沼泽红假单胞菌类胡萝卜素的提取和分析

对沼泽红假单胞菌B．9菌株（Rhodopseudomonas Palustris strain B.9)类胡萝卜素的提取进行了研究。用超声波破碎菌体,类胡萝卜素得量较高;菌体中类胡萝卜素用丙酮提取,提取效果因菌体量,丙酮用量而变,提取液经萃取,皂化,洗涤得类胡萝卜素粗制品,对其分析表明B．9菌株含有螺菌黄素系列的类胡萝卜素。     

高活性光合细菌沼泽红假单胞菌培养特性初探

从广东台山养虾塘底污泥中采用平板涂布法分离光光合细菌,得到一株活性较高的沼泽红假单胞菌（Rhodopseudomonas palustris）,并对其培养特性进行了初步探讨,结果表明：菌株最适生长温度为25－30℃,光照强度为1500－3000lx,适当地添加酵母膏有利于菌体繁殖,酵母膏的最适添另量为质量分数0．15％,盐度范围在质量分数为0．1％－3％均能生长。     

沼泽红假单胞菌的分离鉴定及对重金属铜的响应的研究

从自然水体中分离到一株光合细菌并对其进行鉴定.对光合细菌施加不同浓度Cu2+的影响进行了研究.从信阳市南湾水库大坝下层底泥取样,分离纯化到的红色菌株在显微镜下观察,及生化试验后初步鉴定为一株光合细菌.根据16SrRNA的保守序列设计的常用光合细菌引物.PCR扩增DNA片段大小约为400bp,挑选菌液测序.结果在BLAS...     

沼泽红假单胞菌类胡萝卜素的提取和分析

对沼泽红假单胞菌B.9菌株（RhodopseudomonasPal-ustrisstrainB．9）类胡萝卜素的提取进行了研究。用超声波破碎菌体,类胡萝卜素得量较高;菌体中类胡萝卜素用丙酮提取,提取效果因菌体量、丙酿用量而变;提取波经革取、皂化。洗涤得类胡萝卡素粗制品,对其分析表明B．9菌株含有螺菌黄素系列的类胡萝卜素,     

红假单胞菌的分离鉴定与生长特性

由青岛沿岸潮间带表层沉积物分离出４株光合细菌，经鉴定属于荚膜红假单胞菌和球形红假单胞菌。光照厌氧培养生长实验表明ＨＤ３的最适盐度为Ｓ＝１５－２５，ＰＳ２－２为一淡水菌株。菌株ＨＤ３的最适ＰＨ范围为６．３５－８．３。ＨＤ３、ＲＳ均不能利用硫化物且其生长受较高浓度的硫化物抑制。     

沼泽红假单胞菌在暗纹东方鲀育苗上的应用

报导了沼泽红假单胞菌在暗纹东方育苗中应用的初步研究 .试验过程中按水体 5 0 μg/L的浓度向试验池投放沼泽红假单胞菌 ,研究该菌对育苗池水质、仔鱼育成率以及生长情况的影响 .结果表明 :5 0 μg/L的沼泽红假单胞菌可以有效去除育苗池水的COD(化学需氧量 )、N NH+ 4(氨氮 )以及N NO- 2 (亚硝氮 ) ,从而显著改善育苗池水质 ,稳定水体DO(溶氧 ) ;同时 ,暗纹东方仔鱼育成率以及生长都有了显著的提高     

沼泽红假单胞菌在暗纹东方纯育苗上的应用

报导了沼泽红假单胞菌在暗纹东方鲍育苗中应用的初步研究．试验过程中按水体50μg/L的浓度向试验池投放沼泽红假单胞菌，研究该菌对育苗池水质、仔鱼育成率以及生长情况的影响．结果表明：50μg/L的沼泽红假单胞菌可以有效去除育苗池水的COD(化学需氧量)、N-NH4^ (氨氮)以及N-NO2^-(亚硝氮)，从而显著改善育苗池水质，稳定水体DO(溶氧)；同时，暗纹东方鲍仔鱼育成率以及生长都有了显著的提高．     

红假单胞菌的生理学特性研究

对经过鉴定均属于红假单胞菌属的四个菌株^[5]的生理特性作了系统研究，结果表明：各菌株在光照厌氧条件下可利用多种低分子有机酸、醇类和部分糖类，适宜的氮源有铵盐、谷氨酸和蛋白胨；经计算机寻优，其最适初始pH值为7．0—7．5；不同菌株对NaCl的耐受情况有所不同；酵母膏对菌株P—15N、P—16的生长有明显的刺激作用。     

沼泽红假单胞菌砷代谢基因多样性及进化分析

对已公布全基因组的沼泽红假单胞菌(Rhodopseudanonas palustris)砷代谢基因进行解析,探求其砷代谢机制及进化关系.已公布全基因组的7个菌株中均含有砷抗性(ars)基因簇,主要包括arsR,arsC,arsM,arsB,acr3p,arsH,但不同菌株间的arsR同源性可以有较大差异,有6个菌株同时含有Ⅰ和Ⅱ两类arsC,5个菌株含有arsM,arsM同源性也有较大差异.结果表明:R.palustris砷代谢机制的主体为细胞质As(Ⅴ)还原和As(Ⅲ)甲基化,菌株不同,砷代谢基因呈现明显差异和多样性.     

紫色非硫光合细菌的研究——I.沼泽红假单胞菌的分类鉴定和生理特性

采用改良的Hungate厌氧培养技术-滚管法,从淀粉厂的污泥中,分离得到一株革兰氏阴性,弯曲杆状,出芽繁殖,既能在光照厌氧,也能在黑暗好氧条件下生活的光能异养型Y_6菌株.经形态观察、生理特性的测定,确证Y_6菌株为沼泽红假单胞菌(Rhodopseudomonas Palustris).     

Subcloning and Sequencing of the Form II Ribulose 1,5-Bisphosphate Carboxylase/Oxygenase from Rhodopseudomonas palustris

0　IntroductionRibulose 1,5 bisphosphate (RuBP)carboxylase/oxygenase(RubisCO)isoneofkeyenzymesofthere ductive pentose phosphate pathway ,orCalvin Bassham Bensoncycle .RubisCOisabifunctionalen zymethatcatalyzesthefirststepinthecarbondioxideassimilatorypathwayandphotorespiratorypathwayinallphotosyntheticorganisms ,includingplants ,algae ,cyanobacteria ,andmostphotosyntheticbacteria[16 ] .Thus ,itispositionedtoregulatetheflowofcellcar bonthroughtwocompetingmetabolicpathways .Itisreportedtha…     

利用反向 PCR 鉴定沼泽红假单胞菌中野生质粒

为准确研究沼泽红假单胞菌的野生质粒及其携带的基因信息,在常规碱裂解法基础上,对沼泽红假单胞菌Rhodopseudomonas palustris AS1.2352中野生质粒提取方法进行了优化,优化方法具有易操作、耗时少、纯度高等特点,所得质粒DNA纯度和质量均满足进一步分子操作的需要.同时,利用反向PCR技术鉴定该野生质粒,并结合生物信息学方法对其进行分析,比传统的质粒丢失法验证和考察质粒更为省时、可靠和直观.证明菌株携带4个野生质粒,其中2.3 kb的质粒序列与Escherichia coli pEC157 Rom-like protein gene有97.8%的同源性,推测1885~1887碱基为复制起点.     

沼泽红假单胞菌培养基的优化及降氨氮作用的研究

对沼泽红假单胞菌的培养基进行了优化,并对其降氨氮效果进行了研究.结果表明:沼泽红假单胞菌可以利用多种碳源和氮源,乳酸和草酸铵是实验室培养沼泽红假单胞菌的最适碳源和氮源,乳酸根的质量浓度及碳氮比对沼泽红假单胞菌生长具有显著影响,而磷酸根浓度对沼泽红假单胞菌生长没有显著影响;用正交试验获得最适于培养沼泽红假单胞菌的乳酸质量浓度为1%,碳氮比为1.5,磷酸二氢钾的质量浓度为1.5 g/L;在自然光照、30 ℃条件下,沼泽红假单胞菌的延滞期为2 d,对数生长期为2～10 d,稳定期为10～20 d;沼泽红假单胞菌具有很强的综合降氨氮作用,但其降氨氮效果受水质的影响而不稳定.     

拟穴青蟹PDI保守区域的克隆与序列分析

蛋白二硫键异构酶(PDI)是真核生物重要的多功能蛋白,其基因结构在虾蟹类尚未报道.从拟穴青蟹Scylla pa-ramamosain(Estampador,1949)脑组织中分离纯化总RNA,经逆转录得到cDNA第一条链,并以之为模板利用RACE(rapid-amplification of cDNA ends)技术,扩增出一条950 bp的cDNA.将所得cDNA克隆到质粒载体pTZ57R/T,转化大肠杆菌DH5α细胞并对筛选的阳性克隆测序.通过与目前数据库中序列的比较,在此cDNA编码蛋白中发现其中101个氨基酸与其他物种已知蛋白二硫键异构酶(PDI)中的PDI_a_PDI_a'_C保守区域相似率在64%～79%之间.确定此cDNA编码拟穴青蟹PDI_a_PDI_a'_C保守区域.     

南方鲇GK基因片段的克隆及序列分析

为从南方鲇(Silurus meridionalis)中扩增葡萄糖激酶(GK)基因,根据已报道的GK基因结构中的氨基酸保守区域,设计简并引物;从南方鲇肝胰脏中迅速抽提RNA,将扩增出的产物克隆到pMD18-T载体上并导入到大肠杆菌DH5α中;阳性克隆鉴定后测序.将测序得到的南方鲇GK基因与已知的GK基因进行核苷酸序列比...     

中国四个小型猪品种生长激素基因克隆测序及分子进化研究

研究对中国四个小型猪五指山猪、贵州香猪、滇南小耳猪和藏猪的生长激素基因(pGH,porcine growth hormone)进行了克隆测序及构建分子进化树,考察该激素对小型猪体型的影响。通过筛选合适的引物,采用PCR技术,扩增了四个小型猪品种的pGH基因全序列,并对其进行了克隆测序分析。4个小型猪品种pGH基因全长为2006bp,包括5个外显子和4个内含子,CDS全长为648bp。将4个品种小型猪和长白猪、雅南猪、内江猪进行了核苷酸序列比对,共有63处发生了变异,变异率为2.9%,其中外显子有12处变异,全部为转换;内含子有51处发生了变异,包括转换、颠换和缺失。聚类结果基本符合其地方猪种的地理位置分布原则。     

赤红球菌JDM312株环己酮单加氧酶基因的克隆和序列分析

应用PCR从赤红球菌JDM312株基因组DNA中扩增出chnB基因序列,构建pUC18-chnB重组质粒,转化大肠杆菌DH5α,并对插入片段进行测序,用Clustal X和Mega 3.1软件对测定DNA序列进行相似性和系统发育分析.结果显示：扩增得到的chnB基因大小为1 623 bp,编码由542个氨基酸残基构成的...     

产气荚膜梭菌的β2毒素基因克隆及其核苷酸序列分析

利用PCR技术，从C型产气荚膜梭茵中国标准株C59-44基因组DNA中扩增出了约0．7kb的基因，并将其克隆到pGEM-T栽体上，经酶切鉴定及核苷酸序列分析表明，该基因片段的核苷酸序列与国外报道的β2毒素基因序列一致．     

黑曲霉葡萄糖淀粉酶cDNA的克隆和序列分析及其在大肠杆菌中的表达(英文)

以poly(A)~ mRNA为模板,噬菌体λgt 10 DNA为载体构建了黑曲霉3758的cDNA的文库。用编码黑曲霉葡萄糖淀粉酶329—418位氨基酸的DNA顺序(456bp)作探针从该文库中筛选葡萄糖淀粉酶cDNA。采用原位噬菌斑杂交法获得11个阳性噬菌斑,从其中6个噬菌体中提取DNA进行限制酶切分析和印迹法转移杂交试验,发现这些阳性噬菌体DNA含有不同大小的插入片段,它们都能与DNA探针杂交,表明已克隆了葡萄糖淀粉酶的cDNA。采用单酶切及交叉双酶切法制定了2.1kbcDNA的物理图并对2.1kb片段作了全序列分析。序列分析结果显示,克隆的2.1kb片段含5＇端非编码区,编码葡萄糖淀粉酶的结构基因及3＇端非编码区。克隆的cDNA片段转移至表达载体λgt11,感染大肠杆菌后,产生的噬菌斑转移硝酸纤维素滤膜后与~(125)I标记的抗葡萄糖淀粉酶抗体进行免疫反应,结果证明含2.1kbcDNA的λgt11表现葡萄糖淀粉酶阳性.2.1kb片段也曾转至质粒pPL2,转化大肠杆菌JF1125。细胞裂解物在SDS-PAGE电泳中可看到新的蛋白带。这些结果表明,克隆的黑曲霉葡萄糖淀粉酶cDNA可以在大肠杆菌中表达。