基于非特异性蛋白酶连续酶解的蛋白质全序列测定方法

对蛋白质全序列进行测定, 有助于分析蛋白质的结构, 揭示蛋白质的生物学功能. 针对目前基于质谱的蛋白质测序流程中使用特异性蛋白酶酶解产生的肽段种类少、重叠度低、序列拼接困难等问题, 发展了一种基于非特异性蛋白酶连续酶解的蛋白质全序列测定方法. 构建了连续酶解装置, 并使用多种非特异性蛋白酶对蛋白质进行连续酶解. 利用非特异性蛋白酶酶解位点的非特异性、不同的酶解时间以及不同种类蛋白酶酶解产生肽段的互补性, 提高蛋白质酶解肽段的种类和重叠度, 并发展了蛋白质序列拼接算法对液相色谱质谱联用(LC-MS/MS)和从头测序获得的肽段序列进行拼接. 将此方法应用于牛血清白蛋白和单克隆抗体赫赛汀的全序列测定, 在不考虑亮氨酸和异亮氨酸的情况下, 对牛血清白蛋白和赫赛汀轻链的测序准确度达到100%, 赫赛汀重链的测序准确度为99.7%.     

甲基氯硅烷初产品的组成分析

以气相色谱和色谱-质谱联用技术分析了甲基氯硅烷初产品的组成,对于其中的2-甲基-2-丁烯与甲基二氯硅烷的色谱重叠峰,采用醇解反应处理,并以样品中不会醇解的四甲基硅烷做参照来计算其含量。     

非负矩阵因子分解法分析苍术的气相色谱-质谱重叠峰

非负矩阵因子分解(non-negative matrix factorization,NMF)是对非负数据处理的一种多元统计分析方法.NMF分解结果没有"负值",易于理解和解释,具有比较明确的物理化学意义.由于其多解的特征,文献介绍的NMF算法并不能直接用于化学混合信号解析.作者根据化学波谱的基本特征(化学波谱的平滑性、色谱的单峰性以及质谱的稀疏性)对NMF算法进行了改进,缩小了其多解范围.应用改进的NMF进行模拟HPLC-DAD型两维数据(其中色谱严重重叠和完全重叠)和苍术GC/MS实验数据解析,得到了比较理想的结果.实验表明,改进后的NMF是一个可用于复杂样品化学信号分析的化学计量学新方法.     

非负矩阵因子分解法分析苍术的气相色谱-质谱重叠峰

非负矩阵因子分解（non-negative matrix factorization，NMF）是对非负数据处理的一种多元统计分析方法。NMF分解结果没有“负值”，易于理解和解释，具有比较明确的物理化学意义。由于其多解的特征，文献介绍的NMF算法并不能直接用于化学混合信号解析。作者根据化学波谱的基本特征（化学波谱的平滑性、色谱的单峰性以及质谱的稀疏性）对NMF算法进行了改进，缩小了其多解范围。应用改进的NMF进行模拟HPLC-DAD型两维数据（其中色谱严重重叠和完全重叠）和苍术GC／MS实验数据解析，得到了比较理想的结果。实验表明，改进后的NMF是一个可用于复杂样品化学信号分析的化学计量学新方法。     

A_α型缩聚物的分子量分布函数及对凝胶的分子解释

非线型缩聚物的分子量分布,最早由Flory和Stockmayer应用组合理论得到。不少实际的非线型缩聚体系,分布函数相当复杂。江元生用解动力学方程的方法得到了和组合法相同的结果。Gordon用无规支化理论处理了A_a型缩聚物的分布问题。近年来,唐敖庆等又提出了通过溶胶凝胶分配理论推导分布函数的方法。本文给出一种分子树模型,能更     

线性分析法来解热脱附动力学参数

TPD方法是研究表面常规手段之一.对于如何从实验结果获得正确的脱附动力学参数,已有不少工作发表。然而,现有方法均存在一定的适用范围,尤其是重叠谱解叠,仍然没有很好地解决。本文介绍的线性分析法,不仅适用于简单的一级和二级脱附TPD谱的解析,而且也适用于重叠谱解叠,从而为实验上确定动力学级数和复杂谱解叠提供了依据。     

合金化对VH2解氢性能的影响

采用密度泛函理论(DFT)的第一性原理的平面波超软赝势方法, 研究了C, Si, Ge, Sn, Pb合金化对VH₂的电子结构和解氢性能的影响. 计算结果显示C, Si, Ge, Sn, Pb合金化VH₂后晶体模型的负合金形成热减少, 费米能级E_f处的电子浓度N(E_f)增加, 表明体系结构稳定性减弱, 解氢能力增强|V-H之间重叠集居数和电子密度计算也表明V-H之间相互作用减弱, 解氢能力增强|同时Mulliken集居数计算结果还显示掺杂以后解氢能力增强与V-d轨道Mulliken集居数减少, V-s轨道Mulliken集居数增加有关.     

非平衡溶剂效应的约束平衡理论及在电子转移中的应用

基于经典热力学约束平衡方法,采用新非平衡溶剂化理论研究了Np O+2-Np O2+2体系电子转移反应的溶剂重组能,采用限制密度泛函理论实现电荷定域,用积分方程可极化连续介质模型获得水溶液中极化电荷.计算结果表明,新双球模型和数值解都给出了一致的溶剂重组能理论计算值.     

角重叠模型浅释

本文在分子轨道理论的定性概念基础上扼要介绍角重叠模型的两个基本概念:角重叠参数和角重叠因子。应用该模型计算了各d轨道的能量和配合物的分子轨道稳定化能,讨论了不同d~n电子组态对分子空间构型和八面体配合物取代反应速度的影响,并与晶体场理论所得结果加以对比。     

非贵金属催化剂Ni/AC选择性氢解木质素C-O键

用浸渍法制备了具有高活性的非贵金属催化剂Ni/AC,采用X射线粉末衍射(XRD)、高分辨扫描透射电镜(STEM)对催化剂进行了表征,并研究了催化剂、温度、时间、氢气压力等因素对苯基苯醚选择性裂解C-O键的影响。结果表明Ni/AC在木质素α-O-4模型化合物的氢解反应中表现出较高的活性和选择性,获得了较高收率的甲苯和苯酚(>65.5%)。除此之外该催化剂在真实木质素的氢解反应中也展示出较好的活性。     

元素掺杂对VH2解氢性能的影响

采用密度泛函理论（DFT）的第一性原理的平面波超软赝势方法,研究了Zr、Cu、Zn掺杂对VH2的电子结构和解氢性能的影响．计算结果显示Zr掺杂VH2后晶体模型的负合金形成热增加和费米能级目处电子浓度N（Ef）的减少,体系结构稳定性增强;V—H之间重叠集居数和电子密度计算也显示V-H之间相互作用增强;表明在VH2中掺杂Zr以后吸放氢最大容量增加,但解氢能力减弱．而Cu或Zn掺杂VH2以后晶体模型的负合金形成热减少和费米能级Ef处电子浓度N（Ef）增加,体系结构稳定性减弱;V-H之间重叠集居数和电子密度计算也显示V-H之间相互作用减弱;表明在VH2中掺杂Cu或Zn以后吸放氢最大容量降低,但解氢能力增强．与实验结论相符．同时Mulliken集居数计算结果还显示V-d轨道MuUiken集居数与掺杂有关,掺杂Zr以后V—d轨道Mulliken集居数减少;掺杂Cu或Zn以后V—d轨道Mulliken集居数增加．     

人工神经网络-近红外光谱法用于粉末药品美的康的非破坏定量分析

1　引　　言 　　近红外光谱分析技术在药品分析中得到重视,这是因为该方法的非破坏性,样品不需预处理 ,不需分离,即可直接测定。但其各组分光谱重叠需采用一定的数据处理技术方能获得准确 分析结果。本文应用人工神经网络 进行粉末药品美的康的非破坏性快速定量分析。使用一组美的康粉末药品的近红外漫反射光 谱数据建立人工神经网络模型,预测未知样品。讨论了影响网络的各参数。采用了新的网络 评价标准——逼近度。 　　2　实验部分 　　2.1　仪器和试剂　日本岛津UV-3100型紫外可见近红外分光光度计,附件积分球。测量条件,狭缝为12 nm,扫描范围1100～2500 nm。所用试剂均符合药典标准 。     

一种新型交替迭代算法用于农药GC-MS信号快速分析

化学计量学算法为重叠GC-MS信号解析提供了有效手段. 免疫算法(IAs)可根据标准样品的信号(色谱或质谱)对重叠GC-MS信号进行解析并得到重叠信号中各组分的信息. 但是标样信号与实际测量信号之间的差别会造成解析结果出现偏差. 针对标样信号与测量信号不一致的问题, 作者提出了一种交替迭代算法用于重叠GC-MS测量信号的直接解析. 该方法在不提供标样信号的情况下可以解析出组分的质谱和色谱信息. 计算过程中, 采用随机产生的质谱作为初始输入, 利用最小二乘和IA算法交替计算质谱和色谱, 直到满足终止条件. 采用所建立的方法对40种组分的农药混合物进行了分析, 使用快速升温程序在10 min保留时间内得到了全部组分的色谱和质谱信息.     

RFM模型在航空遥感影像优化中的适用性验证

针对基于共线方程的模型在实际应用中的限制,研究并探索用于航天影像解算的有理函数模型(rational function model,RFM),以及它在航空影像中的解算有效性。从模型的定义、模型的性质以及模型的求解等方面对RFM给出了系统性的解释,并分析了RFM拟合光束法平差的精度。本文以基于共线方程的光束法空中三角测量平差成果为参照依据,比较分析了有理函数模型拟合光束法模型的相对精度。结果表明有理函数模型能以较高精度拟合光束法模型,有能力代替基于严格共线方程的经典模型以完成空中三角测量等任务。本文为RFM在无人机等近景影像中的应用提供了理论借鉴。     

非平衡溶剂化的连续介质模型和超快过程溶剂效应

在连续介质理论基础上, 根据Jackson的能量积分公式导出非平衡态静电自由能和溶剂化能的正确表达式. 引入“弹簧能”概念, 对平衡态和非平衡态的静电能构成给出了合理解释, 即此能量由溶质自由电荷和溶剂极化电荷的自能、 两者之间的相互作用能和极化电荷的“弹簧能”构成. 对目前几种代表性的非平衡溶剂化理论进行了论证和比较, 指出其中存在的基本理论问题. 根据新的非平衡溶剂化能建立了电子转移反应溶剂重组能的双球模型、 光谱移动的单球孔穴点偶极模型, 多级展开方法和非平衡溶剂效应的数值解方法.在Poisson方程求解中引入类导体屏蔽模型, 建立了任意孔穴极化电荷数值解方法并应用到Closs-Miller电子转移体系, 得到与实验值吻合的溶剂重组能, 解决了传统非平衡溶剂化理论高估溶剂重组能的问题.     

电解质溶液自扩散系数的布朗动力学模拟

采用布朗动力学方法对电解质溶液进行了模拟,在传统布朗动力学的基础上综合考虑了流体力学的影响,并且引入SmartMonteCarlo方法的接受概率,避免了离子不现实的移动和位型重叠,这样不仅可以将模拟过程中的时间步长大幅度提高,而且还可使溶质在相空间的演化过程更接近实际.模拟过程以电解质溶液的原始模型为基础,将溶剂看作连续介质,溶质分子之间的相互作用采用软核加静电的势能函数模型,长程静电力采用Ewald加和的处理方法.模拟得到KCl和NaCl溶液的径向分布函数g+-(r),g++(r)和g--(r),并与文献中HNC计算以及模拟的结果进行比较,使用推广的Green-Kubo公式模拟计算溶液中各种离子的自扩散性质,计算结果与实验数据吻合良好.     

重叠模型多重散射X_α——自洽场方法对于平面有机分子的应用

本文将改进的重叠模型多重散射X_α——自洽场方法应用于平面有机分子,如苯、吡啶、哌嗪、吡咯和咪唑分子,和前人的重叠模型相比较,原子间区轨道电荷百分数,不再出现负值的不合理情况,并且在电离势的顺序方面,也得到了较大的改进。     

分解色谱重叠峰的参数契合法

本文研究了色谱重叠峰一阶导数曲线中各极值点的相对位置与重叠子峰面积比之间的关系，提出了一种模式参数契合的色谱重叠峰分解方法，它在准确性方面优于传统的垂线法，在速度方面优于模型拟合法，可用于实时快速处理。     

基于分数阶微分的重叠伏安峰分离方法

根据特定峰信号微分的极值和过零点随着微分阶数的变化而改变,建立了峰信号的极值和过零点与其相应微分阶数的关系式。利用这些关系式建立的估计器Ⅰ和估计器Ⅱ,可以用来估计Gaussian峰、Lorentzian峰和Tsallis峰信号的特征参数,为定量分析重叠峰信号提供了一种新的方法。首先,利用分数阶微分器获得特定峰信号的分数阶阶微分;然后,利用估计器Ⅰ和估计器Ⅱ提取这些特征峰信号的特征参数。对于未知重叠峰信号,采用Tsallis峰作为子峰模型进行重叠峰信号分离,仿真和实测重叠峰信号分离实验表明本方法简单高效。     

求解弱相互作用分子A-BC的振转能级和波函数的SCF-CI方法

给出了一种计A－BC型弱相互作用分子体系的分子间振转激发态的自洽场-组态相互作用(SCF－CI)方法. 首先使用SCF方法代化径向伸缩振动和弯曲振动的基函数,再用CI方法确定精确的振转激发态能级. 在求解-维的伸缩振动SCF方程时,采用Numerov－Johnson算法在给定区间上求解获得振动波函数的数值解. 具体计算了Ar－HCI和Ar－N₂体系的振转激发态的能级以验证该方法. 结果表明,本方法可用较少的组态就能获得可与其它大计算量的方法具有相比拟的精度的结果.