拟南芥翻译延伸因子EF1A的亚细胞定位研究

探讨了拟南芥的翻译延伸因子EF1A的亚细胞定位.以Col野生型拟南芥的cDNA为模板,通过高保真KOD扩增酶获得2 363bp的拟南芥转录延伸因子EF1A基因片段,将其与GFP融合后共同连入p1300表达载体,利用农杆菌侵染法将p35S∶GFP和p35S∶EF1A∶∶GFP转入野生型拟南芥中,观察转基因植物细胞中GFP的表达情况.结果显示:p35S∶GFP转基因植物中,细胞核中GFP荧光强度显著高于细胞质中荧光强度,但是在p35S∶EF1A∶∶GFP转基因植物中,细胞核中荧光强度与细胞质中荧光强度无显著差异,说明在进行蛋白翻译时细胞质中的EF1A含量显著高于细胞核中,这也为翻译延伸因子EF1A的亚细胞定位提供了实验依据.     

δEF1与雌激素受体-α和他莫昔芬耐药关系的研究

乳腺癌是常见的女性恶性肿瘤,抗雌激素耐药是成功治疗的一大障碍,雌激素受体(ER)-α的减少或消失是产生抗药性的首要机制.δ晶体蛋白增强因子1(δ-crystallin enhancer factor1,δEF1)是锌指同源结构域转录因子家族中的一员,在乳腺癌等诸多肿瘤中均证实有δEF1的异常表达.采用RT-PCR、Western blotting和细胞免疫荧光技术,分析了在δ晶体蛋白增强因子1(δEF1)功能缺失情况下雌激素受体阳性乳腺癌细胞中雌激素受体(ER)-α表达的变化及组蛋白乙酰化对ER-α的影响.同时采用细胞活力实验证实δEF1通过调控ER-α的表达影响乳腺癌细胞对抗雌激素药物他莫西芬(tamoxifen,TAM)的敏感性.结果表明:δEF1被抑制后,乳腺癌细胞中ER-α的表达水平明显升高(p0.01),细胞对他莫西芬(TAM)的反应增强,存活率降低(p0.01);而组蛋白乙酰化可以显著恢复细胞中ER-α的表达(p0.01).     

木茼蒿SOC1同源基因的克隆及表达分析

SOC1基因是整合各种成花途径信号,启动植物成花转变的关键基因之一.以木茼蒿为材料,利用RT-PCR技术,克隆了木茼蒿SOC1同源基因AfSOC1;利用qRT PCR技术,对其时空表达模式进行了分析.结果表明:木茼蒿AfSOC1 cDNA长为648 bp,编码216个氨基酸,与拟南芥SOC1和金鱼草DEFH68的同源性...     

用基因芯片的方法对人酪蛋白激酶CK1γ1基因进行表达谱和聚类分析

将人酪蛋白激酶基因CK1γ1的cDNA与4096个胎脑cDNA一起点在玻璃介质的基因芯片上,用16种不同组织或细胞系的mRNA分别杂交该基因芯片,以正常人混合组织mRNA作共同对照,检测CK1γ1基因的表达谱变化,结果显示人CK1γ1基因在15种组织表达没有变化,但在肝癌组织中的表达却显著下调.采集的7例肝癌标本的cDNA与正常肝组织的cDNA重复7次芯片杂交,结果肯定了CK1γ1基因在肝癌组织中表达下调.同时,对芯片杂交结果通过聚类分析,按基因表达谱特征将CK1γ1基因与其他7种基因聚类在一起,提示CK1γ1基因可能在生物学作用方面与这7种基因有某种相关性.     

敲低EEF1A2增强拉帕替尼对HER2+乳腺癌细胞的药效

探究乳腺癌中翻译延伸因子1α2(EEF1A2)与HER2之间的潜在关系。通过TCGA(TheCancerGenomeAtlas)分析EEF1A2mRNA在乳腺癌中的表达情况;利用MTT（噻唑蓝）、克隆形成和Transwell实验方法检测了HER2+乳腺癌细胞SKBR3和MDA-MB-453在EEF1A2蛋白表达敲低及拉帕替尼处理后的增殖、迁移和凋亡情况。结果表明EEF1A2 mRNA在HER2+乳腺癌组织中高表达,并降低了HER2+乳腺癌患者的总生存率;同时,SKBR3和MDA-MB-453细胞中EEF1A2敲低会增强拉帕替尼对细胞体外增殖、迁移和侵袭的抑制,以及对凋亡的促进。Western blot实验结果表明,下调EEF1A2会增强拉帕替尼对HER2+乳腺癌细胞中HER2/AKT通路的抑制。EEF1A2蛋白可成为改善拉帕替尼治疗HER2+乳腺癌效果的潜在靶标。     

NAP1基因和ARHP基因启动子区的生物信息学分析

采用进化足迹法,利用生物信息学在线软件,分析了鼻咽癌相关肽基因NAP1和成人视网膜假定蛋白基因ARHP的启动子结构,在人和小鼠NAP1基因的启动子保守区内预测出38个共同的转录因子结合部位,在人和小鼠ARHP基因的启动子保守区内预测出44个共同的转录因子结合部位,分析结果为NAP1基因和ARHP基因调控区的分析与鉴定,基因表达调控机制的研究提供了重要的参考.     

人翻译延伸因子eEF1A1促进肺癌细胞H1299对紫杉醇和阿霉素药物耐受的研究

在已知人翻译延伸因子eEF1A的多功能性和与细胞存活相关的基础上,本文进一步研究eEF1A的变体蛋白eEF1A1对癌细胞耐药性的影响.eEF1A1基因的蛋白质编码区经过克隆,并瞬时转染了人肺癌细胞H1299,在确定eEF1A1蛋白的胞内表达后,采用MTT法测定高表达eEF1A1的H1299细胞对抗癌药物紫杉醇和阿霉素的耐受.相对于对照细胞,eEF1A1的高表达可显著提高H1299细胞对阿霉素和紫杉醇的耐受性.通过耐药性测试揭示出eEF1A可能参与肿瘤发生的潜在功能.     

拟南芥逆境胁迫诱导转录因子DREB1A基因的克隆和序列分析

以拟南芥基因组DNA为模板,通过PCR扩增得到逆境胁迫诱导转录因子DREB1A基因,将其克隆到pUC19质粒中.序列分析表明获得的基因序列与已报道的该基因的序列完全相同.     

Rab结合蛋白RanBP1的同源基因M3的克隆与功能分析

以Ran结合蛋白RanBP1的保守区域作为探针,低严谨条件下杂交筛选人视网膜cDNA文库,得到阳性克隆M3,它与鼠zhx-1基因高度同源.RH作图将其定位于8q24.11～q24.3.拼接EST序列并填补缺口,得到M3 cDNA全长4 934 bp,与Northern blot得到的主要转录本长度一致.此cDNA全序列包括2 622 bp开放阅读框,编码873氨基酸,含有2种翻译调控元件uUAG和TTATTTAT.该基因预测蛋白含有2个锌指结构,5个同源盒保守区,1个双侧核定位序列(NLS)及35个磷酸化位点,表明它既可能作为转录调控因子,也可能受到上游因子的调控.     

一种基于L1-TV模型的图像修复算法

提出一种基于L1-TV模型的图像修复方法。在正则化框架下采用L1范数度量逼近项,增加了模型修复图像破损部分的能力。利用"变量分裂"思想和半二次光滑化技术,克服L1-TV模型的算法求解困难,使得新模型的解易于求出。与两个已有算法的对比实验结果表明,该算法在获得较高的修复效果的同时,可以显著地降低运算时间。     

基于ITS序列的竹亚科植物分子鉴定研究

利用ITS序列对竹亚科13个属76个竹种进行DNA条形码分子鉴定.该研究提取慈竹属、刚竹属、箬竹属、唐竹属、矢竹属、大明竹属、赤竹属、巴山木竹属、倭竹属、短穗竹属、簕竹属、酸竹属及少穗竹属共13个属62个竹种DNA,对其内转录间隔区ITS序列进行PCR扩增和双向测序,所得序列与GenBank数据库下载的14条ITS序列共76个竹种序列用Clustal X软件比对,再利用MEGA6.06软件构建K2P距离法的NJ系统发育树.结果显示,种内遗传距离为0~3.907,平均遗传距离为0.370;种间遗传距离为0~4.394,平均遗传距离为2.287,种内遗传距离远小于种间遗传距离.ITS序列可用于竹类资源的物种鉴定研究.     

分子序列进化方程的解的研究

利用龙格─库塔（５，６）法，对分子序列进化方程作了数值解，并求出了信息参数Ｄ＿１、Ｄ＿２、Ｘ的进化，及其与突变率和选择强度的依赖关系。分析了Ｄ＿１、Ｄ＿２、Ｘ的稳定值与选择参数之间的各种可能关系。     

山茶属几种植物品种的LC/MS指纹及聚类分析

山茶花除具有观赏价值外,还具有多种药用价值.通过对不同山茶品种进行LC/MS指纹及聚类分析,可以发现不同品种间的差异和共同点,找到不同物种间的植物亲缘关系,为山茶的药用价值和栽培繁殖技术提供理论依据.     

吉林省两城市常见绿化植物单体色彩美景度评价

以吉林省长春市、吉林市各类绿地为研究样地,选择70种常用绿化树种为研究对象,采用SBE法、相关分析、方差分析、逐步回归等方法,确定影响园林植物单体色彩美景度的主要因子,建立美景度预测模型.结果表明:树木姿态(F=2.089,P=0.018)、彩叶光泽(F=2.828,P=0.001)是影响园林植物色彩美景度的主导指标;美景度预测模型SBE=-100.706+17.888x1+24.292x9(x1为彩叶光泽,x9为树木姿态);美景度随彩叶光泽、树木姿态等指标分值的提高而显著提高.     

以核苷酸短程关联为基础的进化树重建

据DNA序列中核苷酸短程关闻为主及其进化依赖性，本提出了一个以少核苷酸频数为基础的进化距离的定义，据此用35个物种的16S（18S）RNA序列构建进化树，得到了和生物学公认的进化树一致的结果。最佳的树为用7－8核苷频数作为距离定义构建而成，这意味着存在着一些7－8核苷酸组成的字串，它们与进化强相关。论的最后部分把这些进化相关字串全部找出。     

多种药用植物抑菌效果研究

采用L8（2）^7正交实验设计和含药培养基实验方法，测定了多种药用植物及不同复方对4种植物痛原菌的最低抑菌浓度（MIC），结果表明，不同植物提取液对四株植物病原菌的MIC各不相同，复方药物的最佳组方为：雷公藤5g、蛇床子10g、大黄5g、苦参10g、马齿苋10g、黄柏10g、黄芩10g．最佳复方药物对4种植物病原菌的MIC分别为：黄瓜黑斑病菌3．2％，青椒枯萎病菌5．0％，黄瓜枯萎病菌4．4％，禾谷类作物病菌3．0％．     

基于IFS的真实感分形植物仿真与实现

在vc＋＋中运用迭代函数系统实现了四川（川东）几种常见树木的真实感形态模拟,并给出了IFS码,通过改变仿射变换的系数,降低了运算量,为植物仿真提供了方法和思路．     

模糊聚类分析在数字水印算法设计中的应用

基于人眼的视觉系统(HVS),将模糊聚类分析的的基本思想应用于静态图像数字水印算法设计。该算法根据模糊聚类分析思想,结合人眼特性将图像中的像素点进行分类,自适应的确定水印的嵌入位置。并可根据实际用途要求,确定分类数,按不同要求对图像像素进行分类选择,在现有技术条件下即可实现一种乃至多种水印的嵌入,更具广泛应用性。     

基于因子分析与聚类分析的高校图书馆读者群分类研究

在分析高校图书馆读者群分类意义的基础上,建立了高校图书馆读者群分类的因子分析与聚类分析算法模型,并以此模型对某高校图书馆读者群进行了分类计算,得到了相关的研究成果。     

基于COI和D-Loop序列豫北虾虎鱼分子系统分析

虾虎鱼在河南省北部广泛分布,但其系统分类和多样性未有报道.从豫北原阳黄寺、安阳小南海、淇县淇河、长垣孙东闸、林州弓上水库等地采集虾虎鱼样本共计23尾,成都岷江样本6尾,分别扩增了线粒体COI基因和D-Loop序列.联合GenBank下载虾虎鱼的COI序列和D-Loop序列,构建了虾虎鱼的系统进化树.结果显示,采自黄寺、小南海、淇县、岷江地区的子陵吻虾虎鱼(Rhinogobius giurinus)聚为一个分支,而采自孙东闸和弓上水库的褐吻虾虎鱼(Rhinogobius brunneus)聚为一个单系群;这两种虾虎鱼遗传分化主要来自群体间.系统发育结果支持子陵吻虾虎鱼的韩国群体与中国群体构成姐妹群关系,中国不同地理种群间则相互交叉.