三聚噻吩TCNQ复合物晶体结构的测定-MM与图形技术在测定晶体结构中的应用

本文利用直接法和应用分子力学与图形技术结合的尝试法,测定了取向无序的三聚噻吩TCNQ复合物的晶体结构,采用0PEC程序对复合物晶体进行堆积分析和堆积能的计算。     

芳基四硫富瓦烯与溴化铜电荷转移复合物的合成及晶体结构

采用溶液扩散的方法合成了硫原子桥联芳基取代四硫富瓦烯1～4与CuBr₂的4种电荷转移复合物(1^+·)(Cu₂Br₆)_0.5、(2^+·)(Cu₂Br₆)_0.5、(3^+·)(Cu₂Br₆)_0.5和(4^+·)(CuBr₂)。晶体结构研究表明,复合物中阴离子呈现2种构型：八面体型(Cu₂^ⅡBr₆)^2-和直线型(Cu^ⅠBr₂)^-,并且4种复合物呈现不同的堆积结构。通过调控芳基上卤素原子取代位置和大小,实现了对电荷转移复合物堆积结构和阴离子构型的有效调控。     

白鲢鱼胰岛素的晶体结构测定

本文继用旋转函数方法对白鲢鱼胰岛素分子在P2_12_12_1晶胞中的取向分析之后,以已知的二锌猪胰岛素分子为模型,应用平移函数及R因子搜索方法,确定了白鲢鱼胰岛素六聚体在晶胞中的位置。在这样得到的模型晶胞中,分子的堆积合理。利用现有的3.5衍射数据,对该模型进行了初步的约束参数最小二乘修正。用修正过的原子参数算得的电子密度图上,未投入修正的多肽链片段有相应的表现。     

密堆积与中学化学中的晶体结构

联系新课程和化学奥赛的有关内容简要论述了晶体结构的密堆积;分析了密堆积在中学化学晶体结构学习中的地位和作用;举例说明了密堆积对于深刻理解晶体结构的内容和在解决晶体结构问题中的应用。     

一种新型密堆积晶体结构模型

研发了一种通过高强磁体连接形成的晶体密堆积模型。模型球间通过磁体吸引连接,能有效避免以插接方式搭建密堆积模型时的连接困难,可以在结构化学教学中方便、快捷、正确地搭建金属单质晶体密堆积模型和部分离子晶体密堆积模型,是一种借助形象思维提高晶体密堆积结构教学效果的教具。     

N-甲基-苯并哒嗪TCNQ复合物的晶体堆积分析

本文对1-N-甲基-苯并哒嗪TCNQ复合物(1-N-M_(ci) TCNQ_2)和2-N-甲基-苯并哒嗪TCNQ复合物(2-N-M_(ci) TCNQ_2)的晶体中排列进行堆积分析, 采用OPEC程序计算它们的堆积能。1-N-M_(ci) TCNQ_2的堆积能为-70.194 kcal mol~(-1), 2-N-M_(ci) TCNQ_2的堆积能为-66.945 kcal mol~(-1)。结果表明, 在这两种TCNQ复合物中, 给体分子的各向尺寸的差异小, 则对TCNQ排列的影响小, 有利于TCNQ分子排列成一维的柱子。     

醋酸棉酚晶体结构

醋酸棉酚(C_(30)H_(30)O_8—CH_3COOH)晶体结构用X射线衍射方法测定。晶体属三斜晶系,空间群为P1,晶胞参数:本结构是用直接法解的。对可观察反射进行全矩阵最小二乘修正,得到最终R=0.063。晶体结构显示一个棉酚分子与一个醋酸分子通过氢键连接构成醋酸棉酚复合物。复合物之间不存在氢键,晶体结构仅由范氏力相互作用维持稳定。     

钓鱼岛石晶体结构的研究

钓鱼岛石是钓鱼岛附近海洋沉积物中发现的一种新矿物。我们测定了不同铬含量的钓鱼岛石系列的晶体结构, 它们是由双尖晶石单元组成的层状结构, 层间由一个含有钠离子的结构层隔开, 氧原子按照立方密堆积的ABCA方式堆积。这些钓鱼岛石的六方晶格常数与其中铬的含量线性相关。本文还讨论了钓鱼岛石中铝离子被铬离子取代的情况。     

电荷转移复合物1-氮-甲基-苯并哒嗪TCNQ和2-氮-甲基-苯并哒嗪TCNQ的能带结构与电性质的研究

本文采用以EHMO为基础的紧束缚近似方法计算了同分异构复合物1-N-Mci TCNQ_2和2-N-Mci TCNQ_2的能带结构。通过计算谐振稳定能估算复合物中TCNQ的电荷。计算结果表明, 复合物晶体中的给体N-Mci对一维能带的前沿轨道无影响。1-N-Mci和2-N-Mci的几何形状不同, 在晶体堆积能量上影响TCNQ的排列, 使两个复合物的TCNQ堆积方式不同, 能带结构也就不一样了。1-N-Mci TCNQ_2复合物的TCNQ之间π-π轨道迭合较好, 能隙小。LU带色散大, LU轨道上的电子为末充满状态(δ≈1.77), 具有较好的导电性能。2-N-Mci TCNQ_2复合物中TCNQ二聚体之间π-π轨道重叠不好, 能隙大, LU带宽很窄, LU轨道上电子为半充满状态(δ≈1.0), 易于形成磁绝缘体, 其导电性比1-N-Mci TCNQ_2差, 这与实验结果是一致的。     

电荷转移复合物1-氮-甲基-苯并哒嗪TCNQ和2-氮-甲基-苯并哒嗪TCNQ的能带结构与电性质的研究

本文采用以EHMO为基础的紧束缚近似方法计算了同分异构复合物1-N-Mci TCNQ_2和2-N-Mci TCNQ_2的能带结构。通过计算谐振稳定能估算复合物中TCNQ的电荷。计算结果表明,复合物晶体中的给体N-Mci对一维能带的前沿轨道无影响。1-N-Mci和2-N-Mci的几何形状不同,在晶体堆积能量上影响TCNQ的排列,使两个复合物的TCNQ堆积方式不同,能带结构也就不一样了。1-N-Mci TCNQ_2复合物的TCNQ之间π-π轨道迭合较好,能隙小。LU带色散大,LU轨道上的电子为末充满状态(δ≈1.77),具有较好的导电性能。2-N-Mci TCNQ_2复合物中TCNQ二聚体之间π-π轨道重叠不好,能隙大,LU带宽很窄,LU轨道上电子为半充满状态(δ≈1.0),易于形成磁绝缘体,其导电性比1-N-Mci TCNQ_2差,这与实验结果是一致的。     

竞赛试题中晶体结构的空隙问题

全国高中生化学竞赛试题十分重视晶体结构的考查,以填隙的视角认识晶体结构有助于竞赛选手正确理解某些晶胞的结构特点;堆积球中空隙的形状、位置和分布特征对认识晶体的结构和性质均十分重要。     

绿豆胰蛋白酶抑制剂Lys活力片段-牛胰蛋白酶复合物的晶体结构测定——分子置换法及3分辨率电子云密度图

本文以修正过的牛胰蛋白酶分子的坐标为模型,应用旋转函数法和平移函数法成功地求得了牛胰蛋白酶分子在绿豆胰蛋白酶抑制剂Lys活力片段(以下简称MBILF)-牛胰蛋白酶(以下简称BTRY)复合物晶体晶胞中的取向和位置。从正确放置于MBILF-BTRY复合物晶胞中的BTRY分子的坐标出发,用Sim权重方法算得的一套相角作为MBILF-BTRY复合物的相角,以2丨F_0|—丨F_(?)丨为系数所得到的3分辨率的电子密度图中,除了投入计算的BTRY分子本身的电子密度外,在BTRY的活性部位附近可以清晰地看到MBILF分子所对应的电子密度及其边界,抑制剂片段的线度约为15×15×25。     

咔哇二乙炔三硝基芴酮电荷转移复合物的分子结构与晶体结构

近年来,聚二乙炔的一维特性引起了人们的注意.为了探索这类给体与有机受体形成的电荷转移复合物,从而获得高电导的聚二乙炔单晶,我们采用X射线衍射法对标题复合物进行了晶体结构测定.本文主要叙述该复合物的分子结构和晶体结构.实验部分一、样品制备将82毫克咔唑二乙炔[1,6-di-(N-Carbazolyl-)2,4-hexadiyne,简称DCH],126毫克三硝基芴酮[2,4,7-trinitrofluorenone,简称TNF]分别溶解在25毫升和15毫升分析纯丙酮中,     

金属卟啉有机共价和非共价修饰多壁碳纳米管

合成了5-(4-羟基苯基)-10,15,20-三苯基卟啉锌配合物, 与活化的多壁碳纳米管(MWNT)发生酯化反应, 从而得到金属卟啉有机共价化学修饰的多壁碳纳米管复合物; 利用金属卟啉环上的π电子与多壁碳纳米管管壁上的π电子通过π-π堆积效应, 得到金属卟啉有机非共价修饰的多壁碳纳米管复合物. 通过透射电镜(TEM)考察了金属卟啉-多壁碳纳米管复合物的形貌特征; 通过红外光谱对产物的化学结构进行了表征; 通过紫外光谱、荧光光谱和热失重分析(TGA)对比分析了两类复合物, 发现非共价修饰的金属卟啉-碳纳米管复合物的荧光淬灭率更高, 非共价修饰的金属卟啉-碳纳米管复合物中卟啉的含量比较高.     

金属卟啉化学共价和非共价修饰多壁碳纳米管

合成了5-(4-羟基苯基)-10,15,20-三苯基卟啉锌配合物,与活化的多壁碳纳米管(MWNT)发生酯化反应,从而得到金属卟啉有机共价化学修饰的多壁碳纳米管复合物;利用金属卟啉环上的π电子与多壁碳纳米管管壁上的π电子通过π-π堆积效应,得到金属卟啉有机非共价修饰的多壁碳纳米管复合物.通过透射电镜(TEM)考察了金属卟啉-多壁碳纳米管复合物的形貌特征;通过红外光谱对产物的化学结构进行了表征;通过紫外光谱、荧光光谱和热失重分析(TGA)对比分析了两类复合物,发现非共价修饰的金属卟啉-碳纳米管复合物的荧光淬灭率更高,非共价修饰的金属卟啉-碳纳米管复合物中卟啉的含量比较高.     

投影图在分子结构及晶体结构学习中的应用

介绍投影图在展示分子及晶体中的对称元素、点阵抽取及了解密堆积中空隙分布情况等方面的应用。     

芳基四硫富瓦烯与碘电荷转移复合物的合成及其晶体结构

采用缓慢挥发溶剂的方法合成了硫原子桥联芳基取代四硫富瓦烯（Ar-S-TTF）与碘的3种电荷转移复合物（1^+·）（I₃）·I₂、（2^+·）（I₅）·I₂和（3²⁺）（I₃）₂,采用单晶X射线衍射、紫外可见光谱、循环伏安对其进行了表征。复合物（1^+·）（I₃）·I₂为C2/c空间群,1^+·呈椅式构型。化合物1与碘之间在溶液中和复合物中电荷转移一致。复合物（2^+·）（I₅）·I₂为P1空间群,2^+·呈椅式构型。复合物（3²⁺）（I₃）₂为Pbca空间群,3²⁺呈独特的平面构型。化合物2和3与碘之间在溶液中和复合物中呈现不同的电荷转移。复合物中聚碘阴离子呈现不同的堆积结构：由I₃^-或I₅^-/I₂组成的一维链状和I₃^-/I₂组成的二维网格状。     

芳基四硫富瓦烯与碘电荷转移复合物的合成及其晶体结构

采用缓慢挥发溶剂的方法合成了硫原子桥联芳基取代四硫富瓦烯(Ar-S-TTF)与碘的3种电荷转移复合物(1^+·)(I₃)·I₂、(2^+·)(I₅)·I₂和(3²⁺)(I₃)₂,采用单晶X射线衍射、紫外可见光谱、循环伏安对其进行了表征。复合物(1^+·)(I₃)·I₂为C2/c空间群,1^+·呈椅式构型。化合物1与碘之间在溶液中和复合物中电荷转移一致。复合物(2^+·)(I₅)·I₂为P1空间群,2^+·呈椅式构型。复合物(3²⁺)(I₃)₂为Pbca空间群,3²⁺呈独特的平面构型。化合物2和3与碘之间在溶液中和复合物中呈现不同的电荷转移。复合物中聚碘阴离子呈现不同的堆积结构：由I₃^-或I₅^-/I₂组成的一维链状和I₃^-/I₂组成的二维网格状。     

银杏磷脂复合物复合率的测定

为制定银杏磷脂复合物的制备工艺的评价标准．以高效液相色谱法测定复合物中黄酮醇苷的含量,计算复合率,以此为评估标准,用正交设计试验优化了制备工艺．确定了高效液相色谱法测定复合物复合率的方法,并对复合物中的银杏内酯进行了鉴别。     

几个含硫杂环化合物的晶体结构

用X-射线单晶衍射法对三个含硫杂环化合物进行了晶体结构分析,测定了晶胞参数、原子空间坐标,计算了键长键角、平面方程及其标准偏差,绘出了分子的构型以及分子在晶体中的堆积方式和分子间距离,并用CNDO/2法计算了五种化合物采取不同构象时分子的总能量和净电荷分布。