拓扑指数与烷烃色谱保留指数的定量相关研究

基于分子图论, 计算了64个链烷烃的一阶连接性指数(¹χ)和奇偶指数(OEI), 并对气相色谱保留指数进行定量结构-性质相关(QSPR)研究, 得到多元线性回归模型RI＝55.7631＋25.7317OEI＋111.4508¹χ (R²＝0.9960, RMS＝9.36, ARD＝1.02%). 交叉验证和预测结果表明, 所建立的QSPR模型具有良好的稳定性和预测能力. 与文献结果比较, 本文所用的参数少, 且计算简便.     

手性有机化合物构效关系的量子拓扑学研究

在拓扑化学理论基础上, 从手性分子中成键原子的结构特征和手性原子所处的局部化学微环境出发, 应用密度泛函理论(DFT), 在B3LYP/6-31＋G(d)水平上计算所得距离代替传统二维距离, 结合分子中各原子的支化度, 应用原子的平衡电负性对分子图进行着色, 并引入手性校正因子进行校正, 得到新型的手性拓扑指数w₁和w₂. 采用偏最小二乘回归法建立了18种手性羟基酸和氨基酸的薄层色谱保留指数R_M的定量结构-保留拓扑模型, 并用这种模型对R_M进行预测, 结果表明预测结果和实验值吻合较好. 同时对拓扑模型采用留一交叉检验法(leave-one-out cross-validation, LOO-CV)和外检验相结合的方法进行测试, 测试结果显示模型具有良好稳定性和较强的预测能力.     

电拓扑状态预测多氯二苯并噻吩及噻吩砜化合物的气相色谱保留指数

以原子类型电拓扑状态指数(ETSI)有效表征了135 个多氯二苯并噻吩(PCDT)和135 个多氯二苯并噻吩砜(PCDTO₂)的分子结构, 应用基于预测的变量选择与模型化(VSMP)方法建立PCDT 和PCDTO₂ 化合物在DB-5 气相色谱柱上的气相色谱保留指数(RI)与分子结构(ETSI)的定量相关模型, 模型的相关系数r² 分别为0.9939 和0.9729, LOO 交叉验证相关系数 q² 分别为0.9921 和0.9692. 为验证模型稳定性和预测能力, 应用17 个PCDT 和PCDTO₂ 训练集样本构建的QSRR 模型的r² 分别为0.9959 和0.9783, LOO 交叉验证相关系数 q² 分别为0.9921 和0.9740, 说明模型具有良好的稳定性. 以此模型预测外部8 个检验集及110 个预测集的RI 值, 8 个检验集样本的结果表明训练集模型具有良好预测能力.     

肿瘤血管阻断剂黄酮-8-乙酸类衍生物的三维定量关系研究

选择了肿瘤血管阻断剂黄酮-8-乙酸类衍生物, 采用比较分子力场分析(CoMFA)和比较分子相似性指数分析(CoMSIA)方法进行三维定量构效关系的研究. 33个化合物建立了预测模型, 6个化合物作为训练集进行模型验证. 其中CoMFA模型的交叉验证系数q²＝0.621, 最佳主成分数为4, 标准偏差s_press＝0.345, 非交叉相关系数r²＝0.945, 标准偏差s＝0.131, F＝120.455. CoMSIA模型的交叉验证系数q²＝0.700, 最佳主成分数为5, 标准偏差s_press＝0.312, 非交叉相关系数r²＝0.946, 标准偏差s＝0.133, F＝94.193. 计算结果表明, 构建的CoMFA和CoMSIA模型具有良好的预测能力, 可用于指导该类化合物的设计.     

拓扑指数与手性化合物构效关系研究

传统的拓扑指数仅考虑原子间的连接关系,不能区分手性信息．故本研究对Am指数与分子连接性指数进行了扩展,并将其用于3-苯基哌啶类手性化合物的构效关系研究．扩展后的拓扑指数构造的数学模型优于用传统的Am指数与分子连接性指数得到的模型．同时进行了变量的两两相关性测试,结果显示所选3个变量之间的相关性较小．通过交叉验证,证明手性拓扑指数所得到的数学模型是稳定的．并进一步运用人工神经网络,得到了满意的结果．     

高效液相色谱法同时测定水体中氧氟沙星及其手性异构体

建立了一种简单快捷的手性配位交换高效液相色谱测定地表水中氧氟沙星及其手性异构体的方法,并研究了常见金属阳离子（Ca²⁺、Mg²⁺、Fe³⁺、Zn²⁺）和腐殖酸（HA）对二者分离的影响。采用C₁₈色谱柱（25 cm×0.46 cm,5 μm）,流动相为pH值4.5的20%（v/v）甲醇水溶液（含4 mmol/L异亮氨酸（配体）和3 mmol/L CuSO₄）,流速为1.0 mL/min,柱温为40℃,检测波长为293 nm。氧氟沙星及其手性异构体左氧氟沙星可在18 min内分离,分离度（R）为2.70。结果表明,不同金属阳离子和腐殖酸对手性分离未见明显影响,但会降低氧氟沙星及其手性异构体的峰面积,其中Fe³⁺和高浓度腐殖酸的影响最大。该法能够快速高效测定地表水中氧氟沙星及其手性异构体,但在测试中需考虑Fe³⁺和高浓度腐殖酸的影响。     

基于偶氮桥连的新型双铁羰基配合物:Fe2(N2C5H10)(CO)6-x (PR3)x的合成及衍生

具有五元环结构的偶氮化合物4,4-二甲基-4,5-二氢-3H-吡咯（N₂C₅H₁₀）,与Fe₃（CO）₁₂在甲苯中加热回流反应,生成双铁六羰基配合物Fe₂（N₂C₅H₁₀）（CO）₆（1）.反应中N=N双键被还原,配体以（N₂C₅H₁₀）^2-的形式与Fe^IFe^I配位,形成具有蝶形结构的34e^-化合物.研究了在脱羰基试剂Me₃NO存在条件下,1和单齿膦配体PR₃反应生成Fe₂（N₂C₅H₁₀）-（CO）₅（PR₃）（PR₃=PPh₃,2a;PCy₃,2b）单取代配合物.光照条件下,化合物1中的CO配体还可以被双齿膦配体dppe[dppe=1,2-C₂H₄（PPh₂）₂]和dppbz[dppbz=1,2-C₆H₄（PPh₂）₂]取代,生成产物的类型和膦配体的夹角相关.与夹角较大的dppe反应,生成桥连产物Fe₂（N₂C₅H₁₀）（CO）₄（μ-dppe）（3a）;而与刚性较大的dppbz反应时,Fe₂（NR）₂的蝶形结构打开呈四元环;其中一个Fe上的CO被取代,dppbz与该Fe中心螯合,生成具有桥连CO的化合物Fe₂（N₂C₅H₁₀）（μ-CO）（CO）₄（κ²-dppbz）（3b）.合成具有Fe^I-CO-Fe^I结构的羰基化合物,一直是模拟[FeFe]氢化酶活性中心还原态结构Fe₂（SR）₂（μ-CO）-（CO）_5-xL_x的重要挑战.该类Fe₂（NR）₂（CO）_6-x（PR₃）_x化合物的合成,能为探索模拟[FeFe]氢化酶活性中心结构提供新的途径和思路.以上化合物均通过核磁[³¹P（¹H）NMR]、红外光谱（IR）、元素分析及X射线单晶结构衍射等表征.     

超高效液相色谱-串联质谱法鉴定与分析乙醛诱导脱氧核糖核苷酸加合物

采用超高效液相色谱-串联质谱法对两种非对映异构体（6S,8S）1,N²-丙基-2'-脱氧鸟苷（ProdG）和（6R,8R）ProdG加合物进行鉴定与分析。通过色谱保留时间及质谱碎裂方式分析,证明乙醛与2'-脱氧鸟苷（dG）反应可形成ProdG加合物。体外实验表明,乙醛能够诱导脱氧核糖核苷酸（DNA）形成ProdG加合物,并且（6R,8R）ProdG的生成量大于（6S,8S）ProdG的生成量。细胞实验结果显示,乙醛暴露能显著提高人肺胚成纤维细胞（MRC5）基因组DNA中ProdG加合物的水平,且ProdG加合物的水平与乙醛的暴露浓度呈正相关。此外,100 μ mol/L的乙醛暴露使（6R,8R）ProdG的含量从（6.4±0.3） 个/10⁸个碱基增加到（127.2±2.7） 个/10⁸个碱基,上调程度大于（6S,8S）ProdG（从（6.5±0.3） 个/10⁸个碱基增加到（115.3±2.5） 个/10⁸个碱基）。该工作为乙醛暴露所引起的DNA加合物水平上升提供了实验依据。     

硫醇的分子连接性指数与气相色谱保留值

硫醇的分子连接性指数与气相色谱保留值赵邦屯王利亚（洛阳师专化学系洛阳４７１０２２）关键词硫醇分子连接性指数气相色谱保留值中图分类号Ｏ６５７．７１有机化合物的色谱保留行为与其结构之间的定量关系研究一直是物理化学、分析化学和生物化学的研究对象之一。长期以...     

手性有机酸保留指数的手性指数及原子类型电拓扑指数模型

基于手性碳原子的取代基次序规则,提出分子手性指数(wj),结合原子类型电拓扑指数(En)研究18种手性羟基酸和氨基酸的薄层色谱保留指数(RM)的定量关系(QSRR).经最佳变量子集回归建立最佳四元数学模型,传统的相关系数(R2)为0.969,留一法(LOO)的交互验证系数(Q2)为0.943,结果证明具有良好的稳健性及预测能力.根据进入该模型的4个结构参数(wj,E13,E16,E17)可知,影响手性有机酸保留指数的主要因素是分子的二维结构特征(如襒O,—OH,—NH2)和分子的手性特征.综上所述,新建wj及En对手性有机酸的保留指数表征具有合理性与有效性,为预测手性有机酸的保留指数提供一种有效方法.     

Methods of studies on quantitative structure–activity relationships for chiral compounds

Chiral compounds are very important in drug development, organic synthesis, materials science, toxicology, or environmental chemistry. Therefore, for creating new drugs, several methods have been suggested in recent years. In several laboratories in the world, some new methods for the derivations of the parameters were constructed and used for studies on quantitative structure–activity/property relationships of chiral molecules. The algorithms reviewed in this paper involve Zargeb group chiral indices, chiral molecular connectivity index, chiral topological charge index, chiral A_m index, chiral indices based on the matrixes, chiral indices based on chiral product, conformation‐independent chirality code, conformation‐dependent chirality code, quantitative two‐dimensional chirality degrees of benzenoids, and so on. Copyright © 2012 John Wiley & Sons, Ltd.     

复杂无机离子晶体晶格能的估算

A novel connectivity index ~mG based on adjacency matrix of molecular graphs was proposed as follows:~mG=∑(g_i·g_j·g_k…)~(0.5).The element g_i of adjacency matrix was defined as g_i=(1 Z_i~(1.4))/(1 r_i~(1.4)),where Z_i and r_i are thecharge number and the thermochemical radius of ion i respectively,and the radii r_i for metal ions are taken to be theGoldschmidt radius.The regression analysis by the connectivity index ~1G can provide a high-quality QSPR modelfor the lattice energies of 245 complex inorganic ionic crystal samples.The results imply that the lattice energiesmay be expressed as a linear model of the connectivity index ~1G.For the linear model the correlation coefficient rand the standard error s are 0.9998 and 228.72 kJ/mol,respectively.The cross-validation by the leave-one-outmethod demonstrates that the model is highly reliable from the point of view of statistics.     

Relationship between GLC retention data and topological indices for a wide variety of solutes on five stationary phases of different polarity

Summary Numerical correlations between the specific retention volumes of several dozen solutes (hydrocarbons and derivatives containing oxygen, nitrogen and halogens) and between the retention indices, from the literature, of 26 chemical derivatives of benzene on several stationary phases have been studied. Although significant linear correlations were usually obtained between logV _g and the valence connectivity indices,¹ X ^v , for hydrocarbons and non-hydrocarbons with the same chemical function, the relationship between logV _g and the Wiener,W, and Balaban,J, indices for hydrocarbons was found to be non-linear. Correlations between retention index increments and valence connectivity index increments for the 26 chemical derivatives of benzene were linear for alkyl substituents only.     

Hosoya polynomials of TUC4C8(R) nanotubes

For a connected graph G, the Hosoya polynomial of G is defined as H(G, x) = ∑_{u,v}?V(G)x^{d(u, v)}, where V(G) is the set of all vertices of G and d(u,v) is the distance between vertices u and v. In this article, we obtain analytical expressions for Hosoya polynomials of TUC₄C₈(R) nanotubes. Furthermore, the Wiener index and the hyper‐Wiener index can be calculated. © 2008 Wiley Periodicals, Inc. Int J Quantum Chem, 2009     

On molecular topological properties of hex‐derived networks

Topological indices are numerical parameters of a molecular graph, which characterize its topology and are usually graph invariant. In quantitative structure–activity relationship/quantitative structure–property relationship study, physico‐chemical properties and topological indices such as Randić, atom–bond connectivity (ABC), and geometric–arithmetic (GA) index are used to predict the bioactivity of chemical compounds. Graph theory has found a considerable use in this area of research. In this paper, we study hex‐derived networks HDN1(n) and HDN2(n), which are generated by hexagonal network of dimension n and derive analytical closed results of general Randić index R_α(G) for different values of α, for these networks of dimension n. We also compute the general first Zagreb, ABC, GA, ABC₄, and GA₅ indices for these hex‐derived networks for the first time and give closed formulae of these degree‐based indices for hex‐derived networks. Copyright © 2016 John Wiley & Sons, Ltd.     

Chiral α-Amino Acid-Based NMR Solvating Agents

Four new chiral α-(nonafluoro-tert-butoxy)carboxylic acids were synthesized from naturally occurring α-amino acids (alanine, valine, leucine and isoleucine, respectively), and tested in ¹H- and ¹⁹F-NMR experiments as chiral NMR shift reagents. The NMR studies were carried out at room temperature, using CDCl₃ and C₆D₆ as solvents, and (RS)-α-phenylethylamine and (RS)-α-(1-naphthyl)ethylamine as racemic model compounds. To demonstrate the applicability of the reagents, the racemic drugs ketamine and prasugrel were also tested.     

两个修正的分子连接性指数用于有机物反磁磁化率的改进QSPR研究

为了预测有机物的摩尔反磁磁化率,基于分子图的连接矩阵和可变的原子价连接性指数δi’提出了一种可变的分子连接性指数mχ’ 及其逆指数mχ”。包含在δi’、 mχ’ 和mχ”定义式中的三个可变参数x、 a和y的最佳值可通过优化方法得到。当x=2.9、a=1.10、y=0.36时, 通过最佳子变量集合法可以构建一个良好的5参数模型。对721个有机物（训练集）,该模型的相关系数r、标准偏差s和平均绝对偏差分别是0.9930、4.96 cgs和3.74cgs。交叉验证说明,从统计学角度该模型具有良好的稳定性。另外该模型对另外360个有机物（测试集）摩尔反磁磁化率预测结果的平均绝对偏差为4.37cgs。结果表明本文的方法在预测有机物摩尔反磁磁化率方面比文献方法更有效。多元线性方法能得到比较理想的预测有机物摩尔反磁磁化率的模型。