DNA与其靶向分子相互作用研究进展

DNA与其靶向分子相互作用的研究不仅对阐述一些抗肿瘤、抗病毒药物及致癌物的作用机理,而且对进一步指导人工核酸酶的合成及DNA高级结构研究等方面的工作都具有重要意义.本文着重评述了近年来不同结构类型的DNA靶向分子与DNA相互作用研究方面的进展.     

尼古丁与DNA相互作用的电化学研究

用线性扫描伏安法、循环伏安法及光谱法研究了尼古丁与DNA在0.2 mol/LpH 6.0的H2C2O4缓冲溶液中的相互作用。研究结果显示,随着DNA的加入,尼古丁峰电流降低,峰电位正移,说明尼古丁是以嵌入形式与DNA结合,生成了一种结合比为2∶1的非电活性化合物,结合常数β为1.56×109。并用多种电化学方法求得了电极过程的动力学参数。     

有机小分子硫堇与DNA相互作用的研究

用光谱电化学和电化学技术研究了硫堇和硫堇与DNA相互作用的电化学和光谱电化学性质，得出了硫堇作为有机小分子能插入DNA双螺旋结构内部的结论，求得了对应的动力学参数。DNA的加入量与硫堇峰电流的降低呈一次线性关系，可望用于DNA浓度检测。     

烟酰胺与DNA相互作用的电化学研究

利用示差脉冲伏安法研究了烟酰胺(NA)与小牛胸腺DNA在pH 8.0条件下相互作用的电化学行为.双链DNA(dsDNA)或单链DNA(ssDNA)的存在导致NA的峰电流明显降低且峰电位负移,表明NA与DNA发生相互作用,生成了复合物,且其作用模式主要是静电模式,但NA与dsDNA的相互作用强于与ssDNA的相互作用,可用于识别dsDNA和ssDNA.通过dsDNA加入前后峰电流的变化,计算得出NA与dsDNA结合常数β=4.946×10(11),结合位点数m=3.此外,NA的峰电流Ip与DNA质量浓度在1～14mg/L的范围内呈线性关系,线性回归方程为Ip(10-5A)=-0.03451cDNA(mg/L)+1.7408,相关系数R为0.9998.该法具有良好的回收率和选择性,可用于样品中DNA的测定.     

咖啡酸与DNA相互作用的电化学研究

用电化学方法研究了咖啡酸与DNA的相互作用,考察了扫速对咖啡酸与DNA相互作用的影响。实验表明,DNA存在使咖啡酸氧化峰的电位正移,咖啡酸的氧化峰峰电流减小,咖啡酸在320 nm吸收光谱的吸收峰降低,呈减色效应,且出现两个等电吸收点,说明咖啡酸与DNA的相互作用以嵌插作用为主。双链DNA(dsDNA)与咖啡酸的结合能力大于单链DNA(ssDNA),结合比为1∶1,结合常数β为2.32×106。     

葛根素与DNA相互作用的光谱法研究

以中性红为光谱探针,采用荧光光谱和紫外-可见光谱法研究了葛根素与DNA的相互作用,考察了离子强度和I-离子浓度对葛根素与DNA作用的影响。结果表明,在生理条件下(pH 7.4),葛根素通过沟槽结合方式与DNA发生作用,DNA对葛根素荧光猝灭属于静态猝灭,测得其结合常数为4.81×104L/mol。     

金属离子与DNA相互作用的研究进展

对金属离子与DNA相互作用的研究进展进行了综述,讨论了不同金属离子与DNA碱基的作用位点以及不同金属离子与DNA相互作用的特点.     

DNA与目标分子相互作用的预测性研究

以量化的分子结构参数和实验结果为依据, 运用模式识别技术、多元线性回归和人工神经网络研究了目标分子与DNA相互作用的主要影响因素, 建立了准确性较高的2个键合常数预测模型和1个作用模式预测模型. 初次量化的分子结构参数有21种, 经过筛选发现其中的10种参数对相互作用有显著影响. 研究结果可为抗癌药物的分子设计和筛选提供有价值的信息.     

DNA与两性表面活性剂相互作用研究

本文综述了DNA与两性表面活性剂相互作用的研究进展,主要介绍了利用荧光显微镜、动静态光散射、相图及浊度等方法对DNA与两性表面活性剂相互作用的观察与形成复合物的表征。由于两性表面活性剂所具有的独特性质,可以实现在特定pH范围通过静电作用诱导DNA构象发生线圈状向小球状的不连续转变,并可通过调节溶液pH值、离子强度等实现对DNA-两性表面活性剂复合物的稳定性的调控。DNA与两性表面活性剂相互作用形成的复合物在非病毒基因载体研究方面具有潜在的应用价值。     

一种新型发光探针与DNA相互作用的研究

本文以稳态荧光光谱、紫外-可见吸收光谱、荧光偏振、热变性、阴离子猝灭等手段,研究了一种具有强电荷转移能力的化合物2,7-二[(N-乙基咔唑-3-基)丙烯-1-酮基]芴与DNA的相互作用。研究结果表明,2,7-二[(N-乙基咔唑-3-基)丙烯-1-酮基)芴与DNA的作用方式是混合模式,以嵌插作用为主,同时存在沟槽相互作用,其咔唑基团可能插入到DNA的碱基对之间,结合常数K为8 123.48mol/L,结合位点n为0.71。该发光探针灵敏度高,结合稳定。     

Studies on Interaction Between Gallocyanine and DNA

IntroductionConsiderable attention has been focused onnew DNA- binding and DNA- modifying agents fromnatural ones to wholly synthetic designs due totheir usage as probes of deciphering the structureand the function of nucleic acids and as potentialchemotherapeutic agents[1— 4] . The application ofthose molecules must be based on the preciseunderstanding of the structural details about thebinding of the agents with the target molecule,double- helical DNA. The interaction of smallmolecules …     

姜黄素与DNA相互作用的电化学性质

采用循环伏安法和差示脉冲伏安法,研究了姜黄素在DNA修饰玻碳电极上与DNA的相互作用.结果表明,姜黄素与DNA之间发生嵌插作用,形成了两种化合物DNA-2curcumin和DNA-curcumin,两者的表观结合常数分别为2.34×10^5L/mol和1.48 L/mol.     

青蒿素与DNA作用的电化学机理

在体积分数为20%乙醇的Britton-Robinson缓冲溶液(pH=7.4)中,利用循环伏安法和紫外可见吸收光谱法研究了青蒿素与DNA的相互作用。电化学研究表明,DNA的存在能导致青蒿素在银电极上-0.672 V处的还原峰电流下降,峰电位正移。通过对比双链DNA(dsDNA)和单链(ssDNA)与青蒿素作用,得出青蒿素可嵌插到DNA分子中,形成非电活性的复合物。电化学方法可计算出DNA与青蒿素的结合比为1∶4,结合常数为3.6×104。电极过程的电化学参数表明,DNA作用前后,α、β值变化不明显,进一步证实了该复合物是非电活性;Ks值变小,表明二者作用后受扩散控制。紫外可见吸收光谱法研究表明,青蒿素对DNA分子发生嵌插作用。通过光谱滴定法可计算二者的结合比和结合常数,同样获得1个DNA结合4个青蒿素分子,结合常数为4.0×104,与电化学方法测定结果相吻合。实验数据显示,青蒿素进入细胞内有可能与细胞核中DNA结合,诱导细胞凋亡。     

芦丁与DNA相互作用的电化学研究

研究了芦丁与 DNA在 p H 5.72条件下相互作用的电化学行为。 DNA的存在能导致芦丁氧化还原峰电流降低 ,峰电位基本不变。通过测定 DNA引入前后的一些电化学参数 ,推测芦丁与 DNA在该条件下结合生成了一种非电活性的超分子化合物。针对该类型体系 ,推导出了一系列的方程 ,求得该超分子化合物的组成为 1∶ 1 ,结合常数 β=2 .49× 1 0 5mol- 1·L。     

聚胺与dna相互作用的相图

利用相图方法研究了聚胺(PA)与DNA的相互作用,初步考察了NaCl对精胺与DNA相互作用的影响。研究结果表明,聚胺与DNA之间不仅存在着强烈的静电作用,同时聚胺与DNA碱基对之间也存在着相互作用。在较低的精胺(SPM)浓度(0.025mmol/L)时就开始出现浊度,而在相同的条件下,亚精胺(SPD)-DNA体系和盐酸胍(GD)-DNA体系在聚胺浓度高达10mmol/L时浊度曲线仍无明显变化;SPD-DNA体系与GD-DNA体系的A260曲线相比,前者随着聚胺浓度的增加吸光度逐渐下降,说明SPD与DNA作用强于GD;由此可见聚胺所带正电荷越多,其与DNA的作用越强,水溶液条件下亚精胺(SPD)和GD与DNA间有较弱的相互作用,但不能使DNA产生相分离;加入NaCl后,由于外加电解质的静电屏蔽效应,SPM与DNA之间的相互作用减弱。NaCl浓度越大,二者之间相互作用越弱,SPM-DNA体系相图曲线的线性相关性越低。     

DNA与苯胺红T的相互作用与荧光定量检测

荧光染料作为分子探针用于核酸的定量测定和构象分析一直备受关注 [1] .已有数十种荧光染料被应用[2 ,3 ] ,如溴化乙锭早期常用作 DNA探针[4 ,5] ,因其有很强的致癌性 ,目前已很少采用 ,而那些无毒性或含有可被衍生的活性基团的探针分子越来越受到青睐 [6～ 8] .苯胺红 T(ST)是一种阳离子型荧光染料 ,它既可很容易地与 DNA双螺旋结构发生插入作用 ,又可由带正电的吩嗪环与 DNA上带负电的磷酸基发生强烈的静电吸附作用 ,还可利用其氨基与 DNA或其它生物分子进行交联 .He等 [9] 曾研究了它与小牛胸腺 DNA之间的作用 ,得到的结合位点数…     

对-二甲胺基亚苄罗丹宁与植物DNA的显色反应研究

在pH 9.5的NH3-NH4Cl缓冲溶液中,对-二甲胺基亚苄罗丹宁(p-DBR)与DNA形成橙色复合物,λmax为480 nm,表观摩尔吸光系数为1.32×107L.mol-1.cm-1。当无CTMAB存在时,DNA对p-DBR的最大结合数N为34,有CTMAB存在时N为204。DNA与p-DBR的作用符合Scatchard模式。利用DNA-p-DBR复合物可测定植物DNA提取液中DNA的含量。方法线性范围为1.25~7.50 mg/L,相对标准偏差(RSD)为2.9%。     

含芘荧光化学敏感器化合物同小牛胸腺DNA分子间的相互作用

研究了含芘荧光化学敏感器分子被ctDNA猝灭的荧光光谱.ctDNA分子对该化学敏感器中芘的激发单体,激基缔合物都有猝灭作用.对激发单体的猝灭速度顺序为;化合物(2)>化合物(1)>芘丁酸>化合物(3);对激基缔合物的猝灭速度顺序为;化合物(2)化合物(3).由得到的荧光猝灭数据,可按公式(2)求得荧光化学敏感器分子与ctDNA分子相互作用的稳定常数.发现化合物(2)与ctDNA分子间有着最强的相互作用能力.按ctDNA和含芘荧光化学敏感器的分子结构、构型以及分子内原子-原子的间距等提出了ctDNA分子与该荧光化学敏感器的作用模型,并对上述结果进行了初步解释.     

维生素B12与DNA相互作用的电化学研究

维生素B12与DNA相互作用的电化学研究;维生素B12; DNA; 循环伏安法; 紫外可见吸收光谱法