光谱法研究百草枯与小牛胸腺DNA的相互作用

以亚甲基蓝(MB)为分子探针,用紫外-可见光谱、荧光光谱、荧光偏振和圆二色光谱研究了百草枯与小牛胸腺(ctDNA)的相互作用.MB分子主要以嵌插方式结合到ctDNA双螺旋结构上,而百草枯则以非竞争方式抑制MB与ctDNA的结合;百草枯对MB-ctDNA体系的荧光偏振以及百草枯对ctDNA圆二色光谱的影响,结果均表明百草枯与ctDNA主要作用方式为非嵌插结合.NaCl对百草枯与ctDNA的结合具有显著的抑制作用,因此可以推断带正电荷的百草枯离子可能通过与ctDNA链上带负电荷的磷酸基以静电相吸的方式结合而堆积在ctDNA双螺旋表面,引起ctDNA收缩,减弱了结合位点附近MB与ctDNA的静电作用;这可能由于钠离子中和了ctDNA磷酸基上的负电荷,从而削弱了百草枯与ctDNA间的静电作用.通过Scatchard方程计算,获得了百草枯与ctDNA的结合常数为1.80×104L·mol-1.     

磁性纳米氧化铁与小牛胸腺DNA相互作用研究

以微波辅助共沉淀法合成磁性纳米氧化铁(MNPs), 分别采用紫外-可见吸收光谱(UV-vis)、拉曼光谱(Raman)及琼脂糖凝胶电泳(GE)研究其与小牛胸腺DNA (ct DNA)的相互作用. UV-vis显示出明显的增色效应, 这是由DNA分子受MNPs的干扰碱基外露而引起的|Raman研究表明DNA分子碱基、脱氧核糖以及磷酸骨架均受到MNPs一定程度的干扰|而GE证实了MNPs并未使DNA分子发生断裂、双链解开等本质性变化. 该研究对MNPs在生物医学领域的安全应用具有重要意义.     

光谱法研究硫酸奎宁与小牛胸腺DNA的相互作用

本文采用紫外吸收光谱、荧光光谱、荧光偏振等方法研究了硫酸奎宁(QN)与小牛胸腺DNA(ctDNA)的相互作用,考察了影响其相互作用的各种因素,探讨了作用机理和作用方式。DNA存在时,QN的荧光被显著猝灭,吸收光谱出现减色现象。荧光偏振和阴离子猝灭等实验证实QN通过嵌插方式与ctDNA作用。测得QN与DNA的本征键合常数为1.51(±0.13)×104 L/mol,结合位点数为0.997,一分子的QN可以和大约1个碱基对作用。     

S-异丙甲草胺与小牛胸腺DNA的相互作用

应用紫外光谱、荧光光谱、DNA热变性法以及黏度法研究了S-异丙甲草胺与小牛胸腺DNA(ctDNA)的相互作用. 结果表明, S-异丙甲草胺使ctDNA在200 nm处的吸收峰发生明显改变, 表现出红移和减色效应, 而对260 nm处的吸收峰产生影响较小, 排除了嵌插作用的可能; ctDNA对S-异丙甲草胺内源性荧光表现出很强的猝灭作用, 且随温度的升高, 其猝灭程度有所下降, 表明S-异丙甲草胺是以形成加合物的方式与ctDNA结合的, 并求得了它们在不同温度下的结合常数; 将不同离子强度条件下S-异丙甲草胺与ctDNA作用以及不同S-异丙甲草胺浓度下ctDNA的热变性温度和黏度变化的研究结果与紫外光谱和荧光光谱相结合, 可以判断S-异丙甲草胺是以沟槽作用的方式与ctDNA结合的.     

温度对中性红与小牛胸腺DNA相互作用的影响

用光谱法和电化学法研究了温度对中性红 (NR)与小牛胸腺DNA (CTDNA)相互作用的影响 ,在低温下和在低浓度下NR嵌入到CTDNA碱基内部 ,NR的显色团嵌入G -C碱基对并与核酸双螺旋的对称轴垂直 (γ =90°) ,当温度升高时 ,部分NR从DNA双螺旋中脱出 ,嵌入的NR发色团的长轴转变为与DNA双螺旋的对称轴成 45°角 (γ =45°)。     

光谱法和电化学法研究中性红与小牛胸腺DNA的相互作用

利用紫外 可见和圆二色光谱(CD)法和伏安方法,研究了小分子染料中性红(NR)与小牛胸腺DNA(CTDNA)的相互作用。实验表明在NR低浓度下,NR能嵌入至核酸双螺旋的碱基内部在G C处与核酸结合,而在较高浓度情况下,嵌入的NR分子与后来的在核酸双螺旋外部的NR分子相互作用发生聚集,从而堆积在DNA双螺旋的表面,同时使核酸的构象由B型转变为Z型。用光谱滴定的方法获得NR与CTDNA作用内部结合常数,分别为:Ka1=2 4×104mol·L-1·cm-1和Ka2=2 1×10-2mol·L-1·cm-1。     

三氯杀螨醇与小牛胸腺DNA作用模式研究

在生理酸度pH=7.4条件下,运用荧光光谱、圆二色谱(CD)和傅里叶变换红外光谱(FT-IR)等多种光谱技术,并结合熔点和粘度测量,研究了三氯杀螨醇与小牛胸腺DNA的相互作用模式。实验发现,三氯杀螨醇使DNA的熔点和粘度增大,DNA-溴化乙锭(DNA-EB)复合物的荧光显著猝灭,表明三氯杀螨醇与DNA发生嵌插结合。FT-IR和CD分析推测三氯杀螨醇主要与鸟嘌呤和胞嘧啶碱基结合,并诱导DNA的双螺旋结构和碱基堆积发生一定程度的变化。     

小牛胸腺DNA的自旋标记研究

本文用2,2,6,6-四甲基-4-(双乙烯亚氨基)三氮嗪代氨基哌啶-1-氧基作标记物。在所得产物(SL-DNA)的ESR波谱中,强固定峰对弱固定化组份占极大优势,二者的微波饱和特性有显著差异。对自旋标记反应在某些细节方面作了研究。对SL-DNA联合使用热变性(100℃,15min)和酸降解(pH≈1.5,37℃,23h),测定了标记物对DNA的结合量,即与一千个核苷酸结合的标记物个数为4.0—12.6。从变温测试得出SL-DNA的结构转变温度约为63℃,并观察到这种温度随着盐浓度的增大而升高。     

时间分辨光谱技术研究亚甲基蓝与小牛胸腺DNA的相互作用

采用时间分辨光谱技术研究了亚甲蓝与小牛胸腺DNA（MB-ctDNA）重水混合体系中MB敏化单态氧（1O2）动力学过程,以此进一步探讨MB与DNA的相互作用。结果表明显示,低浓度ctDNA和高浓度ctDNA的单态氧磷光动力学曲线有着明显不同,这些差异被归结为MB与DNA间结合方式和作用机制的改变。在低浓度ctDNA条件下,MB分子和ctDNA之间形成离子型结合物,MB的吸收带出现显著的减色效应,敏化1O2产量随DNA浓度增加而急剧下降,但ctDNA与1O2没有发生明显的相互作用;而在高浓度DNA时,MB分子和ctDNA之间的相互作用方式转变为以嵌入式结合为主,激发态MB与ctDNA间的能量转移和介质的粘度效应,改变了1O2的动力学特性,大大降低了光敏剂MB敏化1O2的产量,但1O2不为ctDNA所猝灭。这些结果阐明,在MB与DNA的混合体系中,敏化单态氧损坏DNA的Ⅱ型反应不是主要的PDT作用机制。     

农药异丙威与小牛胸腺DNA的作用研究

在生理酸度条件下,采用紫外光谱和荧光光谱法研究异丙威与小牛胸腺DNA的作用表明:DNA对异丙威的荧光有明显的猝灭作用,属于静态猝灭方式;K4[Fe(CN)6]猝灭试验发现DNA对异丙威有明显的保护作用,离子强度的改变对异丙威和异丙威-DNA体系的荧光均无明显影响;异丙威的加入使DNA的熔点升高,并且异丙威能够竞争置换EB与DNA的结合位点。上述实验也表明,异丙威以嵌插方式作用于DNA的结合位点,有可能通过形成DNA加合物的形式造成DNA损伤,从而最终导致基因突变。     

中性红与小牛胸腺DNA相互作用机理的电化学和紫外-可见光谱研究

静电作用;嵌插作用;中性红与小牛胸腺DNA相互作用机理的电化学和紫外-可见光谱研究     

塑化剂邻苯二甲酸二丁酯与小牛胸腺DNA的沟槽结合

运用多种光谱学方法,结合化学计量学多元曲线分辨-交替最小二乘法(MCRALS),以及分子模拟技术,在人体生理酸度(pH=7.4)条件下研究了邻苯二甲酸二丁酯(DBP)与小牛胸腺DNA(ctDNA)的相互作用。采用MCR-ALS法分析了DBP与ctDNA作用的紫外光谱数据矩阵,结果表明DBP与ctDNA作用形成了DBP-ctDNA复合物。荧光猝灭实验显示,ctDNA对DBP的荧光猝灭属于形成复合物的单一静态猝灭,其主要驱动力为疏水作用和氢键。通过单双链、熔点和粘度等实验证明DBP与ctDNA发生了沟槽结合,结合区域为A、T碱基富集区。圆二色谱和琼脂糖凝胶电泳分析表明,DBP与ctDNA结合导致ctDNA结构变得更为松散,但未造成质粒DNA损伤。分子模拟形象直观地展现了两者的结合姿态,预测结果与实验结果吻合。     

环方铂立体异构体与小牛胸腺DNA作用的研究

研究了环方铂三种立体异构体（ＳＳ,ＲＳ和ＲＲ）与小牛胸腺ＤＮＡ的作用。差示扫描量热法（ＤＳＣ）测得的数据显示出三种经合物与ＤＮＡ作用的结果分别使其熔融温度下降了０．６,１．４和２．２Ｋ,有无ＤＮＡ存在时三种化合物及方酸。的＾１３Ｃ核磁共振谱表明,当三种化合物ＤＮＡ作用时,先释放出方酸根生成水铂,而后再与ＤＮＡ结合。综述上述实验结果,对三种化合物与ＤＮＡ的作用强度、方式及机理进行了讨论。     

双酚A与小牛胸腺DNA的嵌插作用

在pH7.4Tris-HCl缓冲条件下,应用多种光谱学方法并结合化学计量学多元曲线分辨-交替最小二乘法(MCR-ALS)、DNA熔点测量、粘度分析以及分子模拟技术,研究了环境雌激素双酚A(BPA)与小牛胸腺DNA(ctDNA)的相互作用。由MCR-ALS解析扩展的紫外光谱数据矩阵,得到了3个反应组分(BPA、ctDNA及BPA-ctDNA复合物)的相对浓度及其光谱曲线,可评估BPA与ctDNA相互作用进程。BPA引起ctDNA熔点和粘度升高、与吖啶橙竞争结合ctDNA表明BPA通过嵌插模式与ctDNA作用。傅里叶红外光谱研究显示,BPA主要结合在ctDNA的A,T碱基富集区,这与分子模拟结果一致。圆二光谱分析表明,BPA与ctDNA作用诱导ctDNA的结构由B构象向A构象转变。     

荧光法研究抗癌药物更生霉素D与小牛胸腺DNA的作用机理

以溴化乙锭(ethidiumbromide,EB)为荧光探针,研究了更生霉素D(actinomyinD,ACTD)与小牛胸腺DNA(calfthymusDNA,CTDNA,以下简称DNA)的作用机理。对荧光光谱、荧光偏振、Scatchard图、DNA热变性曲线、DNA盐效应曲线等研究表明,ACTD与DNA之间主要存在嵌入和沟槽两种作用,并证明ACTD与DNA磷酸基之间不存在静电作用。     

含芘荧光化学敏感器化合物同小牛胸腺DNA分子间的相互作用

研究了含芘荧光化学敏感器分子被ctDNA猝灭的荧光光谱.ctDNA分子对该化学敏感器中芘的激发单体,激基缔合物都有猝灭作用.对激发单体的猝灭速度顺序为;化合物(2)>化合物(1)>芘丁酸>化合物(3);对激基缔合物的猝灭速度顺序为;化合物(2)化合物(3).由得到的荧光猝灭数据,可按公式(2)求得荧光化学敏感器分子与ctDNA分子相互作用的稳定常数.发现化合物(2)与ctDNA分子间有着最强的相互作用能力.按ctDNA和含芘荧光化学敏感器的分子结构、构型以及分子内原子-原子的间距等提出了ctDNA分子与该荧光化学敏感器的作用模型,并对上述结果进行了初步解释.     

中氮茚萘醌类化合物与小牛胸腺dna的相互作用

中氮茚萘醌;小牛胸腺dna;电化学;uv-vis吸收光谱     

2-吡咯类酰腙的合成、晶体结构及与小牛胸腺DNA的相互作用

以2-吡咯甲酰肼与2,4-二羟基苯甲醛和2-羟基-3-甲氧基苯甲醛经缩合反应合成2,4-二羟基苯甲醛-2-吡咯甲酰腙C₁₂H₁₁N₃O₃(Ⅰ)和2-羟基-3-甲氧基苯甲醛-2-吡咯甲酰腙C₁₃H₁₅N₃O₄(Ⅱ),并利用红外光谱、元素分析、¹H NMR、X射线单晶衍射和热重分析进行表征,结果表明晶体Ⅰ属单斜晶系,空间群为P2₁/c,Z=4,晶胞参数为a=1.2586(4) nm,b=0.8050(3) nm,c=1.1914(4) nm;晶体Ⅱ为正交晶系,空间群为P2₁2₁2₁,Z=4,晶胞参数为a=0.4756(2) nm,b=1.2491(6) nm,c=2.2145(11) nm。 热重结果显示,化合物Ⅰ和Ⅱ最大热分解峰分别出现在267.59和284.79 ℃,表观活化能分别为176.6和122.9 kJ/mol,表明化合物Ⅰ和Ⅱ具有较高的热稳定性。 利用粘度实验和微量热实验研究了化合物Ⅰ和Ⅱ与CT-DNA的相互作用,均显示两种化合物均与CT-DNA发生了插入作用,且相互作用过程放热,焓变值分别为ΔH(Ⅰ)=4.67 kJ/mol和ΔH(Ⅱ)=4.40 kJ/mol。     

新型含卤噻唑类酰腙化合物的合成及其与小牛胸腺DNA的相互作用

以2-氨基噻唑-4-甲酸乙酯和水合肼为原料,制得2-氨基噻唑-4-甲酰肼(2); 2与卤代(F, Cl, Br)对苯甲醛反应,合成了3种新型的含卤噻唑类酰腙化合物［C₁₁H₉N₄OSF(3a), C₁₁H₉N₄OSCl(3b)和C₁₁H₉N₄OSBr(3c)］,其结构和性能经元素分析,XRD和TG-DTG表征。结果表明：3a和3c属于三斜晶系,Pī空间群;3b属于单斜晶系,P2(1)/c空间群。3a~3c的热稳定性均较好,最大热分解过程的表观活化能均大于100 kJ·mol^-1。采用UV-Vis研究了3a~3c与小牛胸腺DNA(CT-DNA)的相互作用。结果表明：3a~3c与CT-DNA均以插入方式相互作用。