基于固相萃取的微量糖蛋白糖基化修饰表征技术的建立

结合自制亲水固相萃取富集柱和生物质谱鉴定技术,实现了糖基化蛋白质核糖核酸酶B的糖含量测定、糖基化位点确认、聚糖富集及结构表征,以及不同糖型相对丰度分析。结果表明:其糖含量8.47%,糖基化位点为34位的Asn,糖链主要为5种高甘露糖型结构(Man5-9GlcNAc2)。所建立的HILIC富集技术,有利于针对微量生物样本,如生物工程药物糖蛋白及重要功能糖蛋白,开展位点特异性糖链结构解析,为糖蛋白质的药效或功能研究提供线索。     

液相基质辅助激光解吸电离-傅里叶变换离子回旋共振质谱研究

选用液相基质制样,考察了激光强度、回旋池开门时间等因数对基质辅助激光解吸电离-傅里叶变换离子回旋共振质谱(MALDI—FT—ICR—MS)检测结果的影响,优化了实验条件。使用液相制样方法对5类实际样品进行了MALDI—FT-ICR—MS检测,结果表明：液相基质具有很好的通用性,质谱信号稳定、持久。利用FT-ICR—MS特有的超高分辨率与准确度,能够很准确地测定化合物组成。     

基质辅助激光解吸电离-傅里叶变换离子回旋共振质谱法快速测定全血及尿液中的百草枯

该文建立了一种利用基质辅助激光解吸电离-傅里叶变换离子回旋共振质谱(MALDI-FTICR-MS)快速测定全血及尿液中百草枯的分析方法。采用含1%甲酸的乙腈溶液从生物样品中提取百草枯,并与2,5-二羟基苯甲酸溶液混合后直接进样分析。结果表明,全血、尿液和水中的百草枯在10～5 000μg/L质量浓度范围内线性良好,相关系数(r)为0.995 5～0.999 2;3种基质下的方法检出限(LOD,S/N=3)为0.6～3.0μg/L,定量下限(LOQ,S/N=10)为2.0～10μg/L;百草枯在全血和尿液中的平均回收率为85.2%～110%,相对标准偏差(RSD)为0.40%～7.3%。该方法具有所需样品和溶剂用量少,操作简单,分析速度快,灵敏度高,且稳定可靠等特点,可满足临床及司法鉴定相关的中毒快检需求。     

应用超高分辨质谱成像技术研究脂类分子在小鼠肝组织中的分布

利用基质辅助激光解吸电离-傅里叶变换离子回旋共振质谱仪对磷脂类分子在小鼠肝组织中的分布进行了研究,建立了质谱成像技术检测小鼠肝组织中磷脂类分子分布的分析方法.以7 g/Lα腈基-4-羟基肉桂酸的50%甲醇溶液(含0.2%三氟乙酸)作为基质,采用正离子采集模式,准确鉴定了5类13种磷脂类分子,其分子量主要分布在700～9...     

基质辅助激光解吸离子化质谱及其在生物大分子分析中的应用

近年来质谱离子化技术方面有两项重要成果:基质辅助激光解吸离子化(matrix-assisted laser desorptionionization,MALDI)和电喷雾离子化(electrospray ionization,ESI)。MALDI和ESI的应用使质谱在生物大分子研究方面取得重大突破。本文仅就MALDI的原理、特点、样品准备方法、基质的选择、仪器条件及其在生物大分子应用方面的最新进展进行简要的综述。     

基质辅助激光解吸电离-傅里叶变换离子回旋共振质谱法快速测定蔬菜中百草枯与敌草快

该文基于基质辅助激光解吸电离-傅里叶变换离子回旋共振质谱技术(MALDI-FTICR-MS)建立了冬瓜、黄瓜、小白菜、上海青、韭菜、芹菜和生菜共7种蔬菜中百草枯和敌草快的快速测定方法.研究对比了低浓度2,5-二羟基苯甲酸(2,5-DHB)和α-氰基-4-羟基肉桂酸(CHCA)两种MALDI基质对百草枯和敌草快响应的影响...     

谷氨酸甲基化修饰的基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱分析

利用基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱(MALDI-TOF/TOF)高置信度地鉴定了枯草芽孢杆菌中的蛋白酶抑制剂和杆菌肽F两种蛋白及其翻译后修饰,发现在这两种蛋白质中共有5个肽段发生谷氨酸甲基化,其中肽段FELVVYDSEHK存在FE(Methylation)LVVYDSEHK和FELVVYDSE(Methylation)HK两种形式。结果表明,MALDI-TOF/TOF高能CID所提供的丰富断裂信息和全质量范围扫描对提高分析结果的确定性具有重要作用。此外,这5个甲基化肽段都可以检测到相对含量更高的非甲基化肽段,这为降低分析结果的假阳性提供了辅助判据。在低质量区检测到甲基化赖氨酸的亚胺相关离子m/z 98和143,说明发生了赖氨酸的甲基化;检测到m/z 116则提示发生了谷氨酸甲基化。     

耐药相关果糖二磷酸醛缩酶C的生物质谱分析与鉴定

醛缩酶C是生命代谢过程中重要糖酵解同工酶之一. 应用二维凝胶电泳分离卵巢癌细胞中高表达的果糖二磷酸醛缩酶C, 并通过基质辅助激光解吸电离飞行时间串联质谱对其进行分析与鉴定, 结果表明应用高分辨二维凝胶电泳分离, 结合生物质谱联用技术分析和鉴定未知蛋白具有简单快捷的特点.     

串联飞行时间质谱中亚胺离子的断裂特征及其在肽段鉴定中的作用

基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱(MALDI-TOF/TOF)产生的亚胺离子可以提供丰富的肽段组成信息,该方法通常用于基于数据库搜索的蛋白质鉴定,或者结合化学衍生法用于从头测序,因而在一定程度上限制了对亚胺离子的认识及应用。本研究利用239个串联质谱探索MALDI-TOF/TOF中亚胺离子的断裂特征以及它们在肽段鉴定中的应用,发现在高能碰撞诱导解离条件下组氨酸等14种氨基酸可产生较强的亚胺离子信号(>50%阳性率),氨基酸的化学结构、位置效应和氨基酸残基个数是影响碎片离子强度的主要因素。此外,探讨了亚胺离子应用过程中的假阳性问题,提出亚胺离子相对强度的比较可以降低假阳性和提高肽段鉴定确定度,有助于完善目前的数据库搜索算法和辅助从头测序分析。     

溶菌酶基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱分析中的不常见修饰及脱水反应

利用基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱(MALDI-TOF/TOF)分析了溶菌酶标准蛋白,在常规搜库条件下鉴定到6个独立肽段,Mascot得分420,鉴定覆盖率为54%。此外,经人工解析发现,肽段IVSDG-DGMNAWVAWR(98→112)在样品处理过程中发生了天冬酰胺脱氨化、天冬酰胺脱氨化+甲硫氨酸氧化、天冬酰胺脱氨化+甲硫氨酸氧化+色氨酸氧化等修饰,在激光解吸电离过程中发生脱水反应,脱水位点是脱氨后形成的第103位天冬氨酸。此外,还发现了部分肽段的丙酰胺化修饰。本研究表明,选择一级质谱中的极低丰度离子进行串联质谱分析和利用人工解析方法分析数据库未匹配数据,有可能发现一些特殊的蛋白质修饰,可增加数据利用度和分析结果的确定性。     

聚芳醚砜环状低聚物的基质辅助激光解吸电离质谱分析

采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术分别对两种合成的聚芳醚砜环状低聚物进行了分析研究，并讨论了低聚物中不同聚合度离子组份的分布规律。     

Analysis of MALDI FT-ICR mass spectrometry data: A time series approach

Matrix-assisted laser desorption/ionization Fourier transform ion cyclotron resonance mass spectrometry is a technique for high mass-resolution analysis of substances that is rapidly gaining popularity as an analytic tool. Extracting signal from the background noise, however, poses significant challenges. In this article, we model the noise part of a spectrum as an autoregressive, moving average (ARMA) time series with innovations given by a generalized gamma distribution with varying scale parameter but constant shape parameter and exponent. This enables us to classify peaks found in actual spectra as either noise or signal using a reasonable criterion that outperforms a standard threshold criterion.     

单分散聚苯胺齐聚物的激光解吸电离质谱

采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（ＭＡＬＤＩ－ＴＯＦ－ＭＳ）技术分别对８个单分散的聚苯胺齐聚物进行了分析研究。实验结果表明,ＭＡＬＤＩ－ＴＯＦ－ＭＳ不但可以作为分析单分散聚苯胺齐聚物的直观、准确、快速的分析工具,而且可以为合成路线的确定提供有利的证据。     

可溶性耐药相关钙结合蛋白的生物质谱分析与鉴定

可溶性耐药相关钙结合蛋白最初由Meyers等从长春新碱诱导的中国仓鼠多药耐药细胞株中发现,在多种耐药细胞株中均有高表达,它作为一种钙结合蛋白,一旦大量表达,即可改变细胞内钙环境,从而影响信号传导,使其它受钙调节的蛋白质的功能发生改变。     

双光束光解离在牛泛素蛋白离子的自顶向下质谱分析中的应用研究

自顶向下(Top-down)质谱分析方法是将完整蛋白质离子碎片化,从而在分子水平上提供更加精准、丰富的与蛋白质结构相关的生物学信息.该文首次将3μm红外激光与210 nm紫外激光共同引入到傅里叶变换离子回旋共振质谱仪(FT-ICR MS)的分析池中,获得了牛泛素蛋白离子的自顶向下质谱.通过优化两束激光被引入的时间序列,...     

MALDI-TOF MS测定多肽类聚合物相对分子质量的条件优化

本文用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱来测定多肽类聚合物的相对分子质量,对基质、溶剂以及添加阳离子条件进行了优化。     

A general-purpose baseline estimation algorithm for spectroscopic data

A common feature of many modern technologies used in proteomics - including nuclear magnetic resonance imaging and mass spectrometry - is the generation of large amounts of data for each subject in an experiment. Extracting the signal from the background noise, however, poses significant challenges. One important part of signal extraction is the correct identification of the baseline level of the data. In this article, we propose a new algorithm (the “BXR algorithm”) for baseline estimation that can be directly applied to different types of spectroscopic data, but also can be specifically tailored to different technologies. We then show how to adapt the algorithm to a particular technology - matrix-assisted laser desorption/ionization Fourier transform ion cyclotron resonance mass spectrometry - which is rapidly gaining popularity as an analytic tool in proteomics. Finally, we compare the performance of our algorithm to that of existing algorithms for baseline estimation.The BXR algorithm is computationally efficient, robust to the type of one-sided signal that occurs in many modern applications (including NMR and mass spectrometry), and improves on existing baseline estimation algorithms. It is implemented as the function baseline in the R package FTICRMS, available either from the Comprehensive R Archive Network (http://www.r-project.org/) or from the first author.     

傅里叶变换离子回旋共振质谱测定复杂表面活性剂组分

利用傅里叶变换离子回旋共振质谱(FT-ICR-MS)，分析了两类复杂的离子型表面活性剂样品。实验结果表明：高分辨FT-ICR-MS，可以简单、快速、准确地获得两类化合物的结构信息，利用其高准确度的质量测定数据，计算出复杂样品中各组分的元素组成，鉴定出具体化合物，显示了FT-ICR-MS在分子结构分析和未知物鉴定中的强大能力。