本征值方法在抗氧化剂定量构效关系研究中的应用

Antioxidants are of great interest because of their involvement in many important biological and industrial processes. It is meaningful to study their structure-antioxidant activity relationship (SAAR) and design novel, efficient and low-toxicity antioxidant. In this paper, Eigen Value Analysis (EVA), a 3-dimensional quantitative structure activity relationship (3-D QSAR) method, was employed to study antioxidant SAAR. Significant relational models were obtained with all the PLS cross-validate qcv^2 values being larger than 0.5, meaning that the models have sound predictive power. Compared with other QSAR methods, EVA possesses several advantages, especially that it does not need alignment. It should be believed that EVA will be an efficient approach to SAAR.     

三维定量结构-活性关系研究的近况

本文介绍并综述了以CoMFA, APEX-3D, Ludi和Leapfrog为代表的三维定量结构一活性关系研究方法的近况。作为药物分子设计的新方法，它们在新药设计和先导化合物的产生中起着越来越重要的作版。     

三维定量结构-活性关系研究的近况*

本文介绍并综述了以CoMFA, APEX-3D, Ludi和Leapfrog为代表的三维定量结构一活性关系研究方法的近况。作为药物分子设计的新方法,它们在新药设计和先导化合物的产生中起着越来越重要的作版。     

定量结构-性质/活性关系在分析和环境化学中的进展及应用

定量结构-性质/活性关系(QSPR/QSAR)是目前国际上一个比较活跃的研究领域.该方法将理论计算方法和各种统计分析工具相结合,研究系列化合物的结构与其生物活性和各种物理化学性质之间的定量函数关系.QSPR/QSAR不仅可以建立预测化合物的各种理化性质以及生物活性的理论模型,而且可以发现和确定对化合物的各种性质起决定作...     

“性质-活性关系”对催化剂研究的方法论意义

"结构-活性关系(SAR)"被普遍看作是催化剂研究的核心问题,但本文强调"性质-活性关系(PAR)"对催化剂研究的方法论意义.此处"性质"指反映催化剂与反应物或中间物相互作用行为的一个参数(例如对中间物的吸附能)或参数组,它是催化剂结构与活性之间的桥梁.因性质与活性之间的联系较结构与活性之间的联系更直接,PAR应比SAR较简单和易得,故PAR更具可行性.一旦通过建立PAR而确定了催化剂的关键性质,就可进而探索此关键性质与结构的关系,即"结构-性质关系(SPR)".作者通过举例说明,PAR与SPR相结合不仅相当于SAR,而且比单独的SAR更能深入理解催化剂本质,并提供更多信息.     

芳胺结构致癌活性关系的双区理论定量阐释

本文将双区理论定量地推广到63种芳胺的定量结构致癌活性关系上,借氨基亚氮阳离子与环上环氧化物的双官能烷化作用的观点,建立了芳胺结构与致癌性能间的定量关系式,计算与实验的一致达98％。从而将芳胺类难以捉摸的致癌性能变化,表达为可以理解的结构化学活性关系。     

黄酮类化合物抑制MMP-9的定量结构-活性关系和结构修饰的理论研究

运用密度泛函理论(DFT)和线性回归分析等方法研究了黄酮类化合物抑制MMP-9的定量结构-活性关系(QSAR)和结构修饰. 研究发现, 黄酮类化合物抑制MMP-9的实验生物活性数据－lg EC₅₀值与计算获得的黄酮类化合物的最低空分子轨道能量及分子水合能之间均存在着良好的线性关系|留一法交叉验证结果表明, 所建立的两个相应的QSAR模型都具有良好的稳定性和预测能力. 进一步研究发现, 在黄酮类化合物分子的A环、B环和C环上的合适部位选用供电子能力较强、能降低分子水合能的取代基团对其进行结构修饰, 有利于提高修饰后的分子抑制MMP-9的生物活性. 根据对木犀草素(Luteolin)分子进行结构修饰的结果(共33种化合物), 我们提出了黄酮类化合物抑制MMP-9可能的作用机理, 并设计出8种经结构修饰后生物活性有显著提高的MMP-9抑制剂, 希望将来得到实验的证实.     

氟诺喹酮类药物分子抗肺炎克雷伯氏菌的结构活性关系研究

The structure-activity relationship of °uoroquinolones, which show anti-K. pneumoniae activity, was studied by using principal component analysis (PCA) and hierarchical cluster analysis (HCA). The PCA results showed that the lowest unoccupied molecular orbital energy, energy difference between the highest occupied and the lowest unoccupied molecular orbital, dipole moment, net atomic charge on atom I, molecular polarizability, partition coe±cient and molecular refractivity of these compounds are responsible for the separation between high-activity and low-activity groups. The HCA results were similar to those obtained with PCA. By using the chemometric results, four synthetic compounds were analyzed through PCA and HCA, and three of them are proposed as active molecules against K. pneumoniae which is consistent with the results of clinical experiments. The methodologies of PCA and HCA provide a reliable rule for classifying new °uoroquinolones with anti-K. pneumoniae activity.     

生物-光度法检测抗氧化剂抗氧化活性

建立了一种测定抗氧化剂抗氧化活性的方法,简称为生物-光度法。考察了吸收光谱、细胞液体积、抗氧化剂和自由基产生体系(混合液)与细胞作用的时间、MTT(四甲基偶氮唑盐)与细胞作用时间等因子对测定结果的影响。实验确定的参数为:2×105mL-1的细胞液100μL、混合液与细胞作用时间15 min,20μL 5 mg/mL MTT与细胞作用时间4 h,测定波长为572 nm。并用该方法测定了葡萄籽提取物等的抗氧化活性。     

强镇痛活性生物碱Epibatidine及其类似物的构效关系研究

强镇痛活性生物碱Ｅｐｉｂａｔｉｄｉｎｅ及其类似物的构效关系研究徐建平，何东，王志中，沈家骢，高连勋，宋雅茹（吉林大学化学系理论化学研究所，长春，１３００２３）（中国科学院长春应用化学研究所）（北京师范大学化学系）关键词Ｅｐｉｂａｔｉｄｉｎｅ，ＡＭ１，...     

肉桂酸类抗氧化剂结构—活性关系研究

利用邻菲罗啉化学发光法研究了中草药有效成分氯原酸、连翘酯甙等肉桂酸类抗氧化剂对HO·的清除作用。量子化学计算[3-21G、B3LYP/6-31G(d)]对实验结果给予了合理的解释。 计算结果显示抗氧化剂形成半醌式自由基前后的能量之差(ΔE)能较好地衡量其活性的高低;抗氧化剂半醌式自由基与邻位取代基形成分子内氢键或通过共振形成邻苯醌可使内能降低,半醌式自由基更稳定;脱氢酚羟基的对位含有给电子取代基团时,可使半醌式自由基易形成并提高其稳定性。     

1-取代-2-氨基苯并咪唑衍生物的理论计算及QSAR研究

在B3LYP/6-31＋g(d)计算水平下, 通过运用密度泛函理论(DFT)量子化学方法, 对7种1-取代-2-氨基苯并咪唑衍生物的电子结构特征进行了研究, 获得了它们的电离能、亲合能、化学硬度、化学软度、化学势、电负性、亲电性、分配系数、折射率、极化率、分子体积和分子表面积等参数. 结果表明, 在2-氨基苯并咪唑衍生物的1位引入取代基团, 对化合物的电荷布居和结构性质都有较大的影响|关联了定量结构-活性关系(QSAR), 7种化合物的半数致死量LD₅₀与极化率等有较好的相关性. 这些结果可为1-取代-2-氨基苯并咪唑衍生物的氧化代谢实验研究和毒性机理揭示等提供重要信息.     

光学活性甲苄菊酯的合成及其结构与活性关系的研究

本文改进了Goffinet方法,完成了(±)-trans菊酸的拆分;改进了Campbel?方法,只用一种拆分剂(奎宁)完成了对(±)-cis菊酸的拆分。用IR、~1HNMR、旋光度测定等方法确定了各甲苄菊酯光学异构体的结构。生物试验表明结构与活性有如下关系:1,各异构体中以1R-酯的杀虫活性为高,尤其(-)-(1R,3R)-trans甲苄菊酯对全部测试昆虫均显示较高的杀虫活性;2,昆虫不同,各异构体的活性次序也略有差异。     

多氯联苯的定量结构－性质(活性)关系

多氯联苯(PCBs)是一类重要的持久性环境污染物.首先对所有209个PCB分子进行了HF/6-31G*水平上的结构优化, 在优化结构上获得了分子的表面静电势分布, 并在此基础上对其统计导出的参数进行了计算．其后, 运用多元线性回归方法对PCBs的水溶性、正辛醇/水分配系数、正辛醇/空气分配系数、土壤吸附性、水溶液活度系数、298 K超冷流体蒸汽压、总分子表面积、色谱保留指数、升华焓、蒸发焓、熔融焓、PCB结合芳烃受体活性数据、生物降解度以及生物降解速率参数等理化性质和生物活性与分子的结构参数进行了关联．结果表明:分子静电势参数结合分子表面积和常规的量子化学参数可以很好地用于表达多氯联苯分子理化性质和生物活性与其分子结构间的定量关系．     

黄酮类化合物结构修饰及抗肿瘤活性研究进展

我国天然药物和中药资源丰富,种类繁多,可作为先导化合物进行修饰以提高可成药性。其中,黄酮类化合物是自然界中一种常见的天然多酚类化合物,在抗肿瘤方面具有其独特的生物活性;对其进行结构修饰与改造,可提高黄酮类化合物的生物利用度和抗肿瘤活性。本文通过查阅并整理近几年国内外的黄酮类化合物的相关文献,对黄酮类化合物的母核位点进行结构修饰与改造所得的101个黄酮类衍生物及其抗肿瘤活性及作用机制进行综述,同时讨论了构效关系,以期为黄酮类衍生物的结构修饰和抗肿瘤研究提供参考和帮助。     

3-溴咔唑-9-乙酸晶体中的分叉型氢键及其理论分析

用半经验量子化学AM1方法分析了化合物3-溴咔唑-9-乙酸的分子构象.结果表明,化合物3-溴咔唑-9-乙酸晶体存在分子间非对称分叉型氢键;该非对称分叉型氢键支配化合物的堆积结构.与此同时,同咔唑环氮原子相连的羧甲基易在一定范围内摆动,分叉型氢键是晶体状态下和真空中羧甲基位置变化的原因之一;非对称分叉型氢键使分子体系得到4.97kJ/mol的额外稳定作用能.     

车前草中黄酮类成分结构和性质的理论研究

采用密度泛函理论中ωB97XD/6-311+G(2d,p)方法对车前草中的黄酮类化合物进行量化计算研究, 探讨了该类化合物的构效关系. 首先研究了13种车前草中提取的黄酮类化合物(1~13)和已成药的二氢杨梅素(14)的几何结构、 谱学性质及电子结构, 再运用概念密度泛函理论进行反应指数分析, 最后利用药代动力学平台开展了成药性评价. 根据几何结构的分析结果初步推测14种黄酮类化合物的抗氧化能力强弱顺序为10>12≈ 7>13>6>4>14≈9≈8>11>5>3≈2>1. 核磁共振拟合结果表明, 利用该方法得到的核磁位移理论值与实验值吻合度较高(R²>0.95). 分子表面静电势图显示, 14种黄酮类化合物的静电势的极小值点都位于羰基氧附近, 极大值点都位于羟基氢附近, 且B环上对位羟基的极大值>C环和A环羟基极大值. 全局反应性描述符结果显示, 化合物1, 2, 4, 11和12的化学势较低, 电负性、 亲电指数和硬度较高, 说明这5种化合物的稳定性和反应性较好. 通过局部反应性描述符进一步预测了14种黄酮类化合物的亲核/亲电反应位点. 药代动力学结果显示, 化合物1, 3, 4, 6, 12和13的成药性和药代动力学活性较好. 研究结果表明, 化合物4和12最有成药潜力, 可进行更深入的实验研究.     

黄酮类化合物抗氧化活性的构效关系研究

自由基具有强烈的氧化能力,研究寻找自由基清除剂越来越引起人们的重视。本文对已有实验报道的10种黄酮的结构进行了几何优化,并进行了电子结构计算,以实验测定的黄酮类化合物清除对苯半醌自由基能力的高低,即清除率数据为因变量,以量化计算得到的电子结构指数为自变量,用相关分析和逐步回归方法加以讨论,从理论上对实验结果进行了较为圆满的解释,并得出了较为合理的定量构效关系(QSAR)方程,为设计高活性抗氧化性黄酮类化合物提供了理论参考。