基于自训练的蛋白质相互作用关系抽取方法

基于有监督机器学习算法的蛋白质相互作用关系抽取方法仍然面临一个问题:标注数据集有限,导致算法无法得到充分学习。该文首先构造了一个丰富的特征空间,包括句法、词汇、词性等特征;然后,该文对不同数据集数据分布的不一致性进行了分析,在此基础上提出了一种基于自训练的数据添加算法,通过不断从未标注数据集中选择置信度高的样本加入到已标注数据集中,扩大数据集规模,提高算法效率。实验结果表明:在5个常用的蛋白质相互作用关系数据集上,该方法均有助于提高抽取性能。     

大豆蛋白质提取新工艺

该文针对普通工艺中大量使用碱液直接处理大豆而造成的原料中营养成分损害大，蛋白质产品产量低，纯度低等缺点，提出用离子强度为０．６的ＮａＣｌ溶液萃取大豆蛋白质和用ＨＣｌ溶液调聚大豆蛋白质的新工艺。     

蛋白质-蛋白质相互作用的实验检测方法

生物体内的蛋白质分子常常通过与其他蛋白质分子发生相互作用来发挥其生物功能.因此,研究蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)对于阐明蛋白质分子的生物功能以及分子作用机理具有重要的意义.主要介绍基于生物物理和生物化学原理的检测蛋白质-蛋白质相互作用的实验研究方法,并对发展趋...     

螺旋藻蛋白质提取工艺研究

以钝顶螺旋藻粉为原料, 经复水、胶磨、均质、浸提, 及等电点法, 提取其中的蛋白质,同时研制出钝顶螺旋藻蛋白质提取工艺条件, 使产品的蛋白质含量达89-8 % . 蛋白质的提取率达98 % .     

板蓝根生药中蛋白质提取方法的比较

分别以40％乙醇、20％乙醇和0．02mol／L盐酸3种提取液来提取生药板蓝根中的蛋白质，并以Tris-HCl缓冲液为对照，用752紫外分光光度计测定各样品提取液的O．D值，计算蛋白质的含量：蛋白质浓度(mg／mL)=1．45D280-0．74D260，同时测定各样品的血凝活性，并对板蓝根中蛋白质含量与血凝活性的相关性进行了分析．实验结果表明：3种提取液对同一种板蓝根生药中蛋白质的提取量存在显著差异，其中以40％乙醇为提取液所测得的蛋白质含量最高，但蛋白质含量多少与血凝活性之间并无明显相关性．     

适于双向电泳分析的银杏叶绿体蛋白质提取方法

【目的】获得银杏叶绿体蛋白质的提取方法,在蛋白质水平探讨银杏光合作用对环境的响应机制。【方法】建立一种适合银杏叶绿体蛋白双向电泳分离的实验体系,采用Tris-平衡酚抽提法对银杏叶绿体蛋白质进行提取,并与三氯乙酸(TCA)-丙酮沉降法进行对比分析。【结果】Percoll密度梯度离心法适用于银杏叶绿体的提取,提取的叶绿体平均完整率在85%左右。单向电泳结果显示,与TCA-丙酮沉降法相比,在用Tris-平衡酚抽提法分离的叶绿体蛋白质泳道中,低分子质量蛋白质条带更多、更清晰。进一步的双向电泳结果表明,用Tris-平衡酚抽提法对银杏叶绿体蛋白质进行提取,蛋白质产量更高,图谱清晰,所分离的蛋白点更多,形态更好,条纹影响相对较小。【结论】Tris-平衡酚抽提法可有效地提取高质量的叶绿体蛋白质并进行双向电泳,可用于银杏叶绿体的蛋白质组学分析。     

蛋白质相互作用的研究方法及进展

介绍了蛋白质与蛋白质相互作用的研究方法及进展,包括已经应用的标准技术、物理学方法、最新进展及其他方法。利用蛋白质间相互作用为工具,通过合成可调控转录系统来调整生物系统,可实现对基因功能的微调。     

蛋白质相互作用的研究方法及进展

介绍了蛋白质与蛋白质相互作用的研究方法及进展,包括已经应用的标准技术、物理学方法、最新进展及其他方法.利用蛋白质间相互作用为工具,通过合成可调控转录系统来调整生物系统,可实现对基因功能的微调.     

蓖麻饼提取蛋白质的研究

本文就蓖麻籽榨油后所剩的物质-蓖麻饼中提取分离蛋白质进行了研究,采用正交设计方法,进行提取分离蛋白质的工艺实验,得到了蛋白质提取率在67.5%-93.1%的较佳工艺条件。     

正交法虾壳蛋白质提取条件的研究

根据蛋白质溶液的pH值在某一值时蛋白质的静电荷为零，且蛋白质溶液溶于水形成胶体溶液，在该溶液中加入无机盐后，利用蛋白质盐析的原理分离蛋白质．实验以Na0H质量分数、反应时间、反应温度为三因素，设计成三因素三水平的正交实验，确定出提取虾壳蛋白质的最佳实验条件．     

蛋白质与蛋白质相互作用预测模型综述

蛋白质作为生命活动的物质基础,通过彼此之间的相互作用来参与生物信号传递、能量和物质代谢及细胞周期调控等,因此,预测蛋白质与蛋白质相互作用(PPIs)有助于从系统角度理解生命过程,同时为细胞机制的研究奠定重要基础。目前,高通量测序技术的进步使研究人员获取了海量的蛋白质相互作用数据。面对大量具有潜在可用性的PPIs数据,国内外研究人员提出了多种PPIs预测模型。文章综述了现有的基于计算的PPIs预测方法,并进行分类,讨论了其各自优缺点。最后对PPIs预测方法进行总结和展望,提出了未来可以深入研究的方向。     

蚂蚁蛋白质提取方法的比较研究

以铺道蚁(Tetramorium caespitum)为实验材料,采用正交试验法,对蚂蚁蛋白质的提取条件进行了研究.实验分别采用碱提蛋白法、盐提蛋白法、Tris-HCl缓冲液提蛋白法等3种提取方法.对其主要条件:不同浓度、浸提温度、浸提时间、固液比以及Tris-HCl液的pH值等进行了研究.结果表明,碱提蛋白法的最佳条件为:碱液浓度为1%,固液比为1∶15,浸提时间为60 min,浸提温度为80℃;盐提蛋白法的最佳条件为:盐液浓度为1.5%,固液比为1∶15,浸提时间为60 min,浸提温度为50℃;Tris-HCl缓冲液提蛋白法的最佳条件为:pH值为8.3,固液比为1∶15,浸提时间为90 min,浸提温度为20℃.在这3种方法中,碱提蛋白法的蛋白质得率最高,其次为盐提蛋白法,而Tris-HCl缓冲液提蛋白法最低.     

佤族民间药用动物红蚂蚁蛋白质的提取方法改进

以红蚂蚁为原料,采用单因素实验法,分别用3种盐对红蚂蚁蛋白质的提取条件进行了研究.结果表明,最适合的盐是硫酸铵;最好的提取条件为:固液比(w/v)=1:10、盐浓度为1%、pH=4.0、抽提时间为2h,所得的蛋白质提取率最高为为36%,最低为13%.     

葵花籽粕中蛋白质提取工艺的优化

采用盐提法提取葵花籽粕中的蛋白质,以提取率为评价指标,采用单因素试验探讨NaCl浓度、料液比、提取温度、提取时间、pH值、提取次数对蛋白质提取率的影响,采用正交试验优化提取工艺。结果表明:葵花籽粕中蛋白质的最佳提取工艺条件为NaCl浓度1.5mol.L-1、料液比1∶14(g.mL-1)、温度50℃、提取时间1.5h、pH值8、提取2次,此条件下蛋白质提取率为54.8%。     

多信息融合中文关系抽取技术研究

实体关系抽取是信息抽取的重要组成部分.描述了一种融合多信息的实体语义关系抽取方法,充分利用中文的各种特征和信息来提高关系抽取的性能.该方法主要结合特征向量和树核函数两种方法;特征向量表示了文本的语言信息,树核方法表示了文本的结构化信息.并且在2005年的自主内容抽取(automatic content extraction,ACE)基准语料上进行关系检测和6个关系大类抽取的实验.实验结果表明,该方法能识别出大部分的非关系实例,各种关系类型识别的精确率和召回率也有一定提高.     

一种适合杨树叶片的蛋白质提取方法

高质量的蛋白样品制备是进行双向电泳的前提条件.杨树叶片中因含有丰富的多酚、色素、多糖等物质,给蛋白质的提取带来了困难.为了找到一种适合杨树叶片的蛋白质提取方法,以南林895杨为实验材料,采用三氯乙酸-丙酮沉淀法对杨树叶片蛋白质进行提取.对所提取的蛋白分别用考马斯亮蓝染色法和银染法进行检测,得到了良好的双向电泳图谱.     

山黧豆蛋白质的提取及营养价值研究

优化碱溶酸沉提取山黧豆蛋白的方法,得到山黧豆粗蛋白,并分析其氨基酸组成,同时对山黧豆蛋白质进行了综合的营养价值评价。结果显示,山黧豆蛋白质的较佳提取条件为:提取温度40℃,pH值10,提取时间1h,料液比1∶20g/mL。此条件下,山黧豆蛋白质的提取率最高,蛋白质质量分数高达26.1%。山黧豆蛋白的等电点为pH值5;山黧豆蛋白质中含有18种蛋白质氨基酸,其中谷氨酸质量分数最高为17.4%,其次是天冬氨酸10.0%。其必需氨基酸占总氨基酸的比值EAA/TAA为42%(>40%)、必需氨基酸与非必需氨基酸的比值EAA/NEAA为72.41%(>60%),即均大于FAO/WHO提出的参考蛋白量。山黧豆蛋白中的氨基酸评分、化学评分、氨基酸比值系数以及必需氨基酸比率,除蛋氨酸+胱氨酸、苏氨酸、色氨酸、缬氨酸外,其他均高于WHO/FAO标准;蛋氨酸+胱氨酸、色氨酸分别为第一和第二限制性氨基酸。山黧豆蛋白质的必需氨基酸指数EAAI值为1.16,根据蛋白质的评价标准:EAAI值大于0.9为优质蛋白源,说明山黧豆蛋白质属于优质蛋白。     

菜籽粕中蛋白质含量及提取条件的研究

通过对地处青藏高原泊中县脑山地区菜籽中蛋白质含量的及提取条件研究表明,pH＝10．5的碱性条件是提取蛋白质较适宜的环境,其中可消化的蛋白质可达37．56％,所提取蛋白质可达18．96％。     

Tris-HCl法提取蝶类干标本蛋白质的研究

用Tris-HCl法对蝶类干标本头部、胸部和腹部进行蛋白质的提取,提出了适合蝴蝶干标本蛋白质的提取方法,并成功地应用于SDS-PAGE分析.表明用该方法提取蝴蝶干标本蛋白质可行.     

分子碎片共轭帽基团法研究蛋白质相互作用能

分子碎片共轭帽基团法（MFCC）是近年来发展的一种线性标度方法,在此基础上可以使用全体系量子力学方法来研究蛋白质体系的各种性质．本文采用该方法对蛋白质与小分子之间的相互作用能进行了研究．