代谢谱上可以被区分开,最终鉴定出14种差异代谢物。损伤组肝细胞经保肝阳性药联苯双酯干预后,差异代谢物水平均趋向于正常组,在一定程度上验证了差异标志物与肝损伤的相关性。实验结果表明细胞代谢组学是研究药物肝损伤的有效工具之一。 相似文献
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黄芪黄酮干预脾虚水湿不化大鼠血浆代谢组学研究 总被引:1,自引:0,他引:1
采用高效液相色谱结合飞行时间质谱检测正常大鼠、脾虚水湿不化证大鼠及黄芪黄酮组分干预后大鼠血浆内源性代谢物变化,获取大鼠血浆代谢图谱,研究黄芪黄酮组分干预脾虚水湿不化证的作用机制.采用高脂低蛋白饮食加负重游泳力竭建立脾虚水湿不化证大鼠模型,选择Halo C18色谱柱,流动相为0.05%甲酸-水与0.05%甲酸-乙腈,梯度洗脱,利用液相色谱-串联质谱分析测定大鼠血浆样品.利用主成分分析法对造模前后大鼠血浆样本进行代谢轮廓分析,结合变量投影重要性及显著性分析等筛选对分组贡献最大的差异标志物及相关通路,阐明药物的作用机制.结果表明, 黄芪黄酮组代谢轮廓异于模型组,而接近于正常组,共鉴定出了包含甘油磷脂类、鞘酯类、氨基酸类等在内的11种潜在生物标志物,其代谢通路包括三羧酸循环、甘油磷脂代谢、脂肪酸代谢及氨基酸代谢等,主要涉及体内能量代谢和脂肪代谢.黄芪黄酮干预脾虚水湿不化证大鼠后, 宏观指标(如体重、自主活动)和微观指标(如代谢标志物、血脂)均明显回调,表明黄芪黄酮可能主要通过调节能量代谢、脂肪代谢等途径而发挥健脾利水作用. 相似文献
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药物引起的肝损伤是全世界关注的健康问题,药源性肝损伤的早期诊断仍然是临床治疗肝损伤的一大难题。本研究中,首先利用对乙酰氨基酚、四氯化碳、大黄素、雷公藤甲素和马兜铃酸构建不同类型的肝细胞损伤模型,利用超高效液相色谱-质谱联用技术(UPLC-MS)分别得到正常组和损伤组的细胞代谢轮廓谱。然后利用模式识别构建分类模型,筛选肝损伤相关的差异代谢物。结果显示,不同类型肝损伤在肝细胞代谢谱上可以被区分开,最终鉴定出14种差异代谢物。损伤组肝细胞经保肝阳性药联苯双酯干预后,差异代谢物水平均趋向于正常组,在一定程度上验证了差异标志物与肝损伤的相关性。实验结果表明细胞代谢组学是研究药物肝损伤的有效工具之一。 相似文献
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Sean E. Pidgeon Jonathan M. Fura William Leon Morgan Birabaharan Dr. Dmitri Vezenov Dr. Marcos M. Pires 《Angewandte Chemie (International ed. in English)》2015,54(21):6158-6162
Bacterial peptidoglycan is a mesh‐like network comprised of sugars and oligopeptides. Transpeptidases cross‐link peptidoglycan oligopeptides to provide vital cell wall rigidity and structural support. It was recently discovered that the same transpeptidases catalyze the metabolic incorporation of exogenous D ‐amino acids onto bacterial cell surfaces with vast promiscuity for the side‐chain identity. It is now shown that this enzymatic promiscuity is not exclusive to side chains, but that C‐terminus variations can also be accommodated across a diverse range of bacteria. Atomic force microscopy analysis revealed that the incorporation of C‐terminus amidated D ‐amino acids onto bacterial surfaces substantially reduced the cell wall stiffness. We exploited the promiscuity of bacterial transpeptidases to develop a novel assay for profiling different bacterial species. 相似文献
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α-Amino acids are one type of the main building blocks of living systems, being the primary components of all naturally occurring peptides and proteins. They are the simplest optically active compound in the nature and have multiple functional groups, which enable them to be transformed into a wide variety of optically active substances. The resulting materials show a wide variety of functions such as electron transfer, information transfer, photo reactivity and selective catalytic function, which cannot be imitated by synthetic compounds. Functional macromolecular materials using biological chiral resources such as amino acids have been drawing much interest due to their biocompatibility and biodegradability easing the ecological trouble because amino acid residues can be targeted for cleaving by different enzymes. Also, this type of polymer contains nitrogen, which the organism needs for their growth and shows excellent hydrophilic character, reasonably high melting points and good materials properties even at relatively low molecular weights. However, polymers composed of amino acids alone have limited thermal stability and are insoluble in many common organic solvents, which make these materials difficult to fabricate and utilize. Preparation of hybrid systems between conventional synthetic polymers and linear sequences of amino acids are interesting because amino acid segments possess unique properties, such as directional polarity, chirality and their capability to undergo specific noncovalent interactions. These properties can potentially be used for designing novel hierarchical superstructures with tunable material properties for a wide variety of applications. Herein, the synthesis and properties of synthetic macromolecules having natural amino acids are reviewed in details up to now with excluding polypeptides. 相似文献
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由于氨基酸代谢的多样性和相对独立性,在基础教学中对相关内容的讨论和推广对培养21世纪新型跨学科人才是极其重要的。本文将以三种基本的非极性天然氨基酸——缬氨酸、异亮氨酸和亮氨酸为例,从氨基酸合成代谢的内容和方式等方面做教学模式的探索,并尝试归纳与总结自然界采取这样代谢路径的原因和逻辑。同时,其中相关的生物化学过程也体现出生命体系所采取的不同寻常的合成路径和反应机制。这对于本科生而言不仅是具有趣味性与启发性的良好的素材,也是了解目前研究热点和积累知识的有效渠道,期望对其后续深入的学习和研究有帮助。 相似文献
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Saleem Tahia Dahpy Marwa Ezzat Ghada Abdelrahman Ghada Abdel-Aziz Essam Farghaly Rania 《Applied biochemistry and biotechnology》2019,188(3):854-867
Applied Biochemistry and Biotechnology - Altered plasma levels of branched-chain amino acids (BCAAs) and aromatic amino acids (AAAs) may predict the development of insulin resistance and other type... 相似文献
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《液相色谱法及相关技术杂志》2012,35(12):2369-2393
Abstract A reverse phase high performance liquid chromatographic method for the analysis of plasma amino acids is described. The method employs pre-column derivatization with o-phthaldialdehyde using ethanethiol as the reducing agent. The analysis shows good linearity and reproducibility. An average overall difference of 12% was seen for results obtained by the HPLC method versus those obtained with an amino acid analyzer. The chromatographic parameters of buffer concentration and column temperature were also examined. 相似文献
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Joanna Paradowska Maciej Stodulski Jacek Mlynarski Dr. 《Angewandte Chemie (International ed. in English)》2009,48(24):4288-4297
Wet and wild : Water is a powerful force in nature, as evident in the painting “ES” by Zdzislaw Beksinski (1985, oil, 92 cm×90 cm; reproduced with permission from Piotr Dmochowski), as well as a promising medium for asymmetric reactions. As catalysts, natural amino acids are ideal candidates. This Minireview summarizes recent advances in asymmetric catalysis in water, with amino acids and their derivatives as effective catalysts or essential components.
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高血压患者血浆中游离氨基酸的柱前衍生HPLC法测定 总被引:1,自引:1,他引:1
以2,4-二硝基氯苯为衍生化试剂,建立了反相高效液相色谱法测定人血浆中22种游离氨基酸的方法.衍生化产物用Kromasil C18柱分离,梯度洗脱,紫外检测波长为360 nm.在所研究的浓度范围内,22种氨基酸的线性关系良好(r>0.99),日内精密度(RSD)为1.7% ~4.1%,日间精密度(RSD)为2.8% ~6.9%,方法回收率为90% ~106%.用建立的方法对高血压病人和正常人血浆中的游离氨基酸进行测定,并将测定结果进行主成分分析及判别分析,结果表明高血压病人与正常人血浆中的氨基酸存在显著差异,分类判别率为94.4%. 相似文献
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收集20种天然氨基酸的457种理化性质,按照疏水、电性特征、氢键贡献和立体特征分类后,对它们分别进行主成分分析(Principal component analysis,PCA),得到一个新的氨基酸残基结构描述符SVHEHS.用该描述符分别对血管紧张素转化酶(AngiotensinⅠconverting enzyme,ACE)抑制二肽、三肽、四肽进行序列表征,并用来与生物活性建立偏最小二乘(Partial least square regression,PLS)模型.ACE抑制二肽、三肽、四肽模型的相关系数、交叉验证相关系数、 均方根误差、外部验证相关系数分别为0.607,0.507,0.587,0.783;0.852,0.813,0.232,0.839;1,1,0,0.935.由此说明,采用SVHEHS描述符建立的PLS模型拟合、预测能力均较好,可用于血管紧张素转化酶抑制肽的定量构效关系研究. 相似文献
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基于氨基酸模糊聚类分析的跨膜区域预测 总被引:2,自引:0,他引:2
跨膜蛋白在进化过程中,序列保守性较差,即使是同源蛋白序列的一致性程度也较低,因而在跨膜区预测算法中,通过序列的一致性程度来选取训练集并不能有效地消除预测结果对训练集的过度适应性.本文提出了一种基于氨基酸模糊聚类分析的预测算法,通过氨基酸在各个区域分布的相似性程度进行模糊聚类,从而根据一类氨基酸的分布特性而不是各个氨基酸的分布特性进行跨膜区预测.结果表明,该方法能在一定程度上消除训练集的选取对测试结果的影响,提高跨膜蛋白拓扑结构预测的准确度,特别是提高对目前知之甚少的跨膜蛋白的预测准确度. 相似文献