北京宏剑公司--国内首家化学软件专卖店

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北京宏剑讯科软件技术有限公司常用化学软件

Gaussian0 3———业界应用最广泛的量子化学软件 ,是作半经验计算和从头计算使用最广泛的量子化学软件。可以研究 :分子能量和结构 ,过渡态的能量和结构化学键以及反应能量 ,分子轨道 ,偶极矩和多极矩 ,原子电荷和电势 ,振动频率 ,红外和拉曼光谱 ,NMR ,极化率和超极化率 ,热力学性质 ,反应路径。计算可以模拟在气相和溶液中的体系 ,模拟基态和激发态 ,还可以对周期边界体系进行计算。公司每月一期G0 3软件培训ADF———化学家的通用密度泛函程序 ,专门作密度泛函计算的软件。ADF基于密度泛函理论 (DFT) ,主要应用于量子化学计算。广…     

不同硬件环境下量子化学软件的测试比较

计算机技术的飞速发展使得量子化学计算方法、水平和运算速度等方面有了很大的提高,同时也不断推出新的量子化学软件,诸多软件中,Gaussian和Gamess-US一直处于领先地位,是量子化学工作者的主要研究工具,研究这两种软件的计算速度具有比较强的代表性.针对国内使用微机进行量子化学研究有一定普遍性,我们以单分子计算和过渡态计算为例,对不同硬件产品作了大量测试工作,目的在于给广大的量子化学工作者购机时提供一些参考.     

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Gaussian0 3是做半经验计算和从头计算使用最广泛的量子化学软件。可以研究 :分子能量和结构、过渡态的能量和结构、化学键以及反应能量、分子轨道、偶极矩和多极矩、原子电荷和电势、振动频率、红外和拉曼光谱、NMR、极化率和超极化率、热力学性质、反应路径。计算可以模拟在气相和溶液中的体系 ,模拟基态和激发态 ;计算周期边界体系。是研究诸如取代效应、反应机理、势能面和激发态能量的有力工具。Chemoffice2 0 0 4包含了 :[Chem Draw Ultra]是世界上最受欢迎的化学结构绘图软件 ,是各论文期刊指定的格式。 [Chem3DUltra]提供工作…     

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Gaussview在化学教学中的一些应用

Gaussian量子化学计算程序包是美国Gaussian公司开发的一个功能强大的量子化学综合软件包。可执行各类不同精度的分子轨道计算(包括Hartree-Fock水平从头算(HF)、Post-HF从头算、密度泛函理论(DFT)以及多种半经验量子化学方法),进行分子和化学反应性质的理论预测。目前已成为国     

一种磺酰胺类碳酸酐酶Ⅱ抑制剂3D-QSAR分析新方法

提出了用Gaussian03量子化学计算软件优化磺酰胺类碳酸酐酶Ⅱ抑制剂分子的空间构型,得到相应的3D隐氢分子图、原子的标准定位坐标及其单点能.然后将3D分子隐氢图模拟成一个3D空间刚架元体系,通过求解该体系的无阻尼自由振动固有频率,得到分子体系的3D动态结构特征参量——基频ω0,并选择辅助基团中第一环路结构上取代基的节点顺序数NXm、元素种类数NE和分子单点能绝对值E0作为辅助参量建立QSAR模型,且用于文献报导的29种磺酰胺类碳酸酐酶Ⅱ抑制剂活性的定量结构-活性相关性分析,可得到多元线性回归方程:lgKc=-6.7960-25.3670ω0+2.2525NXm-0.6210NE+0.005779E0,其复相关系数r2大于0.99,其对数标准偏差S0.14,平均偏差小于0.112.     

甲醛分子的结构和性质的计算化学研究——介绍一个计算化学实验

介绍一个为化学专业本科生设计的、运用通用量子化学软件Gaussian和GaussView完成的计算化学实验.实验内容包括最基本的构型优化、频率计算和电子结构分析.旨在通过本实验,使学生初步掌握用量子化学计算方法研究分子结构和性质的基本过程,并能在将来的科研工作中学以致用.     

北京宏剑讯科软件技术有限公司常用化学软件

Gaussian03——业界应用最广泛的量子化学软件,是作半经验计算和从头计算使用最广泛的量子化学软件。可以研究：分子能量和结构,过渡态的能量和结构化学键以及反应能量,分子轨道,偶极矩和多极矩,原子电荷和电势,振动频率,红外和拉曼光谱,NMR,极化率和超极化率,热力学性质,反应路径。计算可以模拟在气相和溶液中的体系,模拟基态和激发态,还可以对周期边界体系进行计算。公司每月一期G03软件培训。     

北京宏剑讯科软件技术有限公司常用化学软件

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醇类化合物热值改进剂的定量结构-色谱保留相关性研究

计算表征了醇类化合物热值改进剂的部分分子连接性指数和5个量子化学参数,同时运用多元线性回归方法对参数进行了优化筛选,在2种不同极性强弱的固定相(PH-5、RTX-WAX)上,分别建立了9种和11种醇类化合物热值改进剂的气相色谱保留值(t)与分子连接性指数和量子化学参数的定量结构-色谱保留关系(QSRR)模型。其相关系数分别为R=0.997和R22=0.971,关系式可分别表示为模型1:t1=-5.972-0.047 ET-1.857~3X_p~v和模型2:t_2=-2.409-0.034 ET,在2种固定相上的QSRR模型的建模计算值复相关系数(R)、采用留一法(leave-one-out)交互检验复相关系数(R)分别为:R_1=0.998、R_(1CV)=0.999和R_2=0.985、R_(2CV)=0.999,结果表明:模型1和模型2与色谱保留指数显著相关的分别有总能量ET、三阶分子连接性指数~3X_p~v和总能量ET,所建模型具有良好稳定性和预测能力,分子连接性指数和量子化学参数能较好地反映化合物的结构特征。     

乙醇分子内及分子间脱水反应机理的计算化学实验研究

介绍了一个面向大三下或大四上本科生的计算化学探索性实验。通过研究乙醇分子内及分子间脱水反应机理,从分子水平理解醇脱水反应过程中酸催化剂的作用机制和反应的能量路径。通过本实验,使学生初步掌握量子化学计算通用软件高斯(Gaussian)的使用方法,掌握结构优化、频率计算、过渡态搜索等基本计算操作,并学会采用量子化学计算手段来研究化学反应的基本过程,为将来科研工作打下重要基础。     

金衬底上阴、阳离子型硫醇分子的量子化学计算

采用量子化学程序Gaussian98从头计算方法，对用做金衬底离子化的2—巯基乙基—二甲基氯化铵和3—巯基丙磺酸钠两种硫醇分子进行了全优化计算，得到了这两种化合物的平衡几何构型、基态能量、分子轨道组成和电荷分布等，并分析讨论了其分子轨道作用性质以及自由硫醇分子和金表面的相互作用．研究发现，表面分子基团带有大部分的净电荷，说明利用金与硫醇分子的自组装可实现金衬底的离子化。     

双二(吡唑)烷四齿桥联配体的合成、晶体结构及量化计算

以四溴乙烷、吡唑及4-碘吡唑为原料在KOH-DMSO体系中合成了3种双二(吡唑)烷四齿桥联配体: 1,1,2,2-四(吡唑)乙烷(1)、1,1,2,2-四(4-硝基吡唑)乙烷(2)和1,1,2,2-四(4-碘吡唑)乙烷(3), 通过元素分析、红外光谱、¹H NMR、¹³C NMR谱表征了它们的结构. 用X-射线单晶衍射法测试了化合物2以及不同分子构型的3-1和3-2的晶体结构. 用Gaussian09量子化学程序包, 采用密度泛函理论(DFT)中的B3LYP方法, 对化合物2, 3-1, 3-2的分子结构进行全参数优化计算, 研究了3个化合物的稳定性、电荷分布. 将量子化学计算结果与单晶衍射实验结果进行了对比分析, 发现二者具有相当高的一致性.     

单环共轭多烯的结构与芳香性研究

基于先进的量化计算软件Gaussian和波函数分析软件Multiwfn,研究结构化学课程中七种单环共轭多烯和环碳18的结构,形成“有图有真相”的立体直观的分子空间结构,形象化展示了各个分子的几何结构、分子尺寸、静电势、芳香性等。将课本知识与先进的量化软件结合起来,在量子化学层次上拓展有关芳香性的认识,引导学生加深对课本知识的理解,同时开拓学生的视野和知识层次。     

四种苯酚衍生物在水溶液中扩散系数的QSAR研究

以Winmopac7软件中AM1量子化学半经验分子轨道方法计算苯酚、邻苯二酚、间苯二酚、对苯二酚和邻苯三酚的水合物的结构参数,利用多元线性回归方法研究了以上5种酚的扩散系数与其分子结构参数之间的关系.结果表明,4种苯酚衍生物的扩散系数与分子的电子能量(Ee),分子的总偶极矩(μT),分子的体积(Vm)有较好的相关性.其回归方程为DT=1.155×10-5+3.675×109 Ee+4.734×10-7μT-9.28×10-3 Vm,R2=0.999 2 SD=1.428×10-7利用此方程预测邻苯三酚的扩散系数为(2.045±0.143)×10-6 cm2/s.此结果表明,AM1量子化学半经验分子轨道方法在对酚类化合物的扩散系数的研究和预测上具有可适用性,此方法也为其他有机化合物在水溶液中的扩散系数的研究和预测提供了新思路和新方法.     

基于异噁唑酮类份菁染料的激发态分子内质子转移的研究

运用量子化学理论计算方法研究了3-甲基-4-(1H-吲哚-3-次甲基)-异噁唑-5-酮(A)及其衍生物份菁染料的激发态分子内质子转移性质.研究表明:在基态3种染料AH(R=H),AO(R=—O(H3))和AP(R=—O(H2Ph))只存在酮式构型,在激发态AH与AP存在酮式和烯醇式2种构型,而AO存在酮式、烯醇式和仲胺式3种构型.红外光谱表明化合物从基态跃迁到激发态存在分子内的氢键增强作用,势能曲线显示激发态的质子转移为放热反应且能垒较低,通过分析电子光谱得到具有较大斯托克位移的激发态分子内质子转移的荧光发射峰,前线分子轨道理论计算进一步说明了其质子转移的发生过程.     

邻氧乙酸苯甲醛缩水杨酰腙及其配合物结构的量子化学研究和生物活性分析

利用Gaussian03W在B3LYP/3-21G水平上对邻氧乙酸苯甲醛缩水杨酰腙(H2L)及其过渡金属[Cu(Ⅱ)、Zn(Ⅱ)、Ni(Ⅱ)]配合物ML进行了量子化学计算,得到了优化构型、分子轨道能量和原子净电荷分布,并从自然原子电荷、前沿轨道能量着手分析了化合物的结构特征与生物活性.     

分子间弱相互作用的计算——构建氢键、卤键势能面

介绍一个面向大三下学期本科生的计算化学实验。通过量子化学计算对比研究两种分子间弱相互作用——氢键和卤键的势能面,使学生对势能面的概念及两种弱相互作用的区别有一定的直观认识。通过实际上机操作,初步了解Gaussian、Gaussview及Origin等计算化学相关软件的使用,并深入理解结构化学及计算化学课程中所学的理论知识。