Slimb通过泛素化降解hippo信号通路的辅转录因子Yki

Yki是hippo信号通路中主要的基因转录辅助因子,调节下游靶基因的表达。它在细胞生长分化、组织器官形成以及成体干细胞维持等方面都起着重要的作用。在果蝇中,Slimb是SCF E3泛素连接复合物中的亚基,具有底物专一性,特异性地降解蛋白质。本研究中发现,在体外Slimb能够通过泛素化降解Yki。进一步利用免疫共沉淀的方法,发现Slimb与Yki能够相互作用。果蝇中过表达yki产生的表型能够被同时过表达Slimb所恢复,被Slimb沉默所加剧。这些研究结果提示Slimb作为E3连接酶的一个亚基,可以调节Yki的稳定性,在研究hippo信号通路调节组织生长发育中具有重要的意义。     

基于转录因子信号识别基因的表达水平

真核生物的基因表达调控过程十分复杂,各种转录因子通过与基因上游特异性序列结合协同地对靶基因的表达水平进行调控.以人类GM12878细胞系为研究对象,基于表达谱RNA-seq数据构建了高低表达基因集合,利用74种转录因子(TF)的ChIP-seq峰值数据计算了转录因子和靶基因的关联分数(TFAS),进而根据转录因子间的相...     

植物中的DREB类转录因子

DREB转录因子属于AP2/EREBP转录因子家族.AP2/EREBP转录因子是特异存在于植物中,与植物发育密切相关的一类转录因子的总称.该家族有五个亚家族,其家族成员的蛋白质序列均含有保守的AP2 domain.其中,DREB转录因子特异地与DRE顺式作用元件相结合,在调节低温,干旱和高盐等胁迫反应时具有重要作用.一个DREB转录因子可以调控下游的多个抗逆基因,从而使植物产生抗逆性.植物抗逆反应是一个非常复杂的过程,目前人们对其信号转导正在进行进一步的探究.     

Wnt信号通路与干细胞定向分化

Wnt信号通路在胚胎发育过程中参与背腹轴的形成、细胞极性的建立以及决定细胞命运.利用干细胞定向分化模型可在体外培养条件下探索Wnt信号通路在哺乳动物早期胚胎发育过程中的分子机理,了解其信号网络对干细胞定向分化中各个事件的调控机制.本文通过综合近期Wnt信号通路的研究,阐述经典Wnt信号通路(Canonical Wnt signaling pathway)在干细胞定向分化中的作用.     

与植物抗逆性有关的转录因子研究概况

转录因子在植物防卫反应和逆境胁迫应答过程中具有重要功能.本文综述了与植物逆境抗性相关的5个转录因子家族:WRKY类、MYB类、bZIP类、NAC类和AP2/EREBP类的研究概况.     

MicroRNA与转录因子调控网络综述

MicroRNA是一类长度约为18-24nt的非编码小RNA,它在转录后水平通过调控靶基因来行使多种生物学功能,例如：细胞周期、分化、细胞增殖和凋亡等。在转录水平,转录因子作为一种重要的调控因子参与调控多种基因的表达。近些年研究表明转录因子可以直接调控miRNA的表达,并且参与了包括肿瘤疾病发生等多种生物学进程。转录因子与miRNA形成的调控网络已被广泛地研究,文中就目前已有的研究成果进行综述,以期为今后转录因子与miRNA调控通路的研究提供一定的理论基础。     

植物MYB转录因子研究

转录因子是通过转录水平或转录后水平上调控目的基因的表达来调控植物生长发育及生理代谢的.MYB(v-myb avian myeloblastosis viral oncogene homolog)转录因子是最大的植物转录因子家族成员之一,参与了细胞分化、细胞周期的调节,激素和环境因子应答,并对植物次生代谢以及叶片等器官形态建成具有重要的调节作用.文章对MYB的发现及其结构特征和功能研究进展进行综述,为进一步开展MYB基因的克隆、功能研究和利用提供参考.     

植物MYB转录因子研究

转录因子是通过转录水平或转录后水平上调控目的基因的表达来调控植物生长发育及生理代谢的.MYB (v-myb avian myeloblastosis viral oncogene homolog)转录因子是最大的植物转录因子家族成员之一,参与了细胞分化、细胞周期的调节,激素和环境因子应答,并对植物次生代谢以及叶片等器官形态建成具有重要的调节作用.文章对MYB的发现及其结构特征和功能研究进展进行综述,为进一步开展MYB基因的克隆、功能研究和利用提供参考.     

基于序列预测转录因子的相互作用

转录因子（TF）对真核生物的转录调控有着举足轻重的作用,而这些转录调控大多不是一个转录因子可以独立完成的,还需要其他转录因子的帮助来共同完成对基因的转录控制。我们提出了一种新的基于序列的方法来预测转录因子的相互作用,利用了转录因子结合位点（TFBS）的距离,方向和相位等信息,利用酵母菌的芯片数据来实现这一思想,获得了165对统计上有相互作用的转录因子,通过与SGD数据库中的蛋白质-蛋白质相互作用的数据进行比较,可以达到约95．5％的正确率。最后我们还利用预测的结果讨论了相互作用的转录因子对在基因组上存在的一些特征,例如,他们对距离,方向,相位的倾向性。希望我们的预测有助于更好的理解真核生物的转录控制网络。     

甘肃武威市胃癌危险因素病例对照研究

选取甘肃省武威市494例胃癌病人并按性别、年龄等为配比条件，选取该市988名健康人群进行1：2配对的病例对照研究。Logistic条件回归分析表明，长期饮用地表水、食用腌菜、肿瘤家族史、胃慢性疾病史等与胃癌发生存在显著正关联．胃慢性疾病史、不良饮食习惯及肿瘤家族史可能是胃癌的危险因素．     

Bioinformatics study indicates possible microRNA-regulated pathways in the differentiation of breast cancer

microRNAs (miRNAs) have been reported to be associated with the pathogenesis and progression of breast cancer.However,little is known about the pathways through which miRNAs regulate these processes,e.g.,the interaction between miRNAs and their target genes with regard to different pathological status of breast cancer,such as histological grades.This study investigated the possible roles of miRNAs in the differentiation of histological grades of breast cancer with a computational approach.Based on a microar...     

影响胃癌根治术后复发转移的因素

目的探讨影响胃癌根治术后复发转移的因素。方法回顾性分析302例胃癌患者根治术后肿瘤复发转移的情况,并采用Logistlc进行单因素和多因素回归分析。结果本组患者根治术后复发转移率为45．4％,术后2年内复发转移率73．7％,2-5年复发转移率21．％,5年后复发转移率4．4％;单一复发转移占83．2％,多部位复发转移占16．8％。单因素分析显示胃癌根治术后复发转移与肿瘤大小、原发灶部位、癌细胞分化程度、大体分型、癌细胞浸润深度、辅助化疗、术后病理、TNM分期有关,经过多因素回归分析后显示肿瘤大小、辅助化疗、TNN分期为胃癌根治术后复发转移的独立因素。结论胃癌根治术后复发转移大部分在术后2年内,以单一复发转移为主;肿瘤大小、1NM分期及辅助化疗为胃癌根治术后复发转移的独立影响因素。     

PMA激活内皮细胞早期应答基因谱分析

血管内皮细胞具有一系列重要生理功能,内皮细胞受外界刺激时可转录众多的mRNA,体现了它们的生物学重要性,内皮细胞的极早期应答基因（Immediate early response gene.ERG)是一类重要的介导基因,决定了外界刺激条件下细胞的最后反应模式,以包含4096条各种人体基因的DNA芯片观察了血管内皮细胞受分化诱导剂PMA（phorbol myristate acetate)激活后早期应答基因的表达谱,证实17条ERG属已知基因,数据处理聚类结果表明,多数ERG属蛋白质激酶及转录调控因子,23条上调新基因从功能归类为ERC;并且报道了其中的一条新基因的序列特征及其染色体位置和基因结构,为研究这个基因的功能提供了有力的实验依据。