3株抗灰霉病放线菌的分离和鉴定

 从云南永胜、中甸采集的土壤样品中分离到3株放线菌菌株YIM31658,YIM31679,YIM31777.具有很强的抗灰霉病活性,防效均达到100%.通过对其进行形态特征、生理生化特性、细胞壁化学组分以及16SrDNA序列等多相分类研究,确定其分属链霉菌属和链孢囊菌属.     

一株具抗菌活性放线菌菌株YIM31249~T的分离和鉴定

从云南洱源采集的土壤样品中分离到1株链霉菌YIM31249TT.该菌株具有很强的抗菌活性.通过对其进行的包括形态、生理生化特性、细胞壁化学组份以及16SrDNA序列等方面的研究,确定其为链霉菌属的一个亚种,我们将其命名为生黑孢链霉菌洱源亚种(Streptomycesmelanosporofacienssubsperyuanensis).菌株YIM31249T气生菌丝和基内菌丝均很丰富,孢子链较长且为螺旋状,部分孢子链螺旋成假孢囊,孢子表面粗糙不带刺,基丝不断裂.     

1株革兰氏阴性细菌菌株YIM31327^T的分离和鉴定

从云南森林土壤样品中分离到1株革兰氏阴性细菌YIM31327^T．通过对其进行的包括形态、生理生化特性、细胞壁化学组份以及16S rDNA序列等多相分类研究，确定其为杜擀氏菌属的1个新种，我们将其命名为黑紫杜擀氏菌(Duganella violaceinigra sp.nov．)．菌株YIM31327^T的最适生长温度为28～30℃，最适生长pH为7．0，细胞短杆状、无孢子形成、有鞭毛、可运动。     

一株高效絮凝剂产生菌的分离和鉴定

应用多相分类手段对絮凝菌株XHUA9进行了分类研究,并对分离提纯的发酵产物进行紫外和红外分析.基于16S rRNA基因序列的系统发育分析表明,该菌和模式菌株Paenibacillus hunanensis的序列同源性为96.7%,基因组DNA-DNA同源性杂交值为51.6%.菌株的主要极性脂肪酸为双磷脂酰甘油、磷脂酰甘油、磷脂酰乙醇胺和磷脂酰肌醇.菌株优势醌为MK-7,主要优势脂肪酸为anteiso-C15:0和C16:0.菌株(G+C)摩尔分数为51.9%.根据上述结果,菌株XHUA9鉴定为类芽孢杆菌属内的新种,命名为Paenibacillus shenyangensis sp.nov..紫外扫描和红外检测等结果表明,菌株XHUA9所产絮凝剂的主要成分为多糖类物质.     

一株产耐高温淀粉酶菌株DW027的鉴定

结合表型性状分析和16S rRNA序列及系统发育分析进行菌株的鉴定.结果显示,DW027菌体呈杆状,革兰氏染色阳性,产芽孢.在LB平板培养基上,菌落呈白色、圆形.16S rRNA基因序列分析表明,与枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)标准序列的同源性达99％,初步鉴定为枯草芽孢杆菌.     

软腐白菜根系土壤中短稳杆菌的分离和鉴定

采用选择性培养基,从软腐白菜根系土壤中分离出产生香气的细菌,通过对菌株进行形态学观察、生理生化试验以及16S rRNA基因序列测定、比对分析和系统发育树构建,对该类群菌株进行初步分类鉴定.结果表明,12株产生烘焙香气细菌的形态学特征及生理生化特性与短稳杆菌(Empedobacter brevis)LMG 4011T(AM177497)一致,16S rRNA基因序列与短稳杆菌基因序列同源性达99.86%,初步鉴定该类菌为短稳杆菌.     

1株嗜碱克氏菌属菌株的分离及系统发育分析

从埃及盐碱土样分离得到1株革兰氏阳性的兼性嗜碱菌株YIMT0003，不产荚膜和芽孢，不具游动性．生长温度范围为室温(约20℃)到37℃，最适生长温度为28℃，生长的pH值范围为pH5～12。对NaCl的耐受范围为1％～5％，DNA的G C mol％为69．44％．16S rRNA全序列分析的结果表明，该菌株与Kocuria polaris CMS76^T亲缘关系最近，但两者在形态、生理生化特征上有差异。有可能是克氏菌属的一个潜在新种。     

产碱杆菌SB1菌株的分离和降解水杨酸的研究

用富集培养法从工业水中分离到一株能以水杨酸为唯一碳源和能源的产碱杆菌ＳＢ１。该菌株在优化培养条件下对水杨酸的降解率可达９９％以上。     

一株高产谷氨酰胺合成酶的LNU 0165菌的鉴定

谷氨酰胺合成酶是应用广泛的生物酶类,以LNU0165为实验出发菌株,对不同pH、温度条件下产谷氨酰胺合成酶的最佳发酵条件进行了研究,通过测定其谷氨酰胺合成酶酶活力,确定LNU0165为高产菌株.从分子水平上对该菌株进行16S rRNA序列分析及同源性比较,以及生理生化的鉴定．根据LNU0165菌株16SrRNA与GenBank数据库中Arthrobacter globiformis的16S rRNA的序列具有99％的同源性,确定LNU0165为球形节杆菌（Arthrobacter globiformis）．     

1株具抑制一氧化氮合成酶活性放线菌菌株的分离和鉴定

 从云南河口采集的土壤中分离到1株稀有放线菌YIM30243^T.该菌株具有很强的抑制一氧化氮(NO)合成酶活性.通过对其进行的包括形态、生理生化特性、细胞壁化学组分以及16SrDNA序列等方面的多相分类研究,确定其为诺卡氏菌属的1个新种,我们将其命名为白色诺卡氏菌(Nocardiaalba sp.nov.).该菌株在大多数培养基上生长良好,气生菌丝呈黄白色至粉红白色,基内菌丝黄白至黄褐色.气生菌丝、基内菌丝均呈不规则断裂.     

一株煤矿地下水硫酸盐还原细菌的分离、鉴定及性质研究

从煤矿井下700 m深处含水层的钻孔涌水中分离获得一株硫酸盐还原细菌GY-2,该菌株革兰氏反应阴性,有芽孢,菌体棒状,能运动,氧化酶阴性;通过16S rRNA系统发育学分析,确定菌株GY-2为滴状脱硫肠状菌(Desul fotomaculum guttoideum).GY-2菌株为兼性厌氧菌,在含有Fe2+的条件下生长...     

一株富含类胡萝卜素光合细菌的分离鉴定

从不同生物环境中分离紫色非硫菌,测定其类胡萝卜素含量,筛选出富含类胡萝卜素的菌株.对该菌株的形态学特征、碳氮源利用情况、最适生长pH值及盐度等生物学特征进行研究;利用PCR技术扩增其16S rRNA基因,测序后进行16S rRNA基因序列分析,研究其分类地位.结果:分离自暨南大学明湖底泥的菌株R2,在所分离的8株紫色非硫菌中,类胡萝卜素质量分数最高,为4.83 mg/g(干菌体),该菌株符合红游动菌属(Rhodoplanes)的生物学特性,其最适生长pH为7.0,盐度为0.2%;16S rRNA基因的分子系统学分析表明,该菌株与红游动菌属的Rhodoplanessp.HA17相似性为99.4%.可确定筛选出一株高产类胡萝卜素的菌株,该菌株属于红游动菌属(Rhodoplanes).     

高产5-氨基乙酰丙酸光合细菌株的分离鉴定

从不同生态环境中分离培养出20株光合细菌,进行5-氨基乙酰丙酸(5-ALA)的产量检测,筛选出一株分离自广州市云溪公园池塘底泥的菌株R5,其5-ALA产量最高,达4.92 mg/L.为了确定菌株R5的分类学地位,对该菌株的形态学、碳源利用情况等生理生化特性进行了研究,表明该菌株符合红假单胞菌属的生物学特征;以菌株R5基因组DNA为模板PCR扩增16S rDNA基因,对PCR产物进行了序列测定,将所测得的核酸序列与相关细菌的16S rRNA序列进行比对,并构建进化树进行系统发育分析,发现菌株R5与沼泽红假单胞菌株KUGB306(Rhodop-seudom onas palustrisKUGB306)形成一个类群,序列同源性为99%.故最后确定该高产5-ALA的菌株属于红假单胞菌属(Rhodopseudom onas).     

乌江网箱养殖丁(魚歲)细菌的分离与分子鉴定

利用微生物学常用的细菌分离、纯化方法从丁(魚歲)中分离出9株菌株,编号分别为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ、Ⅵ、Ⅶ、Ⅷ、Ⅸ.分别扩增出9株菌株的16S rRNA基因约600 bp的片段,并对其测序,将测序结果输入到NCBI(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)中,用BLAST工具对序列进行同源性比对分析,并利用MEGA4绘制系统进化树,结果表明:9株菌株的16S rRNA基因测序结果分别与不动杆菌(Acinetobacter)、嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophi-la)、希瓦氏菌(Shewanella baltica)、不动杆菌(Acinetobacter)、希瓦氏菌(Shewanella baltica)、霍乱弧菌(Vibriocholerae)、枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)、杀鲑气单胞菌(Aeromonas salmonicida)、肺炎克雷伯氏菌(Klebsiellapneumoniae)的16S rRNA基因的核苷酸序列同源,同源性分别为96%,99%,99%,97%,98%,98%,99%,98%,98%.9株菌株的系统进化树明显分为3支,Ⅰ和Ⅳ聚为一支,Ⅶ独聚一支,Ⅱ、Ⅲ、Ⅴ、Ⅵ、Ⅷ、Ⅸ聚为一支,其中Ⅱ和Ⅷ相聚,Ⅲ和Ⅴ相聚后再与Ⅵ相聚,最后与Ⅸ相聚.     

一株氯苯降解菌的分离鉴定

氯苯是重要的化工原料,长期使用对环境造成了严重的危害．为了研究生物方法修复自然环境的可行性,采集化工厂排污口的污泥,利用富集驯化等方式,分离到一株能够降解氯苯的菌株KD131．通过分析该菌株的16SrRNA基因序列,并结合BIOLOG微生物鉴定系统的测定结果,确定KD131为短小芽孢杆菌（Bacillus pumilus）,同时构建了系统进化树．利用气相色谱方法,对分离菌株KD131降解氯苯的能力进行了初步分析,24h内氯苯分解率达60．8％．进一步研究发现,KD131对苯和邻二氯苯也具有一定的降解能力．     

一种有固氮能力的节杆菌菌株的分离和初步鉴定

从日本冲绳县土壤采样经垃圾处理场堆肥化处理,分离到一株有固氮能力的菌株HS-G8,该菌为革兰氏阳性菌,不产芽孢,无运动性．在LB固体培养基上,菌落为黄色,圆形,边缘整齐,有光泽．有明显的杆-球状的生长周期,(1d内呈杆状,2d以上呈球状)．对该菌株HS-G8的16S rDNA的全序列测序并进行DNA同源性分析,发现它与Arthrobacter属的关系最近,与Arthrobacter nifotianae的同源性为99．1％．其主要生理生化特征也与Arthrobacter属相符．初步鉴定HS-G8可能为Arthrobacter属的一个新种。     

一株放线细菌的分离及其系统分类学研究

从青海柴达木盐田周边的盐土中分离到一细菌形态的菌株M-7。通过对其形态、生理生化特性、细胞化学组分及16S rDNA序列分析等多相分类研究,初步确定该菌株为白蚁茵属（Isoptericola）的一潜在新种。菌株M-7的最适生长温度为28～30℃,最适生长pH为7．0～7．5,细胞球形或短杆状、无鞭毛、无孢子形成。