离子液体的定量结构-性质/活性研究

本文系统介绍了离子液体定量结构-性质/活性相关(QSPR/QSAR)的研究方法和步骤,综述了QSPR/QSAR在离子液体的熔点、有机物在离子液体中的无限稀释活度系数、离子液体的表面张力、离子液体的电导率、有机物在离子液体中的溶解度、离子液体的黏度以及离子液体的生物毒性和降解性等方面的最新研究进展,总结了该方法的优缺点,并对未来的研究趋势进行了展望。     

基于雌激素β受体结构雌激素类化合物的三维定量结构-活性关系与分子对接研究

雌激素类化合物由于其对人和野生动物健康的负面影响而受到广泛关注.雌激素受体存在α和β两种亚型,由于雌激素β受体（ERβ）与α受体（ERα）两者结合腔中的氨基酸序列存在明显差异,因此配体化合物在与雌激素β受体和α受体的结合活性和模式上也可能存在较大差别.本文以50个与雌激素β受体结合的化合物为研究对象,应用比较分子相似性指数分析（COMSIA）的三维定量结构-活性关系（3D-QSAR）分析方法研究化合物结构与活性之间的关系,比较了原子契合和基于受体结构两种分子叠合方式对模型质量的影响,建立了相关性显著、预测能力强的定量活性预测模型（R^2=0.961,qLOO^2=0.671,R^2Pred=0.722）,并结合分子对接方法揭示了影响化合物活性的分子结构特征和分子机理.     

三维定量结构-活性关系研究中的受体作用位点模型方法

综述了三维定量构效关系研究的最新进展以及受体作用位点模型方法在3D2Q SAR 中的应用。重点介绍了Compass、GERM 和RSM 3 种新的建立受体作用位点模型的算法, 这些方法对于受体的三维结构未知情况下的Q SAR 研究提供了新的思路。     

GABA受体抑制剂的柔性原子受体模型研究

利用Flarm软件为GABA受体抑制剂建立了其抑制家蝇和大鼠GABA受体的柔性原子受体模型， 很好地模拟了两种受体与药物分子结合的情况，具有较好的预测能力，预测集的预测值与实验值的相关系数（r2）分别达到0.923和0.733，模型的结果与药效团模型有很大的一致性，为揭示药物与两种受体作用的区别提供了依据.     

离子液体的QSPR/QSAR研究

离子液体以其独特的性质广受关注,人们对其潜在的应用价值做了大量的研究,但对离子液体特性和结构与性质/活性相关的研究却很少。本文综述了离子液体定量结构-性质/活性相关(QSPR/QSAR)研究的最新进展,重点介绍了QSPR/QSAR的基本原理和离子液体的熔点、有机化合物在离子液体中的无限稀释活度系数、离子液体的界面张力、有机物在离子液体中的溶解系数和分配系数、离子液体的电导率和黏度以及离子液体的毒性等性质与分子结构的定量关系,并对离子液体分子结构与性质/活性的定量相关研究的发展趋势进行了展望。     

黄酮类化合物抗氧化活性的构效关系研究

自由基具有强烈的氧化能力,研究寻找自由基清除剂越来越引起人们的重视。本文对已有实验报道的10种黄酮的结构进行了几何优化,并进行了电子结构计算,以实验测定的黄酮类化合物清除对苯半醌自由基能力的高低,即清除率数据为因变量,以量化计算得到的电子结构指数为自变量,用相关分析和逐步回归方法加以讨论,从理论上对实验结果进行了较为圆满的解释,并得出了较为合理的定量构效关系(QSAR)方程,为设计高活性抗氧化性黄酮类化合物提供了理论参考。     

启发式方法研究有机化合物在全二维气相色谱中的定量结构-保留关系

采用半经验量子化学PM3的方法计算出130个有机化合物的描述符,用启发式方法分别对化合物在全二维气相色谱的3支色谱柱上的保留值建立了相应的定量结构-保留相关模型,并对模型进行了检验。所建模型呈现较好的线性,相关系数的平方(R2)均大于0.88,标准偏差（S）均小于0.105,留一法交互检验的相关系数的平方(R2cv)与所建模型的R2相当,说明模型具有良好的稳定性。化合物的预测结果显示所建模型有较准确的预测能力。     

环境内分泌干扰物的定量结构-活性相关研究

环境内分泌干扰物(简称为EDCs)由于能够干扰人类和野生动物内分泌系统的正常功能,对人类和野生动物种群的生存和持续繁衍造成严重威胁,而成为国际研究热点.鉴于人工合成化学品种类繁多、结构复杂,发展定量结构.活性相关的快速筛选方法,对环境中污染物进行筛选和评价,具有重要的实际意义.本文综述了环境内分泌干扰物的定量结构一活性相关最新研究进展,尤其是针对雌激素的研究,并对不同的方法作了一些比较,最后展望了其发展方向及其在我国的应用前景.     

应用量化参数和拓扑指数研究吡喃酮类化合物结构与活性的相关性

QSAR;量子化学参数;应用量化参数和拓扑指数研究吡喃酮类化合物结构与活性的相关性     

基于LASSO算法的光谱变量选择方法研究

光谱分析技术由于具有简单、快速、无损等优势,在复杂体系的定性和定量分析中得到了广泛应用。然而光谱中往往包含成百上千的波长点,有些波长点与研究的目标性质并不相关,加大了计算量并降低了模型的预测准确度。因此,在建立模型前需要进行变量选择。最小绝对收缩与选择算子（LASSO）可将回归系数收缩为0,进而达到变量选择的目的。该研究将LASSO用于三元调和油样品近红外光谱和生物样品拉曼光谱的变量选择,基于偏最小二乘（PLS）和多元线性回归（MLR）模型,分别对香油和肌氨酸的含量进行定量分析,并与无信息变量消除－PLS（UVE－PLS）、蒙特卡罗结合UVE－PLS（MCUVE－PLS）和随机检验－PLS（RT－PLS）3种变量选择方法进行比较。结果表明,基于LASSO的变量选择方法保留的变量数最少,运算速度最快。对三元调和油样品,LASSO－PLS预测的准确度最高;对生物样品,LASSO－MLR预测的准确度最高。因此,基于LASSO的变量选择算法有望在光谱分析领域中得到良好应用。     

蛋白质的电子结构与活性关系——理论与计算方法

随着生物工程的发展,要求对蛋白质的电子结构与活性关系进行研究。而不加分割地对蛋白质作完整分子的量子化学计算,至今尚未见报导。其原因在于,未能找到合适的数值计算方法。本文报导了这方面的研究成果。假设一个蛋白质由N个氨基酸残基构成,其中有L对硫-硫键,每一个氨基酸残基有m_n个单元轨道,则整个蛋白质分子的分子轨道可以写成这些单元轨道的线性组合:     

一种基于虚拟受体模型的定量构效关系研究方法

提出了一种可用于定量构效关系研究的ＰＡＲＭ算法，算法中定义了一套虚拟受体原子，并利用遗传算法构造了一系列虚拟受体模型，这些模型具有高的受体－配体相互作用能和生物活性间的相关性，并能预报未知分子的生物活性。应用此算法对钾离子通道开放剂体系进行了ＱＳＡＲ研究，获得了较好的结果。     

桂皮酰胺类化合物分子形状与抗惊活性定量构效关系的研究

采用分子形状分析法研究了26个桂皮酰胺类化合物的结构与抗惊活性的定量关系。相关方程表明抗惊活性与化合物的脂水分配系数(log P)及重叠的表面积(S_0)呈抛物线关系,与酰胺基团的 C—O 键长和 C—N 键长的乘积(代表酰胺基团的面积)呈线性关系。     

7-羟基异黄酮及其衍生物的合成与选择性雌激素受体结合的构效关系研究

以多酚类化合物和多取代苯乙酸类化合物为原料,用一锅法合成了24个7-羟基异黄酮类化合物;并从一锅法制得的3d,3g经脱除甲基得到两个2'-羟基取代的异黄酮化合物4a和4b.雌激素受体(Estrogen receptors,ERs)的选择性结合活性试验表明:26个化合物(包括4个新化合物3r,3s,3u和3v)中,9个化合物与ERβ相对于ERα的选择性作用强于染料木素(Genistein);发现7,8-二羟基异黄酮类化合物与ERβ相对结合能力高于相应7-羟基异黄酮类化合物;4'取代基对化合物与ERβ结合相对于ERα的选择性影响从大到小为:H>Cl>F>OH;2',3'及5'位取代基降低异黄酮对ERα和ERβ的亲和性.     

家蝇与大鼠GABA受体抑制剂的药效团模型及其3D-QSAR研究

采用DISCOtech方法,用7个大鼠γ-氨基丁酸(GABA)A受体抑制剂和11个家蝇GABAA受体抑制剂分别建立了其药效团模型;用CoMFA方法建立了22个大鼠GABAA受体抑制剂和29个家蝇GABAA受体抑制剂的3D-QSAR模型,模型的交叉验证相关系数分别为0.526和0.679,验证了药效团模型的合理性,为设计更高活性和更高选择性的化合物提供了参考     

1,4,2-二氮磷杂环戊-5-(硫)酮类化合物除草活性的构效关系研究

利用与自由能有关的取代基的物理化学参数,考察了1,4,2－二氮磷杂环戊－5－(硫)酮类化合物对除草活性的相关性.根据Hansch方程及多元回归分析,进行了结构与活性定量关系的研究,建立了较好的结构与活性相关式,预测出化合物的活性并得到实验证实.     

多氯萘的气相色谱保留指数与其结构参数的定量关系

在B3LYP/6-31G*水平上计算了76个多氯萘分子,将计算得到的结构参数和热力学参数作为理论描述符引入到与气相色谱保留指数(RI)相关的多元回归分析中,建立了拟合度高、物理意义明确、预测能力强的保留时间-结构参数的相关方程(模型Ⅰ)(r2=0.9957);再以氯原子的取代个数和相互位置作为理论描述符,得出另一模型(模型Ⅱ)(r2=0.9967)。找出了影响多氯萘保留时间的主要因素。     

3-取代硫基-5-(2-羟基苯基)-4H-1,2,4-三唑类化合物抑菌活性的定量构效关系和结构修饰的理论研究

用DFT-B3LYP 方法, 在基组6-31G 水平, 对24 种3-取代硫基-5-(2-羟基苯基)-4H-1,2,4-三唑类化合物分子进行几何优化, 并计算了E_HOMO, E_LUMO, E_NHOMO, E_NLUMO, Q_C1～Q_C8, Q_N1～Q_N3, Q_O, Q_S和ΔE₁, ΔE₂, ΣQ 等量子化学描述符(q_c). 通过最佳变量子集回归建立13 种上述化合物对大肠杆菌、白色念珠菌、金黄色葡萄球菌等抑菌活性(A_J: A_e, A_m 和A_s) 的QSAR 模型. 对于大肠杆菌的A_e 模型的相关系数(R²)和逐一剔除法交叉验证系数R_cv² 依次为0.930 和0.871, 相应白色念珠菌A_m 模型为0.926 和0.869, A_s 模型为0.781 和0.572. 通过R_adj², F, R_cv², VIF, AIC, FIT 等检验, 上述模型具有令人满意的稳健性和预测能力. 结果显示ΔE₁ 和ΣQ 直接影响这些化合物的生物活性: ΣQ 增大, 其抑菌活性增强; ΔE₁ 越高, A_J 下降. 据此提出三唑类化合物分子可能的抑菌机理. 由此发现, 在三唑类化合物分子的R 中合适部位选用吸电子能力较强的取代基团进行结构修饰, 有利于提高被修饰后分子的抑菌活性. 根据对R 进行结构修饰(共提出11 种化合物), 得出4 种抑菌活性均超出100%的三唑类化合物(质量分数为0.01%), 希望将来得到生物实验的证实.     

含天然苯乙烯结构的4-甲基-1,2,4-三唑-硫醚化合物的合成、除草活性及三维定量构效关系(3D-QSAR)研究

为了寻找以天然可再生资源为基础的除草剂,设计并合成了 26个新型含天然苯乙烯结构的4-甲基-1,2,4-三唑-硫醚类化合物,并通过FTIR,1H NMR,13C NMR,ESI-MS和元素分析等方法对其结构进行了确认.初步的除草活性测试表明,在质量浓度为100μg/mL时,大多数目标化合物对油菜胚根生长表现出良好的抑制...     

正相薄层色谱中常见人参皂甙结构与保留值之间关系的初步研究(英文)

 在硅胶薄层板上用氯仿-乙酸乙酯-甲醇-水(体积比为15∶40∶22∶10)作展开剂,测定了常见人参皂甙的Rf值。为了研究它们的结构与保留值之间的关系,对它们的17种结构参数进行了计算。除了拓扑指数和理化参数外,引入了代表构成人参皂甙的母体化合物种类并反映它们分子极性特征的新参数“E”。通过相关分析优化选出范德华分子表面积AW、拓扑指数0B和参数E,建立了多参数线性回归方程,较好地描述了在正相薄层色谱中常见人参皂甙结构与保留值之间的关系,并与人工神经网络方法进行了比较。