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相似文献
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1.
草鱼基因组随机扩增多态性引物及多态性位点的筛选   总被引:4,自引:0,他引:4  
为了建立草鱼基因组DNA多态性分析的指标体系,应用RAPD技术,从180条10碱基随机引物中筛选出了31条能扩增出多态性DNA片段的引物。用这31条多态性引物共扩增出了327条重复性好、带型清晰、分辨率高的谱带。扩增产物的片段大小范围在400—2000bp之间。单一引物扩增条带为5—14条。用这些多态性引物在草鱼基因组DNA中检测到了93个多态性位点,并对这些多态性位点上的等位基因频率进行了统计分析。这31条多态性引物和所检测到的93个多态性位点初步为草鱼基因组的多态性分析提供了可靠的分析指标体系。  相似文献   

2.
葡萄的随机扩增多态性DNA研究   总被引:3,自引:0,他引:3  
采用随机扩增多态性DNA(RAPD)对11个样品进行了研究.这11个品种包含1个欧美杂交种,一个中国野生种(Vitis.piasezkii Var.pagnucii),9个欧亚种(Vitis.vinifera L).选择了多态性好的7个10碱基寡聚糖核苷酸作为随机扩增的引物,在琼脂糖凝胶电泳上产生了76条带,其中63条具有多态性.各引物产生的条带从6到13不等,平均为10.86条/模板,其中9条具有多态性,表明葡萄基因的多态性十分丰富.通过遗传相似性分析表明11个葡萄基因的Nei氏相似性系数分布为0.1027-1.1787,平均相似系数为0.459.通过非加权算术平均数聚类法,获得了11个葡萄品种之间的遗传关系树图,欧亚种群,东亚种群和欧美杂种在遗传关系树图上被成功地聚为3组.本实验发现欧亚种和欧美杂种亲缘关系较近,而和中国野生种亲缘关系远.在欧亚种中,520A和S04的遗传距离最近,其次是井川1010和美人指,最大的遗传距离发生在桑无核和其他欧亚种之间.  相似文献   

3.
目的:分析云南不同地区、不同年代分离鼠疫菌的基因表型。方法:采用随机引物扩增技术(RAPD)对菌株进行分析。结果:共检测了28株鼠疫菌,除一株外,27株均显示有13条带型,并与假结核菌和小肠结肠炎菌有明显的区别。结论:云南家、野两型鼠疫菌株可能具有相同的随机引物扩增基因表征。  相似文献   

4.
DNA分子标记是DNA水平上遗传变异的直接反映,随机扩增多态性DNA(RAPD)技术,是新发展起来的一种DNA分子标记方法。文中详细阐述了RAPD技术的原理,进一步与限制性片段长度多态性(Restriction FragmentLength Polmorphism,RFLP)技术相比,得出它具有快速,简便和对材料要求不高等特点,最后讨论了RAPD技术在生命科学研究中各个方面的广泛应用,包括种基因组的分子谱图建、系统进化发育以及基因定位研究等。  相似文献   

5.
随机引物在番茄DNA扩增及多态性分析中的应用   总被引:1,自引:0,他引:1  
采用RAPD分析方法对5个番茄品种的基因组进行了检测。结果表明,随机引物以10个核苷酸为宜,最佳PCR反应条件为94℃变性30s,36℃退火60s,72℃链延长90s。在该反应条件下,检测了5个番茄品种(系)和一个杂一代的基因组DNA,每个样品可产生多条扩增片段,在不同的品种间表现出明显的多态性。  相似文献   

6.
引物对甘薯品种聚类分析结果的影响   总被引:1,自引:0,他引:1  
应用RAPD技术对10个供试甘薯品种的遗传关系进行了研究,探讨引物数量,多态性率和所用引物带型丰富度对聚类分析结果的影响。结果表明:聚类分析准确度与引物数量,引物的带型数有关,多态性率不是选用引物的主要标志。因此,在利用RAPD技术研究物种间遗传关系时,有必要保证一定数量的引物,且此物具有较多的带型。  相似文献   

7.
半随机单引物PCR扩增产物的特异性研究   总被引:1,自引:1,他引:0  
以M13mp19为模板,寡核苷酸“1224”为引物,进行半随机单引物PCR扩增;分析其扩增产物的限制性内切酶酶切图谱,推定它们分别在M13mp19序列中的确切位置;证实引物“1224”的3端与模板M13mp19负链的互补结合,至少需有连续的4上个核苷酸,才能产生单引物PCR扩增的模板分子,进行有效的PCR扩增,并由此决定了扩增产物中各DNA片段的大小及其在模板DNA序列中的特定位置。  相似文献   

8.
5种白蚁基因组DNA随机扩增多态性研究   总被引:2,自引:0,他引:2  
采用RAPD(Random amplified polymorphic DNA)技术对尖唇异白蚁(Heterotermes aculabialis)、黄肢散白蚁(Reticulitermes flaviceps)、扩头散白蚁(R.ampliceps)、细颚木鼻白蚁(Stylotermes angustignathus)和陇南树白蚁(Glyptotermes longnanensis)等5种白蚁的基因组DNA多态性进行了初步分析。在所用的20个随机引物中有4个引物能扩增出稳定的带型,5种白蚁6个群体共扩增出43条带,均为多态性片段;同一种类不同群体和同一群体不同品级间存在一定程度的多态性,但种间扩增片段差异显著大于种内差异。以UPGMA方法将扩增片段分布和共享度数据矩阵进行聚类分析,所得结果支持我国异白蚁属与散白蚁属合并的观点。  相似文献   

9.
丁(鱼岁)遗传多样性的随机扩增多态性DNA分析   总被引:4,自引:2,他引:4  
利用RAPD分子标记技术对15个丁鱼岁养殖个体的遗传多样性进行分析.选用20个随机引物对其基因组DNA进行PCR扩增,有16个引物可以扩增出稳定且清晰的条带,其中S103、S104和S105为多态引物.16个引物共扩增出65个DNA位点,片段大小在200~3 000 bp之间,其中多态性位点6个,多态位点比例为9.23%.个体间遗传距离在0~0.067 4之间,平均遗传距离为0.028 6.结果显示,丁鱼岁养殖群体的遗传多样性水平较低.  相似文献   

10.
利用微量液体稀释法进行药敏检测和RAPD技术进行基因分型,调查了铜绿假单胞菌在临床各科中的流行情况,以期建立稳定的临床检测系统,在控制院内感染的流行病研究中发挥更大的作用.结果表明耐药谱分6型,Ⅰ型占44.5%,Ⅱ型占18.5%,Ⅲ型占7.4%,Ⅳ型占7.4%,Ⅴ型占11.1%,Ⅵ型(不定型)占11.1%;RAPD分9型,A型占51.9%,B型占7.4%,C型占7.4%,D型占7.4%,E型占7.4%,F型占3.7%,G型占3.7%,H型占7.4%,I型占3.7%.说明基因型A型、耐药谱Ⅰ型的铜绿假单胞菌是此次ICU医院感染暴发流行的菌株,其他型别为非流行相关菌株.比较结果还说明RAPD基因分型的灵敏性、特异性及可靠性优于耐药谱分型,在医院感染流行病学调查中具有较大的应用价值.  相似文献   

11.
甜瓜种苗克隆   总被引:7,自引:0,他引:7  
蔡润  俞虹 《上海交通大学学报》2000,34(11):1586-1590
以古拉巴、蜜翠、伊丽莎白,西莫洛托4个引进杂交种甜瓜和七宝甜瓜,小麦瓜,青皮绿肉、亭林雪瓜本地品种为材料,用其子叶为外植体进行培养,获得无性繁殖系,结果表明,杂交种的芽诱导率高于本地品种;在14种激素配比组合中MS+6-BA0.5mg/L+IAA0.05mg/L培养基丛生芽诱导率最高,达72%-76%;MS+6-BA0.2mg/L+IAA0.05mg/L培养基最利于芽伸长;生根培养基为MS+IAA0.2mg/L+naa0.5mg/L,平均每粒种子可获得的8棵再生植株。  相似文献   

12.
河套蜜瓜ACC氧化酶基因cDNA部分片段的克隆和序列分析   总被引:1,自引:1,他引:1  
以河套蜜瓜(Cucumis melo L.ev Hetao)成熟果实为材料,用硫氰酸胍法提取总RNA,以oligo(dT)15为引物,反转录合成cDNA,利用一对甜瓜ACC氧化酶(1-aminocyclopropane-1-earboxylate oxidase,ACO)基因cDNA的特异性引物进行聚合酶链式反应(PCR)扩增。获得了预期大小的cDNA片段.将此片段克隆于pUCl9质粒中,进行DNA序列分析.序列分析结果表明该片段为545bp,编码甜瓜ACO的第126至第306个氨基酸.该河套蜜瓜ACO基因cDNA序列与Andes甜瓜、Cantaloup charentais甜瓜和哈密瓜的相应序列进行比较,其核苷酸序列与Andes甜瓜的同源性为99.4%;与Cantaloup charentais甜瓜和哈密瓜的同源性均为99.6%。与其对应的氨基酸序列的同源性均为99.4%.  相似文献   

13.
14.
新的矮秆基因的发掘、研究和利用对水稻育种和植物生长发育机制研究有重要的作用.用60Coγ射线辐照粳稻9522,获得一个能稳定遗传的突变体.该突变体表型为株高较野生型矮,叶片短而微卷.将该突变体与籼稻广陆矮杂交,F2代呈3∶1分离,说明该突变体受隐性单基因控制.通过InDel分子标记对F2代分离群体进行遗传定位,将该基因定位于第6染色体InDel标记OS604附近.随后又发展了多对有多态性的InDel分子标记,将该基因座位精细定位在InDel标记XL6-6和XL6-1之间,AP003490和AP005619上,两个引物之间的物理距离为118 kb.本研究为该克隆基因及其作用机理的探究奠定了基础.  相似文献   

15.
I.I.D.随机变量部分和之随机和的极限定理   总被引:8,自引:0,他引:8  
论文研究了部分和之随机和的大数律和中心极限定理,所得结果推广了文献[4]中部分和之和的大数律和中心极限定理。此外,论文还研究了由部分和之和所定义的停时,并且对于停时建立了中心极限定理。  相似文献   

16.
The exploration of new genes controlling rice leaf shape is an important foundation for rice functional genomics and plant archi-tecture improvement. In the present study, we identified a rolling leaf mutant from indica variety Yuefeng B, named rl11(t), which exhibited reduced plant height, rolling and narrow leaves. Leaves in rl11(t) mutant showed abnormal number and morphology of veins compared with those in wild type plants. In addition, rl11(t) mutant was less sensitive to the inhibitory effect of auxin than the wild type. Genetic analysis suggested that the mutant was controlled by a single recessive gene. Gene Rl11(t) was initially mapped between SSR markers RM6089 and RM124 on chromosome 4. Thirty-two new STS markers around the Rl11(t) region were developed for fine mapping. A physical map encompassing the Rl11(t) locus was constructed and the target gene was finally delimited to a 31.6 kb window between STS4-25 and STS4-26 on BAC AL606645. This provides useful information for cloning of Rl11(t) gene.  相似文献   

17.
A cucumber ( Cucumis sativus L. ) molecular linkage map, including 79 random-amplified polymorphic DNAs (RAPD)and two genes , lb for lateral branch and f for female sex expression, is constructed from a cross between a line, S52, with weak lateral growing ability and staminate from Dabieshan Mountains area in China and another line, S06, with strong lateral growing ability and gynoecious from Europe. The map contains nine linkage groups and spans 1110.0 cM with an average distance of 13.7 cM between loci. The lb locus is located in a longer linkage group LG-2 and flanked by two markers, OP-Q5-1 and OP-M-2-2, at 9.3 cM and 15.9 cM, respectively. In the meantime, the RAPD loci, OP-Q5-2 and BC151, in a short linkage group were found to flank f at 13.7 cM and 13.4 cM,respectively. The construction of RAPD map has paved a way for further study of the genes for lateral branch, female sex expression and other agronomic traits in cucumber.  相似文献   

18.
讨论了具有双线性DBL(1,0,1)误差的非线性回归模型的相关性和方差齐性的检验问题,用Score检验方法给出了双线性项检验以及相关性和方差齐性同时检验的检验统计量,并用随机模拟验证了检验方法的正确性;推广和发展了具有线性序列误差回归模型的结果;最后将结果应用于DBL(0,1,1)误差的非线性回归模型。  相似文献   

19.
【目的】以25年生马尾松种源、地点、林分3水平子代试验林为研究材料,从表型、遗传变异两方面开展研究,以期为马尾松遗传育种策略的制定提供有价值参考。【方法】采用SSR分子标记进行遗传结构分析,使用Arlequin 3.5软件依据线性模型估算各层次变异的相对分量。以SAS分析软件依据线性模型对林分生长量数据进行统计分析,以4因素嵌套模型估算各层次变异的相对分量。【结果】遗传多样性分析结果表明,种源间及种源内无明显的遗传分化。分子方差分析结果表明,种源间的遗传变异仅占总变异的2.56%,种源内不同地点间的变异占1.66%,地点内个体间的遗传变异则占总变异的95.78%。生长表型数据分析结果同样显示胸径与材积性状在种源间、种源内地点间、同一地点的优良林分与普通林分间均无显著差异。【结论】分子方差分析与生长性状表型数据方差分析的结果均表明,广西马尾松的主要遗传变异存在于林分内个体间。因此在优良种源中开展优良单株选择可以获得更好的改良效果。该结论对于马尾松遗传育种策略的制定具有重要的参考价值。  相似文献   

20.
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