电喷雾质谱法研究细胞色素Tb5及其F35Y突变体蛋白肽链和辅基的相互作用

本文通过牛肝线粒体细胞色素Tb5和它的F35Y突变体蛋白相对分子质量的外标法测定,得到细胞色素Tb5全蛋白的相对分子质量为10077.5脱辅基蛋白的相对分子质量为9461.4F35Y突变体蛋白的相对分子质量为10093.6,它的脱辅基蛋白的相对分子质量为9477.5,不同nozzle电压下的电喷雾质谱结果表明,该电压的大小明显影响蛋白肽链与血红素辅基之间的非共价结合,随着电压的降低,全蛋白谱峰的强度逐渐增大,然而,过低的电压导致了Na^+,K^+离子加合峰相对强度的增加,而不利于谱图分析。同时,考察到细胞色素Tb5在甲醇溶液和酸性溶液中的变性行为,因此选择nozzle电压70V,10%的甲醇水溶液和pH=7为得到全蛋白质谱峰的最佳条件。相同实验条件下得到的野生型CytTb5和F35Y突变体全蛋白的质谱峰相比较,其相对丰度有悬殊的差异,表明F35Y突变体蛋白的血红素结合能力明显低于野生型蛋白。通过解离出的Hemeb的分子离子峰进行解析,证明铁仍以三价离子存在于血红素辅基中。     

电喷雾质谱法研究人参皂苷Rb1和Rd与细胞色素c的非共价复合物

用质谱法研究了人参皂苷Rb1和Rd与细胞色素c的非共价相互作用, 证明主-客体之间形成了多种化学计量比的复合物, 用直接计算的方法得出人参皂苷Rb1和Rd与细胞色素c形成的非共价复合物的各级解离常数KD, 用竞争体系验证了计算结果, 二者结果相互吻合.     

电喷雾质谱法研究氨基酸的质谱碎裂及其与人参皂苷Rb3的相互作用

用串联质谱法研究了18种常见氨基酸在正离子和负离子模式下的质谱碎裂规律. 结果表明, 在正离子模式下的分子离子峰强度比在负离子模式下的高一个数量级, 氨基酸α-C上的羧基和氨基容易脱掉. 在正离子和负离子模式下都有两种裂解机理. 用电喷雾软电离技术研究了人参皂苷Rb3与18种氨基酸的非共价相互作用, 并采用直接计算的方法得出这些非共价复合物的解离常数. 结果表明, 在水介质中,与其它氨基酸相比, 酸性氨基酸和碱性氨基酸与人参皂苷结合更稳定.     

电喷雾质谱法研究人参皂苷与溶菌酶的相互作用

用电喷雾质谱法研究了溶菌酶与人参皂苷Rg1和Re的非共价相互作用。非共价复合物的解离常数可以由溶菌酶和复合物的峰高直接计算得到。由各个体系得到的溶菌酶与Rg1和Re的一级解离常数KD, 1是一致的，但是二级解离常数KD, 2的差别较大。由此可以推断出复合物的峰高越强，结果的精密度越好。当固定溶菌酶的浓度不变时，复合物的解离常数会随着人参皂苷的浓度的增加而略微的增大。而当固定人参皂苷的浓度时，复合物的解离常数会随着溶菌酶的浓度的增加而减小。计算结果还证明了人参皂苷Rg1与溶菌酶的结合能力大于Re。     

电喷雾多级质谱研究功能小分子与蛋白质的非共价相互作用——推荐一个化学生物学教学实验

肌红蛋白不仅便宜易得,而且自身就是一种由蛋白质和铁卟啉环辅基通过非共价相互作用构成的复合物.因此,以肌红蛋白为研究模型,带领学生实践基于电喷雾多级质谱技术的酶抑制剂直接筛选策略,重点考查不同有机溶剂比例及pH等样品制备条件对复合物测定结果的影响,以及如何利用二级质谱技术实现功能小分子配体的在线定性分析.该实验已在我校化学生物学专业本科生"化学生物学综合实验"教学工作中进行了多轮教学实践,通过实践不断优化实验设计,取得了良好的教学效果.     

细胞色素b5突变体V45H NMR初步研究

通过分析在H2O和D2O中采集,DQF-COSY,TOCSY和NOESY等二维核磁共振波谱鉴定了细胞色素b5定点突变体V45H(残基Val^45突变为His^45)的大多数氨基酸残基的质子自旋系统,通过解析NOESY谱中的dNN(i,i+1),dαN(i,i+1),dαN(i,i+2),dαN(i,i+3),dαβ(i,i+3)和dβN(i,i+1)等NOE相关,完成了其序列特异性归属以及主链和侧链质子共振信号的全归属。突变体V45H的二级结构分析表明残基Val^45突变为His^45对分子的整体折叠影响不大。但是,与野生型细胞色素b5相比较,突变体V45H主链酰胺质子的化学位移指数提示突变使其血红素疏水腔的微环境受到扰动。以上实验结果为进一步测定V45H的溶液结构和分析残基Val^45在蛋白质中的作用提供了基础。     

细胞色素c突变体F82H的表面增强拉曼和电化学研究(英文)

应用表面增强拉曼光谱和循环伏安法研究了细胞色素c及其突变体F82H的氧化还原性质 .结果表明苯丙氨酸对组氨酸的取代使得蛋白质结构更为稳定 .相对于原体蛋白质 ,突变体的氧化还原电位向负电位方向移动 ,这被归因于由氧化还原过程中伴随有配体转换反应影响所致 .     

表面带负电荷氨基酸残基的突变对细胞色素b5与细胞色素c结合和识别的影响

利用核磁共振方法研究表面带不同负电荷氨基酸残基突变后的细胞色素b₅与细胞色素c的结合与识别.结果表明,静电作用在细胞色素b₅与细胞色素c的结合过程中有着重要的贡献,而且这些静电贡献在一定程度上具有累加性,E48的贡献略大于E44.同时还证明Browniandynamicssimulations优化出的Glu48-Lys13,Glu56-Lys₈₇,Asp60-Lys86和heme6-propionate-Tml₇₂(细胞色素b₅的残基排在前面)的结合方式在溶液中的确存在.细胞色素b₅突变体(E48,E56/A,D60/A)及[Cr(oxalate)₃]^3-对细胞色素c的表面结合竞争实验表明,细胞色素c表面结合区Site仍然同细胞色素b₅突变体(E48,E56/A,D60/A)有结合作用,只是结合强度上相对于野生细胞色素b₅同细胞色素c的结合有所降低.这表明除上述的Brownian dynamics simulations模型外,尚有其它如Salemme模型等的结合方式,这也揭示出细胞色素b₅和细胞色素c之间的结合是比较动态的.     

电喷雾电离质谱测定细胞色素b5及其定点突变蛋白

本文利用电喷雾电离质谱技术对胰蛋白酶酶解的细胞色素b5蛋白Tb5及脂肪酶酶解的细胞色素b5蛋白Lb5及它们的定点突变蛋白共八个样品的分子量进行精确测定, 证实定点突变的试验是成功的。     

利用电喷雾质谱研究单链寡聚核苷酸与人参皂苷的相互作用

选择与SARS病毒相关的寡聚核苷酸片段作为靶分子, 利用电喷雾质谱研究人参皂苷与靶分子形成的非共价复合物. 探讨了实验条件对单链寡聚核苷酸靶分子与皂苷类化合物相互作用的影响; 发现非共价作用强度的大小与人参皂苷苷元、糖链的结构有关, 包括人参皂苷苷元的类型、羟基的数目、糖链的长短. 发现人参皂苷与单链寡聚核苷酸靶分子相互作用的强度具有如下规律: 三醇型苷元＞二醇型苷元, 三醇型皂苷＞二醇型皂苷; 在三醇型皂苷中, 三糖＞二糖＞四糖, 一糖＞苷元, 具有相同糖单位的二醇型皂苷的四糖苷中, 分子量小的皂苷＞分子量大的皂苷, 同分异构体中, 同为木糖末端的Rb2＞Rc, 即吡喃型＞呋喃型. 上述研究结果将有助于阐述人参皂苷的药理活性、构效关系.     

Study on the noncovalent complexes of ginsenoside and cytochrome c by electrospray ionization mass spectrometry

The noncovalent complexes of cytochrome c and ginsenoside were studied by electrospray ionization mass spectrometry (ESI-MS). Ginsenoside Rb2 and Re were bound to cytochrome c to form several complexes with different stoichiometric relation. The 1:1 and 1:2 complexes of cytochrome c to ginsenoside were considered and the dissociation constants were obtained according to the intensities of cytochrome c and complexes when the concentrations of cytochrome c and ginsenoside have been known. Competition experiment was performed to validate the result. The K(D) values obtained with different reactive systems were consistent with each other.     

天然有机化合物的质谱研究 VI: 20-C-未被氧化的-对映-贝壳杉烯化合物的质谱

用EIMS、高分辨及B/E联动扫描技术, 对二十一个20-C-未被氧化的-对映-贝壳杉烯化合物的结构特征进行了研究, 根据它们的结构和质谱行为, 分为三种类型的化合物,B环的7C上有取代基, B环的6C上有取代基, B环的6C和7C同时有取代基, 并讨论裂解过程与A、B、C环上的取代基的影响。     

质谱学中的立体化学效应-公桕立体异构体的质谱研究

本文考察了十三个鬼桕毒及其衍生物的立体异构体的质谱性能,借助高分辨质谱裂解方式及特征离子相对丰度的影响,并提出了合理的解释。     

Electrospray ionization mass spectrometry of 5-methyl-2'-deoxycytidine and its determination in urine by liquid chromatography/electrospray ionization tandem mass spectrometry.

The behaviour of 5-methyl-2'-deoxycytidine (m(5)dCyd, claimed to be a potential marker for leukaemia) during the electrospray process was studied. In particular, considerations concerning the effect of solution chemistry (e.g. analyte concentration, pH, etc.) on electrospray ionization mass spectra were drawn. Furthermore, a procedure using liquid chromatography/electrospray ionization tandem mass spectrometry (LC/ESI-MS/MS) for the determination of urinary m(5)dCyd is described. The method is simple, sensitive and highly specific. The pre-treatment procedure gave an average recovery of 79% (relative standard deviation (RSD) of 3%). Method performance was evaluated on spiked urine samples covering the concentration range from 50 ng/mL to 10 microgram/mL, the same as that of an existing inhibition ELISA method. Contrary to findings based on this immunoassay technique, urinary m(5)dCyd in healthy individuals was not detectable and did not increase in the presence of the malignant disease.     

天然产物的质谱研究V.负离子快原子轰击及其碰撞活化质谱法在寡糖苷结构分析中的应用

研究了八种含1一3个糖基的糖苷的负离子快原子轰击(NFAB)质谱,NFAB质谱与相应的正离子谱(PFAB)比较,在高质量区示出较明显的准分子离子[M-H][-]峰而无加合离子峰,从而能较明确指示糖苷的分子量, 在所试验的三种底物甘油、硫代甘油和聚乙二醇-200(PEG-200)中,以PEG-200给出的结果最佳,[M-H][-]离子的碰撞活化谱(NFAB-CA谱)产生的特征离子比[M+H][+]离子PFAB-CA谱中相应离子的丰度大,能更为明确地给出糖基连接顺序信息。     

土槿皮酸类化合物的质谱研究

本文系统地研究了土槿皮甲酸、乙酸和丙酸及其衍生物的质谱.通过质谱-结构关系的分析、高分辨质谱及亚稳数据的测定,阐明了它们在电子轰击下的裂解反应机制.     

Investigation of the interaction between HIV-1 DNA and cyclic peptides by electrospray ionization mass spectrometry

The interaction between HIV-I DNA and five cyclic peptides (CPI-CP5) was investigated using electrospray ionization mass spectrometry (ESI-MS). It revealed that CPI [c(Ala-Tyr-Leu-Ala-Gly)] and CP4 [c(Pro-D-Tyr-Leu-D-Ala-Gly)] have the higher binding affinity with the duplex DNA among the five cyclic peptides.