IOPY/ISPY类HIV-1逆转录酶抑制剂的定量构效关系研究

C-5修饰的3-碘-4-芳氧基/芳硫基吡啶酮(IOPY/ISPY)类化合物是一类潜在的HIV-1非核苷类逆转录酶抑制剂, 特别是这类化合物因具有同时抑制野生型和突变型病毒株的特性, 而受到更加广泛的关注. 首先利用两套2D通用描述符同时构建了该类化合物的线性和非线性定量构效关系模型. 结果表明这些模型都具有较好的预测能力, 并且非线性模型较线性模型预测能力更好些. 为了更好、更形象地描述逆转录酶抑制剂的特征, 进一步结合三维定量构效关系(3D-QSAR)模型, 以及SAReport分析对该类化合物同时抑制野生型和突变型病毒株的结构特征进行了分析, 发现在对这类化合物进行结构修饰时, 需要服从如下三条理论指导原则: (1) R基团中的正负电场分布情况对化合物的活性起着关键作用|(2) R基团最好具有芳香环或芳香杂环和(3) R基团的环结构上连接的取代基不宜太多.     

Screening of new non-nucleoside reverse transcriptase inhibitors of HIV-1 based on traditional Chinese medicines database

HIV-1 RT is an important target for the treatment of AIDS.There are two major classes of antiviral agents that inhibit HIV-1 RT have been identified,nucleoside RT inhibitors(NRTIs) and non-nucleoside RT inhibitors(NNRTIs).In this report,a noval class of non-nucleoside compound with potential RT inhibitory activity were found from the traditional Chinese medicines database (TCMD) using a combination of virtual screening,docking,molecular dynamic simulations,where results were ranked by scoring function of...     

HIV-1逆转录酶抑制剂2-氨基6-苯磺酰基苄腈及其类似物活性OSAR研究

首先利用半经验AM I量子化学方法计算了54个2-氨基-6-苯磺酰基苄腈及其类似物的物理化学、电子结构、指示变量等共28个参数,然后使用偏最小二乘,穷举回归和混沌遗传乘法训练的人工神经网络方法建立了这些参数和其抑制H IV-1逆转录酶活性之间的定量构效关系模型,为设计、合成更高生物活性的该类化合物提供了理论参考。