(E)-2-氰基-3-[4-(2,4-二氟苯氧基)-苄氨基]-3-甲氧基-丙烯酸2-乙氧基乙酯对超螺旋质粒DNA的特异性切割（英文）

研究了一种新型丙烯酸酯(E)-2-氰基-3-[4-(2,4-二氟苯氧基)-苄氨基]-3-甲氧基-丙烯酸2-乙氧基乙酯(MAE)对超螺旋pUC19 DNA的定点切割作用。利用紫外吸收、荧光光谱、凝胶电泳和DNA测序技术研究其核酸切割特异性。紫外吸收光谱的红移和减色效应,以及静态荧光猝灭表明MAE与DNA的作用属于典型的插入模式。不仅如此,凝胶电泳条带的变化以及DNA测序结果表明DNA的定点切割是通过DNA双链的分步水解完成。     

4-氯-2-(1H-咪唑并[4,5-f][1,10]菲咯啉)苯酚铜(Ⅱ)配合物的晶体结构及其与DNA的相互作用

利用菲咯啉酮衍生物4-氯-2-(1H-咪唑并[4,5-f][1,10]菲咯啉)苯酚(HL)设计合成了一种新的单核铜配合物[Cu(L)(5-Cl-sal)(DMF)]ClO_4·DMF(5-Cl-Hsal=5-氯-水杨醛),用元素分析和X射线单晶衍射等手段对配合物进行了表征。该配合物晶体属三斜晶系,P1空间群。用紫外吸收光谱、荧光光谱和凝胶电泳等方法研究了配合物与DNA的相互作用。结果表明,配合物以插入方式与CT-DNA结合,结合常数为1.02×10~3 L·mol~(-1)。同时配合物也能较大程度淬灭EB-DNA复合物的荧光,表观键合常数为4.37×10~5L·mol_(-1),略小于经典键合常数107 L·mol~(-1)。淬灭机理为动态淬灭。凝胶电泳实验研究表明配合物在H_2O_2存在下可将pBR322质粒DNA切割为开环缺口型DNA和线型DNA,配合物浓度越大,切割效果越好。机理研究显示,配合物切割DNA的反应是由羟基自由基(·OH)和单线态氧(~1O_2)作为活性物种的氧化切割过程。     

2,6-二[(2′-甲酚基-2"-羟乙基)氨甲基]-对-甲酚合四锌(Ⅱ)促进DNA水解的研究

本文利用圆二色、荧光光谱和琼脂糖凝胶电泳等方法考察了一个四核锌荧光配合物[ZnⅡ4(L-3H)2](ClO4)2·3.5H2O(I,L=2,6-二[(2′-甲酚基-2″-羟乙基)氨甲基]-对-甲酚)与DNA的结合性质及其DNA水解酶活性.结果表明,配合物I能通过与DNA磷酸骨架的共价结合诱导其构象变化,而本身的荧光被淬灭.该四核锌配合物能在生理条件和不加任何辅助剂情况下水解切割pBR322质粒DNA,且在60μmol·L-1时表现出最大的切割效果,使DNA的水解速率提高了6～7个数量级.     

2,6-二[(2′-甲酚基-2″-羟乙基)氨甲基]-对-甲酚合四锌髤促进DNA水解的研究

本文利用圆二色、荧光光谱和琼脂糖凝胶电泳等方法考察了一个四核锌荧光配合物[ZnⅡ4(L-3H)2](ClO4)2.3.5H2O(I,L=2,6-二[(2′-甲酚基-2″-羟乙基)氨甲基]-对-甲酚)与DNA的结合性质及其DNA水解酶活性。结果表明,配合物I能通过与DNA磷酸骨架的共价结合诱导其构象变化,而本身的荧光被淬灭。该四核锌配合物能在生理条件和不加任何辅助剂情况下水解切割pBR322质粒DNA,且在60μmol.L-1时表现出最大的切割效果,使DNA的水解速率提高了6～7个数量级。     

全反式维甲酸合钇(Ⅲ)配合物对DNA的切割和键合作用(英)

以紫外光谱、荧光光谱、粘度法和凝胶电泳方法研究了全反式维甲酸合钇(Ⅲ)配合物与DNA的作用。结果表明，该配合物能在生理条件下比配体和金属离子更有效地切割质粒DNA，体系离子强度和pH值的变化对配合物的切割活性有较大影响，自由基捕捉剂的加入不影响配合物的切割活性。该配合物对DNA的切割可能通过水解机理进行。该配合物可使DNA的粘度增加，使EB-DNA体系的荧光强度和DNA溶液的紫外吸收强度降低。据此推断，该配合物主要以嵌入方式与DNA作用。     

1,3-双(2-苯并咪唑基)-2-氧杂丙烷与锌配合物的合成、晶体结构及其与DNA作用方式的研究

合成了1,3-双(2-苯并咪唑基)-2-氧杂丙烷合锌(II)配合物, 并用元素分析和X射线衍射进行了表征, 表明其为畸变八面体构型. 用紫外、DNA熔点、荧光、粘度等手段对其与小牛胸腺DNA作用方式进行了研究. 实验结果表明, 由于配合物的八面体构型以及苯并咪唑环的平面性, 其与DNA作用方式可能为部分插入.     

过渡金属配合物Cd[(phen)2(NO3)2]与DNA相互作用的研究

本文合成并表征了过渡金属配合物Cd[(phen)2(NO3)2]，运用紫外光谱、荧光光谱、黏度实验、分子模拟以及量子化学计算等方法研究了配合物与DNA的键合作用，结果表明配合物与DNA之间仅存在较弱的小沟键合作用；另外，凝胶电泳实验表明无论抗坏血酸存在与否配合物都几乎不切割DNA，而镉离子在相同的条件下却能够很好的切割DNA，所以我们可以看出镉配合物的生成减小了镉离子对DNA的损伤，从而在一定程度上降低了镉的致癌性，为降低隔的毒性提供了一种有效的方法。     

2，6-二[(2′-甲酚基-2″-羟乙基)氨甲基]-对-甲酚合四锌(Ⅱ)促进DNA水解的研究

本文利用圆二色、荧光光谱和琼脂糖凝胶电泳等方法考察了一个四核锌荧光配合物[Zn^Ⅱ₄(L-3H)₂](ClO₄)₂·3.5H₂O(I,L=2,6-二[(2′-甲酚基-2″-羟乙基)氨甲基]-对-甲酚)与DNA的结合性质及其DNA水解酶活性。结果表明,配合物I能通过与DNA磷酸骨架的共价结合诱导其构象变化,而本身的荧光被淬灭。该四核锌配合物能在生理条件和不加任何辅助剂情况下水解切割pBR322质粒DNA,且在60 μmol·L^-1时表现出最大的切割效果,使DNA的水解速率提高了6~7个数量级。     

分子模拟及光谱法研究2-乙基-3-(3-硝基苯基)喹唑啉-4-酮与小牛胸腺DNA的相互作用

合成了2-乙基-3-(3-硝基苯基)喹唑啉-4-酮(ENPQO),用紫外光谱法、荧光光谱法、荧光偏振法、离子强度法及分子模拟法研究了ENPQO与小牛胸腺DNA(ct DNA)的相互作用。紫外光谱法显示ct DNA与ENPQO作用后,引起ENPQO紫外吸收光谱的增色效应;在以吖啶橙(AO)为荧光探针的实验中,随着ENPQO浓度的增加,ct DNA-AO体系的荧光被猝灭,其猝灭过程主要是静态猝灭,ENPQO对ct DNA-AO体系的荧光偏振基本无影响;不同浓度的Na Cl溶液未削弱ENPQO对ct DNA-AO的猝灭程度。以上结果均表明ENPQO与ct DNA之间的作用方式主要为沟槽结合。利用分子模拟对接技术预测了ENPQO与ct DNA的结合最优构象,与光谱实验结果一致。     

两个带呋喃悬臂不对称大环双核铜配合物的合成、结构及性质(英文)

合成并表征了2个不对称大环双核铜配合物[Cu2(L1)Cl2]·CH3CN(1)和[Cu2(L2)Br2]·CH3CN·H2O(2)。配合物与CT-DNA的作用通过紫外-可见光谱,粘度实验,圆二色谱和凝胶电泳实验进行了研究。紫外-可见光谱的结果表明配合物与DNA的结合常数分别为6.2×105和7.2×105,圆二色谱的实验表明配合物能与DNA较好的结合,粘度实验表明配合物与DNA的结合为非典型的插入模式,凝胶电泳实验显示配合物通过氧化机理对DNA有较强的切割活性。     

β-K4H3[SiW9O37(CpTi)3]·11H2O环戊二烯钛多酸衍生物与DNA作用研究

某些过渡金属配合物具有特异性催化DNA和RNA断裂的功能, 因而研究过渡金属配合物对DNA和RNA的断链反应对新型抗肿瘤、抗艾滋病化学药物的定向设计及其基因治疗和分子生物学中DNA和RNA的高度专一性定点断裂、 DNA定位诱变和构象识别具有重要意义和应用前景[1,2]. 我们对二茂钛多酸有机金属衍生物合成及抗肿瘤活性研究表明, 环戊二烯钛多氧金属酸盐衍生物具有很高的抗肿瘤活性和较好的水溶性及稳定性, 有潜在的抗肿瘤药用价值[3].     

硫杂蒽酮镍（II）配合物与DNA的作用研究

合成了O-（硫杂蒽酮-[2]-基）-氧乙酸镍（II）配合物。通过元素分析,IR, DTA-TG谱对其结构进行了表征。研究表明：配体羧羰基脱质子后与镍离子配位,配合物中含有一定量的配位水。同时以紫外可见光谱、荧光光谱、园二色谱,电化学方法和凝胶电泳方法研究了该配合物与DNA的作用。结果表明,该配合物能在生理条件下比配体和金属离子更有效地切割质粒DNA,自由基捕捉剂的加入不影响配合物的切割活性。该配合物使DNA溶液的紫外吸收强度和园二色吸收强度降低,DNA的存在可使该配合物的氧化还原活性降低。与溴化乙锭和DNA的竞争反应说明,该配合物主要以嵌入方式与DNA结合。     

三核铜配合物[Cu_3L_2](ClO_4)_2(H_2L=1,3-双（2-羟基-1-苯基-亚甲基）-丙烷)的合成与对pBR322DNA的切断作用

利用席夫碱配体[H_2L = 1，3-双（2-羟基-1-苯基-亚甲基）-丙烷]与铜盐作 用，得到了配合物[Cu_3L_2](ClO_4)_2，并用X射线单晶衍射测定了其晶体结构。 研究了该三核铜配合物与质粒pBR322 DNA之间的相互作用，琼脂糖凝胶电泳实验结 果表明该配合物能够将pBR322 DNA从超螺旋构型切割成开环型和线型。同时，紫外 光谱实验可以推测，配合物在对pBR322 DNA进行切断时，它们之间在一种插入作用 。     

Synthesis,crystal structure,solid-state fluorescence,and interaction with DNA of mononuclear La(III) complex: La(Phen)2L2(NO3)

A mononuclear complex, La(Phen)₂L₂(NO₃) (Phen?=?1,10-phenanthroline, L?=?2-ethylphenylacetic acid), was synthesized by the reaction of La(NO₃)₃·H₂O, Phen and L at room temperature. The central ion shows 10-coordination with two Phen and two L molecules. Elemental analysis, IR spectra, and X-ray single-crystal diffraction were carried out to determine the composition and crystal structure. Solid fluorescence shows the luminescent properties of the complex. DNA-binding properties of the complex were examined by fluorescence spectra. The capability of cleavage of pBR322 DNA by the complex was investigated by agarose gel electrophoresis, showing cleaving efficiency.     

配合物[Co2(EGTB)Cl2]•(BF4)2•5H2O与DNA相互作用的研究

用紫外光谱法、荧光光谱法、黏度法、凝胶电泳法研究了双核钴(II)配合物[Co2(EGTB)Cl2]•(BF4)2•5H2O和DNA的相互作用, 在pH＝7.2的缓冲体系中, 求得配合物与DNA的结合常数. 结果表明, 配合物在接近生理条件下能有效地断裂pBR322DNA, 同时可使DNA的粘度增加, 使EB-DNA体系的荧光强度降低. 配合物与DNA的荧光光谱和紫外光谱表明, 配合物与DNA的作用既存在部分插入结合又存在静电结合模式.     

Gemini表面活性剂(12-6-12)和DNA的相互作用

应用紫外光谱、荧光探针、zeta 电位、动态光散射和凝胶电泳等方法探讨了阳离子gemini 表面活性剂C₁₂H₂₅N⁺(CH₃)₂―(CH₂)₆―(CH₃)₂N⁺C₁₂H₂₅·2Br^-(12-6-12)与DNA之间的相互作用. 研究结果表明, 与传统表面活性剂相比, 偶联表面活性剂特殊的分子结构使其与DNA的作用更强烈. DNA引导表面活性剂在其链周围形成类胶束结构, 开始形成类胶束时对应的表面活性剂临界聚集浓度(CAC)比纯表面活性剂临界胶束浓度(CMC)低两个数量级. CAC与DNA的浓度无关, 而与表面活性剂之间的疏水作用以及表面活性剂与DNA之间的静电吸引作用密切相关. Zeta 电位和凝胶电泳结果显示了DNA链所带负电荷逐渐被阳离子表面活性剂中和的过程. 借助原子力显微镜(AFM)成功观察到了松散的线团状DNA, 球状体随机地分散在DNA链上形成类似于串珠的结构、尺寸较大的球形复合物以及其由于吸附多余的表面活性剂重新带正电而被溶解得到的较小DNA/12-6-12聚集体. 圆二色(CD)光谱结果显示, 12-6-12可以诱导DNA的构象发生改变.     

Structure,DNA bonding,and biological activity of a novel Pb(II) complex of 1,1-bis(5-(pyrazin-2-yl)-1,2,4-triazol-3-yl) methane

A novel complex [Pb(bptm)(NO₃)(H₂O)₂] (bptm = 1,1-bis(5-(pyrazin-2-yl)-1,2,4-triazol-3-yl) methane) is synthesized and characterized by IR spectroscopy and single crystal X-ray diffraction. Its reactivity with calf thymus DNA and HeLa cell DNA is measured using UV absorption and fluorescence spectroscopies. Gel electrophoresis assay demonstrates the ability of the complex to cleave pBR322 plasmid DNA. Eventually, the complex can suitably dock with a special DNA.     

菲咯啉铜切割DNA反应的微量热法研究

利用流动式和间歇式微量热法研究了菲咯啉铜(Ⅱ)-巯基乙醇-O~2体系切割小牛胸腺双链DNA(dsDNA)反应的热力学,确定该DNA断链的总反应为较快的放热反应和焓驱动的反应,但该反应的前期为快速吸热过程,310.15K和pH=7.0时该反应的总摩尔反应焓(Δ~rH~m~,~3)和前期摩尔反应焓(Δ~rH~m~,~1)分别为-35.1和7.29kJ·mol^-^1。同时采用琼脂糖凝胶电泳法观察到了菲咯啉铜(Ⅱ)-巯基乙醇-O~2体系对DNA链的断裂现象。     

全反式维甲酸合铜(II)配合物对DNA的切割和键合作用

以荧光法、粘度法、凝胶电泳和电化学方法研究了全反式维甲酸合铜(II)配合物与DNA的作用. 结果表明, 该配合物能在生理条件下有效切割质粒DNA, 加入H₂O₂后发现该配合物的切割活性增强, 说明该配合物对DNA的切割机理可能有两种: 氧化和水解. 同时可使DNA的粘度增加, 使EB-DNA体系的荧光强度降低. DNA的存在能导致该配合物氧化还原峰电流降低. 据此推断, 该配合物主要以嵌入方式与DNA作用.     

镍邻菲绕啉对DNA固定作用的原子力显微镜表征

原子力显微镜 ( AFM)自 1 986年发明以来得到了广泛的应用和发展 [1,2 ] ,成为众多研究领域中的强有力工具 ,并为其它的研究技术提供了良好的互补手段 .DNA是 AFM首次研究的生物样品之一 ,它使人类首次观察到 DNA分子的原始形貌 ,并实现了接近生理条件下的操作 ,使得随时监测生物大分子的生化反应过程成为现实 [3,4 ] .在 DNA的 AFM研究中 ,样品的制备是其关键 .以阳离子 (如 Mg2 + ,Ba2 + ,Mn2 +和 Ca2 +等 [5] )固定法较为常见 ,其操作简单 ,固定效果好 ,基底效应小 ,但也有一定的局限性 ,如存在限制性内切酶时 ,这些简单离子会…