中药复方的计算机模拟研究

中药复方的特点是多靶酶、多靶点及多种组分起作用。在中药复方的制作过程中也伴随着复杂的物理和化学变化,可能形成各种复合物。因此中药复方是一个复杂的分子体系,其作用机理也非常复杂。利用实验室方法分离纯化获得组分已是一个非常艰巨的任务,而研究其作用机理更是...     

胶体化学中计算机模拟的进展

简述了当前计算机模拟在胶体化学中的主要应用，特别涉及到数值方法的改进，热力学性质的模拟，簇团形成或破裂的动力学性质的模拟以及簇团结构和形貌特征的模拟。基本揭示了当前计算机模拟在胶体化学中的主要应用和最新进展。     

高分子熔体结晶的两维计算机模拟

高分子熔体结晶的两维计算机模拟胡文兵，于同隐，卜海山（复旦大学高分子科学系，复旦大学材料科学系，上海，２００４３３）关键词计算机模拟，有序相变，高分子１９５６年Ｆｌｏｒｙ［１］从平均场近似的格子模型证明：高分子链的非柔顺性会导致长链的完全有序排列．此...     

聚丙烯表面的计算机模拟

用计算机模拟的方法详细研究了聚丙烯薄膜表面分子级别的结构 .采用无定形本体聚丙烯产生初始的随机父链 ,将一条随机父链在二维边界条件下进行塌陷 ,研究薄膜在真空中的构型 .用 10 0个重复单元的父链生成厚度为 3 5nm的薄膜 .发现薄膜内部密度等于聚丙烯的本体密度 ,而离自由表面 0 8nm处薄膜的密度开始跌落 .主链键在内部随机取向 ,在自由表面附近则明显沿薄膜表面平面取向 ,键开始有序取向的程度大致与质量密度相对于本体密度的减小一致 .与聚丙烯本体相比 ,薄膜表面中CH2 CH 的反式结构和旁式结构是增加的 ,这是因为分子链能更好的沿薄膜平面舒展 .同时通过聚丙烯无定形本体 (3D周期性 )和薄膜 (2D周期性 )中的链的能量的差异计算了薄膜内部能量对表面能量的贡献 .     

线型缩聚反应的计算机模拟

缩聚反应是一类重要的高分子合成方法。其中最简单的反应为线型缩聚体系,它可分为两类,分别是含有两个可缩合的官能团的单体或单体对进行的相互缩合的体系。Flory在上世纪四十年代采用统计方法对该缩聚体系做过系统的理论研究,并在官能团等活性的假定下提出了著名的Flory分布函数,由此揭示了反应体系中数均聚合度xn、重均聚合度xw、不同聚合度分子的分布情况与反应程度p的关系。本文利用计算机模拟的方法,同样在官能团等活性的假定下模拟了线性缩聚反应的全反应过程,所得到的结果与用统计方法所得到的结果完全一致。本方法是对整个真实反应过程的直观模拟,对研究相似的以逐步聚合反应机理进行的反应具有普适性,并具有可拓展到模拟更真实的粘性聚合体系以及研究反应动力学的潜力。     

分析化学实验演示的计算机模拟

介绍分析化学实验演示计算机辅助教学(CAI)软件。     

单壁碳纳米管吸附氢气的计算机模拟

采用巨正则系统的蒙特卡罗方法（GCMC）模拟常温（T－293K）时氢气在单壁碳纳米管中的吸附过程,氢气分之间、氢气分子与碳原子之间的相互作用采用Lennard-Jones模型,其中,将氢气对整个碳纳米管中所有碳原子的作用进行加和,以获得氢气分子与单根给定半戏的碳纳米管的相互作用模型,研究和讨论了5种半径的碳纳米管在293K时的吸附等温线以及在293K和5MPa时给定半径的碳纳米管的吸附量随管间距离的变化。     

高分子液晶条带织构的计算机模拟

The relationship between the vector version and tensor version of Frank distortion energy for the liquid crystal was established, through which the relationship between the Frank elastic constants and the expansion coefficients of spatial derivatives for the orientational order parameter Sij of liquid crystalline polymer was obtained. Ginzberg-Landau equation for the orientational order parameter Sij was numerically solved by using the cell dynamical system, which involves a free energy functional containing Landau-de Gennes orientational free energy, Maier-Saupe anisotropic interaction free energy and Frank distortion free energy. Incase of the splay elastic constant being much lager than the bend elastic constant, the evolution process of band textures in liquid crystalline polymer during the shear relaxation and its small angle light scattering patterns were simulated. The influence of preshear rate on the band forming and band structure was investigated. It was found that the formation of longitudinal band textures is due to the much rapider longitudinal splay relaxation than the latitudinal bend relaxation, and the induced times of band forming and the characteristic length of band structure decrease with the increasing of preshear rate, which is consistent with the experimental results.     

计算机模拟内毒素吸附剂吸附机理的研究

应用计算机模拟的方法研究了内毒素吸附剂的吸附机理. 模拟结果显示, 以二甲胺为配体的吸附剂, 当β位存在羟基时, 此羟基可与内毒素分子间形成氢键, 并形成一个八元环的稳定结构. 此时吸附剂与内毒素之间存在静电、 氢键、 疏水相互作用和八元环的协同作用. 同时模拟了羟基位于配体不同位置的吸附剂与内毒素的相互作用. 结果表明, 静电作用为主要的相互作用力, 羟基的位置对吸附剂的吸附能力影响显著.     

计算机模拟蛋白质纯化实验

将计算机辅助教学手段（即ＣＡＩ）用于高等学校的教学工作，近年来已取得了很大发展，这是高校教学改革的重要方向。而将ＣＡＩ用于实验教学，模拟动态的实验过程，则难度相对较大，目前成熟的实用软件还不多见。在生物化学大实验中使用计算机模拟纯化生物大分子的实验软...     

无规共聚物熔体结晶的计算机模拟

1956年Flory基于Onsager的思想提出了高分子有序化的"堆积原理",即由于链的非柔顺性导致链构象的空间各向异性,只有有序化排列才能在有限的空间中放入大量的各向异性分子而不必改变其构象,由此发展的平均场格子理论被向列型有序的MonteCarlo模拟所证明。     

色谱分离过程的计算机模拟

本文探讨了用计算机模拟色谱分离过程的可能性，并给出了实用算法及其模拟的色谱图。文中最后介绍了应用该算法编制的教学辅助软件ＶｉｒＣｈｒｏｍ     

La—LaCl3—KCl熔体的计算机模拟研究

用Monte Carlo方法对La-LaCl_3-KC1体系在1223K时的结构进行了计算机模拟研究,得到了熔体中诸离子对的偏径向分布函数和体系在1223K的势能和内能。结果表明,在熔体中La(Ⅲ)有相当一部分以LaCl_6~3六配位形式存在,而La(Ⅱ)则主要以LaCl_4~2四配位形式存在。结果还表明,熔体中的自由体积分布不均匀,存在许多不规则的空孔和缝隙,其中XK~+·YC1~-集团内的缝隙比纯KC1熔体中的缝隙明显增多。     

计算机模拟技术在表面活性剂研究中的应用

根据表面活性剂溶液行为的模拟所需的时间和空间尺度,介绍了三种主要的计算机模拟方法:原子模拟、粗粒模拟和介观模拟.综述了这些模拟方法在表面活性剂单体、缔合体系及与聚合物相互作用等研究中的应用.指出了用计算机模拟方法研究表面活性剂体系的发展前景.     

计算机模拟原子簇的稳定构型和能量性质

用密度泛函(DFT)方法研究了铜原子簇Cu~n(n=2,3,4,6)的稳定几何构型和电子结构。通过拟合从头算势能面构造铜原子簇势能函数的双体、三体及四体项，并利用该函数和全局优化“Basin-Hopping”算法得到较大铜原子簇(n=13～56)能量极小的结构，计算结果与实验及其它计算结果相一致。     

DPH-环糊精纳米管状聚集体的计算机模拟

1,6-二苯基－1,3,5-己三烯（1,6-diphenyl-1,3,5-hexatriene）（简称DPH）不能与α-环糊精，但可以分别与β-、γ-环糊精通过超分子自组装作用形成纳米管状结构的聚集体.该文采用分子力学和分子动力学模拟对这些聚集体在中性和碱性下条件的理论模型进行了预测，并分析了其主客体间的非键相互作用以及氢键的形成情况.计算结果表明，在碱性条件下，环糊精分子间氢键的消失导致了纳米管状结构的解离；而空腔过小是α-环糊精和DPH之间不能形成纳米管状结构的原因.     

DyF3—LiF系熔体结构的计算机模拟研究

用Ｍｏｎｔｅ Ｃａｒｌｏ法计算机模拟研究ＤｙＦ３－ＬｉＦ系熔体，得到了径向分布函数和局部结构等信息。研究表明，Ｆ＾－紧密聚集在Ｄｙ＾３＋周围，而与Ｌｉ＾＋之间却存在一定的缝隙。该熔体中主要存在着二种离子类型：以ＤｙＦ＾３－ｎｎ型络离子（以ＤｙＦ＾３－６的八面体络离子为主）和“游离状”的Ｌｉ＾＋离子。同时，由于Ｆ＾－的聚集，一些ＤｙＦ＾３－ｎｎ型络离子通过“氟桥”组成ＤｙｍＦ＾３ｍ－ｎｍ型更加复杂的     

计算机模拟原子簇的稳定构型和能量性质

用密度泛函(DFT)方法研究了铜原子簇Cu~n(n=2,3,4,6)的稳定几何构型和电子结构。通过拟合从头算势能面构造铜原子簇势能函数的双体、三体及四体项,并利用该函数和全局优化“Basin-Hopping”算法得到较大铜原子簇(n=13～56)能量极小的结构,计算结果与实验及其它计算结果相一致。