鸟嘌呤红外光谱的密度泛函理论研究──标度量子力学(SQM)力场处理

用密度泛函理论DFT(B3LYP)/6-31G^*方法对鸟嘌呤分子的酮-胺式和醇-胺式异构体的几何结构、振动谐性力场和红外光谱进行了研究.理论力场由迁移自相关分子异胞嘧啶和咪唑的力常数标度因子进行标度.算得振动频率与鸟嘌呤的实验基质隔离IR光谱比较平均偏差对酮-胺式和醇-胺式分别为6.6和6.0cm^-1.根据振动频率的势能分布和DFT计算的光谱强度值对鸟嘌呤分子的实验振动基频进行了理论归属.     

CIC（O）NCS分子筛振动光谱的理论研究

采用密度泛函理论DFT（B3LYP）方法,以6－31G为基组对CIC（O）NCS的反式和顺式两种构型的几何结构、振动谐性力场和红外光谱进行了研究 。B3LYP／6－31G的理论力场由适用于B3LYP／6－31G计算水平和大多数有机分子的一套固定标度因子进行标度,根据标度后的理论力场进行简正坐标分析得到的势能分布（PED）和红外光谱强度值对CIC（O）NCS分子物顺式和反式两种构型的振动基频进行了理论归属。     

ClC(O)NCS分子振动光谱的理论研究

采用密度泛函理论DFT(B3LYP)方法,以6-31G^*为基组对ClC(O)NCS的反式和顺式两种构型的几何结构、振动谐性力场和红外光谱进行了研究.B3LYP/6-31G^*的理论力场由适用于B3LYP/6-31G^*计算水平和大多数有机分子的一套固定标度因子进行标度.根据标度后的理论力场进行简正坐标分析得到的势能分布(PED)和红外光谱强度值对ClC(O)NCS分子的顺式和反式两种构型的振动基频进行了理论归属.     

有机配体Schiff碱4-(2-羟基苯基)-亚氨基-戊-2-酮的从头算研究

本文通过从头算HF／6－31G（d）方法,对Schiff4－（2－羟基苯基）－亚氨基－戊－2－酮 进行了理论研究,提供了该化合物两种互变异构体的几何构型参数、电子结构、IR光谱性 、偶极矩数据,并借助热、动力学手段,分析了两种互变异构体的异构平衡过程。计算结果表明：（1）从几何构型、电子 结构和相对能量的角度考虑,由于较强的分子内氢键作用和较大的共轭体系,亚胺烯醇式更为稳定。（2）从分子极性的角度考虑,烯胺酮式具有较大的偶极矩,其较强的分子间作用力有利形成晶体,因而烯胺酮式以晶体的形式存在。（3）由烯胺酮式向亚胺烯醇式转化的互变异构反应是热力学自发反应,但受到较大活化能的控制,是一个动力学稳定体系。分析了极性溶剂存在的互变异构反应是热力学自发反应,但受到较大活化能的控制,是一个动力学稳定体系。分析了极性溶剂存在将有利于反应发生且标题化合物以亚胺烯醇式存在于极性溶剂中的作用。以上结论均与实验研究结果相符。     

2-氟-5-溴吡啶分子振动光谱的密度泛涵理论研究

用密度泛函理论方法B3LYP以及6-311++G(2df,2pd)基组对2-氟-5-溴吡啶分子 的平衡几何构型进行了优化并计算了该分子的振动谐力场。使用Pulay的标度方法 对理论力场进行了标度。采用Wilson的GF矩阵方法,根据标度后的理论力场进行了 简正坐标分析,对2-氟-5-溴吡啶分子的振动基频进行了理论研究,得到了势能分 布和红外振动频率。与红外频率的实验值相比较,理论频率的均方差为24 cm~(-1) 。此外,根据振动模式的势能分布对此分子的振动基频进行了理论归属,并对前人 的指认进行了修正和补充。     

2-氟-5-溴吡啶分子振动光谱的密度泛涵理论研究

用密度泛函理论方法B3LYP以及6-311++G(2df，2pd)基组对2-氟-5-溴吡啶分子 的平衡几何构型进行了优化并计算了该分子的振动谐力场。使用Pulay的标度方法 对理论力场进行了标度。采用Wilson的GF矩阵方法，根据标度后的理论力场进行了 简正坐标分析，对2-氟-5-溴吡啶分子的振动基频进行了理论研究，得到了势能分 布和红外振动频率。与红外频率的实验值相比较，理论频率的均方差为24 cm~(-1) 。此外，根据振动模式的势能分布对此分子的振动基频进行了理论归属，并对前人 的指认进行了修正和补充。     

氟磺酸氟振动光谱的从头算

采用从头算HF／SCF方法以6-31G基组研究了FOSO2F分子的几何结构、振动谐性力场和红外光谱强度．理论力场由Pulay的标度量子力学方法进行标度,计算得到的振动频率与实验值比较平均偏差为6．3cm-1．根据振动频率的势能分布和从头算红外光谱强度值对此分子的振动基频进行了理论归属．     

氟磺酸氯分子振动光谱的从头算研究

采用从头算HF方法以6-31G^*基组研究了对ClOSO₂F分子的几何结构、振动谐性力场和红外光谱.理论力场由Pulay的标度量子力学方法进行标度,算得的振动频率与实验值比较,平均偏差为6.0cm^-1.根据振动频率的势能分布和从头算红外光谱强度值对此分子的振动基频进行了理论归属.     

FC(O)NCS 分子振动光谱的理论研究

采用DFT(B3LYP)方法,以6-3G*为基组对FC(O)NCS的顺式和反式两种构型的几何结构,振动谐性力场和红外光谱进行了研究。B3LYP/6-31G*计算水平和大多数有机分子的一套固定标度因子进行标度。根据标度后的理论力场进行简正坐标分析得到的势能分布(PED)和红外光谱强度值对FC(O)NCS分子的顺式和反式两种构型的振动基频进行了理论归属。     

XSO_2NCO(X=F,Cl)分子振动光谱的从头算研究——谐性力场和频率分布

采用从头算方法以 6 31G 基组对XSO2 NCO(X =F ,Cl)分子的振动谐性力场和红外光谱进行了研究 .由最小二乘法通过拟合FSO2 NCO分子的理论和实验频率优化了一套力常数校正因子 ,然后将其迁移到ClSO2 NCO分子中 ,以产生一个纯理论预测的振动基频 .利用校正后的力场计算得到FSO2 NCO和ClSO2 NCO的振动频率 ,与实验值比较平均偏差分别为 3cm-1和 5cm-1.根据用校正后力场进行简正坐标分析得到的势能分布 (PED)和从头算红外光谱强度值对此二分子的振动基频的指认进行了讨论 .     

18-冠醚-6的构象研究

以柔性大分子１８－冠醚－６为研究对象，将ＭＮＤＯ法所得的三种构象的静电势电荷用于分子力学计算，得到了三种构象的能量，同时计算了电负性电荷，亦将其用于分子力学计算，将两种计算结果进行比较发现，有可能将电负性作为分子力学、分子动力学计算的力场参数。     

尿素分子振动光谱的密度泛函理论研究

用密度泛函理论方法BLYP/6-31¹⁺+G(2df,2pd)对尿素分子的平衡几何构型进行了优化,并计算了该分子的谐力场.使用Wilson的GF矩阵方法,对尿素分子的振动基频进行了理论研究.根据振动频率的势能分布对此分子的振动基频进行了理论归属,计算的振动频率和能级指认均同实验结果吻合较好.     

Λ-及Δ-[Ru(phen)2dppz]n+对错配DNA的识别作用的分子模拟

本文通过在ESFF(Extensible Systematic Force Field)力场下对其作用中的体系势能进行分子力学计算，分析了手性金属配合物Λ－及Δ-[Ru(phen)2dppz]^n 对错配DNA d(CCGAATGAGG)2的识别机理，并在分子水平上对其做了详细解释。     

从硬球微扰理论推导马丁-侯状态方程

从Ｂａｒｈｅｒ－Ｈｅｎｄｅｒｓｏｎ的硬球微扰理论出发，运用幂级数形式的径向分布函数和分段的势能函数导出马丁－侯状态方程，推导过程中导出了一种理论式，计算Ｐ－Ｖ－Ｔ性质的精确度与马丁－侯原式相当，理论式的常数与分子微观参数有确定的函数关系。     

丙酮酸分子结构与振动光谱的密度泛函理论研究

用密度泛函方法BLYP、B3LYP和从头算Hartree-Fock(HF)方法在6-31G*基组水平上对丙酮酸分子的几何结构（甲基的重叠式和交错式两种构象）和振动光谱分别进行了优化和计算,并给出了各种频率所对应的红外强度及拉曼活性,对光谱进行了指认。结果表明：在丙酮酸分子的两种构象中,重叠式比较稳定*B3LYP计算得到的构型参数与实验结果比较一致;在振动频率的计算中,BLYP未标度力场所计算的非CH3伸缩振动基频预测值和实验值的平均绝对偏差为10.4cm-1;而HF标度力场的平均绝对偏差为17.9cm-1。说明两者的结果与实验观测频率比较吻合,但B3LYP的频率计算值偏差（38.3cm-1）较大。根据振动频率的势能分布和红外光谱强度对此分子的振动基频进行了理论归属。     

硝胺及其甲基衍生物的从头计算研究 3: 甲硝胺及其同位素衍生物的谐性力场和振动光谱

用TEXAS从头计算程序,取STO-4-21G基组,计算了甲硝胺的谐性力场和振动光谱.直接理论计算的谐性力场经由其他分子转移来的经验校正因子校正后,提供了甲硝胺振动基频的预测.预测值和甲硝胺分子在气相中的振动光谱实验值之间的平均偏差为31cm^-1.为了获得更合适的气相甲硝胺振动力场和预测它的同位素衍生物的振动光谱,我们优化了一组新的校正因子,使理论值和实验值的平均偏差减为8.9cm^-1.用这组校正因子得到的力场预测了三个同位素衍生物的振动光谱,其同位素位移的理论预测值和实验值符合良好.     

硝胺及其甲基衍生物的从头计算研究 Ⅲ.甲硝胺及其同位素衍生物的谐性力场和振动光谱

用TEXAS从头计算程序,取STO-4-21G基组,计算了甲硝胺的谐性力场和振动光谱.直接理论计算的谐性力场经由其他分子转移来的经验校正因子校正后,提供了甲硝胺振动基频的预测.预测值和甲硝胺分子在气相中的振动光谱实验值之间的平均偏差为31cm~(-1).为了获得更合适的气相甲硝胺振动力场和预测它的同位素衍生物的振动光谱,我们优化了一组新的校正因子,使理论值和实验值的平均偏差减为8.9cm~(-1).用这组校正因子得到的力场预测了三个同位素衍生物的振动光谱,其同位素位移的理论预测值和实验值符合良好.     

硝胺及其甲基衍生物的从头计算研究 3: 甲硝胺及其同位素衍生物的谐性力场和振动光谱

用TEXAS从头计算程序,取STO-4-21G基组,计算了甲硝胺的谐性力场和振动光谱.直接理论计算的谐性力场经由其他分子转移来的经验校正因子校正后,提供了甲硝胺振动基频的预测.预测值和甲硝胺分子在气相中的振动光谱实验值之间的平均偏差为31cm^-1.为了获得更合适的气相甲硝胺振动力场和预测它的同位素衍生物的振动光谱,我们优化了一组新的校正因子,使理论值和实验值的平均偏差减为8.9cm^-1.用这组校正因子得到的力场预测了三个同位素衍生物的振动光谱,其同位素位移的理论预测值和实验值符合良好.     

ABEEM/MM浮动电荷力场应用于血红素结构的研究

运用拟合的参数, 应用ABEEM/MM浮动电荷力场对血红素分子结构进行了模拟. 结果表明, 该力场与CHARMM力场相比, 能更好地模拟晶体结构. 计算的ruffing构象能与B3LYP/6-31G*计算结果的线性相关系数在0.98以上, 同时表明血红素分子中twist-angle对ruffing构象具有明显影响. ABEEM/MM力场计算的细胞色素c552中血红素分子的电荷分布与CHARMM固定电荷力场的比较, 更准确地反映了血红素分子的电荷分布以及极化现象.     

3—芳胺甲烯基—6—烷基（芳基）_5,6—二氢—2H—吡喃—2,4—二 …

以５,６－二氢－６－烷基（芳基）－２Ｈ－吡喃－２,４－二酮（１）、芳胺（２）和原甲酸三乙酸进行缩合反应、合成了２０个３－芳胺甲烯基－６－烷基（芳基）－５,６－二 喃－２,４－二酮（３）,由于分子内氢键的合成,化合物３由一对构象异构体４和５组成,生物活性初步测定结果表明,这些化合物均有一定的杀菌活性。