基于QSAR模型的有机磷化合物毒性预测

随着有机磷化合物(OPs)的广泛应用,其在越来越多的环境介质中被检测出来。大多数OPs具有毒性,但人们缺乏快速且有效的预测手段来对毒性进行评估。本文将结合E-Dragon软件计算的分子描述符,采用不同的QSAR模型对36个OPs的毒性进行预测。文中采用后退法作为描述符筛选方法,以均方根误差(RMSE)作为评价标准,共找到14个对线性核函数支持向量机(SVM)模型贡献较大的描述符;在最终得到的SVM模型交叉验证结果中,计算值与实际值的相关系数为0. 913,均方根误差为0. 388;外部测试验证结果中,平均相对误差为9. 10%。此外,采用多元线性回归(MLR)、人工神经网络(ANN)以及偏最小二乘回归(PLS)模型对OPs的毒性进行预测,交叉验证结果显示,三个模型的计算值与实际值的相关系数分别为0. 878、0. 686与0. 620,没有SVM模型的预测能力好。因此采用线性核函数的SVM模型对OPs进行毒性预测是一个行之有效的方法。     

Multi-KNN-SVR组合预测在含氟化合物QSAR研究中的应用

为深入认识含氟农药生物活性与其结构之间的关系, 建立了理想的QSAR模型, 从化合物油水分配系数等7个分子结构描述符出发, 基于支持向量回归(SVR)和MSE最小原则, 经自动寻找最优核函数和非线性筛选描述符, 构建了多个K-最近邻(KNN)预测子模型. 再经非线性筛选获得保留子模型, 以保留子模型实施组合预测(Multi-KNN-SVR). 33种含氟化合物对5种不同病害生物活性的留一法组合预测结果表明, 采用非线性筛选描述符和KNN子模型能有效地提高预测精度, 基于多个KNN子模型的非线性组合能进一步提高预测性能. Multi-KNN-SVR组合预测在QSAR以及其它相关预测研究中具有广泛应用前景.     

Lasiodiplodins系列化合物的NMR研究

从南海马尾藻(Sargassum sp.)内生真菌No.ZZF36中分离得到3个十二元环内酯化合物-lasiodiplodin (1),de-O-methyllasiodiplodin (2)和5-hydroxy-de-O-methyllasiodiplodin (3)。利用波谱技术确定其结构,并对lasiodiplodins系列化合物的波谱特征进行了分析。     

甲状腺激素受体配体化合物的定量构效关系(QSAR)研究

研究了68个TR（Thyroid Hormone Receptor,甲状腺激素受体）配体化合物的化学结构与活性的定量构效关系．采用实验室新近提出的三维原子场全息相互作用矢量,对化合物进行了结构参数化表达,采用逐步回归对变量进行筛选后,建立了定量构效关系模型．复相关系数和交互检验复相关系数R^2=0．767,Q^2=0．625（TRα）,R^2=0．734,Q^2=0．61（TRβ）．模型具有良好的稳定性和预测能力,证明了该三维原子场全息相互作用矢量在分子结构表征和生物活性预测上的适用性,并可应用于潜在和新型的TR配体化合物的设计和开发．     

有机化合物的QSAR研究

QSAR即定量结构——活性相关,从研究化合物的分子结构入手,运用适当的描述符,选取合适的结构参数和理化参数,建立起结构和生物活性之间的定量关系。本文概述了进行有机物QSAR研究的必要性,QSAR的研究方法及其在环境科学方面的应用。     

苯甲酰硫脲类化合物生物活性的QSAR模型和结构修饰的理论研究

基于分子拓扑邻接矩阵,计算了18种苯甲酰硫脲衍生物的原子类型电性拓扑状态指数(En)。通过多元线性逐步回归方法,建立了令人满意的En与苯甲酰硫脲衍生物对金黄色葡萄球菌的抑制活性(D)的定量结构-活性相关模型(QSAR)。该模型的相关系数(R2)、标准偏差(S)分别为0.861及1.273,该模型的计算值与相应实验值基本吻合。经Rcv2、VIF、FIT、AIC等指标检验,所建模型具有良好的预测能力与稳健性。利用该模型探讨了苯甲酰硫脲衍生物对金黄色葡萄球菌的抑制机理。根据进入模型的2个电性拓扑状态指数E1、E7可知,影响苯甲酰硫脲衍生物对金黄色葡萄球菌的抑制活性的主要因素是分子的二维结构特征-CH3和在芳环中=CH-等结构碎片。由结构修饰提出5种化合物,其中3种的抑菌活性均超出18mm,有待以后生物实验予以证实。     

基于QSAR/QSSR的苯并三唑化合物选择性抑制PTP-1B的研究

蛋白酪氨酸磷酸酶1B (PTP-1B)特异性抑制剂是近年来治疗II型糖尿病药物研发的热点. PTP-1B与T细胞蛋白酪氨酸磷酸酶(TCPTP)同源性很高, 为了避免在使用PTP-1B抑制剂过程中对TCPTP产生交叉抑制, 则需要设计开发对PTP-1B具有高活性和高特异选择性的小分子化合物. 苯并三唑类化合物对PTP-1B的抑制活性很高, 并且其中一些化合物对PTP-1B表现出了较好的特异选择性, 具有良好的药用开发前景. 通过CoMFA和CoMSIA两种方法分别对该类化合物进行了三维定量结构-活性关系(3D-QSAR)和三维定量结构-选择性关系(3D-QSSR)研究, 并建立了相关的预测模型. 计算结果表明PTP-1B中的Arg24与化合物的氢键相互作用是提高选择性的重要因素, 并且在R2位引入氢键供体且体积较大的强供电子基团, 将有利于化合物抑制活性的提高, 而在R2位取代基的末端引入氢键受体且体积较大的强吸电子基团, 将有利于化合物选择性的提高.     

维甲化合物与维甲X受体相互作用模拟及QSAR研究

用分子对接确定了一系列RXR激动剂与受体的作用方式,与X衍射测得的晶体复合物中9-cis-RA的作用方式相近。对接后的配体-受体复和物经分子力学优化后更接近药效构象,两者相互作用能与活性具有一定的相关性,相关系数R^2=0.64。用活性构象建立的CoMFA模型比低能构象建立的CoMFA模型有更高的可信度,其交叉验证相关系q^2=0.791,非交叉验证相关系数γ^2=0.988,绝对误差SE=0.099,f6,33=456.8。     

HEPT类化合物的QSAR研究

为定量结构／活性相关性研究提取了量子化学参数,拓扑指数Am,分子连接性指数^mxt及疏水性常数,同时应用正交变换和最佳变量子集算法（Leaps-and-Bonds)进行了变量压缩和选择,进而实施了多元回归分析,并由此结果进行了HEPT类化合物（1－[(2-hydroxyethoxy)methyl]-6-(phenylthio)-thymine derivatives)的结构／活性关系的理论解释,进行了人工神经网络法对于该类化合物的活性预测,其结构明显好于多元回归法。     

1－硫脲乙基－2－芳基－2－咪唑啉化合物的合成

１－硫脲乙基－２－芳基－２－咪唑啉化合物的合成刘运廷，章荣玲（山东工业大学数理系济南，２５００１４）关键词咪唑啉，硫脲基，芳基，合成咪唑啉衍生物由于具有缓蚀、杀菌、抗癌等活性而迅速发展￣［１，５］。作者曾研究过各种咪唑啉衍生物的合成￣［６］，系采用通...     

2－羟基－1－萘醛缩苯胺类Schiff碱化合物结构的研究

合成了９个２－羟基－１－萘醛缩苯胺类Ｓｃｈｉｆ碱化合物，通过ＩＲ、１ＨＮＭＲ和１３ＣＮＭＲ测定，对其波谱进行了研究。在１ＨＮＭＲ谱中，得出酚羟基质子的化学位移值与苯环上的间位和对位取代基的Ｈａｍｍｅｔ常数有很好的线性关系：δ＝１４．９６－２．２６σ，ｒ＝０．９７，ｎ＝８。证明了此类Ｓｃｈｉｆ碱化合物的结构为烯醇亚胺结构。     

Fabrication of Dendrimer－like PAMAM Based on Silica Nanoparticles

A G 4.0 dendrimer-like poly (amido amine) (PAMAM) based on silica nanoparticles was fabricated via a divergent approach.It was built from γ-aminopropyi silica nanoparfides (APSN) core via repetitive addition of acrylate (MA) and hexylenediamine (HDA). FT-IR and EA were used to monitor the progress of dendrimer during each step. The amino group content of the resulting product increased from 0.49 to 3.72 mmol/g after the 4th generation. In addition, the percentage of grafting increased with increasing generation and reached to 65.9% after 4th generation. It was found that the resulting silica nanoparticles could be dispersed in methanol with a mean hydrodynamic particle diameter of 152.7 nm although the silica nanoparticles had agglomerated during the storage period.     

系列羟基苯基卟啉化合物荧光性质的研究

对照紫外光谱的变化分析了5种卟啉周边羟基的数目、位置及其在不同溶剂条件下的荧光光谱的变化情况.研究表明,利用控制卟啉周边取代基的数目、对称性及选择溶剂可获得不同强度的荧光物质.     

5－氟尿嘧啶－卟啉化合物的合成及抗癌活性

以37％－45％的产率合成了六个新的5－氟尿嘧啶-卟啉化合物，通过元素分析 、红外光谱、紫外可见光谱、核磁共振谱和质谱确定了其结构。抗癌试验表明，化 合物A3，A4，A5对Hela（宫颈癌细胞）有明显的抑制作用。     

Na_（1－x）Zr（2－x）Nb_xP_3O_（12）系列化合物的水热晶化研究

采用水热晶化反应，制备出传统需要高温固相反应合成的掺杂ＮＡＳＩＣＯＮ化合物Ｎａ（１－ｘ）Ｚｒ（２－ｘ）ＮｂｘＰ３Ｏ１２（０＜ｘ＜１），并应用ＸＲＤ、ＩＲ方法对产物的晶体结构进行了研究，表明水热晶化产物是纯的物相并具有与ＮａＺｒ２Ｐ３Ｏ１２相同的结构．固体３１ＰＮＭＲ研究证实Ｎｂ（５＋）部分取代了Ｚｒ（４＋）所在位置，参与骨架的组成，并统计分布于结构中．水热晶化产物与固相反应产物具有相同的离子电导性能．     

1，2－二氢－3H－吲哚－3－酮类化合物的光化学合成

１，２－二氢－３Ｈ－吲哚－３－酮类化合物的光化学合成凌可庆（淮北煤炭师范学院化学系，淮北，２３５０００）关键词吲哚衍生物，单重态氧反应，１，２－二氢－３Ｈ－吲哚－３－酮衍生物，光合成１，２－二氢－３Ｈ－吲哚－３－酮是重要的有机合成中间体，广泛用于多种...     

3-芳氧基丙醛系列化合物的合成研究

3-芳氧基丙醛系列化合物是一类重要的中间体,广泛地应用于医药、塑材、表面活性剂等领域.探索与改进了3-芳氧丙醛的合成方法,以取代酚与3-溴-1,1-二甲氧基缩丙醛发生取代反应,在酸性条件下脱保护以最高82%的总收率合成了系列3-芳氧基丙醛化合物.本方法反应条件温和、操作简单、总收率高,具有较强的应用前景.     

1－芳酰基－3－（4－苯磺酰胺）硫脲类化合物的合成

以无水丙酮作溶剂，由芳酞基异硫氰酸酯与磺胺反应合成了一系列薪的１－芳酸基－３－（４－苯磺酰胺）硫脲。     

Mo（W）－Cu（Ag）－S原子簇化合物的研究现状

本文在研究Ｍｏ（Ｗ）－Ｃｕ（Ａｇ）－Ｓ原子簇化合物的低热固态合成化学基础上，详细地对该类簇合物进行了归纳，从中提出：１．（Ｍ＝Ｍｏ，Ｗ；ｎ＝２，３，４）作为配体中心．２．氧原子在簇合物中仅作为端基，不参与同其他金属成键．３．单个ＭＳ４（Ｍ＝Ｍｏ，Ｗ）基团最多只能键合六个Ｃｕ（Ａｇ）原子，即最大核数为七．４．迄今为止所有Ｍｏ（Ｗ）－Ｃｕ－Ｓ原子簇化合物中Ｃｕ均为＋１价．５．预计合低价态Ｍｏ（Ｗ）的这类簇合物将会有很大进展．