二十面体病毒及其衣壳蛋白质

许多病毒具有二十面体结构。本文对已经发现的各种二十面体病毒进行了分类,分析了二十面体病毒衣壳的结构特征,阐述了二十面体病毒的结构蛋白。     

模拟构筑二十面体病毒衣壳结构的研究进展

许多病毒具有二十面体对称结构,二十面体病毒衣壳结构的模拟构筑已成为物质结构的研究目标之一.介绍了二十面体病毒衣壳结构的几种模型,对各种模型的特点及应用范围进行了归纳,并对衣壳结构模拟构筑的意义进行了简要介绍.     

关于B12二十面体结构单元成键情况的探讨

单质硼有多种复杂的晶体结构.对于α-菱形单质硼的结构,有关的教科书大多是作如下描述的:“……其基本的结构单元为正二十面体的对称几何构型.每个面近似为一个等边三角形,20个面相交成12个角顶.每个角顶为一个硼原子所占据,每个硼原子与邻近的5个硼原子等距离.如图1,每个二十面体通过处在腰部的6个硼原子以三中心     

Al-Fe-Ce非晶合金中的二十面体短程序

采用X射线衍射(XRD)和高分辨透射电镜(HRTEM)对Al-Fe-Ce非晶合金的局域结构进行了研究,分析了二十面体短程序对非晶合金的形成及热稳定性的影响.Al-Fe-Ce非晶合金中的二十面体短程序均匀弥散分布在非晶基体中.Al颗粒被二十面体化学短程序紧紧包围,二十面体化学短程序阻碍了Al颗粒的长大,面心立方铝(fcc-Al)的形核需要二十面体结构的分解及溶于其中的元素的扩散.二十面体结构单元的存在和均匀分布有利于增强非晶合金的玻璃形成能力和非晶相的热稳定性.     

二十面体准晶对非晶形成影响的模拟

采用分子动力学模拟技术,以液态金属Ni为例,研究了在不同冷却条件下形成晶体及非晶的过程.模拟采用镶嵌原子法(EAM)作用势,得到了不同温度、不同冷却速度下Ni的径向分布函数以及原子组态变化的重要信息,利用键对分析技术探讨了二十面体准晶对非晶形成的影响.     

二十面体碳硼烷的亲电取代定位效应理论研究

利用Ｇａｕｓｓｉａｎ９４从头计算程序在６－３１Ｇ基组下对二十面体碳硼烷Ｃ２Ｂ１０Ｈ１２、ＣＢ１１Ｈ１２＾－及其衍生物ＣＢ１１Ｈ１１Ｂｒ＾－进行了从头计算，结果表明，在亲电取代反应中，杂原子Ｃ具有对、空间定位效应，取代基－Ｂｒ为邻，对位定位基因，与实验事实相符。     

金团簇二十面体结构融合过程中其催化活性的演变

近年来,由有机配体保护的原子精确金属团簇在合成方面已取得了重要进展,其独特的原子结构对一些化学反应产生独特的催化效果.原子精确的团簇催化剂明显不同于纳米颗粒催化剂和单原子催化剂,是一种关联均相和多相的、原子数目确定、尺寸均一、结构精确的新型催化剂.从原子尺度上精确构筑团簇催化剂,探究亚纳米尺度的微观结构对催化性能的影响...     

二十面体对称性(I~h)分子的从头计算研究II. 铜原子簇Cu~13的电子结构

应用对称性约化计算方案, 完成了铜原子簇Cu~13(I~h)三种基组下的从头计算, 最大维数390。为了进行比较, 也进行了Cu~2、Cu~4、Cu~6及Cu~8的计算。经过优化, 获得基态及平衡几何、布居、结合能等数据, 表明Cu~13可能稳定存在。Cu~13中以d成分为主的分子轨道均已填满, 对化学键无实际贡献, 成键作用为s, p性质; 再者, d带与s带不相交叠, 无金属Cu能带的特征。无论平衡几何、布居及结合能数值均与采用的其组很有关系, 虽然定性趋势是一致的。     

二十面体壳层结构——纪念C60发现10周年

圆顶建筑、病毒衣壳和C₆₀分子·笼的生成机制和尺寸差别很大，但都属二十面体壳层，遵循同一几何规律。圆顶建筑和病毒衣壳由近似全等的三角面构成，有12个五键连3⁵顶，10（T-1)个六键连3⁶顶，其中三角面数T=h²+hk十k²是二十面体的一个三角中的小三角面数，h,k是六角坐标系中3⁵顶的坐标。另一方面，全碳分子笼C_n(包括其原型C₆₀)由12个五角面与10(T-1)个六角面围成，全是三键连顶(h,k是一个五角面中心的坐标)。显然，这两类二十面体壳层是对偶的，也就是它们的面、顶有互换关系。本文讨论这些二十面体壳层的几何特征及富勒烯的多样性，强调不同学科间的联系和科学研究的继承与发展的关系。     

二十面体对称性(I~h)分子的从头计算研究II. 铜原子簇Cu~13的电子结构

应用对称性约化计算方案, 完成了铜原子簇Cu~13(I~h)三种基组下的从头计算, 最大维数390。为了进行比较, 也进行了Cu~2、Cu~4、Cu~6及Cu~8的计算。经过优化, 获得基态及平衡几何、布居、结合能等数据, 表明Cu~13可能稳定存在。Cu~13中以d成分为主的分子轨道均已填满, 对化学键无实际贡献, 成键作用为s, p性质; 再者, d带与s带不相交叠, 无金属Cu能带的特征。无论平衡几何、布居及结合能数值均与采用的其组很有关系, 虽然定性趋势是一致的。     

计算透射电镜薄样品中面状特征迹线转动角的新公式

鉴于现有文献中关于面状特征迹线转动角的计算公式(简称pp公式)与实验测量结果相差较大,笔者模拟薄晶体样品位向调整时的双倾操作过程,推导出计算面状特征迹线方向随样品倾转而变化的新公式。通过与实验测量值及pp公式计算结果相比较,证实本公式给出的计算值与实验结果相符,并再次反映出pp公式的不适用性。     

Ru修饰Pd二十四面体纳米晶的合成及其甲醇电催化氧化性能

表面结构控制和表面异种金属修饰是调控催化剂反应性的重要方法。因此,我们结合高指数晶面结构的高反应性与表面修饰异种金属,合成具有{730}高指数晶面的钯二十四面体纳米晶,并通过循环伏安扫描电沉积法得到Ru修饰的钯二十四面体纳米晶。电化学测试结果表明,低的Ru覆盖度(θ_(Ru)=0.08)可显著提高对碱性介质中甲醇电氧化的催化性能。电化学原位红外光谱结果表明,少量Ru的修饰没有减少CO的生成,而是促进了低电位下甲醇氧化成甲酸根。     

从黑鳗藤藤茎中分离到的两个新C-21甾体苷

从黑鳗藤茎部分分离到两个新的C-21甾体苷，分别命名为黑鳗藤苷M (1)，N (2)，以及一个已知化合物stephanoside M (3)。通过化学方法和多种光谱手段，包括一维及二维核磁共振，这两个新化合物的结构可以鉴定为12-O-惕各酰基-20-O-N-甲基邻氨基苯甲酰基肉珊瑚苷元3-O-b-D-葡萄吡喃糖基-(1→4)-6-去氧-3-O-甲基-b-D-阿洛吡喃糖基-(1→4)-b-D-磁麻吡喃糖基-(1→4)-b-D-磁麻吡喃糖苷(1)，以及12-O-桂皮酰基-20-O-烟酰基(20S)-孕甾烷-6-烯-3b,5a,8b,12b,14b,17b,20-庚醇3-O-b-D-葡萄吡喃糖基-(1→4)-6-去氧-3-O-甲基-b-D-阿洛吡喃糖基-(1→4)-b-D-磁麻吡喃糖基-(1→4)-b-D-磁麻吡喃糖苷(2)。     

[Co(aipamp或apamp)(amp)Cl][ZnCl4]两体系中四个几何异构体的合成、结构解析以及量子化学计算

利用单晶X射线衍射解析了[Co(aipamp)(amp)Cl][ZnCl₄] (aipamp=2-[(2-氨基异丙基)氨基甲基]呲啶,amp=2-(氨基甲基)吡啶)体系中两个异构体Ⅱ的结构和[Co(apamp)(amp)Cl][ZnCl₄](apamp=2-[(2-氨基丙基)氨基甲基]呲啶)体系中一异构体Ⅲ的结构.晶体Ⅰ属单斜晶系,空间群P2₁/n,a=1.08028(10) nm,b=1.84843(18) nm,c=1.25582(12) nm,α=90.00°,β=97.150(2)°,γ=90.00°,V=2.4881(4) nm³,D_c=1.620 g·cm^-3,Z=6,F(000)=582,R=0.0361,wR=0.0974,晶胞中含4个配合物阳离子,4个[ZnCl₄]^2-阴离子;晶体Ⅱ 属三斜晶系,空间群 P1,a=0.9957(2) nm,b=1.0207(3) nm,c=1.1478(3) nm,α= 102.584(5)°,β=91.559(5)°,γ=98.462(5)°,V=1.1240(5) nm³,D_c=1.699 g·cm^-3,Z=2,F(000)=580.00,R=0.0449,wR=0.0984,晶胞中含2个配合物阳离子,2个[ZnCl₄]^2-阴离子.晶体Ⅲ属三斜晶系,空间群P1,a=0.82423(7) nm,b=1.7199(8) nm,c=1.36399(1) nm,α=86.6350(10)°,β=81.7140(10)°,γ=67.6230(10)°,V=1.10278(15) nm³,D_c=1.734 g·cm^-3,Z=2,F(000)=582.00,R=0.0332,wR=0.0823,晶胞中含4个配合物阳离子,4个[ZnCl₄]^2-阴离子.三异构体中Co³⁺为六配位,且配合物阳离子中具有C-H…π 结构.用一、二维核磁共振技术解析了第四个配合物在溶液中的结构,论证了该异构体属于[Co(apamp)(amp)Cl][ZnCl₄]体系.4个异构体具有共同的结构特征--分子内C-H…π结构.     

[Co(aipamp或apamp)(amp)Cl][ZnCl4]两体系中四个几何异构体的合成、结构解析以及量子化学计算

利用单晶X射线衍射解析了[Co(aipamp)(amp)Cl][ZnCl4] (aipamp=2-[(2-氨基异丙基)氨基甲基]呲啶,amp=2-(氨基甲基)吡啶)体系中两个异构体Ⅱ的结构和[Co(apamp)(amp)Cl][ZnCl4](apamp=2-[(2-氨基丙基)氨基甲基]呲啶)体系中一异构体Ⅲ的结构.晶体Ⅰ属单斜晶系,空间群P21/n, a=1.08028(10) nm, b=1.84843(18) nm, c=1.25582(12) nm, α=90.00°, β=97.150(2)°, γ=90.00°, V=2.4881(4) nm3, Dc=1.620 g·cm-3, Z=6, F(000)=582, R=0.0361, wR=0.0974,晶胞中含4个配合物阳离子,4个[ZnCl4]2-阴离子;晶体II属三斜晶系,空间群 P1, a=0.9957(2) nm, b=1.0207(3) nm, c=1.1478(3) nm, α= 102.584(5)°, β=91.559(5)°, γ=98.462(5)°, V=1.1240(5) nm3, Dc=1.699 g·cm-3, Z=2, F(000)=580.00, R=0.0449, wR=0.0984,晶胞中含2个配合物阳离子,2个[ZnCl4]2-阴离子.晶体III属三斜晶系,空间群P1, a=0.82423(7) nm, b=1.7199(8) nm, c=1.36399(1) nm, α=86.6350(10)°, β=81.7140(10)°, γ=67.6230(10)°, V=1.10278(15) nm3, Dc=1.734 g·cm-3, Z=2, F(000)=582.00, R=0.0332, wR=0.0823,晶胞中含4个配合物阳离子,4个[ZnCl4]2-阴离子.三异构体中Co3+为六配位,且配合物阳离子中具有C-H…π 结构.用一、二维核磁共振技术解析了第四个配合物在溶液中的结构,论证了该异构体属于[Co(apamp)(amp)Cl][ZnCl4]体系.4个异构体具有共同的结构特征--分子内C-H…π结构.