线虫基因组外显子与内含子序列特征研究

根据外显子在密码子三个位点上的分布不均匀性 ,引入非均匀指标 H I,来研究线虫基因外显子与内含子的序列特征 .通过推广 H I参数 ,定义干涉指标 R,对外显子和内含子的多个片段的特征进行研究 ,得到了 R值分布以及与外显子和内含子片段的关系 .     

模式生物的外显子、内含子和基因间序列的识别

基于核酸序列在剪切位点上保守性、组分的不同和编码序列阅读框架的3周期性,模式生物全基因组序列分为外显子、内含子和基因间序列三类.三个标准离散源分别由64个三联体在整条序列上的概率和4个碱基序列首尾(剪切位点附近)共30个位点上的概率共同构成.某条序列的类型就由该序列的离散量同相应区间上三个标准离散量的离散增量确定.结果表明:具有184个信号参数的离散量预测比只有64个三联体参数的结果要高出5%,总体预测成功率:线虫为87.37%,拟南芥为91.08%,果蝇为92.28%,原核生物大肠杆菌的二种序列预测率为92.88%,酵母菌为94.88%.     

核酸序列非均匀指数(HI)的约化

考虑到在计算 H I值时 ,任何一种碱基在序列中出现的理论频数都应该大于 5 ,故而对原 H I公式进行了约化处理 ,并将约化后的 H I值与原 H I值作了对比 ,发现不同的约化方式所得到的 H I值在描述序列不均匀性时的效果是不同的 ,用编码区所偏好的约化语言进行约化后所得到的 H I值在应用于高 GC含量、中 GC含量以及总共的外显子和内含子的识别时 ,其效果要优于原 H I值     

果蝇胚胎不同表达水平基因内含子序列特征的比较分析

对果蝇胚胎低表达和高表达水平基因内含子的序列结构进行分析,发现2种表达水平的基因内含子序列特征有明显差异.高表达基因的内含子一般比低表达基因的长,其中高表达基因第1内含子的平均长度是低表达基因的2.62倍,第2内含子的平均长度是低表达基因的1.79倍.两类基因第1内含子中的CpG岛含量最高,并且高表达基因内含子中CpG岛含量要高于低表达基因.此外,与低表达基因相比,TATA box、CAAT box和GC box在高表达基因内含子中出现的频数明显要高些,尤其是在第1内含子中.作者还提取出果蝇胚胎2种表达水平基因第1内含子中高频出现的6-mer简单重复序列,发现一些重复序列与实验得到的转录因子结合位点相符合.这些结果提示内含子特别是第1内含子有可能调控果蝇胚胎基因的转录从而影响基因的表达水平.     

从“三驾马车”的创作反观“现实主义冲击波”

“现实主义冲击波”是20世纪末出现的特有的一种文学现象，河北的“三驾马车”的作品是其杰出代表。他们的作品都客观真实地描绘社会现实、作家也亲身去体验和观察社会，并且在作品中塑造了一系列典型环境中的典型人物形象，充分显示了“现实主义冲击波”的现实精神。     

“学以致用”的三重境界

本文浅论在语文教学中依托新课标,以素质教育为目的,通过教学手段引导学生"学以致用"达到学习课本、超越课本、创造自我的三重境界。     

如何发挥煤矿“一通三防”作用

本文介绍如何建立建全通风制度、瓦斯制度、局部通风制度,杜绝和减少瓦斯爆炸事故发生。     

“三研究”、“三重视”提高高三化学复习课的有效性

如何使高三化学复习更趋合理且有效,本文结合福建近几年的高考,对通过"三研究、三重视"提高高三化学复习课的有效性进行探析。     

分析6000组人类DNA序列的碱基分布

分析了 6 0 0 0组人类DNA序列的碱基分布 ,根据DNA碱基的立方体和它的内接正四面体的对称性结构和三维塞尔宾斯基铺垫的一级结构补形的共同点 ,提出了人类DNA序列的碱基分布为边长是 6 4的正八面体 ,并且和Zhangetal.以前提出的半径为 1 4的球分布作了详细的比较 ,证明了本文的结论具有一定的合理性     

连续小波变换法分析核酸序列的长程相关性

提出了基于连续小波变换的检测核酸序列长程相关性的新方法。利用小波变换来观察序列，再用分数布朗运动建立数学模型，计算Hurst指数，并以此来衡量序列的长程相关性。最后发现在同一个基因内，外显子序列的Hurst指数明显小于内含子序列，此特征是这两种序列的显区别。     

基于隐马尔可夫模型的DNA序列识别

利用隐马尔可夫模型训练中不同结构的DNA序列的L值分布范围不同的特点,对传统多类投票模型进行改进,提出一种优于传统算法的快速训练算法,该算法只需训练出一类隐马尔可夫模型参数.对DNA内含子和外显子序列进行识别,平均识别率达到了90.8%.与支持向量机相比,隐马尔可夫模型在解决多分类问题方面具有优势,不但计算时间少,而且识别率高.     

猴附睾特异性表达基因LCN6第5号内含子的克隆及分析

用PCR法扩增了猴LCN6基因第5号内含子区的基因组DNA片断,并将该片断克隆到T-载体中,用Southern Blot的方法鉴定阳性克隆。经测序后与人LCN6基因的第5号内含子相比较,两者的同源性达到了87％。根据对已有小鼠,大鼠,猴及人LCN6基因第5号内含子DNA序列比较,可知在LCN6基因的进化中由于基因组DNA序列,特别是剪切位点的改变使得原本在小鼠中转录的一个转录子mLCN6β在大鼠、猴及人中不被转录。     

人cDNA序列中二类甲硫氨酸密码子的区分

在人类cDNA序列确定全长基因的过程中，必须判断第一个ATG密码子是真正的起始密码子还是框内的非起始作用的甲硫氨酸密码子，在总结了这二类密码子上下文共有序列特征，周期性，密码子的碱基偏向性，以及编码的氨基酸的疏水性等方面差异的基础上，从模式识别的角度出发，将这二类密码子视为由此构成的多维特征空间中的二个模式类，应用费歇线性判别法进行分类器的设计，并对分类器的错误率进行估计，表明在这些特征下，这二类密码子可以区分，以此分类器的判断真正的起始密码子和非起始甲硫氨酸密码子，其准确率可达75％。     

浅述服装形态的设计关系

本文主要研究服装外部造型、内部结构和物质形态的设计关系,从外部形态、内部形态和物质形态三方面的细部分别进行阐述,说明服装形态设计的基本设计内容,外部形态决定内部形态的风格,内部形态又制约外部形态,物质形态是实现前两者设计的载体。     

核酸非编码序列信息指标的进一步分析

从信息论角度入手,进一步对13类、约1200个核酸非编码序列进行研究。对信息指标作了长度修正,找到了一些非编码区的特殊结构。得到非编码区遵守与编码区一样的进化规律,非编码区进化水平低于编码区的结论。