基于Topomer CoMFA方法对芳基硫代吲哚衍生物的分子建模与设计

采用Topomer CoMFA方法对30个芳基硫代吲哚衍生物进行三维定量关系研究,建立了3D-QSAR模型,所得模型的交叉验证相关系数q~2,非交叉验证相关系数r~2,外部验证的复相关系数Q_(ext)~2分别为0.562,0.878,0.985,结果表明该模型具有较好的稳定性和预测能力.Topomer CoMFA模型等势面提供的立体场与静电场可视化图像,直观的揭示了这一系列化合物中不同取代基结构对其生物活性的影响,运用这些信息进行分子设计,在理论上获得了5个具有较高活性的新化合物,该QSAR的实验结果可为合成新药提供理论参考.     

近红外光谱分析测定鱼丸中的水分和淀粉含量

用近红外光谱技术分析了草鱼鱼丸中水分和淀粉的含量,并建立了数学模型.以定标集和验证集的相关系数(rc,rv)及预测标准误差(SEC,SEP)作为模型优劣的判定依据.结果表明,采用偏最小二乘法(PLS)建立的数学模型效果最佳,具有较高的相关系数和较低的预测标准误差.水分和淀粉模型中,定标集样本的相关系数rc分别为0.9834,0.9634;预测标准误差分别为0.6293,0.8875;验证集样本的相关系数rv为0.9841,0.9699;预测标准误差分别为0.6358,0.8850.该研究说明利用近红外光谱分析技术测定鱼丸中水分和淀粉的含量是可行的.     

基于Topomer CoMFA的苯磺酰基亚胺噻唑衍生物的三维定量构效关系研究和分子设计

采用Topomer CoMFA方法对21个苯磺酰基亚胺噻唑衍生物进行三维定量构效关系研究,得到了HIV-1非核苷类逆转录酶抑制剂的3D-QSAR模型,其拟合复相关系数r2=0.964,交互验证复相关系数q2=0.801,外部验证复相关系数Qext2=0.959;采用基于片段的药物设计方法 Topomer Search从ZINC数据库中虚拟筛选出3个Ra基团和7个Rb基团,且设计得到21个新化合物.结果表明:该模型不仅稳定性良好,而且具有较强的预测能力;采用Topomer Search技术能够有效的筛选进而设计出新的化合物,为抗艾滋病新药的设计提供理论依据.     

3D-QSAR Study of 7,8-Dialkyl-1,3-diaminopyrrolo-[3,2-f] Quinazolines with Anticancer Activity as DHFR Inhibitors

在对一系列抗癌性7,8-二烃基-1,3-二氨基吡咯-[3,2-f]喹唑啉类二氢叶酸还原酶抑制剂的二维定量构效关系(2D-QSAR)研究基础上,应用比较分子场分析法对该类配合物进行了三维定量构效关系(3D-QSAR)研究. 建立了具有良好的统计学性能及预报能力的3D-QSAR模型,非交叉验证相关系数为0.993,交叉验证相关系数为0.619,估算的标准误差0.208, 统计方差比193.4. 该模型表明立体场因素的影响比静电场因素大很多,此结果与我们已经报道的2D-QSAR模型结果相一致. 然而,3D-QS     

部分有机物蝌蚪麻醉活性的预测

基于定量结构-活性相关性（QSAR）原理,研究了49种有机化合物结构与其蝌蚪麻醉活性的内在定量关系。首先应用分子电性作用矢量（molecular electronegativity interaction vector,MEIV）表征49种有机化合物的结构,再采用多元线性回归（MLR）方法建立了相应的QSAR预测模型,最后对所建模型分别进行了内部验证和外部验证。所建模型的复相关系数(Rcum)、留一法(LOO)交互校验复相关系数(RCV)和外部样本校验复相关系数(Qext)分别为0.9415、0.9127和0.9253,证明该模型均具有较高的稳定性和预测能力。     

分子表面随机采样分析用于苯乙基噻唑硫脲衍生物抗艾滋病药物的3D-QSAR研究

采用分子表面随机采样分析(RASMS)对61个苯乙基噻唑硫脲衍生物抗艾滋病药物进行定量构效关系研究.运用多元线性回归(MLR)建模,同时采用内部及外部双重验证的办法对所得模型稳定性能进行深入分析和检验.MLR建模的复相关系数(Rcum)、留一法交互校验复相关系数(QCV)和外部样本校验复相关系数rm(test)分别为0.919、0.856和0.848.结果表明,RASMS能较好表征噻唑硫脲化合物N-(2-苯乙基)-N`-(2-噻唑基)-硫脲(PETT)及其衍生物抗艾滋逆转录酶抑制剂的分子结构信息,且所建模型具有良好稳定性和预测能力,可用于研发新型抗艾滋病药物.     

土壤金属元素近红外光谱定量校正模型适应性初步研究

为研究土壤金属元素近红外光谱定量校正模型适应性,采用近红外光谱结合偏最小二乘算法,针对风干土壤中的K,As,Hg,Cu,Zn,Pb,Cr,Cd元素,在剔除异常值后,建立定量校正模型;并对风干、烘干处理的外部验证集样品分别预测上述元素含量。结果表明,风干外部验证集样品的预测值-参考值相关系数皆大于相应烘干外部验证集样品的预测值-参考值相关系数;风干外部验证集各元素的预测值-参考值均具有显著的相关关系,烘干外部验证集中K,Hg,Cr的预测值-参考值之间不具有显著的相关关系。对土壤金属元素近红外光谱定量校正模型的适应性进行了初步研究,可为土壤中金属元素快速定量监测方法以及农产品产地环境监测等提供一定的参考。     

三维全息原子场作用矢量用于苦味二肽QSAR研究

本文利用三维全息原子场作用矢量(3D-Ho VAIF)对苦味二肽分子结构进行表征,并利用逐步回归结合多元线性回归建立苦味二肽定量构效关系模型,同时采用内外部双重验证的方法检验模型的稳定性.所建模型相关统计参量如下:复相关系数(R_(cum)~2)、留一法(LOO)交互验证相关系数(R_(cv)~2)、外部样本验证相关系数(Q_(ext)~2)和均方根误差(RMSE)分别为0.983、0.934、0.876和0.145.结果表明,3D-VAIF能较好地表征苦味二肽结构,优于传统的氨基酸描述子.为强活性肽类药物分子设计和改造提供指导.     

苯并噁嗪酮衍生物类抗艾滋病药物3D-QSAR研究

摘要：采用三维全息原子场作用矢量（3D-HoVAIF）对36个苯并噁嗪酮衍生物类抗艾滋病药物进行定量构效关系(QSAR)研究.运用偏最小二乘回归（partial least square regression, PLS）建模,同时采用内部及外部双重验证的办法对所得模型稳定性能进行了深入分析和检验.PLS建模的复相关系数（Rcum）、留一法（leave-one-out, LOO）交互校验（cross-validation, CV）复相关系数（QCV）和外部样本校验复相关系数（Qext）分别为0.906、0.865、0.815.结果表明,3D-HoVAIF能较好表征类苯并噁嗪酮衍生物抗艾滋病药物分子结构信息,因而能建立具有良好稳定性和预测能力的QSAR模型,为抗艾滋病药物的研发提供一定的理论基础.     

苯乙基噻唑硫脲衍生物抗艾滋病药物3D-QSAR研究

采用三维全息原子场作用矢量（3D-HoVAIF）对61个苯乙基噻唑硫脲衍生物类抗艾滋病药物进行定量构效关系（QSAR）研究.运用偏最小二乘回归（partial 1east square regression,PLS）建模,同时采用内部及外部双重验证的办法对所得模型稳定性能进行了深入分析和检验.PLS建模的复相关系数(R_cum)、留一法交互校验复相关系数(Q_CV)和外部样本校验复相关系数(Q_ext)分别为0.907、0.878、0.913.结果表明,3D-HoVAIF能较好表征苯乙基噻唑硫脲衍生物抗艾滋病药物分子结构信息,因而能建立具有良好稳定性和预测能力的QSAR模型,为抗艾滋病药物的研发提供一定的理论基础.