苯并嗪酮衍生物的3D-QSAR分析

苯并嗪酮衍生物是近年来发现的一类抗血小板聚集化合物, 在前人研究的基础上利用比较分子场分析(CoMFA)和比较分子相似性指数分析(CoMSIA)对23个苯并嗪酮衍生物进行了三维定量构效关系(3D-QSAR)研究. 其中CoMFA模型交叉验证系数Q2=0.703, 回归系数R2=0.994, 计算值与实验值的平均方差SEE=0.053, 统计方差比F=184.773; CoMSIA模型Q2=0.847, R2=0.992, SEE=0.058, F=171.670. 两种方法得到的模型都具有较好的预测能力. 结果表明, 标题化合物中8-位取代基R1静电效应起主要作用; 2-位取代基R2立体效应占主导作用, 但官能团大小要适中. 根据研究结果设计了六种活性较高的化合物.     

苯并噁嗪酮衍生物的3D-QSAR分析

苯并噁嗪酮衍生物是近年来发现的一类抗血小板聚集化合物,在前人研究的基础上利用比较分子场分析(CoMFA)和比较分子相似性指数分析(CoMSIA)对23个苯并噁嗪酮衍生物进行了三维定量构效关系(3D-QSAR)研究.其中CoMFA模型交叉验证系数Q2=0.703,回归系数R2=0.994,计算值与实验值的平均方差SEE=0.053,统计方差比F=184.773;CoMSIA模型Q2=0.847,R2=0.992,SEE=0.058,F=171.670.两种方法得到的模型都具有较好的预测能力.结果表明,标题化合物中8-位取代基R1静电效应起主要作用;2-位取代基R2立体效应占主导作用,但官能团大小要适中.根据研究结果设计了六种活性较高的化合物.     

HIV-1逆转录酶抑制剂的3D-QSAR研究及分子设计

采用Topomer Co MFA方法对24个二芳基苯胺衍生物进行三维定量构效关系研究,建立了3DQSAR模型,所得优化模型的非交叉相关系数、交互验证系数以及外部验证的复相关系数分别为0.928,0.654和0.940,结果表明该模型具有良好的稳定性和预测能力。采用分子对接技术对药物与受体的作用机制进行了研究,结果显示,药物与HIV-1逆转录酶的LYS172,GLU138,LYS101等位点作用明显。运用这些信息进行分子设计,在理论上获得了一些具有较高活性的新的二芳基苯胺类抗艾滋病药物,该QSAR的研究结果可为新药合成提供理论参考。     

1,2,4—三唑并（1,5—a）嘧啶—2—磺酰胺类除草剂的CoMFA研究

1,2,4-三唑并[1,5－a]嘧啶-2-磺酰胺类除草剂是继磺酰脲之后所开发出的又一类以ALS为作用耙标的超高效除草剂．本文采用比较分子力场分析方法对该类除草剂进行了三维定量构效关系研究,结果发现立体场和静电场对该类化合物的除草活性均有重要影响,其中以立体场为主．根据我们所得的QSAR模型,可以对该类化合物的结构与活性关系进行很好的解释．     

QSAR Study on Some N-[5-（2-Furanyl）-2-methyl- 4-oxo-4H-thieno[2,3-d]pyrimidin-3-yl]-carboxamide and 3-Substituted-5-（2-furanyl）-2-methyl-3H-thieno- [2,3-d]pyrimidin-4-ones Using Three-dimensional Holographic Vector of Atomic Interaction Field

Study on the quantitative structure-activity relationship （QSAR） of 26 compounds, N-[5-（2-furanyl）-2-methyl-4-oxo-4H-thieno[2,3-d]pyrimidin-3-yl]-carboxamide and 3-substituted- 5-（2-furanyl）-2-methyl-3H-thieno[2,3-d]pyrimidin-4-ones, with three-dimensional holographic vector of atomic interaction field （3D-HoVAIF） was carried out. SMR-PLS QSAR models have been created and good correlation coefficients and cross-validated correlation coefficients were obtained. The result shows that the models have good prediction capability and favorable stability and the 3D-HoVAIF is applicable to the molecular structural characterization and biological activity prediction.     

6-异位-5,8-O-二甲基乙酰紫草素衍生物的2D/3D-QSAR研究

本文综合运用密度泛函理论(DFT)、分子力学(MM2)和统计学等方法对22个具有抗人体乳腺癌(MDA-MB-231)活性的6-异位-5,8-O-二甲基乙酰紫草素类衍生物进行二维(2D)定量构效关系(QSAR)研究,同时运用比较分子相似性指数分析(Co MSIA)方法进行三维(3D)QSAR研究。所建最优2D-QSAR方程的留一法交叉验证系数(q2)和拟合相关系数(R2)分别为0.833和0.900;Co MSIA(SEHA)模型的q2和非交叉验证系数(r2)分别为0.624和0.999,预测相关系数R2pred为0.838,表明所建立的2D/3D-QSAR模型都具有良好的统计学意义及合理、可信的预报能力,可以预测未知化合物的活性。研究结果为理解该类化合物的作用机理和设计合成更高活性的新化合物提供理论参考。     

Quantitative Correlation of Chromatographic Retention and Acute Toxicity for Alkyl（1- phenylsulfonyl） Cycloalkane Carboxylates and Their Structural Parameters by DFT

1 INTRODUCTION Quantitative structure-activity relationship (QSAR)is one of the necessary methods that could be emp- loyed to evaluate the hazards of organic chemicals. QSAR equation could be applied to predict the biological activity of unknown compounds, espe- cially for initial screening and evaluation of toxic compounds[1]. Moreover, the quantitative relation- ship between molecular structure and chromatogra- phic retention (capacity factor lgKW) could also bedeveloped to explain …     

1-取代-2-氨基苯并咪唑衍生物的理论计算及QSAR研究

在B3LYP/6-31＋g(d)计算水平下, 通过运用密度泛函理论(DFT)量子化学方法, 对7种1-取代-2-氨基苯并咪唑衍生物的电子结构特征进行了研究, 获得了它们的电离能、亲合能、化学硬度、化学软度、化学势、电负性、亲电性、分配系数、折射率、极化率、分子体积和分子表面积等参数. 结果表明, 在2-氨基苯并咪唑衍生物的1位引入取代基团, 对化合物的电荷布居和结构性质都有较大的影响|关联了定量结构-活性关系(QSAR), 7种化合物的半数致死量LD₅₀与极化率等有较好的相关性. 这些结果可为1-取代-2-氨基苯并咪唑衍生物的氧化代谢实验研究和毒性机理揭示等提供重要信息.     

Quantitative Correlation of the Acute Toxicity of Phenylthio-carboxylates with Their Structural and Thermodynamic Parameters by DFT Calculation

1 INTRODUCTION As industrial raw materials and pesticide, thio-ether, sulfoxide and sulfone have been used moreand more extensively. On the other hand, they havealso attracted chemists’ much attention due to theirpotential environmental hazards. Quantitative struc-ture-activity relationship (QSAR) is an effective me-thod evaluating the hazards of organic chemicals[1].QSAR equation could be employed to forecast thebiological activity of unknown compounds, which issignificant for initia…     

具有除草活性的3-(嘧啶基-2)-1,3,4-噁二唑-2(3H)-酮衍生物的设计、 合成与定量构效关系的研究

设计合成了一系列未见文献报道的5-叔丁基-3-[4-取代-5-(氢)甲基嘧啶-2-基]-1,3,4-噁二唑-2(3H)-酮的衍生物, 其结构均经过1H NMR, IR和元素分析表征. 生测结果显示, 部分化合物表现出较好的除草活性. 定量的结构与活性关系研究表明, 它们的除草活性与取代基的立体效应参数和电性参数呈现很好的相关性, 相关系数r大于0.8. 当作用对象为油菜时, 化合物的活性可能主要与取代基R2的邻位立体效应参数Es和电性参数相关; 当作用对象为稗草时, 化合物的活性主要与取代基R2邻位立体效应参数Es和间位取代基电性参数相关.