N-乙氧羰基-N'-取代芳基硫脲晶体中的弱相互作用及超分子结构研究

合成了3种N-乙氧羰基-N'-取代芳基硫脲并确定了其晶体结构,晶体结构表明,在这些化合物中存在分子内及分子间的氢键,分子间的氢键将化合物1和2组装成了一维链状的超分子结构,由于空间因素,化合物3没有形成类似于1,2中的氢键组装成的链状超分子结构,而是形成了氢键链接的二聚体.同时在化合物1,3中还存在分子间的芳环间的π-π相互作用.在化合物1的晶体中,这种π-π相互作用使相邻的超分子链之间相互关联.化合物3的晶体中,相邻的二聚体间又通过π-π相互作用连接成了无限延伸的一维链状结构.     

N-乙氧羰基-N'-取代芳基硫脲晶体中的弱相互作用及超分子结构研究

合成了3种N-乙氧羰基-N'-取代芳基硫脲并确定了其晶体结构, 晶体结构表明, 在这些化合物中存在分子内及分子间的氢键, 分子间的氢键将化合物1和2组装成了一维链状的超分子结构, 由于空间因素, 化合物3没有形成类似于1, 2中的氢键组装成的链状超分子结构, 而是形成了氢键链接的二聚体. 同时在化合物1, 3中还存在分子间的芳环间的π-π相互作用. 在化合物1的晶体中, 这种π-π相互作用使相邻的超分子链之间相互关联. 化合物3的晶体中, 相邻的二聚体间又通过π-π相互作用连接成了无限延伸的一维链状结构.     

DNA甲基化-非甲基化碱基间堆积作用的理论研究

运用二级Mфller-Plesset(MP2)理论方法和cc-pVDZ基组优化了6-甲基鸟嘌呤(O6-MethylG),4-甲基胸腺嘧啶(O4-MethylT)以及5-甲基胞嘧啶(C5-MethylC)与DNA碱基鸟嘌呤(G),腺嘌呤(A),胞嘧啶(C),胸腺嘧啶(T)之间的堆积构型.在MP2/aug-cc-pVXZ//MP2/cc-pVDZ(X=D,T)水平上,采用完全基组外推方法校正了堆积碱基对间的相互作用能,并用完全均衡校正法(CP)校正了基组重叠误差(BSSE).MP2计算结果表明,DNA碱基甲基化使得嘧啶-嘧啶、嘧啶-嘌呤堆积碱基间的平行旋转角发生明显改变,并使堆积碱基间的相互作用能增大.在MP2/cc-pVDZ计算级别上得到了各堆积碱基对的全电子波函数,并用分子中的原子理论(AIM)分析了堆积碱基对间的弱相互作用.AIM分析结果显示,甲基化增强了堆积碱基间的π-π作用,且甲基氢与相邻碱基间形成H2CH…X(X=O,N,CH3,NH2)等类型的氢键.甲基化损伤使碱基间重叠程度增大、π-π作用增强以及堆积碱基间形成多个氢键,是堆积作用能增加的主要原因.     

锌配合物Zn(phen)(H2O)(3-mba)2的合成、结构表征及荧光性质

常温下,溶液法合成了一个单核结构的锌配合物Zn (phen)(H2O)(3-mba)2(phen:邻菲咯啉;3-Hmba∶3-甲基苯甲酸),并用红外光谱、元素分析、热重分析以及X射线单晶衍射表征了其结构.结果表明,配合物属于三斜晶系,空间群P1,晶胞参数:a=10.893(2)(A),b=11.461(2)(A),c=11.505(2)(A),α=95.54(3)°,β=115.80(3)°,γ =100.25(3)°,V=1247.9(4) (A)3,C28H24N2O5Zn,Mr=533.86,Z =2,Dc=1.421 g·cm-3,F(000) =552,最终偏离因子[I≥2σ(I)]R1=0.0471,wR2 =0.0954.在配位物分子中,中心锌离子是五配位模式,双分子间先通过O—H…O氢键形成二聚体,继而二聚体间通过相邻分子中的邻菲咯啉芳环的π-π堆积作用沿着a方向形成了一维超分子链.对配合物的荧光性能进行了测试.CCDC 1023439.     

3,4,5-三羟基苯甲酸二聚体氢键结构性质

分子间相互作用在生物和材料等科学中发挥着关键作用,研究分子间相互作用的本质意义重大。氢键是分子间相互作用的一种主要形式,在确定分子构象和晶体结构以及生物分子尤其是核酸和蛋白质的结构功能中起着重要作用[1-3]。苯甲酸衍生物广泛存在于生物大分子内,与生物活性离子通过氢键作用等改变生物活性分子的活性功能,研究苯甲酸衍生物分子间氢键相互作用对于了解生物体内的化学现象具有重要意义。研究表明菱角的抗肿瘤作用明显,实验上已经从菱角中成功提取了活性单体化合物:3,4,5-三羟基苯甲酸二聚体[4],理论研究标题化合物的氢键结构与氢…     

双链状异金属超分子化合物[Cu(oxbe)Ni(dpt)(H2O)]ClO4·0.5H2O的合成、晶体结构和磁性

以N-(2-羧基苯)-N’-(氨乙基)草酰胺根阴离子(oxbe)为桥联配体, 端接二丙烯三胺(dpt), 合成了铜镍异双核配合物[Cu(oxbe) Ni(dpt)(H2O)]ClO4·0.5H2O. 通过元素分析和IR 光谱对配合物进行了表征, 利用X射线单晶衍射测定了其晶体结构. 该化合物分子间通过氢键相互作用, 形成双链状超分子结构. 5—300 K 变温磁化率研究结果表明, 化合物中双核体系 Cu(SCu=1/2)-Ni(SNi=1) 中心原子间通过草酰胺桥联发生较强的反铁磁相互作用(磁参数J=-62.3 cm-1, g=2.11).     

具有新颖嵌合作用的金属配合物的微波合成、晶体结构及性质研究

在微波辐射条件下合成了两种新的离子液体金属配合物[Ni(m-HNDA)2(H2O)4](1),[Zn(m-HNDA)2(H2O)4]·H2O(2),用元素分析、红外光谱、紫外光谱对它们进行了表征,通过X射线单晶衍射测定了它们的晶体结构.在晶体结构中,标题物通过基团间的嵌合作用,π-π相互作用和分子间氢键自组装成了三维网状的多孔结构.由氢键和π-π相互作用的强弱推测标题物的稳定性次序2>1,与实测热稳定性次序完全吻合;电化学性质表明,金属的配位改变了配体的循环伏安性质.另外,两种配合物可在水溶液中高选择性的识别氟离子.     

肾上腺素盐酸盐和水的相互作用研究

使用核磁共振和电化学循环伏安法,对肾上腺素盐酸盐(AH)和水的相互作用进行了探讨.研究结果表明:AH不仅能和水分子形成分子间氢键,当浓度较大时,AH的苯环还可发生π-π堆积作用.此外,溶液pH对二者相互作用基本无影响.     

芳酰胺折叠体分子内N—H…OMe氢键强度评估

为了评估分子内N—H…OMe氢键诱导的芳酰胺折叠体分子内氢键的稳定性, 我们从相应间-苯二胺和间-苯二甲酸前体出发构筑了3个三、五和七聚体芳酰胺折叠体, 并合成了3个并入这些折叠体片段的基于十六烷二胺的酰胺聚合物. ¹H NMR, 定量芳酰胺氢-氘交换和晶体结构研究揭示, 折叠体中间区域的氢键最弱, 而处于骨架两端的氢键最为稳定. 氢-氘交换实验测定出了不同酰胺氢发生这一过程的半衰期, 最大差别约为8倍. 对并入折叠体片段的聚合物的单分子力谱(SMFS)研究揭示, 折叠体片段内不同区域分子内氢键的稳定性与单个折叠体分子内相应位置氢键的稳定性一致. 通过SMFS实验, 我们还测定出了不同氢键的绝对力值. 结果显示, 并入到聚合物中的短的三聚体折叠体具有最强的分子内氢键, 而五聚体和七聚体折叠体的部分分子内氢键较弱, 其力值出现在较低位置.     

软X-射线分光晶体马来酸氢十八酯的晶体结构

测定了标题化合物C_(22)H_(40)O_4的晶体结构，属空间群Pī，a=0.6833(2)，b=3.1662(5)，c=0.5392(1) nm，α＝90.63(2)．β=102.61(2)，γ＝89.03(2)°，Z=2偏离因子R=0.0465，晶体中分子通过氢键形成二聚体，二聚体在晶体中排列成层，进而这些层堆垛成晶体结构，层内二聚体之间相互作用比层之间的相互作用强．分子中的十八烷基的碳原子基本共面．其碳链呈锯齿状伸展，初步解释了晶体生长过程中的一些现象．     

锌配合物Zn(phen)(H_2O)(3-mba)_2的合成、结构表征及荧光性质（英文）

常温下,溶液法合成了一个单核结构的锌配合物Zn(phen)(H2O)(3-mba)2(phen:邻菲咯啉;3-Hmba:3-甲基苯甲酸),并用红外光谱、元素分析、热重分析以及X射线单晶衍射表征了其结构。结果表明,配合物属于三斜晶系,空间群P 1,晶胞参数:a=10.893(2)A,b=11.461(2)A,c=11.505(2)A,α=95.54(3)°,β=115.80(3)°,γ=100.25(3)°,V=1247.9(4)A3,C28H24N2O5Zn,Mr=533.86,Z=2,Dc=1.421 g·cm-3,F(000)=552,最终偏离因子[I≥2σ(I)]R1=0.0471,wR2=0.0954。在配位物分子中,中心锌离子是五配位模式,双分子间先通过O—H…O氢键形成二聚体,继而二聚体间通过相邻分子中的邻菲咯啉芳环的π-π堆积作用沿着a方向形成了一维超分子链。对配合物的荧光性能进行了测试。CCDC 1023439。     

β-羰基酰胺类化合物的配位及晶体结构

为确认β-羰基酰胺类化合物与铜离子的配位位点,合成了6种β-羰基酰胺类配体L1～L6,分别与Cu(Ⅱ)进行配位反应.对生成的配合物进行单晶培养,并采用X射线衍射仪测定了单晶结构.结果表明,只有配体L6(2-苯甲酰乙酰苯胺)的铜配合物能够得到单晶.在其单晶中,Cu(Ⅱ)离子与来自2个配体的4个氧原子配位形成长方形的构型;配合物中存在分子内氢键、分子间氢键和π-π相互作用.     

杯［4］芳烃衍生物一维超分子的晶体结构研究

杯芳烃是继冠醚、环糊精之后的第三代主体分子 ,在主客体化学、超分子化学中占有重要地位 [1～ 3] .据文献报道 ,在杯 [4]芳烃衍生物中存在各种各样的作用力 [4 ] ,如分子内氢键 [3,4 ]、分子间氢键 [5]、阳离子 -π作用 [6 ]、CH3-π作用 [7]和 π-π相互作用 [8,9]等 .本文报道了杯 [4]芳烃衍生物 5 ,1 1 ,1 7,2 3 -四叔丁基 -2 6,2 8-二 [2 -(甲氧基羰基 )苄氧基 ]-2 5 ,2 7-二羟基杯 [4]芳烃 (简称 L,结构式见 Scheme1 )的晶体结构 .研究中发现 ,分子中存在分子内氢键和分子间π-π相互作用 ,后者使化合物 L形成了一维锯齿形的超分子…     

三聚氰胺和对苯二氧乙酸共晶中的三维氢键网络(英文)

合成了一个新的超分子聚合物{(MAH+)2(p-BDOA2-)·4H2O}n(MA=三聚氰胺;p-BDOAH2=对苯二氧乙酸),通过X-射线对其结构进行了表征。在该聚合物中,三聚氰胺被质子化,相邻的三聚氰胺分子通过氢键形成一维阳离子链(MAH+)n,相邻的阳离子链由p-BDOA2-阴离子连接构成波浪状的二维层,层状结构通过水分子的氢键和π-π堆积形成三维结构。     

三聚氰胺和对苯二氧乙酸共晶中的三维氢键网络

合成了一个新的超分子聚合物{(MAH+)2(p-BDOA2-)·4H2O}n(MA=三聚氰胺;p-BDOAH2=对苯二氧乙酸),通过X-射线对其结构进行了表征。在该聚合物中,三聚氰胺被质子化,相邻的三聚氰胺分子通过氢键形成一维阳离子链(MAH+)n,相邻的阳离子链由p-BDOA2-阴离子连接构成波浪状的二维层,层状结构通过水分子的氢键和π-π堆积形成三维结构。     

两个基于[Fe(bpca)(CN)3]-的一维3d-4f异金属配合物的合成和晶体结构

以[(bpca)Fe(CN)3]-(bpca=二(2-吡啶羰基)酰胺阴离子)为构筑基元,设计合成了2个新颖的3d-4f异金属配合物,{[(bpca)Fe(CN)3Pr(H2O)5]Cl2}n(1)和{[(bpca)2Fe2(CN)6Pr(H2O)6]Cl·4H2O}n(2),并测定了它们的晶体结构.化合物1的晶体属正交晶系,Pnma空间群;而化合物2属三斜晶系,P1空间群.在这2个化合物中,[(bpca)Fe(CN)3]-和[Pr(H2O)x]3 (1,x=5;2,x=6)交替排列形成一维链状结构,并通过π-π堆积作用、氢键作用及分子间短距离相互作用形成三维网络结构.     

两种不同构型的吡唑啉酮衍生物的合成与结构

报道了PMBP-PCH(PCH为2-吡啶甲酰肼)和PMBP-INTH(INTH为异烟酰肼)2种化合物的合成与晶体结构分析,PMBP-PCH属三斜晶系,具有P空间群,a=7.783(2),b=10.993(3),c=12.621(3)?=92.96(2),=103.87(2),g=101.54(2),V=1021.5(5)3,Z=2,Dc=1.307g/cm3,m(MoK?=0.088mm-1,F(000)=421,R=0.0436,wR=0.0937.晶体结构表明,在此分子内形成了一个大的共轭体系,由于分子间氢键力的作用,使它们在晶体中以二聚体的形式存在.PMBP-INTH晶体属单斜晶系,具有P21/c空间群,a=14.083(4),b=13.865(3),c=10.609(2)?=101.66(2)o,V=2028.8(8)3,Z=4,Dc=1.301g/cm3,m(MoK?=0.087mm-1,F(000)=832,R=0.0473,wR=0.0898.此化合物在O(1)原子与邻近分子的N(1)原子之间存在较强的氢键,在结晶的过程中,通过分子间质子迁移,使该化合物形成了1个以N(2)为负电荷中心,N(1)为正电荷中心的两性离子结构,且分子通过此氢键形成了一维链状结构,并沿b轴呈层状堆积.     

Synthesis and crystal structure of 1 ,1,1-tris-(p-nitrophenyloxymethy1 )propane

采用1,1,1-三(羟甲基)丙烷与苯磺酰氯反应,得到中间产物1,1,1-三(苯磺酰基氧甲基)丙烷,然后在碱性条件下与对硝基酚反应,生成了目标化合物.本文使用红外光谱、1HNMR和单晶X射线衍射分析等方法对中间产物及目标化合物进行了表征,晶体结构分析表明目标化合物属于三斜晶系,P-1空间群,晶胞参数为:a=0.78731( 11),b=1.25683 (18),c=1.31155(18) nm,α=97.554(6),β=103.184(5),γ=102.840(6)°,V=1.2091 (32) nm3,Z=2,Dc=1.366g/em3,M,=497.45,R1=0.0512,wR2=0.1600.化合物分子通过氢键、π-π堆积等弱相互作用形成了一种2D超分子层状结构.CCDC:848867     

生物合理设计光系统Ⅱ抑制剂研究--Ⅷ. 丙烯酸酯(酰胺)类化合物的分子设计、合成及其生物活性研究

运用分子模拟方法研究了丙烯酸酯(酰胺)类化合物与D1蛋白间的相互作用.　结果表明它们的结合主要包括 氢键相互作用, van der Waals力相互作用及π-堆积相互作用.　发现化合物分子中酯键醇基部分中电负性原子能否与D1蛋白SER 268形成氢键作用是其表现出良好抑制活性的重要因素.　因此推测D1蛋白中SER 268可能是另一重要的结合位点.　在此基础上设计并合成了新型结构的丙烯酸酯(酰胺)类化合物.　生物活性测定结果表明,它们如期表现出良好的Hill反应抑制活性.     

三聚氰胺与1,3-苯二磺酸盐共晶中的氢键作用

合成了一个新的配合物[(HMA )2.(BD2-)].H2O(HMA=三聚氰胺,BD2-=1,3-苯二磺酸盐),通过X射线衍射、元素分析、红外光谱、热重分析对其进行了结构表征,该晶体属于三斜晶系,空间群P1,晶胞参数:a=9.305(1),b=10.272(1),c=12.297(1),α=80.56(2)°,β=71.47(2)°,γ=63.27(2)°,V=994.9(2)3,μ=0.337mm-1,Dc=1.697g/cm3,F(000)=528,R=0.0649,wR2=0.1467,2990个可观察衍射点。三聚氰胺被质子化,相邻的三聚氰胺分子通过N—H…N氢键形成(MAH )∞带子,而相邻的BD2-阴离子通过C—H…O弱氢键形成一条波状的带子(BD2-)∞,N—H…O、N—H…Ow氢键将相邻的(MAH )x(阳离子带子和(BD2-)∞阴离子带子连接成二维网络,层状结构通过N—H…O氢键以及π…π作用堆积成三维微孔结构。